Plasmid Database

Plasmid Database
Diplomarbeit 2006/2007, Abteilung Informatik
Ausgangslage
Plasmide sind kleine, ringförmige DNA-Moleküle,
die in Bakterien vorkommen. Die Herstellung
solcher Plasmide im Labor erfolgt in mehreren
Schritten. Der gesamte Prozess ist teuer, kann
Wochen dauern und man ist sich dabei nie sicher,
dass nicht eine andere Forschungsgruppe etwas
sehr ähnliches bereits gemacht hat.
Resultate
Das Ergebnis dieser Diplomarbeit erfüllt alle zu
Beginn gestellten Anforderungen, sowie einige
zusätzlichen Punkte. Durch Verwendung von Open
Source Produkten sind keine Kosten entstanden.
Ausblick
In der Applikation wurde ein Bio-Algorithmus
(BLAST) eingebaut. Die Biologie bietet viele weitere
Grundlagen für interessante Informatikprojekte.
Aufgabenstellung
Das angestrebte Ziel dieser Diplomarbeit besteht
darin, eine Datenbank zu entwickeln, in der die
Forscher ihre elektronischen Sequenzinformationen
zusammen mit ihrer Email-Adresse ablegen
können. Benutzer können über ein Web-Interface
nach Eigenschaften oder nach Sequenzen suchen
und jenen Forschern eine Anfrage senden, die ein
entsprechendes Plasmid haben.
Durchführung
Die Anforderungen wurden mittels eines
Pflichtenhefts mit den Auftraggebern besprochen.
Nach Erstellung diverser Diagramme wurden die
Technologien gegeneinander abgewogen und
ausgewählt. Die Entwicklung der Applikation basiert
auf aktuellen Technologien.
Diplomanden:
Betreuender Dozent:
Auftraggeber:
Chantal Isler
Carla Santoro
Prof. Bernhard C. Wyss
Dr. Frederic J. Hoerndli
Dr. Bernhard M. Kohli