Tutorium 2

Mathematik und Naturwissenschaften, Biologie, Biochemie
Biochemie II - Tutorium
Dresden, 20.10.2016
Alexander Götze
3.Semester Molekulare Biotechnologie
[email protected]
Mi. 2DS DRU. 68 H
Michel Heidecker
5. Semester Biologie
[email protected]
Do. 1.DS SE2 211 U
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Ablauf des Tutoriums
• Einführung und Wiederholung
• Vorlesungszusammenfassung
• Übungsaufgaben
• Selbststudium
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Einführung, Lösen der
Selbststudiumsaufgaben
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Teilen Sie die proteinogenen Aminosäuren in
fünf nachvollziehbare Gruppen ein
Unpolar,
Ungeladen
Aliphatisch
Polar,
ungeladen
Aromatisch
Glycin Gly G
Serine Ser S
Phenylalanine Lysine Lys K
Phe F
Aspartate
Asp D
Alanine Ala A
Threonine
Thr T
Tyrosine Tyr Y
Histidine
His H
Glutamate
Glu E
Proline Pro P
Cysteine
Cys C
Trypthophan
Trp W
Arginine
Arg R
Valine Val V
Asparagine
AsnN
Leucine Leu L
Glutamine Glu
Q
Isoleucine
Ile I
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Methionine
Met M
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Positiv
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Negativ
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Schlussfolgern Sie, welche Reaktionen gefordert
sind, um aus UMP dTTP zu machen.
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Schlussfolgern Sie, welche Reaktionen gefordert
sind, um aus UMP dTTP zu machen
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Schlussfolgern Sie, welche Reaktionen gefordert
sind, um aus UMP dTTP zu machen
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Warum eignen sich Triglyceride nicht zur
Bildung von Biomembranen, Sphingolipide
hingegen schon?
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Warum eignen sich Triglyceride nicht zur
Bildung von Biomembranen, Sphingolipide
hingegen schon?
•
Sphingolipide amphiphil (Hydrophober Schwanz und Hydrophiler Kopf)
• Hydrophober Teil: Langkettiger Alkylrest
• Hydrophiler Teil: Phosphat-Rest + kleines organisches Molekül oder
Oligosaccharid
•
Triacylglyceride ausschließlich lipophil (keine hydrophile Kopfgruppe)
• Biomembranen bestehen aus Lipiddoppelschicht, die ausschließlich aus
amphiphilen Molekülen bildbar ist.
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Zusammenfassung
Grundlagen
des
Stoffwechsel
s
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Grundlagen des Stoffwechsels:
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Phosphorylierung durch ATP
•
ATP hat ein mittleres Phosphorylierungspotential (ΔG der Hydrolyse einer
Phosphorylgruppe)
 ATP kann viele Moleküle phosphorylieren
 ADP kann von vielen Molekülen phosphoryliert werden
•
Hydrolyse erzeugt Energie, Phosphorylierung benötigt Energie.
 Gruppen mit höherem Phosphorylierungspotential können nicht ohne weiteres von
ATP phosphoryliert werden.
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Redox Co-Faktoren von Enzymen
•
•
•
Cofaktor := Coenzym + Cosubstrat
Redox Co-Faktor := Moleküle, die für die Funktion von Oxidareduktasen
unerlässlich sind.
Elektronenaufnehmender Teil ist:
• Bei NAD+ : Nicotinamid
•
Bei FAD : Isoalloxazin
• Besitzen mittleres Reduktionspotential
 Kann viele Moleküle reduzieren
 Kann von vielen Molekülen reduziert werden
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Glykolyse  Beschaffungsprozess von ATP und
NADH
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Einfachere
Übungsaufgaben
•Bestimmen Sie die Oxidationszahlen der Molekül
• Formaldehyd
• Acetaldehyd
• Glukose-6-P (nur C6, pH 0,01)
• Glycerol
• Pyruvate
•Erklären Sie den Begriff Hydrolyse am Beispiel der
Abspaltung von Pi von ATP (mit Strukturformel!)
Info: ATP ist ein Nukleotid
•Überlegen Sie sich mögliche Folgen des
Unterschieds zwischen NAD+ und NADP+.
Zwei Folgen genügen.
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•
Nennen Sie die Anzahl der drei Produkte (Pyruvat, H 2O, H+) der Glykolyse
(Gesamtreaktion)
Hinweise: Edukt ist Glukose und durch die Reaktion werden 2 NAD + und
2 ADP+P in 2 NADH und 2 ATP umgewandelt.
Hinweise: Ihr sollt hier Atome zählen.
•
Zeichnen Sie drei Moleküle die mindestens drei C-Atome enthalten und Teil der
Glykolyse sind. Info: NMP
•
Lactat entsteht aus einem Produkt der Glykolyse. Benennen Sie das Produkt und
Überlegen Sie, welche Reaktionen erforderlich sind, um es zu erhalten. Handelt es
sich um eine endergone oder exergone Reaktion. Info: NAD + ist ein Ion in
wasserhaltiger Umgebung.
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Selbststudium
•
Bringen Sie die Teilschritte der Hydrolyse in die richtige Reihenfolge
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Selbststudium
•
Ordnen Sie die während der Glykolyse verwendeten Enzyme den jeweiligen
Klassen zu.
•
Erklären Sie, ob und wieso es sich bei der Thioredoxin um ein Oxidations oder
Reduktionmittel handelt.
•
Welche Struktur nehmen einzelne Nukleotide in polarer Flüssigkeit ein. Wie
verändert sich die Extinktion der Moleküle (Hyperchromischer Effekt)
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Quellen:
http://www.spektrum.de/lexika/
images/biok/f2f787_w.jpg
https://www.spektrum.de/lexik
a/showpopup.php?
lexikon_id=11&art_id=9552&nu
mmer=787
http://www.nature.com/nrmicro
/journal/v12/n9/images/nrmicro
3330-f1.jpg
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