Zentrum für Humangenetik Universität Bremen Quantitative Analysen der HMG-Expression in ausgewählten malignen Neoplasien Dissertation Zur Erlangung des Grades eines Doktors der Naturwissenschaften - Dr. rer. nat - Dem Promotionsausschuss Dr. rer. nat. im Fachbereich Biologie / Chemie der Universität Bremen vorgelegt von Britta Meyer Bremen, 29.09.2006 1. Gutachter: Prof. Dr. J. Bullerdiek 2. Gutachter: Prof. Dr. L. Rensing Hiermit erkläre ich, Britta Meyer, geboren am 08.08.1974, dass zum Verfassen der vorliegenden Dissertation „Quantitative Analysen der HMG-Expression in ausgewählten malignen Neoplasien” folgende drei Aussagen zutreffen: 1. Ich habe die Arbeit ohne unerlaubte fremde Hilfe angefertigt. 2. Ich habe keine anderen als die von mir angegebenen Quellen und Hilfsmittel benutzt. 3. Ich habe die den benutzten Werken wörtlich oder inhaltlich entnommenen Stellen als solche kenntlich gemacht. Bremen, 29.09.2006 Britta Meyer Inhaltsverzeichnis 1 Einleitung........................................................................................................ 1 2 Material und Methoden .................................................................................. 9 2.1 Gewebeproben ............................................................................................. 9 2.2 Blutproben .................................................................................................... 9 2.3 Zelllinien ....................................................................................................... 9 2.4 DNA-Isolierung ........................................................................................... 10 2.4.1 2.4.2 2.4.3 2.4.4 2.5 Isolierung genomischer DNA aus Zellkultur ............................................ 10 Plasmid DNA-Isolierung.......................................................................... 10 BAC DNA-Isolierung ............................................................................... 10 Quantifizierung von DNA im Photometer ................................................ 10 RNA-Isolierung ........................................................................................... 10 2.5.1 2.5.2 2.5.3 2.5.4 2.5.5 RNA-Isolierung aus Frischgewebe und Zellen........................................ 10 RNA-Isolierung aus Blut (PAXgene) ....................................................... 11 RNA-Isolierung aus Blut (ROCHE) ......................................................... 11 mRNA-Anreicherung............................................................................... 12 Quantifizierung von RNA im Photometer ................................................ 12 2.6 Northern Blot .............................................................................................. 12 2.7 cDNA-Erststrangsynthese .......................................................................... 13 2.8 PCR............................................................................................................ 13 2.9 Gelelektrophorese ...................................................................................... 13 2.10 Klonierung und Sequenzierung von DNA-Fragmenten............................... 14 2.11 Herstellung von cDNA/DNA-Sonden .......................................................... 14 2.12 BAC-Screening und Verifizierung ............................................................... 15 2.13 Semi-quantitative RT-PCR ......................................................................... 15 2.14 Quantitative Real-time PCR ....................................................................... 16 2.14.1 Absolute Quantifizierung bei humanen Templates ................................. 16 2.14.2 Absolute Quantifizierung bei caninen Templates .................................... 18 2.14.3 Relative Quantifizierung.......................................................................... 18 2.15 Herstellung rekombinanter HMGB1-Proteine in Bakterien ......................... 19 2.16 SDS-PAGE ................................................................................................. 20 2.17 Statistische Auswertung ............................................................................. 20 3 Ergebnisse.................................................................................................... 21 3.1 Mapping und Charakterisierung ausgewählter HMG-Gene beim Modelltier Hund........................................................................................................... 21 3.1.1 Mapping und Charakterisierung des caninen HMGA1-Gens .................. 21 3.1.2 Mapping und Charakterisierung des caninen HMGB1-Gens .................. 23 3.2 Quantitative Expressionsanalysen von HMGA2 und HMGB1 beim Menschen bzw. Hund ................................................................................. 24 3.2.1 Quantitative Expressionsanalyse des HMGA2-Gens im Tumor und korrespondierenden tumorfreien Lungengewebe von NSCLC-Patienten 24 3.2.2 Quantitative Expressionsanalyse des HMGA2-Gens in Prostatageweben des Hundes............................................................................................. 25 3.2.3 Quantitative Expressionsanalyse des HMGA2-Gens im Blut von Mammakarzinompatientinnen ................................................................. 26 3.2.4 Quantitative Expressionsanalyse des HMGA2-Gens im Blut von Patienten mit unterschiedlichen Diagnosen ............................................................ 27 3.2.5 Quantitative Expressionsanalyse des HMGA2-Gens im Blut von Patienten mit Erkrankungen des hämatopoetischen und lymphatischen Systems im Vergleich zu gesunden Probanden ......................................................... 28 3.2.6 Semi-quantitative Expressionsanalyse des HMGB1-Gens in Sarkomen des Hundes............................................................................................. 30 3.3 Untersuchung zur Funktion des HMGB1-Proteins...................................... 32 3.3.1 Untersuchung zur angiogenen Wirkung des HMGB1-Proteins ............... 32 4 Diskussion.................................................................................................... 33 5 Zusammenfassung ...................................................................................... 47 6 Summary....................................................................................................... 49 7 Literatur ........................................................................................................ 51 8 Danksagung ................................................................................................. 67 9 Publikationsübersicht.................................................................................. 68 10 Anhang.........................................................................................................154 10.1 Tabellen.....................................................................................................154 10.2 Abbildungen ..............................................................................................161 Abkürzungsverzeichnis °C A AC AGE AK ALL AML APL AS BAC BCR bFGF Bp C c-ABL CCND1 CD CDK cDNA CDS CFA CLL CML Da dCTP DNA DNase dNTP DTT EDTA ER EtOH FAB FACS FAM FISH FFPE g G Grad Celsius Adenin Adenocarcinoma Advanced glycation end products Antikörper Akute lymphatische Leukämie Akute myeloische Leukämie Akute Promyelozyten Leukämie Aminosäure Bacterial artificial chromosome Breakpoint cluster region Basic fibroblast growth factor Basenpaare Cytosin v-abl Abelson murine leukemia viral oncogene homolog Cyclin D1 Cluster of differentiation Cyclin-abhängige Kinasen Copy DNA Codierende Sequenz Canis familiaris Chronische lymphatische Leukämie Chronische myeloische Leukämie Dalton Desoxycytidintriphosphat Desoxyribonukleinsäure Desoxyribonuklease Desoxynukleosidtriphosphat Dithiothreitol Ethylendiamintetraessigsäure Östrogenrezeptorstatus Ethanol French American British, Klassifizierung der AML Fluorescence activated cell sorting 6-Carboxyfluorescein-aminohexyl Amidit Fluoreszenz in situ Hybridisierung Formalin-fixiert in Paraffin eingebettet Gravitationsbeschleunigung Guanin GAPDH GST h HCl HFPE HMG HMGA HMGA1a HMGA1b HMGB HMGN HOPE HSA Hz IL-1β IHC IPTG J JNK Kb KCl kDa KRAS l LB LPS M MAP MDS µg, µl, µm, µM mg, ml, mm, mM MGB MgCl2 MgSO4 min M-MLV MOPS mRNA NaCl NaOH NCBI Glycerinaldehyd-3-Phosphat Dehydrogenase Glutathion S-Transferase Stunde Salzsäure HOPE-fixiert in Paraffin eingebettet High Mobility Group High Mobility Group Protein A High Mobility Group Protein A Isoform a High Mobility Group Protein A Isoform b High Mobility Group Protein B High Mobility Group Protein N Hepes-glutamic acid buffer mediated organic solvent protection effect Homo sapiens Hertz Interleukin-1β Immunhistochemie Isopropyl-Thio-β-D-Galactopyranosid Joule c-Jun N-terminale Kinase Kilobasenpaare Kaliumchlorid Kilodalton Kirsten rat sarcoma viral oncogene homolog Liter Luria Bertani Lipopolysaccharid Molar Mitogen-activated protein Myelodysplastisches Syndrom Mikrogramm, -liter, -meter, -molar Milligramm, -liter, -meter, -molar Minor groove binder Magnesiumchlorid Magnesiumsulfat Minute Moloney Murine Leukemia Virus 3-[N-Morpholino]propansulfonsäure Messenger Ribonukleinsäure Natriumchlorid Natriumhydroxid National Center for Biotechnology Information ng, nm, nM NRAS NSCLC OD ORF PAC PAGE PCR PBS PMSF PR qRT-PCR RAGE RB RISH RNA RNase RNAi rRNA RT RT-PCR SCC SDS sec sRAGE SSC ssDNA T TAE TAMRA TNF-α TNM TP53 U UNG UTR UV v V VEGF w Nanogramm, -meter, molar Neuroblastoma RAS viral (v-ras) oncogene homolog Non-small cell lung cancer Optische Dichte Offenes Leseraster P1-derived artificial chromosome Polyacrylamid-Gelelektrophorese Polymerase-Kettenreaktion Phosphate buffered saline Phenylmethansulfonylfluorid Progesteronrezeptorstatus Quantitative Real-time RT-PCR Receptor for advanced glycation end products Retinoblastoma RNA in situ Hybridisierung Ribonukleinsäure Ribonuklease RNA-Interferenz Ribosomale Ribonukleinsäure Raumtemperatur Reverse Transkriptase-PCR Squamous cell carcinoma Natriumdodecylsulfat Sekunde Soluble RAGE Standard Saline Citrat Single stranded DNA Thymin Tris-Acetat EDTA 6-Carboxy-tetramethyl-rhodamin Tumornekrosefaktor α Tumorklassifikation (T - Tumor, N - Nodus, M - Metastasen) Tumorsuppressorprotein p53 Unit Uracil-N-Glykosylase Untranslatierte Region Ultraviolett Volumen Volt Vascular endothelial growth factor Gewicht Einleitung 1 1 Einleitung In der Krebsbehandlung besteht ein großes Interesse an molekularen Biomarkern, welche in Ergänzung der histopathologischen Standardmethoden die Diagnose, Prognosestellung und Therapieplanung bei malignen Erkrankungen verbessern könnten (Bast et al., 2005; Basil et al., 2006). Als potentielle Tumormarker werden seit längerem die High Mobility Group (HMG)Proteine diskutiert, insbesondere HMGA1, HMGA2 sowie HMGB1. In einer Vielzahl von Tumoren konnte eine Überexpression der HMGA-Proteine mit einem aggressiveren Phänotyp korreliert werden (Tamimi et al., 1993; Chiappetta et al., 1998; Abe et al., 2003a; Balcerczak et al., 2003; Flohr et al., 2003; Miyazawa et al., 2004). Für die HMGB1-Proteine wurde ebenfalls eine Überexpression in einer Reihe von Tumoren verglichen mit dem korrespondierenden Normalgewebe beschrieben. HMGB1 scheint bei der Invasion und Metastasierung der Tumoren eine wichtige Rolle zu spielen (Xiang et al., 1997; Taguchi et al., 2000; Brezniceanu et al., 2003). Zu Beginn dieser Arbeit im Jahre 2002 basierten Angaben zur Höhe der HMGExpression bei malignen Neoplasien zumeist auf Untersuchungen mittels semiquantitativer RT-PCR oder auf Northern Blot-Analysen. Eine echte quantitative Expressionsanalyse wurde erst mit Einführung der quantitativen Real-time RT-PCR (qRT-PCR) möglich. Die qRT-PCR ist durch Einsatz einer fluoreszenzmarkierten Sonde sehr spezifisch und sensitiv, so dass auch seltene Transkripte verlässlich quantifiziert und falsch negative Ergebnisse vermieden werden können. Thema der vorliegenden Arbeit ist die quantitative Analyse der HMGA- und HMGBExpression in verschiedenen malignen Neoplasien des Menschen sowie des Modelltieres Hund im Vergleich zu entsprechenden nicht-neoplastischen Geweben und Zellen. Ziel ist es, über Expressionsanalysen u.a. mit Hilfe der qRT-PCR die Bedeutung einer Reaktivierung der HMG-Gene für die Entstehung und Progression von Tumoren zu untersuchen. HMG-Proteine sind kleine Chromatin-assoziierte Nicht-Histon-Proteine, welche ursprünglich über ihre gemeinsamen physikochemischen Eigenschaften definiert wurden. So lassen sich die Proteine mit 0,35 M NaCl aus Chromatin extrahieren, sind löslich in 2% Trichloressigsäure bzw. 5% Perchlorsäure und besitzen einen hohen Anteil an basischen und sauren Aminosäuren. Der Name leitet sich aus ihrer hohen Einleitung 2 Mobilität im sauren Harnstoff-Polyacrylamidgel ab (Goodwin et al., 1973; Johns, 1982). Sämtliche Proteine der HMG-Familie gehören zu den „architektonischen Transkriptionsfaktoren“ (Grosschedl et al., 1994). Sie können allein keine Transkription auslösen, sondern ermöglichen durch Änderung der DNA-Konformation definierte Protein-DNA- sowie Protein-Protein-Wechselwirkungen und regulieren somit die Expression einer Vielzahl von Zielgenen (Bustin et al., 1996). Gemäß ihrer charakteristischen funktionellen Domänen erfolgte eine Einteilung in drei Proteinfamilien: HMGA, HMGB und HMGN (Bustin et al., 1996; Bustin, 2001). Die Proteine der HMGA-Familie binden über drei so genannte AT-Hooks mit hoher Affinität an AT-reiche Sequenzen in der kleinen Furche der DNA (Solomon et al., 1986; Reeves et al., 1990). Die HMGB-Proteine besitzen zwei HMG-Box-Domänen, mit denen sie sequenzunspezifisch ebenfalls an die kleine Furche der DNA binden (Bianchi et al., 1992), während sich die HMGN-Proteine über eine Nukleosomenbindende Domäne an nukleosomale DNA anlagern (Crippa et al., 1992). Auch aufgrund dieser unterschiedlichen funktionellen Motive induziert jede der drei HMGFamilien spezifische Änderungen der DNA-Struktur und besitzt individuelle zelluläre Funktionen (Bustin, 1999). Zur Familie der HMGA-Gene gehören HMGA1 und HMGA2. Das HMGA1-Gen ist in der chromosomalen Region 6p21 lokalisiert und codiert für die Proteine HMGA1a, HMGA1b und HMGA1c, welche Produkte dreier Splicevarianten des HMGA1-Gens sind (Johnson et al., 1989; Friedmann et al., 1993; Nagpal et al., 1999). Das HMGA2Gen, welches in der chromosomalen Region 12q14-15 lokalisiert ist (Chau et al., 1995; Schoenmakers et al., 1995), hat mindestens zwei Splicevarianten HMGA2a und HMGA2b (Hauke et al., 2002). Neben den drei stark konservierten DNAbindenden AT-Hooks besitzen die HMGA-Proteine eine saure C-terminale Domäne (Friedmann et al., 1993; Chau et al., 1995). Über die gesamte Länge der HMGAProteine wurden posttranslationale Modifikationen, wie Phosphorylierung, Acetylierung, Methylierung und Poly(ADP)-Ribosylierung, identifiziert, welche sowohl die Bindungseigenschaften der Proteine als auch ihre biologische Aktivität beeinflussen können (Elton et al., 1986; Nissen et al., 1991; Sgarra et al., 2003). Durch die Anlagerung von HMGA-Proteinen werden Änderungen der DNA-Struktur, wie z.B. Krümmung, Streckung, Entwindung und Supercoils induziert (Lehn et al., 1988; Falvo et al., 1995; Chase et al., 1999; Bagga et al., 2000; Slama-Schwok et al., 2000). Einleitung 3 Diese Konformationsänderungen der DNA sowie Protein-Protein-Wechselwirkungen von HMGA-Proteinen mit anderen Transkriptionsfaktoren beeinflussen die Bildung stereospezifischer Enhanceosomen an Promotoren einer Reihe von Genen, wodurch deren Expression positiv so wie auch negativ reguliert werden kann (Thanos et al., 1995; Klein-Hessling et al., 1996; Zentner et al., 2001). Erst kürzlich wurde gezeigt, dass Hmga1-„knockout“-Mäuse unter Hypertrophie des Herzens und malignen Erkrankungen des hämatologischen und lymphatischen Systems leiden (Fedele et al., 2006). Die homozygote Deletion des Hmga2-Gens führt bei Mäusen zu einem stark verminderten Wachstum („pygmy“-Phänotyp) (Zhou et al., 1995), während transgene Mäuse, die eine trunkierte Variante des HMGA2-Gens exprimieren, einen abnorm großen „giant“-Phänotyp mit vorwiegend abdominaler Lipomatose zeigen (Battista et al., 1999). Einen ähnlichen Phänotyp mit übersteigertem Wachstum weist auch ein zum Zeitpunkt der Untersuchung 8-jähriger Junge mit einer Keimbahnmutation im HMGA2-Gen auf, was die Bedeutung von HMGA2 für Wachstum und Entwicklung unterstreicht (Ligon et al., 2005). Die Expression der HMGA-Proteine ist maximal während der Embryonalentwicklung und in stark proliferierenden Zellen, während sie in voll differenzierten adulten Zellen und Geweben kaum nachweisbar ist (Chiappetta et al., 1996; Rogalla et al., 1996; Hirning-Folz et al., 1998; Gattas et al., 1999). In einer Reihe von Neoplasien konnte jedoch eine Reexpression der HMGA-Gene detektiert werden. In benignen, zumeist mesenchymalen, Tumoren, wie z.B. Lipomen, Uterus-Leiomyomen, pleomorphen Adenomen der Kopfspeicheldrüse und in chondroiden Hamartomen der Lunge, ist die transkriptionelle Reaktivierung wahrscheinlich auf chromosomale Translokationen zurückzuführen (Schoenmakers et al., 1995; Kazmierczak et al., 1996; Hennig et al., 1997; Williams et al., 1997; Gattas et al., 1999; Kazmierczak et al., 1999; Sornberger et al., 1999). Bei malignen Tumoren scheinen genregulatorische Mechanismen bei der Reaktivierung der HMGA-Expression eine wichtige Rolle zu spielen. Eine Expression von HMGA1-Proteinen oder der korrespondierenden mRNA wurde in einer Vielzahl von Karzinomen detektiert, wie z.B. beim kolorektalen Karzinom (Fedele et al., 1996; Abe et al., 1999; Kim et al., 1999; Chiappetta et al., 2001; Balcerczak et al., 2003), Prostatakarzinom (Bussemakers et al., 1991; Tamimi et al., 1993), Schilddrüsenkarzinom (Chiappetta et al., 1995; Chiappetta et al., 1998), Mammakarzinom (Liu et al., 1999; Flohr et al., 2003; Chiappetta et al., 2004), Ovarialkarzinom (Masciullo et al., 2003) und Zervixkarzinom (Bandiera et al., 1998). Einleitung 4 Weniger Studien sind über die Expression des HMGA2-Gens bei malignen Tumoren durchgeführt worden. Zu den malignen Tumoren, bei denen eine Überexpression von HMGA2 detektiert wurde, gehören das Plattenepithelkarzinom der Mundhöhle (Miyazawa et al., 2004), das Mammakarzinom (Rogalla et al., 1997), das Pankreaskarzinom (Abe et al., 2003b) und das nicht-kleinzellige Bronchialkarzinom (Rogalla et al., 1998). Zudem wurde eine Expression im Blut von AML- bzw. CMLPatienten (Rommel et al., 1997) und bei Patientinnen mit metastasiertem Mammakarzinom festgestellt (Sezer et al., 2000; Langelotz et al., 2003). Die HMGA-Expression korreliert in einer Reihe von Tumoren mit dem Grad ihrer Malignität bzw. der Metastasierungsneigung und wird deswegen als diagnostischer bzw. prognostischer Marker diskutiert (Bussemakers et al., 1991; Tamimi et al., 1993; Bandiera et al., 1998; Chiappetta et al., 1998; Abe et al., 1999; Abe et al., 2003a; Balcerczak et al., 2003; Flohr et al., 2003; Chiappetta et al., 2004; Miyazawa et al., 2004). Hinweise auf eine direkte Beteiligung der HMGA-Proteine bei der Tumorgenese wurden durch die Inhibition der HMGA2-Synthese mittels AntisenseVektoren erbracht, was die neoplastische Transformation durch Retroviren in Schilddrüsenzellen der Ratte verhindert (Berlingieri et al., 1995). Zudem konnte durch eine erhöhte HMGA-Expression in verschiedenen Zelllinien ein transformierter Phänotyp induziert werden (Wood et al., 2000a; Wood et al., 2000b; Reeves et al., 2001; Treff et al., 2004). Die Induktion der Hmga-Expression in transgenen Mäusen führt zur Entwicklung von verschiedenen Tumoren, was die wichtige Rolle der HMGA-Proteine bei der Entstehung von Tumoren in vivo verdeutlicht (Fedele et al., 2002; Xu et al., 2004; Fedele et al., 2005; Zaidi et al., 2006). Die Familie der HMGB-Proteine umfasst HMGB1, HMGB2 und HMGB3, wovon HMGB1, auch Amphoterin genannt, das am besten untersuchte Protein ist. Das humane HMGB1-Gen ist auf Chromosom 13q12-13 lokalisiert (Ferrari et al., 1996) und codiert für ein 215 AS langes Protein (Wen et al., 1989). Das hochkonservierte HMGB1-Protein besitzt zwei DNA-bindende Domänen HMG Box A und HMG Box B mit überwiegend basischen AS (Reeck et al., 1982; Bianchi et al., 1992) sowie einen sauren C-Terminus, der an Wechselwirkungen mit anderen Proteinen, z.B. Histonen, beteiligt ist (Stros et al., 1990) und die DNA-Bindungsaffinität von HMGB1 reguliert (Stros et al., 1994). Während HMGB1 mit hoher Affinität an spezielle DNAStrukturen, wie z.B. „Four-way junction DNA“ (Bianchi et al., 1989; Webb et al., 1999) Einleitung 5 und Cisplatin-DNA-Addukte bindet (Pil et al., 1992), ist die sequenzunspezifische Bindung von HMGB1 an die kleine Furche linearer DNA eher schwach. Die Rekrutierung von HMGB1-Proteinen zu bestimmten DNA-Sequenzen erfolgt über Protein-Protein Wechselwirkungen mit anderen nukleären Proteinen (Agresti et al., 2003). Die Anlagerung von HMGB1 an die DNA bewirkt eine starke Krümmung der DNA (Pil et al., 1993), was die Bildung von Multiproteinkomplexen ermöglicht. Durch die Interaktion mit HMGB1 wird die Aktivität einer Reihe von Transkriptionsfaktoren reguliert, wie z.B. des TATA-binding-protein (TBP), p53, NF-κB, verschiedener Steroidhormonrezeptoren und HOX-Proteine (Agresti et al., 2003). Hmgb1„Knockout“-Mäuse sterben kurz nach ihrer Geburt aufgrund einer unzureichenden Transkription des Glucocorticoid-Rezeptor-Gens an Hypoglykämie, was die wichtige Rolle von HMGB1 bei der Genregulation verdeutlicht (Calogero et al., 1999). HMGB1 wird in fast allen Zelltypen exprimiert, die Expression in Geweben von gesunden Probanden variiert jedoch je nach Differenzierungsgrad und Alter (Muller et al., 2004). Hohe nukleäre HMGB1 Level findet man in wenig differenzierten Zellen, während die Expression in ausdifferenzierten Zellen oft deutlich herunterreguliert ist (Seyedin et al., 1981; Mosevitsky et al., 1989; Begum et al., 1990). HMGB1 wird in transformierten Zelllinien stark exprimiert (Parkkinen et al., 1993) und in den meisten malignen Neoplasien wurde eine Überexpression verglichen mit den entsprechenden Normalgeweben gefunden, so z.B. beim Leberzellkarzinom (Kawahara et al., 1996), beim Magen- und kolorektalen Adenokarzinom (Xiang et al., 1997), beim Mammakarzinom (Brezniceanu et al., 2003) und in leukämischen Zellen (Cabart et al., 1995). Neben der Rolle als architektonischer Transkriptionsfaktor im Zellkern hat HMGB1 auch extrazelluläre Funktionen (Muller et al., 2001). Bei Entzündungen oder Verletzungen kann HMGB1 sowohl passiv freigesetzt als auch aktiv sezerniert werden. Eine passive Freisetzung erfolgt bei Zelltod durch Nekrose, jedoch nicht nach Apoptose, und führt zur Einleitung von Entzündungsprozessen (Scaffidi et al., 2002). Außerdem wird die Migration u.a. von glatten Muskelzellen und Mesoangioblasten und damit die Geweberegeneration angeregt (Degryse et al., 2001; Palumbo et al., 2004). Zum anderen wird HMGB1 durch aktivierte Monozyten und Makrophagen als Antwort auf verschiedene Endotoxine oder Zytokine, wie z.B. LPS, TNF-α oder IL-1β, aktiv sezerniert und bewirkt als Zytokin-ähnlicher Faktor die Freisetzung weiterer Zytokine (Wang et al., 1999a; Andersson et al., 2000). Darüber Einleitung 6 hinaus fungiert HMGB1 als Ligand von RAGE (Rezeptor for advanced glycation end products) (Hori et al., 1995). Durch Bindung von HMGB1 an RAGE werden die MAPKinasen p38, SAP/JNK und p44/p42 aktiviert, welche bei der Wachstumsregulierung von Zellen eine wichtige Rolle spielen. Es konnte gezeigt werden, dass eine Blockade der HMGB1-RAGE-Signalkaskaden das Wachstum und die Metastasierung von implantierten und spontan auftretenden Tumoren erheblich verringert (Taguchi et al., 2000). Im Rahmen dieser Promotionsarbeit sollte erstmals die HMG-Expression in größeren Serien maligner Neoplasien bzw. im Blut von Patienten mit malignen und anderen Erkrankungen quantitativ untersucht werden. Lungenkrebs stellt die häufigste krebsbedingte Todesursache dar. Da die Tumoren meist erst in fortgeschrittenem Stadium diagnostiziert werden, ist die Prognose mit einer 5-Jahres-Überlebensrate von unter 10% (Europa) sehr schlecht (Parkin et al., 2005). Lungenkarzinome entwickeln sich aus prämalignen Läsionen, die an verschiedenen Stellen innerhalb des bronchoalveolären Epithels entstehen können (Saccomanno et al., 1974). Dieser Feldkanzerisierungs-Prozess (Strong et al., 1984) ist auf eine wiederholte Exposition der Lunge gegenüber Karzinogenen, hauptsächlich verursacht durch Tabakkonsum, zurückzuführen (Parkin et al., 1994). Lungenkrebs wird in zwei Hauptgruppen unterteilt, das kleinzellige Bronchialkarzinom (SCLC) und das nicht-kleinzellige Bronchialkarzinom (NSCLC). Die häufigsten Formen des NSCLC stellen das Plattenepithelkarzinom (SCC) und das Adenokarzinom (AC) dar. Bisher detektierte genetische Veränderungen bei Lungenkrebs treten jeweils nur bei einer begrenzten Zahl von Fällen auf, so dass weiterhin nach molekularen Markern für die Früherkennung und die Entwicklung neuer Therapieansätze gesucht wird (Kettunen et al., 2004). Da das HMGA2-Protein als ein solches Target bei NSCLC diskutiert wird, sollten im Rahmen dieser Arbeit korrespondierende Tumor- und Nicht-Tumorgewebe von ACund SCC-Patienten erstmals quantitativ mittels qRT-PCR hinsichtlich ihrer HMGA2Expression untersucht werden. Zusätzlich zu den quantitativen Untersuchungen an Frischgewebe sollte die HMGA2-Expression mittels Immunhistochemie (IHC) an HOPE-fixierten, in Paraffin eingebetteten (HFPE) Gewebeschnitten nachgewiesen werden. Einleitung 7 In vorangegangenen Untersuchungen wurde eine HMGA2-Reexpression auch im peripheren Blut von Leukämie- und Tumorpatienten detektiert (Rommel et al., 1997; Sezer et al., 2000; Langelotz et al., 2003). Zu Beginn dieser Arbeit lagen jedoch ausschließlich Ergebnisse qualitativer Analysen der HMGA2-Expression mittels konventioneller RT-PCR im peripheren Blut vor. Im Rahmen dieser Arbeit sollte der Einfluss diverser Erkrankungen auf die HMGA2-Expression im Blut erstmalig mittels quantitativer Real-time RT-PCR untersucht werden. Zum einen erfolgten quantitative Genexpressionsanalysen am Blut eines Kollektivs von Mammakarzinompatientinnen vor und während der Therapie, um Auswirkungen der Behandlung auf die HMGA2Expression zu testen. Zum anderen wurde die HMGA2-Expression im Blut von Patienten mit verschiedenen hämatopoetischen bzw. Tumoren, lymphatischen mit malignen Systems, sowie Erkrankungen mit des verschiedenen Autoimmunerkrankungen quantitativ bestimmt. Die Expressionsdaten wurden mit denen gesunder Spender verglichen. Aufbauend auf diesen Ergebnissen sollte im Folgenden die HMGA2-Expression im peripheren Blut eines umfassenderen Kollektivs von Patienten mit Leukämien und anderen Erkrankungen des hämatopoetischen und lymphatischen Systems quantitativ untersucht werden. Neben Untersuchungen zur Expression des HMGA2-Gens wurden im Rahmen dieser Arbeit zudem Analysen zur Expression und Funktion von HMGB1 durchgeführt. Erstmals sollte die HMGB1-Expression in caninen Osteosarkomen untersucht werden. Canine Osteosarkome sind maligne, sehr aggressive Knochentumoren, die ebenso wie humane Osteosarkome standardmäßig mit Cisplatin behandelt werden (MacEwen, 1990; Vail et al., 2002). Da HMGB1 durch Bindung an Cisplatin-DNA-Addukte die Reparatur der DNA durch „nucleotide excision repair“-Mechanismen behindert und damit die antitumorale Wirkung des Zytostatikums Cisplatin verstärkt (Zamble et al., 1996; He et al., 2000), sollte die intertumorale Varianz der HMGB1-Expression mittels Northern Blot-Analyse untersucht werden. Die Entwicklung einer semi-quantitativen RT-PCR sollte zeigen, ob diese Methode eine kosten- und zeitsparende Alternative zum Blot bietet. Darüber hinaus sollte die Funktion des humanen HMGB1-Proteins als angiogener Faktor im in vitro-Modell untersucht werden. Einleitung 8 Als Basis für Untersuchungen am Modelltier Hund sollten im Rahmen dieser Arbeit die caninen HMGA-Gene sowie das canine HMGB1-Gen auf dem Hundegenom gemappt und ihre Struktur und cDNA-Sequenz aufgeklärt werden. Für HMGA1 und HMGB1 sollten basale Expressionsmuster mittels Northern Blot-Analysen bestimmt werden. Zudem sollten quantitative Analysen der HMGA2-Expression mittels qRTPCR bei caninen Prostatageweben verschiedener Histologien zeigen, ob ein Zusammenhang zwischen Höhe der HMGA2-Expression und Aggressivität der Tumoren besteht. Material und Methoden 2 Material und Methoden 2.1 Gewebeproben 9 Die humanen Tumorproben und korrespondierenden tumorfreien Gewebeproben der Patienten mit nicht-kleinzelligem Bronchialkarzinom (NSCLC) stammen aus der Klinischen und Experimentellen Pathologie des Forschungszentrums Borstel. Die verwendeten Gewebeproben des Hundes wurden von der Klinik für kleine Haustiere der Stiftung Tierärztliche Hochschule Hannover zur Verfügung gestellt. 2.2 Blutproben 36 Blutproben von Patienten mit unterschiedlichen Diagnosen und 46 Proben von Patienten mit Erkrankungen des hämatopoetischen und lymphatischen Systems für die HMGA2-Genexpressionsanalysen wurden von D. Krisponeit des Zentrums für Innere Medizin, Hämatologie und Onkologie, Klinikum Bremen-Mitte entnommen und bereitgestellt. Sieben weitere Blutproben von CML-Patienten stammen von C. Junghanß, Abteilung Hämatologie und Onkologie, Klinik für Innere Medizin der Universität Rostock. Das Patientenmaterial für die vergleichenden Expressionsanalysen vor und während der Therapie im Blut von 22 Mammakarzinompatienten wurde von C.-O. Schulz, Innere Klinik mit Schwerpunkt Onkologie und Hämatologie der Charité Campus Mitte in Berlin zur Verfügung gestellt. Die mittels FACS aufgereinigten mononukleären CD33+/CD34+ Zellen aus peripherem Blut bzw. Knochenmark von insgesamt fünf Leukämiepatienten wurden von der Arbeitsgruppe Tumorimmunologie und Experimentelle Stammzelltransplantation, Abteilung Hämatologie und Onkologie, Klinik für Innere Medizin, Medizinische Fakultät der Universität Rostock zur Verfügung gestellt. 2.3 Zelllinien Die verwendeten caninen Zelllinien ZMTH3 und MTH52 wurden im Zentrum für Humangenetik der Universität Bremen etabliert. ZMTH3 leitet sich von einem Pleomorphen Adenom der Mamma und MTH52 von einem malignen kleinzelligen Tumor der Mamma ab. Material und Methoden 10 Die Leukämiezelllinien NB4 (akute Promyelozyten Leukämie, APL) und HL-60 (akute myeloische Leukämie, AML) wurden von der Arbeitsgruppe Tumorimmunologie und Experimentelle Stammzelltransplantation, Abteilung Hämatologie und Onkologie, Klinik für Innere Medizin, Medizinische Fakultät der Universität Rostock zur Verfügung gestellt. 2.4 DNA-Isolierung 2.4.1 Isolierung genomischer DNA aus Zellkultur Zur Isolierung genomischer DNA aus Zellkultur wurde das QIAamp DNA Mini Kit (Qiagen, Hilden) gemäß den Angaben des Herstellers im „Protocol for cultures cells“ verwendet. 2.4.2 Plasmid DNA-Isolierung Die Isolierung von Plasmid DNA erfolgte mit Hilfe des QIAprep Spin Miniprep Kit (Qiagen) gemäß den Angaben des Herstellers. Zur Plasmid-Isolierung wurden standardmäßig 10 ml Übernacht-Kulturen in selektivem LB-Medium verwendet. 2.4.3 BAC DNA-Isolierung BAC DNA wurde mittels QIAGEN Plasmid Maxi Kit (Qiagen) nach Angaben des Herstellers im „Very Low-Copy Plasmid/Cosmid Purification“-Protokoll isoliert. Ausgangsmaterial waren entsprechende 5 ml LB-Kulturen, mit denen nach 8 h Wachstum 250 ml Übernacht-Kulturen mit selektivem LB-Medium angeimpft wurden. 2.4.4 Quantifizierung von DNA im Photometer Zur Quantifizierung von DNA wurden 2-5 µl DNA-Lösung mit 60 µl Bidest in einer Küvette gemischt und im BioPhotometer (Eppendorf, Hamburg) bei 260 nm gemessen. 2.5 RNA-Isolierung 2.5.1 RNA-Isolierung aus Frischgewebe und Zellen Die RNA-Isolierung aus Gewebe, mononukleären Zellen und Zellkulturen erfolgte im Allgemeinen mit Hilfe des RNeasy Mini Kits (Qiagen) gemäß den Angaben des Material und Methoden 11 Herstellers. Die Zerkleinerung des Gewebes wurde in Puffer RLT mittels Skalpell durchgeführt und die Homogenisierung des Lysats durch Zentrifugation in QIAshredder-Säulen (Qiagen) erreicht. Alternativ wurde die Aufschließung und Homogenisierung der Proben mit Hilfe des TissueLysers durch Schütteln für 2 x 3 min bei 25 Hz unter Verwendung von 5 mm Stahlkügelchen ausgeführt. Bei proteinreichem Gewebe wurde das RNeasy Mini Protokoll für die Isolierung aus Herz, Muskel und Haut-Gewebe verwendet, welches sowohl einen Proteinase K-Verdau als auch einen DNase I-Verdau umfasst. Die für den Northern Blot benötigten RNA-Mengen wurden aus bis zu 250 mg Gewebe mittels RNeasy Midi Kit (Qiagen) gemäß dem RNeasy Midi Protokoll für die Isolierung aus Herz, Muskel und Haut-Gewebe isoliert, welches einen Proteinase KVerdau beinhaltet. Dazu wurden die Gewebeproben in 2 ml RLT-Puffer aufgenommen und mit dem Homogenisator Ultra-Turax (IKA-Werke, Staufen) zerkleinert und homogenisiert. Die weitere Durchführung erfolgte gemäß den Herstellerangaben. 2.5.2 RNA-Isolierung aus Blut (PAXgene) Die Abnahme von je 2,5 ml Vollblut erfolgte direkt in die mit einer RNAStabilisierungslösung gefüllten PAXgene Röhrchen der Firma PreAnalytiX (Qiagen). Die Lagerung der gefüllten Röhrchen erfolgte entweder bei 4°C für bis zu 7 Tage oder bei -20°C. Die Isolierung der Gesamt-RNA wurde gemäß den Herstellerangaben durchgeführt. Um eine komplette mechanische Zerstörung der genomischen DNA zu gewährleisten, wurde das Lysat nach dem Proteinase KVerdau mittels QIAshredder-Säule (Qiagen) homogenisiert. Des Weiteren wurde ein DNase I-Verdau auf der Säule durchgeführt, um DNA-Kontaminationen der RNA zu minimieren. Das Eluat wurde abweichend vom Protokoll ohne Denaturierung sofort quantifiziert und bei -80°C gelagert. 2.5.3 RNA-Isolierung aus Blut (ROCHE) Je 5 ml Vollblut wurden im Verhältnis 1:10 mit „RNA/DNA Stabilization Reagent for Blood/Bone Marrow“ (Roche Diagnostics, Mannheim) versetzt und bei -20°C gelagert. Die Isolierung von Gesamt-RNA aus 25 ml des Lysats (enthält 2,5 ml Blut) erfolgte mit Hilfe des High Pure RNA Isolation Kit (Roche Diagnostics) nach Angaben Material und Methoden 12 des Herstellers, wobei das Lysat in mehreren Schritten auf jeweils zwei Säulen aufgetragen wurde. 2.5.4 mRNA-Anreicherung Die Anreicherung von poly A+ mRNA aus Gesamt-RNA erfolgte mittels Oligotex mRNA Kit (Qiagen) gemäß den Herstellerangaben. 2.5.5 Quantifizierung von RNA im Photometer Zur Quantifizierung der isolierten RNA wurden in einer Küvette 60 µl 10 mM Tris-HCl (pH 8,0) mit 3 µl der RNA gemischt und bei 260 nm die Absorbanz mit dem BioPhotometer (Eppendorf) bestimmt. Da für die absolute Quantifizierung über RealTime PCR eine genaue Konzentrationsbestimmung maßgeblich ist, erfolgten die entsprechenden Messungen in Triplikat. Gegebenenfalls wurden Verdünnungen der RNA mit RNase-freiem Wasser hergestellt, um eine Konzentration von ca. 100 – 125 ng/µl RNA zu erreichen, so dass bei der Verwendung von 250 ng RNA mindestens 2 µl der RNA in die cDNA-Synthese eingesetzt werden konnten. 2.6 Northern Blot Die Northern Blot-Analyse erfolgte nach einem modifizierten Hybond XL Protokoll (Amersham Biosciences, Buckinghamshire, UK). Es wurden je 5 µg mRNA in einem denaturierenden 1,2% (w/v) Agarosegel mit 0,67% (v/v) Formaldehyd in 1x MOPS Puffer bei 80 V ca. 3 h aufgetrennt. Anschließend erfolgte eine Inkubation für 20 min in 50 mM NaOH, gefolgt von zwei Inkubationen für je 15 min in 1,5 M NaCl/0,5 M Tris-HCl (pH 7,5) und zwei weiteren Inkubationsschritten für je 15 min in 10x SSC (pH 7,0). Die RNA wurde mittels Kapillarblot über Nacht mit 10x SSC auf eine geladene Hybond-XL Membran (Amersham Biosciences) übertragen. Eine kovalente Bindung der RNA wurde mit Hilfe des Crosslinking unter UV-Licht (0,4 J/cm2) erreicht. Die Markierung der wie unter Punkt 2.11 beschrieben hergestellten cDNA-Sonden mit dem Radionuklid [α-32P]dCTP mit Hilfe des Megaprime DNA labelling system (Amersham Biosciences) und die Hybridisierung des Blots wurden im Zentrum für Humangenetik von H. Murua Escobar und A. M. Flohr durchgeführt. Material und Methoden 13 Für die Auswertung des Northern Blots wurden die Signale mit dem Storm PhosphorImager (Molecular Dynamics, Sunnyvale, USA) detektiert und mit dem Computerprogramm „ImageQuant“ (Molecular Dynamics) quantifiziert. 2.7 cDNA-Erststrangsynthese cDNA-Erststrangsythesen wurden im Allgemeinen mit 2,5 µM Poly-(A)-AdapterPrimer AP2 (5’ AAGGATCCGTCGACATCT(17) 3’), 0,5 mM der vier dNTPs, 0,01 M 1,4-Dithiotreitol und 1x Erststrangpuffer (50 mM Tris-HCl, 75 mM KCl, 3 mM MgCl2, pH 8.3) an 5 µg Gesamt-RNA bzw. 500 ng mRNA mit Hilfe der Reversen Transkriptase Superscript II (Invitrogen, Karlsruhe) gemäß Herstellerangaben in einem 20 µl Reaktionsvolumen durchgeführt. Die Reaktion erfolgte für 50 min bei 42°C und wurde durch eine Inkubation von 15 min bei 70°C gestoppt. 2.8 PCR Sämtliche PCR bzw. RT-PCR-Ansätze wurden standardmäßig mit ca. 50-200 ng DNA bzw. 2 µl cDNA und 2,5 U Taq-Polymerase (Invitrogen), 1,5 mM MgCl2, 0,2 mM der vier dNTPs sowie 0,4 µM Forward und Reverse-Primer gemäß Herstellerangaben in einem 50 µl Reaktionsvolumen angesetzt. Die Reaktion erfolgte nach folgendem Schema im Mastercycler Gradient (Eppendorf): Initiale Denaturierung für 5 min bei 94°C, anschließend 35 Zyklen mit Inkubationen für 30 sec bei 94°C, 30 sec mit einer dem Primerpaar angepassten Annealingtemperatur und 45 sec bei 72°C gefolgt von einem finalem Elongationsschritt für 10 min bei 72°C. 2.9 Gelelektrophorese PCR- und RT-PCR-Produkte wurden standardmäßig in einem 1,5% (w/v) Agarosegel versetzt mit 0,1 μg/ml Ethidiumbromid in TAE-Puffer (0,04 M Tris-Base, 0,04 M Essigsäure, 1 mM EDTA, pH 8,0) elektrophoretisch bei 100 V für ca. 90 min aufgetrennt. Anschließend wurden die Gele im UV-Durchlicht bei 254 nm mit einer Polaroidkamera fotografiert. Material und Methoden 2.10 14 Klonierung und Sequenzierung von DNA-Fragmenten Nach der gelelektrophoretischen Auftrennung von PCR- bzw. RT-PCR-Produkten wurden einzelne Banden erwarteter Fragmentlänge mittels Skalpell aus dem Agarosegel herausgeschnitten und die darin enthaltene DNA mit Hilfe des QIAEX II Kits (Qiagen) gemäß den Angaben des Herstellers isoliert. Die Ligation der aufgereinigten PCR-Produkte über den 3’ terminalen Desoxyadenosin-Überhang erfolgte mit Hilfe des Klonierungsvektors pGEM-T Easy (Promega, Mannheim) gemäß dem Standard Reaktionsprotokoll des Herstellers in 10 µl Reaktionsvolumen bei 4°C über Nacht. Die Thermotransformation erfolgte ebenso wie die Herstellung der kompetenten Bakterien nach dem Protokoll von Inoue et al. (1990) (Inoue et al., 1990). Für die Transformation der Ligationsansätze in thermokompetente E. coli DH5α Bakterien wurde SOB-Medium (2% (w/v) Bacto-Trypton, 0,5% (w/v) Hefeextrakt, 10 mM NaCl, 2,5 mM KCl, 10 mM MgCl2, 10 mM MgSO4, pH 7,0), zum Ausplattieren sowie zur Übernachtkultivierung der Bakterien wurde LB-Medium (1% (w/v) NaCl, 1% (w/v) Bacto-Trypton, 0,5% (w/v) Hefe-Extrakt, pH 7,0) eingesetzt. Positive Klone wurden über „Blue-White-Screening“ auf 2% LB-AIX-Platten (100 µg/ml Ampicillin, 0,5 mM IPTG, 50 µg/ml X-Gal) identifiziert. Die Isolierung der Plasmid-DNA aus 10 ml LB-Übernachtkulturen erfolgte mit Hilfe des QIAprep Spin Miniprep-Kits (Qiagen) nach Herstellerangaben. Standardmäßig wurde der Erfolg der Transformation durch einen Restriktionsverdau über die EcoRI Schnittstellen der Multiple Cloning Site des Vektors pGEM-T Easy und gelelektrophoretische Auftrennung verifiziert. Anschließend erfolgte die Sequenzierung derjenigen Klone mit erwarteten Restriktionsfragmentlängen durch die Firma MWG (Ebersberg) unter Verwendung der Standardprimer M13uni (5’ TGTAAAACGACGGCCAGT 3’) und M13rev (5’ CAGGAAACAGCTATGACC 3’). Die Sequenzdaten wurden mit Hilfe von Programmen des Softwarepaketes „Lasergene” (DNASTAR, Madison, USA) ausgewertet. 2.11 Herstellung von cDNA/DNA-Sonden Zur Herstellung der cDNA-Sonden für die Hybridisierung im Northern Blot und der DNA-Sonden zum BAC-Screening wurden geeignete cDNA- bzw. DNA-Fragmente der nachzuweisenden Gene wie beschrieben kloniert und über Sequenzierung verifiziert. Die klonierten Fragmente wurden als Template für die anschließende Material und Methoden 15 Amplifizierung über PCR eingesetzt. Die PCR-Produkte wurden im Gel aufgetrennt, mittels QIAEX II (Qiagen) aus dem Gel isoliert und dienten wiederum als Template für eine zweite PCR, welche frei von störenden Plasmiden ist und deren Produkte nach Aufreinigung mittels QIAquick PCR Purification Kit (Qiagen) und photometrischer Quantifizierung direkt in die radioaktive Markierung eingesetzt werden konnten (s. Kapitel 2.6). 2.12 BAC-Screening und Verifizierung Das BAC-Library-Screening erfolgte über zwei unterschiedliche Wege: Für HMGA1 und HMGB1 wurden canine RPCI-81 BAC/PAC Filter (BACPAC Resources, Oakland, USA) mit radioaktiv markierten caninen DNA-Sonden gemäß dem Herstellerprotokoll („Hybridisation of High Density Filters“) durch H. Murua Escobar im Zentrum für Humangenetik hybridisiert. Signale wurden mittels Storm PhosphorImager (Molecular Dynamics) detektiert und positive Klone identifiziert. Alternativ wurden die caninen CCND1 und NRAS BACs mittels PCR-Screening mit humanen CCND1 Primern bzw. caninen NRAS Primern an der DogBAC library (http://www.dogmap.ch) identifiziert. Sämtliche BAC-Klone wurden mittels PCR, Klonierung und Sequenzierung verifiziert. 2.13 Semi-quantitative RT-PCR Für die semi-quantitative Expressionsanalyse wurde eine Duplex-PCR an caniner cDNA etabliert, um die Expression des Zielgens im Verhältnis zum HousekeepingGen GAPDH bestimmen zu können. Gegenüber den unter 2.8 beschriebenen PCRBedingungen wurde die Zyklenzahl auf 28 beschränkt, so dass beide Amplifikationen in der exponentiellen Phase gestoppt wurden. Die Visualisierung der PCR-Fragmente erfolgte in einem 1,2% (w/v) Agarosegel, welches in einer Vistra Green Färbelösung bestehend aus 50 ml 1x TAE-Pffer und 5 µl Vistra Green für 15 min lichtgeschützt gefärbt wurde. Die Signale wurden mit Hilfe des Storm PhosphorImagers (Molecular Dynamics) detektiert und mit dem Computerprogramm „ImageQuant“ (Molecular Dynamics) quantifiziert. Material und Methoden 2.14 16 Quantitative Real-time PCR Zur quantitativen Analyse der HMGA2-Expression in Blut, Zellen und Gewebe wurde die Methode der quantitativen Real-time RT-PCR (qRT-PCR) nach dem TaqManPrinzip (Livak et al., 1995) sowohl zu Anwendung bei humanen wie auch caninen Templates etabliert. Zwei verschiedene Methoden stehen bei der Expressionsanalyse eines Zielgens mittels Real-time RT-PCR zur Verfügung, die absolute und die relative Quantifizierung. Bei der absoluten Quantifizierung wird die absolute Transkriptmenge des Zielgens anhand einer externen Standardkurve mit bekannten Konzentrationen ermittelt. Ergebnisse werden als Kopienzahl pro eingesetzte Nukleinsäuremenge angegeben. Bei der relativen Quantifizierung erfolgt die Normalisierung der Expression eines Zielgens mit Hilfe eines Referenzgens, welches als endogene Kontrolle dient. Damit ist keine spektrometrische Quantifizierung der eingesetzten RNA nötig, was bei der Analyse geringer RNA-Mengen von Vorteil ist. Anders als bei der absoluten Quantifizierung werden die Transkriptmengen nicht auf einen Standard bekannter Konzentration bezogen, sondern die Expression relativ zu einer festgesetzten Probe, dem so genannten Kalibrator, angegeben. Als endogene Kontrolle diente 18S rRNA, welches in Vorversuchen eine konstante Expression in den zu untersuchenden Proben zeigte. Zudem muss bei der relativen Quantifizierung gewährleistet sein, dass die PCR-Amplifikationen von Ziel- und Referenzgen eine vergleichbare Effizienz aufweisen. 2.14.1 Absolute Quantifizierung bei humanen Templates Zur absoluten Transkription Quantifizierung durch M-MLV der HMGA2-Expression Reverse Transkriptase wurde (Invitrogen) die mit Reverse einem genspezifischen HMGA2 Reverse Primer (5’ GCCATTTCCTAGGTCTGCCTC 3’) (Gross et al., 2003) unter Verwendung zweier Mastermixe durchgeführt. 2 µl Mastermix I bestehend aus 1 µl HMGA2lo (2 µM) und 1 µl dNTPs (10 mM) wurden zu jeweils 250 ng RNA pipettiert und mit der entsprechenden Menge an dest. H2O auf ein Volumen von 12 µl gebracht. Zur Auflösung von Sekundärstrukturen wurde jeder Ansatz für 5 min bei 65°C inkubiert und 1 min auf Eis gelagert. Nach kurzer Zentrifugation wurde Mastermix II mit 4 µl 5x Erststrangpuffer (50 mM Tris-HCl, 75 mM KCl, 3 mM MgCl2, pH 8.3), 2 µl 1,4-Dithiotreitol (0,1 M DTT), 1 µl RNaseOUT (40U) (Invitrogen) und 1 µl M-MLV (200 U) auf Eis zugefügt, durch Pipettieren Material und Methoden 17 vermischt und abzentrifugiert. Die Erststrangsynthese erfolgte für 50 min bei 37°C im Eppendorf Gradient Thermocycler (Eppendorf) und wurde durch Inkubation für 15 min bei 70°C gestoppt. Für die Real-time PCR zur HMGA2-Expressionsanalyse wurden Dreifach- bestimmungen mit jeweils 2 µl cDNA entsprechend 25 ng RNA-Äquivalenten in einem Reaktionsvolumen von 25 µl durchgeführt. Für alle zu messenden Proben eines Laufes wurde ein Mastermix mit 600 nM Forward Primer (5’ AGTCCCTCTAAAGCAGCTCAAAAG 3’) und Reverse Primer (s. oben), 200 nM fluoreszenzmarkierter Sonde (5’ 6-FAM-AGAAGCCACTGGAGAAAAACGGCCATAMRA 3’) (Gross et al., 2003), 1x Universal PCR Mastermix (Applied Biosystems, Darmstadt) und dest. Wasser angesetzt und in 96-well Platten (Sarstedt, Nümbrecht) vorgelegt. Nach der Zugabe von jeweils 2 µl cDNA, dem Verschließen der Platte mit transparenter Klebefolie (Applied Biosystems) und Zentrifugation für 15 sec bei 1000 x g erfolgte die PCR-Amplifikation mittels ABI Prism 7000 Sequence Detection System (Applied Biosystems), bzw. mit Hilfe des Applied Biosystems 7300 Real-Time PCR System (Applied Biosystems) unter folgenden PCR-Bedingungen: Zunächst erfolgte eine Inkubation für 2 min bei 50°C zur Aktivierung der Uracil-N-Glykosylase (UNG), welche Kontaminationen durch vorherige PCR-Produkte beseitigt. Zur Denaturierung des Templates und gleichzeitiger Deaktivierung der UNG bzw. Aktivierung der HotStart Taq-Polymerase wurde 10 min bei 95°C inkubiert. Anschließend wurden 40-45 Zyklen mit 15 sec Denaturierung bei 95°C und einem kombinierten Annealing- und Elongationsschritt für 1 min bei 60°C durchgeführt. Bei jedem qRT-PCR Lauf wurden zwei „Non-template“-Kontrollen mit Wasser statt cDNA bzw. mit der Wasserkontrolle aus der cDNA-Synthese und eine „-RT“-Kontrolle ohne Reverse Transkriptase durchgeführt, welche als erstes pipettiert und anschließend mit Folie verschlossen wurden. Da bei der absoluten Quantifizierung die Transkriptmengen in Bezug auf eine Standardgerade ermittelt werden, wurde parallel eine Verdünnungsreihe (102 bis 108 Kopien) eines dem PCR-Fragment entsprechenden synthetisch hergestellten 80 bp ssDNA-Standards (5’ AGAGTCCCTCTAAAGCAGCTCAAAAGAAAGCAGAAGCCACTGGAGAAAAACGGCCAAGAGGCAGACCTAGGAAATGGCCA 3’) mit bekannter Konzentration sowohl in der cDNA-Synthese als auch bei der PCR mitgeführt (Bustin, 2000). Zur Normalisierung wurden alle Ergebnisse auf 250 ng Gesamt-RNA Material und Methoden 18 bezogen, so dass Transkriptmengen in Kopienzahl / 250 ng Gesamt-RNA angegeben wurden. 2.14.2 Absolute Quantifizierung bei caninen Templates Eine Real-time RT-PCR zur absoluten Quantifizierung der HMGA2-Expression bei caninem Template wurde entsprechend der unter 2.14.1 beschriebenen Methode etabliert. Auf Grund der hohen Konserviertheit des HMGA2-Gens zwischen Hund und Mensch konnten sowohl der humane Reverse Primer als auch die humane fluoreszenzmarkierte Sonde beibehalten werden, Forward Primer (5’ AGTCCCTCCAAAGCAGCTCAAAAG 3’) und Standard (5’ AGAGTCCCTCCAAAGCAGCTCAAAAGAAAGCAGAAGCCACTGGAGAAAAACGGCCAAGAGGCAGACCT AGGAAATGGCCA 3’) wurden der caninen HMGA2-Sequenz entsprechend angepasst. Sowohl die cDNA-Synthese als auch die Real-time PCR erfolgten wie unter 2.14.1 beschrieben. 2.14.3 Relative Quantifizierung Die cDNA-Synthese zur relativen Quantifizierung erfolgte wie für die absolute Quantifizierung unter 2.14.1 beschrieben mit dem Unterschied, dass als Primer ein Hexamergemisch (150 ng/µl Random Hexamers) verwendet wurde, welches die Umschreibung der gesamten RNA einschließlich rRNA in cDNA ermöglicht. Abweichend vom oben angegebenen Protokoll wurde dem 50 min Inkubationsschritt bei 37°C ein Annealingschritt von 10 min bei 25°C vorangestellt. Für die relative Quantifizierung mittels Real-time PCR wurden sowohl für Ziel- als auch Referenzgen fertige Genexpressionsassays verwendet, welche genspezifische Primer und eine FAM-MGB-markierte Sonde enthalten (HMGA2: Hs00171569_m1; 18S: Hs99999901_s1, Applied Biosystems). Die Reaktionen erfolgten in einem Reaktionsvolumen von 20 µl in Triplikat. Je 18 µl eines Mastermixes mit 2x Universal PCR Mastermix (Applied Biosystems), 20x HMGA2- bzw. 18S-Assay und dest. Wasser wurden in 96-well Platten (Sarstedt) vorgelegt. Nach der Zugabe von je 2 µl cDNA wurden die verschlossenen Platten für 15 sec bei 1000 x g zentrifugiert. Anschließend erfolgte die PCR-Amplifikation mittels Applied Biosystems 7300 RealTime PCR System (Applied Biosystems) gemäß den unter 2.14.1 angegebenen Parametern. Analog zur absoluten Quantifizierung wurden bei jedem qRT-PCR Lauf zwei „Non-template“-Kontrollen und eine „-RT“-Kontrolle mitgeführt. Die Auswertung Material und Methoden 19 der Real-time PCR erfolgte gemäß der „comperative CT-method“ (ΔΔCT-Methode) (Livak et al., 2001) mittels Applied Biosystems 7300 Sequence Detection Software, Version 1.2.3, RQ Study Application (Applied Biosystems). 2.15 Herstellung rekombinanter HMGB1-Proteine in Bakterien Für die Expression rekombinanter HMGB1-Proteine wurde ein bereits fertiges Konstrukt bestehend aus dem humanen HMGB1-ORF kloniert im Expressionsvektor pGEX-6P-1 (Amersham Biosciences) mit GST-Fusion-Tag verwendet, welches in E. coli BL21 Zellen als Glycerolstock (H1Oo-4) vorlag. Die Aufreinigung der HMGB1-GST-Fusionsproteine erfolgte nach einem modifizierten Protokoll des „GST Gene Fusion System Handbook“ (Amersham Biosciences). Dazu wurden die Bakterien auf LBAG-Platten (100 µg/ml Ampicillin, 20 mM Glucose) ausgestrichen, in einer 10 ml LBAG-Vorkultur für 6 h bei 37°C und einer anschließenden 1 l LBAG-Hauptkultur für ca. 17 h bei 18°C kultiviert. Bei einer OD600 von 0,6 - 0,8 erfolgte die Induktion durch Zugabe von 200 µl 0,5 M IPTG. Nach einer Inkubation für 2 h bei 18°C wurden die Bakterien durch Zentrifugation für 15 min mit 4000 x g bei 4°C pelletiert und in 100 ml PBS* (90 ml PBS, 10 ml Glycerol 100%, 50 µl 1 M PMSF, 500 µl 1 M DTT, 100 µl 1 mg/ml Aprotenin) auf Eis resuspendiert. Die Lyse der Bakterien erfolgte durch Einfrieren in flüssigem Stickstoff, Auftauen bei 37°C, Zugabe von 200 µl Lysozym (50 mg/ml) und Inkubation für 30 min bei 6°C gefolgt von 2 weiteren Einfrier- und Auftauschritten. Nach Zugabe von 5 ml Tween 20 erfolgte eine weitere Inkubation des Lysats für 30 min bei 6°C unter leichtem Schütteln. Dann wurde das Lysat erneut eingefroren und aufgetaut und für 30 min mit 20.000 x g bei 4°C zentrifugiert. Der Überstand wurde mit 2 ml 50% (v/v) „Slurry“ (Glutathione Sepharose 4B, Amersham Biosciences) versehen und zur Bindung des GST-Tags der Fusionsproteine für 45 min bei 6°C unter leichtem Schütteln inkubiert. Nach einer Zentrifugation für 10 min mit 1000 x g bei 4°C wurde der Überstand verworfen und das „Slurry“ mit den daran gebundenen Fusionsproteinen durch dreimalige Zugabe von 10 ml PBS und Zentrifugation für 5 min mit 500 x g bei 4°C gewaschen. Anschließend wurde erneut mit 10 ml PreScission Cleavage Buffer (PSCB: 50 mM Tris-HCl (pH 7,0), 150 mM NaCl, 1 mM EDTA, 1 mM DTT) gewaschen und für 5 min mit 500 x g bei 4°C zentrifugiert. Zum Trennen der Proteine vom GST-Tag und damit auch von der Glutathione Sepharose wurde das Pellet mit 40 µl (40U) PreScission Protease und 960 µl PSCB bei 6°C Material und Methoden 20 über Nacht inkubiert und anschließend für 5 min mit 500 x g bei 4°C abzentrifugiert. Der Überstand mit dem gelösten HMGB1 Protein wurde bei -80°C gelagert. 2.16 SDS-PAGE Die Überprüfung der rekombinant exprimierten HMGB1-Proteine erfolgte über SDSPolyacrylamid Gelelektrophorese (PAGE). Gemäß dem BioRad Mini Protean IIProtokoll zur Herstellung von „Discontinuous Polyacrylamid Gels“ (Bio-Rad Laboratories, München) wurden Gele mit 12% Separationsgel (0,375 M Tris-HCl, pH 8,8) und 4% Sammelgel (0,125 M Tris-HCl, pH 6,8) angefertigt. Die Auftrennung im Laufpuffer (0,1% (w/v) SDS, 0,02 M Tris-Base, 0,2 M Glycine) erfolgte für ca. 40 min bei 200V. Das Gel wurde mit 0,1% (w/v) Coomassie Blue R-250 Färbelösung gefärbt und mit einer 40% (v/v) Ethanol/10% Eisessig-Lösung entfärbt. 2.17 Statistische Auswertung Die statistische Analyse der HMGA2-Expressionsunterschiede zwischen Tumormaterial und tumorfreien Proben von NSCLC-Patienten erfolgte über den einseitigen Zweistichproben t-Test bei abhängigen Stichproben (Paarvergleichstest). Da die Transkriptmengen keine Normalverteilung aufwiesen, wurde dem t-Test eine logarithmische Transformation der Werte vorangestellt. Die statistische Auswertung der HMGA2-Expression im Blut von Mammakarzinompatientinnen und von Leukämiepatienten erfolgte unter Verwendung des Paarvergleichstests bzw. des einseitigen Zweistichproben t-Tests unter Annahme unterschiedlicher Varianzen. Um einen statistischen Zusammenhang zwischen zwei Merkmalen zu bestimmen, wurden Korrelationstests nach Spearman bzw. Pearson durchgeführt. Sowohl der durchgeführte Test, der entsprechende Korrelationskoeffizient als auch das zugehörige Signifikanzniveau sind angegeben. Ergebnisse mit p-Werten unter 0,05 wurden als signifikant erachtet. Ergebnisse 21 3 Ergebnisse 3.1 Mapping und Charakterisierung ausgewählter HMG-Gene beim Modelltier Hund Für die im Rahmen dieser Arbeit geplanten Genexpressionsstudien der HMG-Gene wurde auch auf Gewebe des Modelltieres Hund zurückgegriffen, da hier die Bereitstellung von Probenmaterial erheblich einfacher ist als beim Menschen. Der Hund stellt in vielerlei Hinsicht ein geeignetes Tiermodell für die humane Krebsforschung dar. Der Hauptvorteil des caninen Modells besteht in den diversen Tumorerkrankungen, die im Unterschied zu anderen Modelltieren beim Hund spontan auftreten. Zudem zeigen die caninen Krebserkrankungen ein ähnliches biologisches und histologisches Verhalten wie die korrespondierenden menschlichen Erkrankungen. Aufgrund der guten medizinischen Versorgung und der im Vergleich zum Menschen geringeren ethischen Probleme beim Hund ist neben der Beschaffung von Probenmaterial auch die Durchführung von Therapiestudien einfacher als beim Menschen. Zu den Krebserkrankungen des Hundes, welche als geeignetes Modell für humane Neoplasien gelten, zählen u.a. Osteosarkome, Mammakarzinome, Bronchialkarzinome und Prostatakarzinome. 3.1.1 Mapping und Charakterisierung des caninen HMGA1-Gens I) Becker et al. (2003) II) Murua Escobar et al. (2004) III) Murua Escobar et al. (2005) Die HMGA1-Proteine sind an einer Vielzahl zellulärer Prozesse beteiligt, wie z.B. Genregulation, Integration viraler DNA in das Genom und neoplastische Transformation von Zellen. Eine Überexpression des HMGA1-Gens wurde für eine Reihe maligner Tumoren beschrieben, wobei die Höhe der HMGA1-Expression oft mit dem Grad der Malignität bzw. der Metastasierungsneigung eines Tumors korreliert. Zudem wurden chromosomale Abberationen des humanen HMGA1-Gens auf Chromosom 6p21 in vielen gutartigen meist mesenchymalen Tumoren, wie z.B. in Uterusleiomyomen, chondroiden Hamartomen der Lunge, Lipomen sowie follikulären Schilddrüsenadenomen, detektiert. Ergebnisse 22 Im Rahmen dieser Arbeit wurde das canine HMGA1-Gen unter Verwendung entsprechender BAC-Klone auf Chromosom CFA 23 des Hundes gemappt. Anders als beim Menschen stellt dieses Chromosom keinen Hot-Spot für chromosomale Bruchpunkte beim Hund dar. Die molekulare Charakterisierung der caninen HMGA1 cDNA ergab hingegen eine sehr hohe Ähnlichkeit zwischen Hund und Mensch. Wie beim Menschen besteht die cDNA des Hundes aus 6 Exons, welche die beiden Splicevarianten HMGA1a und HMGA1b codieren. Die Ähnlichkeit der gesamten cDNA-Sequenz beträgt für beide Splicevarianten 80,6%. 5’UTR, CDS und 3’UTR zeigen 95,6%, 95,1% bzw. 74,7% Sequenzähnlichkeit zwischen Hund und Mensch. Die aus der caninen cDNASequenz abgeleiteten Proteine HMGA1a und HMGA1b weisen eine Länge von 107 bzw. 96 AS auf und zeigen eine 100% Sequenzübereinstimmung zu den entsprechenden humanen Splicevarianten. Ein Vergleich zu orthologen Proteinsequenzen anderer Organismen, wie z.B. Maus, Ratte, Hamster, Schwein, Pferd, Rind und Huhn, zeigt, dass nur das Pferd dieselbe Sequenzübereinstimmung zum Menschen aufweist wie der Hund, jedoch ist bislang nur die equine HMGA1bVariante in der NCBI-Datenbank verzeichnet. Alle anderen Spezies weisen eine Ähnlichkeit zwischen 69,7% (Huhn) und 99,1% (Schwein) auf, wobei die funktionellen AT-Hook Domänen besonders stark konserviert sind. Bei der Sequenzanalyse der CDS von zwölf verschiedenen Hunderassen wurde für HMGA1b bei einer Probe eines Teckels ein Basenaustausch detektiert, welcher zum Einbau einer abweichenden AS an Codon 64 führt. Um einen Eindruck über die Expression des HMGA1-Gens beim Hund zu gewinnen, wurde ein Northern Blot mit Gesamt-RNA bzw. mRNA aus Nieren-, Milz-, Herz-, Lungen- und Muskelgewebe durchgeführt. Die Hybridisierung mit einer radioaktiv markierten HMGA1a-cDNA-Sonde zeigt in allen Geweben außer der Niere eine Bande mit ca. 1,8 Kb Länge. Dieser Wert entspricht der vom Menschen bekannten mRNA-Länge. Ergebnisse 3.1.2 23 Mapping und Charakterisierung des caninen HMGB1-Gens IV) Murua Escobar et al. (2003) Das humane HMGB1-Gen hat neben seiner Rolle im Zellkern als architektonischer Transkriptionsfaktor auch eine extrazelluläre Funktion. Dieses „Doppelleben“ macht HMGB1 als Target in der Krebstherapie so interessant. Bestimmte Zellen, wie z.B. Makrophagen, sezernieren HMGB1, welches als Ligand an den RAGE-Rezeptor binden kann. Die Bindung von HMGB1 an RAGE führt zur Aktivierung der MAPKinasen p38, SAP/JNK und p44/p42, welche bei entzündlichen Prozessen und der Tumormetastasierung eine wichtige Rolle spielen. Zur Charakterisierung des caninen HMGB1-Gens wurden die cDNA-Sequenz, die genomische Struktur, die Lokalisation im Hundegenom und das Expressionsmuster untersucht. Das canine HMGB1-Gen liegt auf Chromosom CFA 25 und besteht wie auch das humane Gen aus fünf Exons und vier Introns. Die aus der cDNA-Sequenz abgeleitete Proteinsequenz mit 215 AS stimmt zu 100% mit der des Menschen überein, wohingegen Rind und Maus jeweils einen AS-Austausch in der sauren Cterminalen Domäne des Orthologs aufweisen. Die Expressionsanalyse mittels Northern-Blot mit Gesamt-RNA bzw. mRNA aus Nieren-, Milz-, Herz-, Lungen- und Muskelgewebe ergab eine deutliche Expression in allen Geweben außer der Niere. Analog zum Menschen wurden zwei HMGB1-Transkripte mit einer Länge von 1,4 und 2,4 Kb detektiert. Ergebnisse 3.2 24 Quantitative Expressionsanalysen von HMGA2 und HMGB1 beim Menschen bzw. Hund 3.2.1 Quantitative Expressionsanalyse des HMGA2-Gens im Tumor und korrespondierenden tumorfreien Lungengewebe von NSCLC-Patienten V) Meyer et al. (im Druck) Lungenkrebs ist weltweit die häufigste krebsbedingte Todesursache. Grund dafür ist das meist fortgeschrittene Stadium des Tumors zum Zeitpunkt der Diagnosestellung. Eine Aufklärung der molekularen Mechanismen, welche bei Entwicklung und Progression der Tumoren eine Rolle spielen, könnte bei der Früherkennung und der Entwicklung von neuen Therapieansätzen helfen. In früheren Untersuchungen unserer Arbeitsgruppe mittels konventioneller RT-PCR konnte eine HMGA2Reexpression im Tumor von 14/19 NSCLC-Patienten detektiert werden, während im nicht-neoplastischen Umgebungsgewebe keine HMGA2-Expression festzustellen war. Ziel dieser Studie war die quantitative Analyse der HMGA2-Expression bei Patienten mit NSCLC. Tumorproben und korrespondierendes tumorfreies Lungengewebe von 17 Adenokarzinompatienten (AC) und 17 Plattenepithelkarzinompatienten (SCC) wurden mittels quantitativer Real-time RT-PCR untersucht und die Ergebnisse immunhistochemisch überprüft. Eine HMGA2-Expression konnte in allen untersuchten Lungenproben detektiert werden. Die Transkriptmengen variieren zwischen 289 und 525.947 Kopien pro 250 ng Gesamt-RNA im tumorfreien Gewebe und zwischen 5.422 und 16.991.545 Kopien im Tumorgewebe. In 33/34 Fällen konnte eine Überexpression von HMGA2 mRNA im Tumor verglichen zum korrespondierenden Umgebungsgewebe mit statistisch hoch signifikanten Unterschieden sowohl für die Adenokarzinompatienten (p < 0,0001) als auch für die Plattenepithelkarzinompatienten (p < 0,0001) festgestellt werden. Die HMGA2-Expression im Tumor liegt bis zu 911,02-fach (Mittelwert 158,41) für die Adenokarzinome und bis zu 2503,68-fach (Mittelwert 336,26) für die Plattenepithelkarzinome über der Expression im entsprechenden nicht- neoplastischen Gewebe, wobei ein statistisch signifikant höherer Anstieg (p < 0,05) bei den Plattenepithelkarzinomen zu verzeichnen ist. Eine signifikante Korrelation zu Grading oder Staging der Tumoren konnte nicht nachgewiesen werden, jedoch ist die höchste HMGA2-Transkriptmenge unter den Adenokarzinomproben bei der Ergebnisse 25 einzigen Neoplasie mit T4-Klassifizierung detektiert worden. Die qRT-PCRErgebnisse konnten durch immunhistochemische Untersuchungen, welche an einem Teil der NSCLC-Proben durchgeführt wurden, bestätigt werden. 3.2.2 Quantitative Expressionsanalyse des HMGA2-Gens in Prostatageweben des Hundes VI) Winkler et al. (in Vorbereitung) Neben dem Menschen ist der Hund die einzige Spezies, bei der häufig Prostatatumoren spontan auftreten. Zudem sind große Übereinstimmungen der beiden Spezies hinsichtlich Entwicklung und Progression der Adenokarzinome, wie z.B. Histopathologie und Metastasierungsverhalten, zu beobachten. Ebenso wie beim Menschen variiert die Aggressivität von Prostatatumoren des Hundes stark, so dass die Identifizierung von molekularen Markern, welche Rückschlüsse auf die Malignität eines Tumors erlauben, für eine verbesserte Prognosestellung und Therapie von großem Interesse ist. Bisherige Untersuchungen beim Menschen haben gezeigt, dass die Expression von HMGA1 mit der Aggressivität von Prostatatumoren korreliert. Zudem wird HMGA2 in anaplastischen Zellen der Prostata reexprimiert. Im Rahmen dieser Studie konnte bei der quantitativen Untersuchung der HMGA2Expression in 16 caninen Prostatageweben mit unterschiedlichen histologischen Befunden mittels Real-time RT-PCR eine erhebliche Überexpression von HMGA2 in Tumorgewebe verglichen mit gesundem Prostatagewebe nachgewiesen werden. Im nicht-neoplastischen Gewebe schwankt die HMGA2-Expression zwischen 127 und 1.433 Transkripten pro 250 ng Gesamt-RNA, in benignen Veränderungen der Prostata zwischen 963 und 20.755 Transkripten und in Adenokarzinomen zwischen 27.215 und 4.239.000 Transkripten. Der mit zunehmender Malignität der Tumoren steigende HMGA2-Level zeigt, dass die HMGA2-Expression als prognostischer Marker sowohl beim Menschen als auch beim Hund dienen könnte. Ergebnisse 3.2.3 26 Quantitative Expressionsanalyse des HMGA2-Gens im Blut von Mammakarzinompatientinnen Unpublizierte Ergebnisse Brustkrebs ist der häufigste maligne Tumor bei Frauen. Daher wird seit langem neben den histologischen und klinischen Parametern nach molekularen Faktoren gesucht, die Auskunft über die Prognose von Brustkrebserkrankungen geben können. In Untersuchungen an Blutproben von Brustkrebspatientinnen konnte mittels konventioneller RT-PCR eine HMGA2-Expression bei Patienten mit metastasiertem Mammakarzinom nachgewiesen werden, während dieses Transkript bei gesunden Spendern nicht detektierbar war. Statistische Analysen ergaben eine Korrelation zwischen HMGA2-Expression und schlechter Prognose bezüglich der Überlebenszeit, so dass die HMGA2-Expression im peripheren Blut als prognostischer Marker dienen könnte. Im Rahmen dieser Arbeit sollte eine quantitative Analyse der HMGA2-Expression mittels Real-time RT-PCR an Blut von Brustkrebspatientinnen durchgeführt werden. Zudem sollte untersucht werden, ob sich die HMGA2-Expression während einer Therapie verändert und eventuell Rückschlüsse auf das Ansprechen der Therapie zulässt. Dazu wurde von 22 Mammakarzinompatientinnen (s. Anhang, Tab. 1) je eine Blutprobe vor Therapiebeginn (-1) sowie eine zweite Probe während der Therapie (-2) entnommen und relativ quantifiziert. In allen untersuchten Blutproben war mittels der relativen Quantifizierung eine HMGA2-Expression nachweisbar. Aufgrund der teilweise sehr geringen RNAAusbeute schwanken einige der Ct-Werte für die endogene Kontrolle 18S jedoch so stark, dass nur in 16 von 22 Fällen eine verlässliche Quantifizierung der HMGA2Expression möglich war. Bei diesen 16 Patientinnen variiert die HMGA2-Expression vor Therapie um das 19,7-fache und nach der Therapie um das 13,3-fache. Es sind keine statistisch signifikanten Zusammenhänge der Expressionshöhen mit den klinischen Daten festzustellen. Ein Vergleich der HMGA2-Expression im Blut von Patientinnen mit und ohne Metastasen mittels Zweistichproben t-Test unter Annahme unterschiedlicher Varianzen ergab keine signifikanten Expressionsunterschiede zwischen diesen beiden Gruppen. Bezieht man die relative Transkriptmenge im Blut jeder Patientin während der Therapie auf die entsprechende Probe vor der Therapie, so dass diese als Kalibrator den Wert eins annimmt, wird deutlich, dass während der Ergebnisse 27 Behandlung sowohl Expressionssteigerungen bis zum 5,8-fachen (Patient 15) als auch Abnahmen der Expression bis zum 5,2-fachen (Patient 09) zu verzeichnen sind (s. Anhang, Abb. 1). Der Paarvergleichstest zeigt, dass die Therapie keine allgemeine Auswirkung auf die HMGA2-Expression hat, das heißt, die Therapien vermochten die HMGA2-Expression aller Patientinnen weder signifikant zu vermindern noch zu erhöhen. 3.2.4 Quantitative Expressionsanalyse des HMGA2-Gens im Blut von Patienten mit unterschiedlichen Diagnosen Unpublizierte Ergebnisse Frühere HMGA2-Expressionsanalysen mittels konventioneller RT-PCR hatten gezeigt, dass HMGA2 im peripheren Blut gesunder Probanden nicht detektierbar ist, während bei CML- bzw. AML-Patienten sowie in CD34-positiven hämatopoetischen Stammzellen von gesunden Personen eine HMGA2-Expression nachweisbar ist. Zudem konnte, wie unter 3.2.3 beschrieben, eine HMGA2-Reexpression im Blut von Patienten mit metastasiertem Mammakarzinom festgestellt werden. Um die Auswirkungen verschiedenster Erkrankungen auf die HMGA2-Expression im Blut zu evaluieren, wurden im Rahmen dieser Arbeit zunächst 36 Blutproben u.a. von Patienten mit soliden Tumoren, mit malignen Erkrankungen des hämatopoetischen bzw. lymphatischen Systems sowie mit verschiedenen Autoimmunerkrankungen erstmals mittels quantitativer Real-time RT-PCR untersucht und mit Blut von sieben gesunden Spendern verglichen (s. Anhang, Tab. 2). Im Gegensatz zu vorhergehenden Untersuchungen unter Verwendung der konventionellen RT-PCR war eine HMGA2-Expression in allen Blutproben nachweisbar, sowohl bei den diversen Patienten als auch bei den untersuchten gesunden Probanden (s. Anhang, Abb. 2). Mit Ausnahme der Probe 45 sind im peripheren Blut keine signifikanten Unterschiede in der HMGA2-Expression zwischen den Patienten mit verschiedenen Diagnosen (Mittelwert 6.689 Transkripte / 250 ng Gesamt-RNA ohne Probe 45 bzw. 10.878 Transkripte mit Probe 45) und den untersuchten gesunden Probanden (Proben 30-36, Mittelwert 5.819 Transkripte / 250 ng Gesamt-RNA) festzustellen. Die Blutprobe 45, welche eine 27-fache Überexpression verglichen zum Mittelwert im gesunden Blut zeigt, stammt von einem Ergebnisse 28 Patienten mit CML in Akzeleration nach abgebrochener Therapie, der in der Zwischenzeit verstorben ist. Bei den übrigen Patienten schwanken die Werte zwischen 1.126 Transkripten gemessen bei einem Patienten mit angeborenem gemischten variablen Immundefektsyndrom und 15.131 Transkripten bei einer Immunthrombozytopenie, was einer Varianz um das 13-fache entspricht. Die gesunden Probanden zeigen hingegen nur eine Varianz um das 2-fache. Neben der beschriebenen CML mit HMGA2-Überexpression waren unter den untersuchten Patienten zwei weitere maligne Erkrankungen des hämatopoetischen Systems vertreten. Sowohl Patient 1 mit CLL unter Endoxan-Behandlung als auch Patient 13 mit Myelodysplastischem Syndrom (MDS) zeigten mit 5.809 bzw. 8.221 Transkripten pro 250 ng Gesamt-RNA keine erhöhte HMGA2-Expression. 3.2.5 Quantitative Expressionsanalyse des HMGA2-Gens im Blut von Patienten mit Erkrankungen des hämatopoetischen und lymphatischen Systems im Vergleich zu gesunden Probanden VII) Meyer et al. (in Vorbereitung) Unpublizierte Ergebnisse Aufbauend auf den unter 3.2.4 beschriebenen Ergebnissen sollte im Folgenden die HMGA2-Expression im peripheren Blut eines umfassenderen Kollektivs von 53 Patienten mit verschiedenen Erkrankungen des hämatopoetischen und lymphatischen Systems, darunter 37 Leukämiepatienten, quantitativ untersucht werden (s. Anhang, Tab. 3). Die mittels qRT-PCR gemessene HMGA2-Expression schwankt stark mit Werten zwischen 2.870 Transkripten pro 250 ng Gesamt-RNA bei einem Patienten mit hochmalignem Lymphom und 6.360.200 Transkripten bei einem CML-Patienten in der Blastenkrise, was einer Varianz um das 2.216-fache entspricht (s. Anhang, Abb. 3). Da unter den elf am höchsten exprimierenden Patienten ausschließlich Leukämiepatienten zu finden sind, wurde diese Gruppe gesondert betrachtet und ihre Expressionsdaten mit denen der gesunden Probanden aus der vorhergehenden Untersuchung verglichen (s. Anhang, Abb. 4). Bei den Leukämiepatienten schwankt die HMGA2-Expression zwischen 3.936 (AML nach MDS) und 6.360.200 Transkripten (CML in Blastenkrise). Diese Varianz um das 1.616-fache steht einer Ergebnisse 29 ca. 2-fachen Varianz bei den gesunden Probanden gegenüber. Statistische Analysen mittels einseitigem t-Test unter Annahme unterschiedlicher Varianzen ergaben eine signifikant erhöhte HMGA2-Expression im Blut von Leukämiepatienten verglichen mit dem Blut gesunder Probanden (p < 0,05). Um festzustellen, ob die Therapie einen Einfluss auf die HMGA2-Expression hat, wurden Patienten, welche sich zur Zeit der Blutabnahme in der Therapie befanden bzw. eine Therapie hinter sich hatten, mit solchen Patienten, bei denen das Blut vor einer Therapie entnommen wurde, verglichen. Mittels eines entsprechenden t-Tests ergaben sich keine statistisch signifikanten Unterschiede. Eine gesonderte Betrachtung der HMGA2-Expression im peripheren Blut aller CMLPatienten (s. Anhang, Tab. 3) einschließlich des Patienten 45 mit CML in Akzeleration aus der vorangegangenen Studie (vgl. 3.2.4) zeigt, dass dieses Patientenkollektiv ebenfalls eine starke Varianz der HMGA2-Expression aufweist. Die gemessene Transkriptmenge reicht von 4.392 bei Patient C2 in Remission bis zu 6.360.200 Transkripten pro 250 ng Gesamt-RNA bei Patient B22 in der Blastenkrise, dem einzigen Patienten ohne Philadelphia-Chromosom bzw. nachweisbarem BCRABL-Fusionstranskript (s. Anhang, Abb. 5). Die statistische Analyse der Ergebnisse ergaben signifikante Korrelationen der Leukozytenzahlen zum Zeitpunkt der Blutabnahme und der gemessenen HMGA2-Expressionslevel sowohl für alle untersuchten CML-Patienten (Spearman-Korrelation: r = 0,899; p < 0,0001) als auch bei den Philadelphia-positiven Patienten (Spearman-Korrelation: r = 0,879; p < 0,0001). Da die HMGA2-Expression überproportional zur Leukozytenzahl ansteigt, ist von einer Hochregulierung der HMGA2-Gens in den besonders für die fortgeschrittenen Stadien der CML charakteristischen unreifen leukämischen Zellen auszugehen. Die Daten der Expressionsanalyse bei AML-Patienten (s. Anhang, Abb. 6) zeigen keine derartige Korrelation mit der Leukozytenzahl (s. Anhang, Tab. 3). Die Transkriptmenge schwankt bei dieser Gruppe der Patienten zwischen 3.936 Transkripten pro 250 ng Gesamt-RNA bei einer AML nach MDS unter Therapie und 2.686.860 bei gleicher Diagnose vor einer Behandlung. Es finden sich jedoch keine generellen signifikanten Unterschiede zwischen allen AML-Patienten während oder nach einer Therapie zu jenen, bei denen noch keine Behandlung aufgenommen wurde. Allerdings ergibt der t-Test, dass AML-Patienten allgemein eine statistisch Ergebnisse 30 signifikant höhere HMGA2-Expression aufweisen als die gesunden Probanden (p < 0,05). Um weitere Einsichten über die HMGA2-Expression bei AML-Patienten zu erhalten, wurden im Durchflusszytometer (FACS) angereicherte mononukleäre Zellen aus dem peripheren Blut oder Knochenmark von fünf AML-Patienten mit unterschiedlichen Anteilen an CD33- und CD34-positiven Zellen mittels qRT-PCR untersucht (s. Anhang, Tab. 3). Bis auf eine Probe mit 7.251 Transkripten zeigen alle Proben eine erhöhte Expression mit 144.781 bis 1.027.741 Transkripten pro 250 ng Gesamt-RNA (s. Anhang, Abb. 7). Ein direkter Zusammenhang mit dem Anteil an CD33- und CD34-exprimierenden Zellen ist aufgrund der begrenzten Probenzahl nicht festzustellen. Die stärkste Expression findet sich jedoch bei einer Probe mit 90% CD34-positiven Zellen, welche hämatopoetische Stammzellen bzw. Progenitoren repräsentieren. Die parallel untersuchten Zelllinien von Patienten mit akuter Promyelozyten Leukämie (APL) bzw. AML zeigen mit 574.453 bzw. 827.466 Transkripten pro 250 ng Gesamt-RNA ebenfalls eine starke Expression (s. Anhang, Abb. 7). 3.2.6 Semi-quantitative Expressionsanalyse des HMGB1-Gens in Sarkomen des Hundes VIII) Meyer et al. (2004) Die Platinderivate Cisplatin und Carboplatin gehören zu den am häufigsten angewendeten Zytostatika bei der Krebstherapie. Ihre Wirkung beruht auf der Bildung von kovalenten Cisplatin- bzw. Carboplatin-DNA-Addukten, welche die DNAReplikation und Transkription behindern und somit zur Apoptose der betroffenen Zellen führen. Das HMGB1-Protein bindet mit hoher Affinität an diese Addukte und verhindert so deren Reparatur durch „nucleotide-excision repair“, was die zytostatische Wirkung der Platinderivate verstärkt. Eine intertumorale Varianz der HMGB1-Expression könnte demnach den Therapieerfolg mit Cisplatin bzw. Carboplatin beeinflussen. Vorstellbar ist auch eine Anpassung der eingesetzten Dosis der Chemotherapeutika abhängig von der individuellen HMGB1-Expression, um häufig auftretende Nebenwirkungen zu vermindern. Ergebnisse 31 Sowohl bei humanen als auch bei caninen Osteosarkomen wird standardmäßig eine Therapie mit Cisplatin bzw. Carboplatin durchgeführt. Deshalb wurden im Rahmen dieser Studie sieben canine Sarkome, darunter fünf Osteosarkome, ein Fibrosarkom und ein Leiomyosarkom, mittels Northern Blot-Analyse und semi-quantitativer RTPCR auf ihre HMGB1-Expression hin untersucht. Die Northern Blot-Analyse ergab nach Normalisierung der eingesetzten RNA-Menge über die GAPDH-Expression eine deutliche Varianz der HMGB1-Expression um das 5,5-fache. Anschließend wurde eine semi-quantitative HMGB1/GAPDH Duplex-RT-PCR etabliert, deren Ergebnisse statistisch signifikant mit den Blottingergebnissen korreliert (Pearson Korrelation: r = 0,8919, p = 0,0071). Die detektierte deutliche intertumorale Varianz der HMGB1-Expression in sieben Sarkomen des Hundes zeigt die Bedeutung dieses Tumormarkers in Bezug auf das Ansprechen auf eine Chemotherapie mit Cisplatin bzw. Carboplatin. Die Etablierung der semi-quantitativen Duplex-PCR ermöglicht eine material- und zeitsparende quantitative Analyse der HMGB1-Expression, welche auch in der klinischen Praxis einsetzbar ist. Ergebnisse 32 3.3 Untersuchung zur Funktion des HMGB1-Proteins 3.3.1 Untersuchung zur angiogenen Wirkung des HMGB1-Proteins IX) Schlüter et al. (2005) Während der Tumorentwicklung kommt es durch unzureichende Neubildung von Blutgefäßen häufig zu Sauerstoffmangel im schnell proliferierenden Gewebe. Dies kann zum einen zur Induktion der Apoptose von Tumorzellen, zum anderen zur Bildung nekrotischer Bereiche in den betroffenen hypoxischen Arealen führen. Ein ungehemmtes Tumorwachstum ist demnach nur bei ausreichender Vaskularisierung des Gewebes möglich, was durch den sogenannten „Angiogenetischen Switch“ ermöglicht wird. Sowohl in hypoxischen als auch nekrotischen Bereichen eines Tumors kommt es zur vermehrten Expression angiogener Wachstumsfaktoren, welche die Neubildung von kleinen Blutgefäßen fördern. Zudem werden durch nekrotische Zellen Makrophagen angelockt, welche ihrerseits eine Reihe von angiogenen Zytokinen und Wachstumsfaktoren ausschütten. Das High Mobility Group Protein HMGB1 wird sowohl von den nekrotischen Zellen eines Tumors als auch von aktivierten Makrophagen sezerniert. Durch immunhistochemische Untersuchungen konnte im Rahmen dieser Arbeit die Expression von HMGB1 in nekrotischen Tumorbereichen von Mammakarzinomen bestätigt werden. Daraufhin wurde die mögliche angiogene Wirkung von HMGB1 auf die Differenzierung von Endothelzellen unter Verwendung eines dreidimensionalen Spheroid-Modells getestet. Erstmalig konnte gezeigt werden, dass durch rekombinant hergestelltes HMGB1 in-vitro die Migration von Endothelzellen und die Aussprossung von neuen Blutgefäßen induziert werden kann. Nach Applikation von 2 µg/ml, 0,4 µg/ml bzw. 0,08 µg/ml HMGB1 wurde eine statistisch signifikante (p < 0,0001) dosisabhängige kapillarähnliche Aussprossung beobachtet. Zwei Mechanismen der angiogenen Wirkung von HMGB1 in vivo sind denkbar: zum einen könnte HMGB1 selbst direkt als angiogener Faktor wirken und zum anderen könnte HMGB1 indirekt über Aktivierung von Makrophagen die Sekretion von angiogenen Faktoren, wie z.B. VEGF, induzieren. Diskussion 4 Die 33 Diskussion HMGA-Proteine sind architektonische Transkriptionsfaktoren, die eine entscheidende Rolle bei der neoplastischen Transformation, Progression und Metastasierung von Tumoren spielen. Eine Überexpression des embryonalen HMGA2-Proteins bzw. des HMGA2-Gens konnte bei einer Reihe maligner Tumoren detektiert werden, darunter das Mammakarzinom (Rogalla et al., 1997), das Pankreaskarzinom (Abe et al., 2003b) und das nicht-kleinzellige Bronchialkarzinom (Rogalla et al., 1998). Zu Beginn dieser Arbeit im Jahre 2002 waren keinerlei quantitative Untersuchungen zur HMGA2-Expression bei malignen Tumoren erhältlich. Im Rahmen dieser Arbeit wurde eine quantitative Real-time RT-PCR (qRTPCR) zur Quantifizierung der HMGA2-Expression in malignen Neoplasien, u.a. bei nicht-kleinzelligen Bronchialkarzinomen (NSCLC), etabliert. In der Studie von Meyer et al. (2006) wurde korrespondierendes tumorfreies Lungengewebe von 17 Patienten mit Adenokarzinom (AC) und 17 Patienten mit Plattenepithelkarzinom (SCC) untersucht (Meyer et al., 2006b). Es konnte mittels qRT-PCR gezeigt werden, dass HMGA2 sowohl in allen Tumorproben als auch im nicht-neoplastischen Lungengewebe nachweisbar exprimiert wird. Verglichen mit den entsprechenden tumorfreien Lungengeweben ergab die absolute Quantifizierung der Expression eine statistisch hoch signifikante Überexpression des HMGA2-Gens sowohl für die untersuchten AC- als auch die SCC-Proben. Im Mittel war bei den AC- bzw. den SCC-Proben eine 159-fache bzw. 336-fache HMGA2-Überexpression zu verzeichnen, mit einer signifikant höheren Expressionssteigerung bei den SCCProben. In einer zusätzlichen Untersuchung eines Teils der Gewebeproben mittels Immunhistochemie (IHC) konnte in sechs der sieben höchstexprimierenden Fälle ebenfalls eine HMGA2-Expression nachgewiesen werden, was die Ergebnisse der qRT-PCR bestätigt. Ein Vergleich der beiden Detektionsmethoden zeigt, dass die PCR-basierte Methode um ein Vielfaches sensitiver ist als die IHC. Während mittels qRT-PCR 289 Kopien in 250 ng Gesamt-RNA detektierbar waren, konnte ein positives IHC-Ergebnis nur in Proben mit einer Expression von mindestens 1,3·106 HMGA2-Transkripten nachgewiesen werden. Eine Korrelationsanalyse zwischen HMGA2-Transkriptmengen und histopathologischen Parametern der Tumoren, wie TNM, Grading und Staging, ergab keinen signifikanten Zusammenhang, jedoch ist Diskussion 34 auffällig, dass die höchste HMGA2-Transkriptmenge unter den AC-Proben bei der einzigen Neoplasie mit T4-Klassifizierung detektiert wurde. In früheren Untersuchungen wurden chromosomale Rearrangierungen des HMGA2Gens bei chondroiden Hamartomen der Lunge festgestellt (Fletcher et al., 1995; Kazmierczak et al., 1995). Zudem konnten Rogalla et al. (1998) eine Reexpression von HMGA2 in NSCLC-Proben mittels konventioneller RT-PCR in 14 von 19 NSCLCProben nachweisen, während in keinem der untersuchten Umgebungsgewebe Transkripte detektierbar waren (Rogalla et al., 1998). Der in dieser Arbeit erstmals erbrachte Nachweis von HMGA2-Transkripten auch im histologisch tumorfreien Gewebe verdeutlicht die höhere Sensitivität der qRT-PCR gegenüber der herkömmlichen RT-PCR. Übereinstimmend konnte in neueren Studien mittels qRTPCR eine HMGA2-Expression auch in gesundem Myometrium (Gross et al., 2003) bzw. in normalen Keratinozyten der Mundhöhle (Miyazawa et al., 2004) detektiert werden, was auf eine Basalexpression von HMGA2 in gesundem Gewebe hinweist. Bemerkenswert sind die starken Schwankungen der HMGA2-Expression um das 1820-fache im nicht-neoplastischen Gewebe. Die Entwicklung von Lungentumoren ist ein multifaktorieller Prozess, bei dem prämaligne Läsionen an verschiedenen Stellen innerhalb des bronchoalveolären Epithels entstehen. Diese sind gekennzeichnet durch genetische Veränderungen, welche auch im Bronchialkarzinom vorhanden sind (Park et al., 1999; Wistuba et al., 1999). Demnach könnten die erhöhten HMGA2-Transkriptmengen, die in einigen der nachweislich tumorfreien Gewebeproben gefunden wurden, Folge bzw. Kennzeichen dieser charakteristischen prämalignen Veränderungen sein. Diese Annahme wird durch neueste Untersuchungen an malignen und prämalignen Läsionen der Lunge gestützt (Sarhadi et al., 2006). In der betreffenden Arbeit wurden Gewebe-Mikroarrays mit 152 Lungenkarzinomen und Gewebeschnitte von 17 Patienten mit Hyperplasie, Metaplasie und Dysplasie des Bronchienepithels immunhistochemisch auf ihre HMGA2-Expression untersucht. Neben 90% der Karzinome waren auch einzelne Zellen bzw. Areale des normalen Bronchienepithels HMGA2-positiv. Zudem war eine schwache HMGA2-Expression in den untersuchten Metaplasien und eine höhere Expression in den meisten Dysplasien zu verzeichnen. Statistische Analysen mittels Log-Rank Test ergaben für die untersuchten AC-Proben eine signifikante Korrelation der HMGA2-Expression mit einer schlechten Überlebensrate. Die zusätzlich von Sarhadi et al. (2006) durchgeführte relative Quantifizierung der HMGA2-Expression Diskussion 35 mittels qRT-PCR an 23 Lungenkarzinomen, darunter je acht AC- und acht SCCProben, verglichen mit drei tumorfreien Lungengeweben bestätigen zudem die im Rahmen dieser Promotion festgestellte Überexpression bei NSCLC. Im Unterschied zu den Ergebnissen dieser Arbeit beträgt die Überexpression im Tumor im Schnitt jedoch nur das 6-fache der im tumorfreien Gewebe gemessenen Expression. Zusammenfassend kann festgestellt werden, dass die quantitativen Ergebnisse zur Überexpression des HMGA2-Gens die Bedeutung der HMGA2-Expression sowohl als diagnostischer als auch als prognostischer Marker beim NSCLC untermauern. Da Prostatatumoren bezüglich ihrer Malignität sehr heterogen sind und somit nach genetischen Markern zur verbesserten Klassifikation der Tumoren gesucht wird (Bussemakers et al., 1991), wurde im Rahmen dieser Arbeit in Zusammenarbeit mit S. Winkler die HMGA2-Expression bei caninen Prostatageweben mit unterschiedlichen histologischen Befunden quantitativ mittels qRT-PCR untersucht (Winkler et al., 2006). In früheren Untersuchungen mittels RNA in situ Hybridisierung (RISH) konnte die Expression des dem HMGA2-Gen verwandten HMGA1-Gens mit der Aggressivität der untersuchten Prostatatumoren korreliert werden (Tamimi et al., 1993; Tamimi et al., 1996). Erst kürzlich wurde die Reexpression von HMGA2 bei Zellen eines anaplastischen Adenokarzinoms der Prostata nachgewiesen (Diana et al., 2005). Der Hund ist neben dem Menschen die einzige Spezies, bei der Prostatatumoren spontan auftreten (Boutemmine et al., 2002). Aufgrund ihres ähnlichen histologischen und biologischen Verhaltens gelten Prostatatumoren des Hundes als anerkannte Modelle für die entsprechenden humanen Neoplasien (MacEwen, 1990; Knapp et al., 1997). Im Rahmen dieser Arbeit konnte mittels qRTPCR erstmals eine erhebliche Überexpression von HMGA2-mRNA-Transkripten in Tumorgeweben im Vergleich zu gesundem Prostatagewebe nachgewiesen werden. Entsprechend den untersuchten nicht-neoplastischen Geweben der voran- gegangenen Studie an NSCLC-Patienten wurde eine geringe Expression auch in den Prostatageweben gesunder Hunde detektiert. In benignen Veränderungen der Prostata konnten erhöhte HMGA2-Transkriptmengen nachgewiesen werden, während die stärkste Expression in Adenokarzinomen zu verzeichnen war. Der mit zunehmender Malignität der Prostatatumoren steigende HMGA2-Level zeigt, dass die HMGA2-Expression als prognostischer Marker sowohl beim Menschen als auch beim Hund dienen könnte. Diskussion 36 Vorangegangene Untersuchungen mit der konventionellen RT-PCR haben gezeigt, dass auch im Blut von Patienten mit malignen Neoplasien eine Reexpression von HMGA2 detektiert werden kann. In dieser Arbeit sollten erstmals quantitative Analysen an RNA aus peripherem Blut von Patienten mit unterschiedlichen Diagnosen durchgeführt werden. Zunächst wurde die HMGA2-Expression im Blut von 22 Mammakarzinompatientinnen, darunter 14 Patientinnen mit Metastasen, vor Therapiebeginn sowie während der Therapie relativ quantifiziert. In früheren Untersuchungen mittels heminested RT-PCR konnte eine HMGA2-Expression in invasiv duktalen Mammakarzinomen vornehmlich mit hohem histologischen Grading detektiert werden, während in tumorfreien Umgebungsgeweben keine nachweisbare HMGA2- Expression auftrat (Rogalla et al., 1997). Mit derselben Methode konnte eine HMGA2-Expression im Blut von Patientinnen mit metastasiertem Mammakarzinom detektiert und mit einer schlechten Prognose bezüglich der Überlebensrate korreliert werden (Sezer et al., 2000; Langelotz et al., 2003). Keine HMGA2-Expression war hingegen im Blut gesunder Spender und bei Patientinnen ohne Metastasen detektierbar (Sezer et al., 2000). In der vorliegenden Arbeit konnte in allen Blutproben der Patientinnen mit Mammakarzinom, darunter hauptsächlich invasiv duktale Tumoren, eine HMGA2-Expression detektiert werden. Bei den 16 verlässlich quantifizierbaren Probenpaaren konnten allerdings keine statistisch signifikanten Expressionsunterschiede zwischen den Proben von Patienten vor und während der Therapie festgestellt werden. Die Ergebnisse von Sezer et al. (2000) und Langelotz et al. (2003) konnten ebenfalls nicht bestätigt werden. Weder ließen sich signifikante Expressionsunterschiede zwischen Patienten mit und ohne Metastasen nachweisen, noch konnte eine Korrelation der HMGA2-Transkriptmengen vor der Therapie zu TNM oder Grading der Tumoren ermittelt werden. Diese Ergebnisse werden im Wesentlichen von parallel zu dieser Arbeit ebenfalls mittels qRT-PCR gemachten Untersuchungen von Fabjani et al. 2005 gestützt. Darin wurde die HMGA2Expression in Blutproben von Brustkrebspatientinnen verschiedener Histologien mit der Expression gesunder Individuen verglichen. Es wurden keine signifikanten Unterschiede zwischen beiden Gruppen gefunden. Darüber hinaus konnten auch keine Zusammenhänge zwischen der Höhe der HMGA2-Expression und jeglichen histopathologischen Daten hergestellt werden (Fabjani et al., 2005). Damit scheint die HMGA2-Expression im peripheren Blut von Patientinnen als Indikator für Diskussion 37 Brustkrebs wenig geeignet. Allerdings konnte in derselben Arbeit ein Zusammenhang der HMGA2-Expression mit dem invasiven Wachstum von Mammatumorzelllinien hergestellt werden, was als Hinweis darauf interpretiert wurde, dass HMGA2 bei der Invasion von Tumoren eine Rolle spielt. Dieses Ergebnis passt wiederum zu der eingangs erwähnten Reexpression von HMGA2 in invasivem Mammakarzinomgewebe (Rogalla et al., 1997). Zur Klärung der Frage, ob andere Erkrankungen einen Einfluss auf die HMGA2Expression im peripheren Blut haben, wurde im Rahmen dieser Arbeit die HMGA2Expression in 36 Blutproben u.a. von Patienten mit diversen Tumoren, mit malignen Erkrankungen des hämatopoetischen bzw. lymphatischen Systems sowie mit verschiedenen Autoimmunerkrankungen quantitativ bestimmt. Als Vergleichskollektiv dienten sieben Proben gesunder Spender. Über die absolute Quantifizierung mittels qRT-PCR konnte in allen untersuchten Proben eine HMGA2-Expression nachgewiesen werden. Im Gegensatz zu früheren Untersuchungen mittels konventioneller RT-PCR (Rommel et al., 1997; Sezer et al., 2000) waren auch sämtliche Proben gesunder Probanden nachweisbar HMGA2-positiv. Dieses Ergebnis zeigt erneut die um ein Vielfaches höhere Sensitivität der qRT-PCR gegenüber der konventionellen RT-PCR. Die bereits erwähnten Untersuchungen von Fabjani et al. (2005) mittels qRT-PCR bestätigen die Expression von HMGA2Transkripten auch im Blut gesunder Probanden. Allerdings zeigt die Expression in der betreffenden Arbeit eine Schwankung um das 170-fache, während in der hier vorliegenden Arbeit im Blut gesunder Probanden nur Schwankungen um das zweifache detektiert wurden. Diese vergleichsweise kleine Variation kann zum einen auf die niedrigere Probenzahl der im Rahmen dieser Arbeit durchgeführten Studie zurückzuführen sein, zum anderen jedoch auch auf die Verwendung einer RNAStabilisierungsreagenz, welche Genexpressionsänderungen, die normalerweise nach der Blutentnahme in vitro stattfinden, verhindert. Im Vergleich der HMGA2Expression im Blut aller Patienten mit der Expression im Blut der gesunden Probanden konnte kein signifikanter Unterschied festgestellt werden. Einzig die Expression der Probe eines Patienten mit chronisch myeloischer Leukämie (CML) in Akzeleration ist mit dem 27-fachen der durchschnittlichen Expression des Vergleichskollektivs deutlich erhöht. Übereinstimmend dazu haben Rommel et al. (1997) mit Hilfe der herkömmlichen RT-PCR im Blut von elf CML- und drei AMLPatienten und in CD34-positiven hämatopoetischen Stammzellen eine HMGA2- Diskussion 38 Expression detektiert, während im Blut gesunder Probanden keine HMGA2Expression nachweisbar war (Rommel et al., 1997). Aufbauend auf diesen Ergebnissen wurde im Folgenden die HMGA2-Expression in einem Kollektiv aus 53 Patienten mit verschiedenen Erkrankungen des hämatopoetischen und lymphatischen Systems erstmals quantitativ untersucht. Die gemessene HMGA2-Expression zeigt sehr starke Schwankungen um das 2.216fache. Den niedrigsten Wert weist ein Patient mit hochmalignem Lymphom und den höchsten Wert ein CML-Patient in der Blastenkrise auf. Da unter den elf am höchsten exprimierenden Patienten ausschließlich Leukämiepatienten zu finden sind, wurde diese Gruppe gesondert betrachtet. Ihre Expressionsdaten wurden dafür mit denen der gesunden Probanden aus der vorhergehenden Untersuchung verglichen. Leukämien sind maligne Erkrankungen des blutbildenden Systems. Sie sind gekennzeichnet durch eine Infiltration des hämatopoetischen Systems mit atypischen Leukozyten und ihren funktionsuntüchtigen Vorstufen (Blasten). Durch Verdrängung der normalen Blutbestandteile wird die Blutbildung im Knochenmark gestört und es kommt zur Anämie. Je nach klinischem Verlauf und Abstammung der pathologisch veränderten Leukozyten unterscheidet man akute und chronische sowie lymphatische und myeloische Leukämien (Kleihauer et al., 1978). Die Auswertung der quantitativen Analyse im Blut von Leukämiepatienten ergab eine Schwankung der HMGA2-Expression um das 1.616-fache, was einer bei den gesunden Probanden gemessenen Abweichung um das zweifache gegenübersteht. Verglichen mit dem Blut gesunder Probanden zeigen statistische Analysen eine signifikant erhöhte HMGA2-Expression im Blut von Leukämiepatienten. Keine signifikanten Unterschiede konnten hingegen zwischen Patienten nach bzw. während einer Therapie und unbehandelten Patienten festgestellt werden. Dabei ist jedoch zu berücksichtigen, dass der höchste Wert bei einer CML gemessen wurde, die sich trotz Behandlung in der Blastenkrise befand, so dass davon auszugehen ist, dass in diesem Fall die Therapie keine Wirkung mehr zeigt. Ohne diesen Patienten (B22) liegt die Irrtumswahrscheinlichkeit für den entsprechenden t-Test bei 0,0502, so dass ein signifikantes Ergebnis mit p < 0,05 nur knapp verfehlt wird. Abgesehen von den Ergebnissen von Rommel et al. (1997) konnten auch in weiteren Untersuchungen eine HMGA2-Reexpression und/oder chromosomale Re- arrangierungen im Bereich des HMGA2-Gens im Blut oder Knochenmark von Patienten mit malignen Erkrankungen des hämatologischen Systems nachgewiesen Diskussion 39 werden. Submikroskopische Deletionen wurden in 20 von 78 untersuchten Fällen von akuter lymphatischer Leukämie (ALL) detektiert (Patel et al., 2005). Verschiedene Rearrangierungen des HMGA2-Gens wurden zudem bei einem Patienten mit chronisch lymphatischer Leukämie (CLL) (Santulli et al., 2000) und einem Patienten mit ALL (Pierantoni et al., 2003) nachgewiesen. Eine Reexpression des HMGA2-Gens war mittels RT-PCR bei zwei Patienten mit Osteomyelofibrose und myeloider Metaplasie mit Translokation im Bereich des HMGA2-Gens und in zehn weiteren Patienten ohne verändertem Karyotyp nachweisbar, während keine Expression bei gesunden Probanden detektiert werden konnte (Andrieux et al., 2004). Trunkierte HMGA2-Transkripte oder aberrante Splicevarianten wurden bei sechs Patienten mit myeloider Leukämie mit Rearrangierungen der chromosomalen Region 12q13-15 (Odero et al., 2005) sowie in zwei Fällen von akuter myeloischer Leukämie (AML) identifiziert (Kottickal et al., 1998). Zudem wurde in der letzteren Studie eine starke Expression eines trunkierten HMGA2-Transkripts unter anderem bei der CML-Zelllinie BV 173 detektiert, welche keine offensichtliche Rearrangierung der chromosomalen Region 12q aufweist (Kottickal et al., 1998). Die chronische myeloische Leukämie (CML) ist gekennzeichnet durch die starke und unkontrollierte klonale Vermehrung hauptsächlich der Granulozyten. Während in der chronischen Phase sämtliche Vorstufen der Granulopoese im peripheren Blut nachweisbar sind, kommt es in der Akzeleration bzw. Blastenkrise zu einem Differenzierungsarrest und der Akkumulation undifferenzierter Blasten im peripheren Blut der Patienten (Clarkson et al., 1997; Hehlmann et al., 2005). In 95% der Fälle kommt es durch reziproke Translokation zur Fusion des c-ABL-Gens auf Chromosom 9q34 mit dem BCR-Gen auf Chromosom 22q11 und damit zur Bildung des so genannten Philadelphia-Chromosoms (Nowell et al., 1960; Rowley, 1973), was zur Expression des BCR-ABL-Fusionsproteins führt (Shtivelman et al., 1985; Ben-Neriah et al., 1986). Dieses Fusionsprotein codiert für ein Onkogen, welches im Unterschied zum normalen c-ABL-Gen eine konstitutive Tyrosinkinaseaktivität besitzt und für die Ausprägung des malignen Phänotyps verantwortlich ist (Konopka et al., 1984; Kloetzer et al., 1985). Die HMGA2-Expression im peripheren Blut aller im Rahmen dieser Arbeit mittels qRT-PCR untersuchten CML-Patienten zeigte eine Schwankung um das 1448-fache (Meyer et al., 2006a). Die niedrigsten Transkriptmengen finden sich bei Patienten mit CML in chronischer Phase oder in Remission, stark erhöhte Werte finden sich bei zwei Patienten in Akzeleration, der höchste Wert bei einem Diskussion 40 Patienten mit CML in der Blastenkrise. Es konnte erstmals gezeigt werden, dass die Leukozytenzahl im Blut der Patienten zum Zeitpunkt der Blutabnahme mit dem HMGA2-Expressionslevel signifikant korreliert. Der Anstieg der HMGA2-Expression ist jedoch weit höher als der Anstieg der Leukozytenzahlen, was auf eine Hochregulierung des HMGA2-Gens in den leukämischen Zellen schließen lässt. Grund für den überproportionalen Anstieg der HMGA2-Expression könnte die Akkumulation undifferenzierter Blasten bei Progression der CML in Akzelerationsphase und Blastenkrise sein. Da diese Blasten unreife Zellen mesenchymalen Ursprungs sind, die sich unkontrolliert vermehren, stimmt dieses Ergebnis mit früheren Untersuchungen überein, wonach HMGA2 vornehmlich in undifferenzierten und proliferierenden mesenchymalen Zellen und Geweben exprimiert wird (Manfioletti et al., 1991; Rogalla et al., 1996; Zhou et al., 1996; Hirning-Folz et al., 1998). Die größte Gruppe der im Rahmen dieser Studie untersuchten Leukämiepatienten stellen die AML-Patienten dar. Die AML umfasst eine heterogene Gruppe von Erkrankungen, die u.a. anhand der Morphologie der proliferierenden Blasten gemäß der FAB-Klassifikation in die Subtypen M0 bis M7 untergliedert wird (Bennett et al., 1985). Die Daten der Expressionsanalyse bei AML-Patienten zeigen keine Korrelation der HMGA2-Transkriptmengen zur Leukozytenzahl, was auf eine unterschiedlich starke Expression in diesen Zellen bei den verschiedenen Probanden hinweist. Es konnte jedoch gezeigt werden, dass AML-Patienten allgemein eine statistisch signifikant höhere HMGA2-Expression aufweisen als die gesunden Probanden. Eventuell auch aufgrund der begrenzten Probenzahl war ein Zusammenhang zwischen Subtyp und HMGA2-Transkriptmenge nicht nachweisbar. Zusätzlich wurden im Durchflusszytometer (FACS) angereicherte mononukleäre Zellen aus dem peripheren Blut oder Knochenmark von fünf AML-Patienten mit unterschiedlichen Anteilen an CD33- und CD34-positiven Zellen und zwei APL(akute Promyelozyten Leukämie) bzw. AML-Zelllinien quantitativ auf ihre HMGA2Expression untersucht. Sowohl in vier der fünf untersuchten Zellpopulationen als auch in den beiden Zelllinien konnte im Vergleich zum Kontrollblut eine stark erhöhte HMGA2-Expression nachgewiesen werden. CD33-Antigene werden von myeloiden Progenitorzellen exprimiert und treten bei ca. 80-90% aller AMLs auf (Peiper et al., 1988), während CD34-Antigene Marker der pluripotenten hämatopoetischen Stammzellen sind und bei AML-Patienten u.a. abhängig vom jeweiligen Subtyp sehr Diskussion 41 unterschiedlich häufig exprimiert werden (Katz et al., 1985; Kanda et al., 2000). Da schon in der Untersuchung von Rommel et (1997) eine Expression des HMGA2Gens in CD34+ hämatopoetischen Stammzellen gesunder Spender nachgewiesen wurde, müssen weitere vergleichende Studien zeigen, ob die erhöhten HMGA2Werte einiger AML-Patienten auf die Anreicherung von Stammzellen im peripheren Blut zurückzuführen sind oder ob es zur Hochregulierung des HMGA2-Gens in den leukämischen Zellen kommt. Weiterhin stellt sich die Frage, ob ein Zusammenhang zwischen HMGA2-Expression und Verlauf der Erkrankung besteht und die Höhe der Expression damit Rückschlüsse auf die Prognose der Patienten erlaubt. Die CD34Expression wurde als prognostischer Faktor für das Ansprechen auf eine Therapie vielfach untersucht und ist nach wie vor umstritten (Kanda et al., 2000; Junghanss et al., 2005). Eine Ausweitung der Studie zur quantitativen Analyse der HMGA2Expression muss in der Zukunft zeigen, ob sich die Ergebnisse in einem größeren Probenumfang ähnlich verhalten. Aufgrund der Heterogenität der unter dem Begriff AML zusammengefassten Subtypen M0 bis M7 sollten speziell Blutproben aus größeren Patientenkollektiven jeder dieser Gruppen vor und während einer Therapie untersucht werden. Die im Rahmen dieser Arbeit gefundene signifikante Überexpression von HMGA2 im Blut von Leukämiepatienten, in Prostatakarzinomen des Hundes sowie bei NSCLC zeigt einen deutlichen Zusammenhang zwischen HMGA2-Überexpression und malignem Phänotyp. Übereinstimmende Ergebnisse wurden u.a. auch bei Pankreaskarzinomen und Plattenepithelkarzinomen festgestellt (Abe et al., 2003b; Miyazawa et al., 2004), so dass HMGA2 als Target für mögliche kausale Krebstherapien über Inhibierung des Proteins diskutiert wird. Berlingieri et al. (1995) haben gezeigt, dass durch Inhibierung der HMGA2-Proteinsynthese über Antisense-Konstrukte die neoplastische Transformation von Schilddrüsenzellen der Ratte verhindert werden kann (Berlingieri et al., 1995). Neben gentherapeutischen Strategien über AntisenseKonstrukte oder RNA-Interferenz (RNAi), ist auch der Einsatz so genannter „small molecules“ denkbar, welche in die Zelle eindringen und Proteine gezielt blockieren können. Ein anderer klinisch relevanter Aspekt der HMGA2-Überexpression wurde von Boo et al. (2005) beschrieben. Demnach besteht bei Brustkrebszellen eine Korrelation zwischen erhöhter HMGA2-Expression und einer gesteigerten Sensitivität gegenüber Diskussion 42 dem Anthracyclin Doxorubizin und anderen DNA-Doppelstrangbruch-induzierenden Zytostatika (Boo et al., 2005). Dieser Effekt ist offenbar eine Folge der gestörten DNA-Reparaturmechanismen, welche in HMGA2-exprimierenden Zellen beobachtet wurde und könnte für die Therapie der stark HMGA2-exprimierenden Neoplasien eine wichtige Rolle spielen. Entsprechend konnte gezeigt werden, dass sowohl natives HMGA2 als auch trunkierte HMGA2-Varianten die Promotoraktivität des DNA-Reparatur-Gens ERCC1 stark herunterregulieren (Borrmann et al., 2003). Die so erhöhte genomische Instabilität könnte ursächlich mit der Tumorentstehung zusammen hängen. Es bleibt die Frage, wie es zur Hochregulierung der HMGA2-Expression in den untersuchten malignen Neoplasien kommen kann. Bei vielen gutartigen zumeist mesenchymalen Tumoren ist die HMGA2-Reexpression auf Aberrationen in der entsprechenden chromosomalen Region 12q13-15 zurückzuführen (Schoenmakers et al., 1995; Kazmierczak et al., 1996; Dal Cin et al., 1997; Kazmierczak et al., 1998; Kazmierczak et al., 1999b). Diese Chromosomenveränderungen können entweder zur Reaktivierung der Expression oder zur Expression aberranter Transkripte des HMGA2-Gens führen (Kazmierczak et al., 1995; Petit et al., 1996). Neueste Ergebnisse belegen, dass weder die Trunkierung der HMGA2-Transkripte noch die Fusion zu ektopischen Sequenzen für die neoplastische Transformation von mesenchymalen Zellen nötig sind. Ausschlaggebend für die Tumorgenese von benignen mesenchymalen Tumoren scheint vielmehr die Überexpression des HMGA2-Gens an sich zu sein, unabhängig von der Beschaffenheit des exprimierten HMGA2-Transkripts (Zaidi et al., 2006). Die Tatsache, dass bei malignen Tumoren im Allgemeinen keine wiederkehrenden Translokationen der 12q13-15 Region festzustellen sind, lässt darauf schließen, dass hier andere Mechanismen der Genaktivierung zur HMGA2-Reexpression führen. Eine starke Induktion der HMGA2Expression kann u.a. durch die PI-3 Kinase bzw. Ras/MAP Kinase Signalkaskaden sowie über Signalwege des oxidativen Stresses vermittelt werden (Li et al., 1997; Ayoubi et al., 1999; Zentner et al., 2001). Geht man von einem mehrstufigen Prozess der Krebsentstehung aus, könnte die Hochregulierung der HMGA2-Expression Folge der Reaktivierung des Gens durch frühere Ereignisse in der Tumorgenese sein. Das HMGB1-Protein wird im Gegensatz zu den HMGA-Proteinen auch in vielen adulten nicht-neoplastischen Geweben deutlich messbar exprimiert. Die Höhe der Diskussion 43 HMGB1-Expression unterliegt jedoch einer gezielten Regulation und nimmt mit zunehmender Differenzierung der Gewebe ab (Muller et al., 2004). In malignen Neoplasien wurde eine Überexpression des HMGB1-Gens u.a. in Leberzellkarzinomen (Kawahara et al., 1996), beim Magen- und kolorektalen Adenokarzinom (Xiang et al., 1997), beim Mammakarzinom (Brezniceanu et al., 2003) und in leukämischen Zellen (Cabart et al., 1995) gefunden. Das HMGB1-Protein bindet mit hoher Affinität an Cisplatin-DNA-Addukte (Pil et al., 1992). Cisplatin ist eine anorganische Verbindung, welche als Zytostatikum weite Verbreitung in der Behandlung maligner Neoplasien findet. Die Wirkung von Cisplatin beruht in erster Linie auf der Bildung von DNA-Intrastrang-Quervernetzungen, welche eine Biegung der DNA-Struktur bewirken und sowohl die DNA-Replikation als auch die Transkription beeinträchtigen (Pinto et al., 1985; Mello et al., 1995). Die Bindung von HMGB1 an diese deformierten DNA-Strukturen hat Einfluss auf die Sensibilität der Zelle gegenüber Cisplatin. Es wurde gezeigt, dass HMGB1 in vitro die Reparatur von DNA-Addukten durch „nucleotide excision repair“-Mechanismen verhindert (Huang et al., 1994; Zamble et al., 1996). Zudem führt eine durch Steroidhormone induzierte Überexpression von HMGB1 bei humanen Brustkrebszellen zur Sensibilisierung der Zellen gegenüber Cisplatin (He et al., 2000). Auf der anderen Seite wird HMGB1 in Cisplatin-resistenten Zelllinien und in bestimmten Cisplatinbehandelten Geweben überexprimiert (Nagatani et al., 2001; Li et al., 2006). Da Cisplatin auch vielfach bei der adjuvanten Chemotherapie des Hundes Verwendung findet (Vail et al., 2002), sollte im Rahmen dieser Arbeit die Expression des HMGB1Gens bei Osteosarkomen des Hundes untersucht werden. Als Voraussetzung für derartige Untersuchungen an Geweben des Hundes wurden zunächst die cDNASequenz, die genomische Struktur und die chromosomale Lokalisation des caninen HMGB1-Gens bestimmt. Zudem wurde mittels Northern Blot-Analyse die Expression der beiden vom Menschen bekannten 1,4 und 2,4 kb Splicevarianten des caninen HMGB1-Gens in Milz-, Herz-, Lungen- und glattem Muskelgewebe, jedoch nicht in der Niere, des Hundes nachgewiesen (Murua Escobar et al., 2003). Anschließend wurde die HMGB1-Expression in fünf caninen Osteosarkomen, einem Fibrosarkom und einem Leiyomyosarkom mittels Northern Blot-Analyse und semi-quantitativer RTPCR untersucht (Meyer et al., 2004a). Beide Methoden zeigten deutliche Schwankungen der HMGB1-Expressionslevel in den caninen Sarkomen. Vergleichbare Ergebnisse wurden bei humanen Mammakarzinomen dokumentiert (Flohr et al., Diskussion 44 2001; Brezniceanu et al., 2003). Die deutliche intertumorale Varianz der HMGB1Expression könnte künftig für die Chemotherapie von caninen Osteosarkomen mit Cisplatin von Bedeutung sein: zum einen könnten Behandlungserfolge mit Cisplatin besser abgeschätzt, zum anderen könnte die Höhe der Cisplatingabe an die entsprechende HMGB1-Expression angepasst werden, um Nebenwirkungen so gering wie möglich zu halten. Da beim Hund viele Krankheiten große Ähnlichkeiten zu den entsprechenden humanen Erkrankungen aufweisen, bietet sich das Hundemodell für zukünftige Studien über die Bedeutung der HMGB1- Expressionshöhe auf die Wirkung einer Cisplatintherapie an. Darüber hinaus zeigt die gute Korrelation der Northern Blot-Ergebnisse mit der semi-quantitativen RTPCR, dass letztere Methode eine schnelle und kostengünstige Alternative für die Bestimmung der HMGB1-Expression darstellt. Im Gegensatz zum HMGA2-Gen sind für das HMGB1-Gen Retropseudogene sowohl im humanen (Stros et al., 1993; Rogalla et al., 2000; Strichman-Almashanu et al., 2003) als auch im caninen Genom (persönliche Mitteilung von H. Murua Escobar) identifiziert worden und können eine Quantifizierung der HMGB1-Expression über qRT-PCR verfälschen. Die qRT-PCR ist aufgrund ihrer hohen Sensitivität besonders empfindlich gegenüber Verunreinigungen mit genomischer DNA (Bustin, 2002). Da durch Standardaufreinigungsmethoden eine DNA-Kontamination der isolierten RNA kaum zu vermeiden ist, werden gegenwärtig verschiedene Methoden zur Beseitigung dieses Problems getestet, um zukünftig entsprechende Untersuchungen zur HMGB1-Expression bei einem größeren Kollektiv an Sarkomen mittels qRT-PCR durchführen zu können. Neben der nukleären Funktion des HMGB1-Proteins als architektonischer Transkriptionsfaktor spielt extrazelluläres HMGB1 eine wichtige Rolle als Mediator von Entzündungsprozessen und bei der Tumormetastasierung (Muller et al., 2001). Bei schnell wachsenden Tumoren kann es durch unzureichende Neovaskularisierung und damit verbundene Hypoxie zur Bildung von nekrotischen Zellarealen kommen, welche zum einen angiogene Wachstumsfaktoren ausschütten, zum anderen Makrophagen anlocken, welche wiederum zahlreiche Wachstumsfaktoren und Zytokine freisetzen (Leek et al., 1999; Harris, 2002). HMGB1 kann sowohl von den nekrotischen Zellen eines Tumors in den extrazellulären Raum entlassen werden (Scaffidi et al., 2002) als auch von aktivierten Makrophagen aktiv sezerniert werden (Wang et al., 1999a; Wang et al., 1999b). Sezerniertes HMGB1 führt wiederum zur Diskussion 45 Aktivierung von Makrophagen und somit zur Synthese von verschiedenen Zytokinen (Andersson et al., 2000). Extrazelluläres HMGB1 interagiert mit membranständigen Rezeptoren, darunter RAGE (Receptor for advanced glycation end products). RAGE wird u.a. von Neuronen (Hori et al., 1995; Huttunen et al., 2002), Monozyten (Hou et al., 2004; Rouhiainen et al., 2004), Makrophagen (Kokkola et al., 2005), Endothelzellen (Kuniyasu et al., 2003) und glatten Muskelzellen (Lander et al., 1997) exprimiert. Verschiedene Untersuchungen haben gezeigt, dass die HMGB1/RAGEInteraktion die Migration und Invasion von Zellen sowie das Tumorwachstum und die Tumormetastasierung induziert (Taguchi et al., 2000; Degryse et al., 2001). Durch Bindung von HMGB1 an RAGE werden über verschiedene Signalkaskaden ERK1/2 und NF-κB aktiviert (Yang et al., 2005), die beide bei der Angiogenese eine Rolle spielen (Eliceiri et al., 1998; Klein et al., 2002). Okamoto et al. (2002) haben gezeigt, dass AGEs (advanced gycation end products), die eigentlichen Liganden von RAGE, Angiogenese induzieren können (Okamoto et al., 2002). Im Rahmen dieser Arbeit konnte in der Untersuchung von Schlueter et al. (2005) eine angiogene Wirkung von HMGB1 bei Endothelzellen nachgewiesen werden (Schlueter et al., 2005). Durch Applikation von rekombinant hergestelltem HMGB1 konnte im dreidimensionalen Spheroidmodell eine dosisabhängige Induktion der Zellmigration und die Ausbildung von neuen kapillarähnlichen Strukturen beobachtet werden. Bestätigt werden diese Ergebnisse durch neuere Untersuchungen von Mitola et al. (2006). Übereinstimmend konnte in vitro durch rekombinantes HMGB1 die Aussprossung von endothelialen Zellen im dreidimensionalen Fibringel induziert werden. Zudem konnte durch HMGB1 in vivo die Neovaskularisierung in der Chorioallantoismembran (CAM) von Hühnerembryonen angeregt werden. Durch eine Blockade von RAGE mit neutralisierenden Antikörpern kommt es zur Inhibition der beobachteten Effekte, was darauf hinweist, dass die HMGB1/RAGE-Interaktion bei der Angiogenese eine wichtige Rolle spielt (Mitola et al., 2006). Diese Ergebnisse stehen im Widerspruch zur Arbeit von Taguchi et al. (2000), in welcher durch sRAGE keine Inhibierung einer mit bFGF (basic fibroblast growth factor) induzierten Kapillaraussprossung in der Hornhaut erreicht werden konnte (Taguchi et al., 2000). Da neben RAGE noch andere Rezeptoren für HMGB1 bekannt sind, welche bei der Angiogenese eine Rolle spielen (Yuan et al., 2004; Frantz et al., 2005), könnte die durch HMGB1 induzierte Angiogenese über verschiedene Signalkaskaden erfolgen. Zu klären ist außerdem, ob HMGB1 die Sekretion angiogener Wachstumsfaktoren in vivo durch direkte Diskussion 46 Interaktion mit Endothelzellen und/oder indirekt über die Aktivierung von Makrophagen induziert. Zusätzlich zur Quantifizierung der HMGA2- und HMGB1-Expression bei verschiedenen Tumorentitäten und zur funktionellen Analyse des HMGB1-Gens als angiogener Faktor wurde als Voraussetzung für zukünftige Expressionsanalysen das canine HMGA1-Gen charakterisiert und auf den Hundechromosomen lokalisiert (Becker et al., 2003; Murua Escobar et al., 2004; Murua Escobar et al., 2005). Für das HMGA1-Gen konnten beide vom Menschen bekannten Splicevarianten HMGA1a und HMGA1b mit der charakteristischen 33 bp Deletion und die Expression einer 1,8 kb HMGA1 mRNA mittels Northern Blot-Analyse in Milz-, Herz-, Lungen- und glattem Muskelgewebe des Hundes nachgewiesen werden. Die aus den cDNA-Sequenzen abgeleiteten Proteinsequenzen stimmen zu 100% mit den menschlichen überein, was die Relevanz des Hundes als Modell für weiterführende Untersuchungen und Therapiestudien hinsichtlich der HMG-Proteine unterstreicht. Der hohe Grad an Konserviertheit zwischen Hund und Mensch wurde darüber hinaus bei der Charakterisierung des caninen CCND1-Gens bestätigt (Meyer et al., 2004b). Zusammenfassung 5 47 Zusammenfassung Die High Mobility Group (HMG)-Proteine HMGA1, HMGA2 und HMGB1 werden seit längerem als potentielle Tumormarker diskutiert. Sie gehören zur Gruppe der HMGProteine, welche als architektonische Transkriptionsfaktoren an der Regulation der Chromatinstruktur und der Expression einer Reihe von Genen beteiligt sind. Eine Überexpression bzw. Reexpression dieser embryonalen Proteine konnte in einer Reihe von malignen Erkrankungen detektiert werden. Da zu Beginn dieser Arbeit im Jahre 2002 keine quantitativen Analysen zur HMGAExpression bei malignen Tumoren vorlagen, sollte im Rahmen dieser Arbeit erstmals die HMGA2-Expression in soliden Tumoren und im peripheren Blut von Patienten überwiegend mit malignen Erkrankungen mittels quantitativer Real-time RT-PCR (qRT-PCR) untersucht werden. Die absolute Quantifizierung der HMGA2-Expression in Tumorproben und korrespondierendem nicht-neoplastischen Lungengewebe von 34 Patienten mit nicht-kleinzelligem Bronchialkarzinom (NSCLC) ergab eine statistisch hoch signifikante Überexpression sowohl in den untersuchten Adenokarzinomen als auch in den Plattenepithelkarzinomproben. Die in einigen der nachweislich tumorfreien Gewebeproben gefundenen erhöhten HMGA2-Transkriptmengen könnten Kennzeichen prämaligner Veränderungen sein, die häufig innerhalb des bronchoalveolären Epithels von Rauchern und/oder Tumorpatienten zu beobachten sind. In 16 caninen Prostatageweben mit unterschiedlichen histologischen Befunden konnte mit Hilfe der entsprechend modifizierten Methode mit zunehmender Malignität der Tumoren ein steigender HMGA2-Level detektiert werden. Diese Ergebnisse unterstreichen die Relevanz der HMGA2-Expression als diagnostischer und prognostischer Marker in der Krebsbehandlung. Durch eine relative Quantifizierung der HMGA2-Expression im peripheren Blut von 22 Mammakarzinompatientinnen mittels qRT-PCR konnte im Gegensatz zu früheren Untersuchungen mit Hilfe der konventionellen RT-PCR in allen untersuchten Blutproben eine HMGA2-Expression nachgewiesen werden. Zudem konnten keine signifikanten Expressionsunterschiede zwischen Patientinnen mit und ohne Metastasen festgestellt werden, so dass die HMGA2-Expression im peripheren Blut von Patientinnen als prognostischer Faktor für Brustkrebs wenig geeignet scheint. Bei weiteren Untersuchungen mittels qRT-PCR an 36 Blutproben u.a. von Patienten mit soliden Tumoren, mit malignen Erkrankungen des hämatopoetischen bzw. Zusammenfassung 48 lymphatischen Systems sowie mit verschiedenen Autoimmunerkrankungen konnte lediglich bei einem Patienten mit CML eine stark erhöhte HMGA2-Expression gegenüber den sieben Proben gesunder Probanden festgestellt werden. Darauf aufbauend wurden 56 Blutproben von Patienten mit Erkrankungen des hämatopoetischen bzw. des lymphatischen Systems auf ihre HMGA2-Expression untersucht. Bei den Leukämiepatienten allgemein sowie speziell bei den AMLPatienten konnte eine statistisch signifikante Überexpression des HMGA2-Gens gezeigt werden. Zudem wurde bei den zwölf untersuchten CML-Patienten eine Korrelation der HMGA2-Transkriptmenge mit der Leukozytenzahl im Blut der Probanden zum Zeitpunkt der Blutabnahme festgestellt. Da HMGB1 nachweislich die zytostatische Wirkung von Cisplatin verstärken kann und dieses Zytostatikum zur Standardtherapie bei Osteosarkomen des Hundes gehört, wurde die HMGB1-Expression in sieben caninen Sarkomen untersucht. In vorausgehenden Sequenzanalysen konnte gezeigt werden, dass das canine HMGB1-Gen und das abgeleitete Protein eine hohe Ähnlichkeit zum menschlichen Ortholog aufweisen. Mittels Northern Blot-Analyse und mittels semi-quantitativer RTPCR konnte übereinstimmend in sieben caninen Sarkomen eine stark unterschiedliche HMGB1-Expression festgestellt werden. Dieses Ergebnis könnte für künftige chemotherapeutische Behandlungen mit Cisplatin von Bedeutung sein. Neben der nukleären Funktion des HMGB1-Proteins als architektonischer Transkriptionsfaktor spielt extrazelluläres HMGB1 eine wichtige Rolle als Mediator von Entzündungsprozessen und bei der Tumormetastasierung. Im Rahmen dieser Arbeit konnte in vitro erstmalig eine angiogene Wirkung des HMGB1-Proteins bei humanen Endothelzellen nachgewiesen werden. Die Applikation von rekombinant hergestelltem HMGB1 führte im dreidimensionalen Spheroidmodell zur dosisabhängigen Induktion der Zellmigration und zur Ausbildung von neuen kapillarähnlichen Strukturen. Summary 6 49 Summary The high mobility group (HMG) proteins HMGA1, HMGA2, and HMGB1 have been discussed as potential tumour markers for years. They belong to the group of HMG proteins acting as architectural transcription factors regulating chromatin structure and gene expression. Over- or re-expression of these embryonic proteins have been detected in various malignancies. Since at the outset of this work in the year 2002 no quantitative analyses of HMGA expression in malignant tumours existed, it was the aim of this study to examine HMGA2 expression in solid tumours and in the peripheral blood of patients mainly with malignant neoplasias using quantitative real-time RT-PCR (qRT-PCR). Absolute quantification of HMGA2 expression in matching tumourous and non-tumourous lung tissue of 34 non-small cell lung cancer patients revealed a highly significant overexpression in the adenocarcinoma as well as in the squamous cell carcinoma samples. In some of the non-neoplastic tissues elevated levels of HMGA2 transcripts were detected which could be due to premalignant changes frequently observed in bronchoalveolar epithelium of smokers and/or lung cancer patients. In 16 canine prostatic tissues with diverse histologic findings a correlation of HMGA2 level and malignant potential was apparent using an accordingly modified qRT-PCR protocol. These results underline the relevance of HMGA2 expression as diagnostic and prognostic marker in cancer therapy. By relative quantification using qRT-PCR HMGA2 expression could be detected in the peripheral blood of all 22 mamma carcinoma patients tested, which is in contrast to previous studies with conventional RT-PCR. Furthermore, no significant differences of HMGA2 expression were detected between patients with or without metastatic disease, indicating that HMGA2 expression in the peripheral blood is not applicable as prognostic marker for breast cancer. qRT-PCR analyses of 36 blood samples from patients with solid tumours, malign diseases of the haematopoietic and lymphatic system, and various autoimmune diseases compared to seven samples of healthy donors showed a strong HMGA2 over-expression solely for one CML patient. Based on this result a study on 56 patients with diseases of the haematopoietic and lymphatic system was conducted. For the leukaemia patients in general as well as for the AML patients in particular a significant over-expression of HMGA2 could be shown. In addition, for the twelve CML patients examined a positive correlation of Summary 50 HMGA2 mRNA transcript levels and white blood cell count at the time of blood drawl was found. Since it was shown that HMGB1 can sensitise cancer cells to cisplatin and this cytostatic drug is commonly used for the treatment of osteosarcomas of the dog, HMGB1 expression was examined in seven canine sarcomas. Preceding sequence analyses revealed a strong similarity of the canine HMGB1 gene and the deduced protein to the human orthologs. Northern Blot analysis and semi-quantitative RT-PCR consistently showed a clear variation of HMGB1 expression, which could be of importance for further therapeutic protocols using cisplatin. Apart from the nuclear function of the HMGB1 protein as architectural transcription factor, extra cellular HMGB1 plays an important role as mediator of inflammation and in tumour metastasis. Herein the angiogenic potential of recombinant HMGB1 protein was shown in vitro for the first time. Application of HMGB1 induced cell migration and sprouting in an endothelial sprouting assay in a dose dependent manner. 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Jan Thies (ja, nein, vielleicht…äh doch nicht) Soller und dem Rest der Hundegruppe für eine wirklich tolle Zeit in und außerhalb des ZHG. Ebenso möchte ich mich bei den ehemaligen Mitarbeitern des ZHG Dr. Aljoscha Flohr, Dr. Sven Hauke, Dr. Maren Meiboom, Dr. Piere Rogalla, Dr. Claudia Schlüter, Dipl.-Biol. Sandra Ehser und Dipl.-Biol. Sabine Wallbaum ganz herzlich für die Unterstützung und Freundschaft bedanken. Außerdem danke ich meinen Freunden Birte (bis bald im Chat), Andi, Kiki, Thorsten, Claudia B., Claudia L., Claudia R., Sandra (Bubi), Claudia H., Gjon und einigen mehr dafür, dass sie immer für mich da waren und sind. Nicht zuletzt möchte ich mich von ganzem Herzen bei meiner Familie bedanken, die mir bei allen Höhen und Tiefen zur Seite gestanden hat und ohne deren immerwährende Unterstützung diese Arbeit nicht möglich gewesen wäre. Publikationsübersicht 9 68 Publikationsübersicht In der folgenden Übersicht sind die der vorliegenden Arbeit zugrunde liegenden Publikationen in der Reihenfolge, in der sie im Ergebnisteil erscheinen, aufgeführt: I) Becker K, Murua Escobar H, Richter A, Meyer B, Nolte I, Bullerdiek J (2003) The canine HMGA1 gene maps to CFA 23. Anim Genet 34: 68-69 II) Murua Escobar H, Soller JT, Richter A, Meyer B, Winkler S, Flohr AM, Nolte I, Bullerdiek J (2004) The canine HMGA1. Gene 330: 93-99 III) Murua Escobar H, Soller JT, Richter A, Meyer B, Winkler S, Bullerdiek J, Nolte I (2005) "Best friends" sharing the HMGA1 gene: comparison of the human and canine HMGA1 to orthologous other species. J Hered 96: 777-781 IV) Murua Escobar H, Meyer B, Richter A, Becker K, Flohr AM, Bullerdiek J, Nolte I (2003) Molecular characterization of the canine HMGB1. Cytogenet Genome Res 101: 33-38 V) Meyer B, Loeschke S, Schultze A, Weigel T, Sandkamp M, Goldmann T, Vollmer E, Bullerdiek J (2006) HMGA2 overexpression in non-small cell lung cancer. Molecular Carcinogenesis (im Druck) VI) Winkler S, Murua Escobar H, Meyer B, Loeschke S, Eberle N, Simon D, Baumgartner W, Nolte I, Bullerdiek J (2006) HMGA2 expression in canine prostatic tissues – a potential prognostic tool. (in Vorbereitung) VII) Meyer B, Krisponeit D, Junghanss C, Neugebauer C, Murua Escobar H, Bullerdiek J (2006) Quantitative expression analysis in peripheral blood of CML patients: correlation of HMGA2 expression and WBC status. (in Vorbereitung) Publikationsübersicht 69 VIII) Meyer B, Murua Escobar H, Hauke S, Richter A, Winkler S, Rogalla P, Flohr AM, Bullerdiek J, Nolte I (2004) Expression pattern of the HMGB1 gene in sarcomas of the dog. Anticancer Res 24: 707-710 IX) Schlueter C, Weber H, Meyer B, Rogalla P, Röser K, Hauke S, Bullerdiek J (2005) Angiogenetic signaling through hypoxia. HMGB1: an angiogenetic switch molecule. Am J Pathol 166: 1259-1263 Folgende zusätzliche Publikationen erscheinen nicht im Ergebnisteil, sind jedoch der vorliegenden Arbeit beigefügt: X) Meyer B, Murua Escobar H, Winkler S, Dolf G, Schelling C, Bullerdiek J, Nolte I (2004) Molecular characterization and mapping of the canine cyclin D1 (CCND1) gene. Anim Genet 35: 413 XI) Richter A, Murua Escobar H, Günther K, Meyer B, Winkler S, Dolf G, Schelling C, Nolte I, Bullerdiek J (2004) The canine NRAS gene maps to CFA 17. Anim Genet 35: 355-356 I) The canine HMGA1 gene maps to CFA 23 Becker K, Murua Escobar H, Richter A, Meyer B, Nolte I, Bullerdiek J Anim Genet 34: 68-69 (2003) Eigenanteil: - Erstellen der DNA-Sonde für BAC-Screening und BAC-Verifizierung II) The canine HMGA1 Murua Escobar H, Soller JT, Richter A, Meyer B, Winkler S, Flohr AM, Nolte I, Bullerdiek J Gene 330: 93-99 (2004) Eigenanteil: - Amplifizierung und Klonierung von cDNA-Fragmenten - Herstellung der Northern Blot-Sonde - Sequenzanalyse Gene 330 (2004) 93 – 99 www.elsevier.com/locate/gene The canine HMGA1 Hugo Murua Escobar a,b, Jan T. Soller a, Andreas Richter a, Britta Meyer a, Susanne Winkler a, Aljoscha M. Flohr a, Ingo Nolte b, Jörn Bullerdiek a,* b a Centre for Human Genetics, University of Bremen, Leobener Strasse ZHG, D-28359 Bremen, Germany Small Animal Clinic, School of Veterinary Medicine, Bischofsholer Damm 15, D-30173 Hanover, Germany Received 28 October 2003; received in revised form 19 December 2003; accepted 15 January 2004 Received by D.A. Tagle Abstract Due to the emerging advantages of numerous canine diseases as a genetic model for their human orthologs, the dog could join the mouse as the species of choice to unravel genetic mechanisms, e.g. of cancer predisposition, development and progression. However, precondition for such studies is the characterisation of the corresponding canine genes. Human and murine HMGA1 non-histone proteins participate in a wide variety of cellular processes including regulation of inducible gene transcription, integration of retroviruses into chromosomes, and the induction of neoplastic transformation and promotion of metastatic progression of cancer cells. Chromosomal aberrations affecting the human HMGA1 gene at 6p21 were described in several tumours like pulmonary chondroid hamartomas, uterine leiomyomas, follicular thyroid adenomas and others. Over-expression of the proteins of HMGA1 is characteristic for various malignant tumours suggesting a relation between high titer of the protein and the neoplastic phenotype. In this study, we characterised the molecular structure of the canine HMGA1 cDNA, its splice variants and predicted proteins HMGA1a and HMGA1b. Furthermore, we compared the coding sequence(s) (CDS) of both splice variants for 12 different breeds, screened them for single nucleotide polymorphisms (SNPs) and characterised a basic expression pattern. D 2004 Elsevier B.V. All rights reserved. Keywords: High mobility group proteins; HMGA1; HMGA1a; HMGA1b; Comparative genomics 1. Introduction As witnessed by a number of recent articles (Kuska, 1996; Kingman, 2000; Ostrander et al., 2000; Vail and Abbreviations: A, adenosine; aa, amino acid(s); BAC, bacterial artificial chromosome; bp, base pair(s); cDNA, DNA complementary to RNA; CDS, coding sequence(s); CFA, Canis familiaris; Ci, Curie; D, Dalton; dCTP, deoxycytidine 5V-triphosphate; DNA, deoxy-ribonucleic acid; DNase, deoxyribonuclease; G, guanosine; GAPDH, glyceraldehyde3-phosphate dehydrogenase; HMG, high mobility group; HMGA1, high mobility group protein A1; HMGA2, high mobility group protein A2; HSA, Homo sapiens; M-MLV, Moloney murine leukemia virus; mRNA, messenger ribonucleic acid; NCBI, National Center for Biotechnology Information; ORF, open reading frame; PCR, polymerase chain reaction; RACE, rapid amplification of cDNA ends; RNA, ribonucleic acid; SDS, sodium dodecyl sulfate; SNP, single nucleotide polymorphism; UTR, untranslated region. * Corresponding author. Tel.: +49-421-2184239; fax: +49-4212184239. E-mail address: [email protected] (J. Bullerdiek). 0378-1119/$ - see front matter D 2004 Elsevier B.V. All rights reserved. doi:10.1016/j.gene.2004.01.009 MacEwen, 2000), a growing number of scientists predict that human genetics will focus on the dog in this century (Kuska, 1996). Due to the emerging advantages of numerous canine diseases as a genetic model for their human counterparts, the dog could join the mouse as the species of choice to unravel genetic mechanisms, e.g. of cancer predisposition, development and progression. The proteins of the human HMGA1 gene HMGA1a and HMGA1b are associated with various human diseases including cancer. Due to the similarities of various human and canine cancer entities, the characterisation of the canine HMGA1 gene could open new fields for experimental and therapeutic approaches. Four human members of the HMGA protein family are presently known: the HMGA1a, HMGA1b, HMGA1c and HMGA2 proteins, which can modify chromatin structure by bending DNA, thus influencing the transcription of a number of target genes. The human HMGA1 gene on 6p21 encodes the well characterised 94 H. Murua Escobar et al. / Gene 330 (2004) 93–99 HMGA1a and HMGA1b proteins (formerly known as HMGI and HMGY) derived by alternative splicing and the barely characterised HMGA1c variant, while the HMGA2 protein is encoded by a separate gene on chromosome 12 (12q14 – 15) (for review, Reeves and Beckerbauer, 2001). Expression of HMGA1 is detectable only at very low levels or is even absent in adult tissues, whereas it is abundantly expressed in embryonic cells (Chiappetta et al., 1996). In humans, 6p21 is often affected by aberrations leading to an up-regulation of HMGA1 in benign mesenchymal tumours, e.g. lipomas, uterine leiomyomas, pulmonary chondroid hamartomas and endometrial polyps (Williams et al., 1997; Kazmierczak et al., 1998; Tallini et al., 2000). Transcriptional activation due to a chromosomal alteration of HMGA1 is probably an early and often even primary event of cancer development. In contrast, HMGA1 expression in malignant epithelial tumours seems to be a rather late event associated with an aggressive behaviour of the tumours. Thus, an overexpression of HMGA1 was reported for a number of malignancies including thyroid, prostatic, pancreatic, cervical and colorectal cancer (Tamimi et al., 1993; Chiappetta et al., 1995, 1998; Fedele et al., 1996; Bandiera et al., 1998; Abe et al., 1999, 2000). The correlation between HMGA expression and tumour aggressiveness in these malignancies has led to the conclusion that HMGA expression may present a powerful prognostic molecular marker. The causal role of HMGA1 expression in the progression of carcinomas has been elucidated by a set of in vitro experiments involving HMGA1 sense and antisense transfection assays (Reeves et al., 2001). An experimental approach aimed at the down-regulation of HMGA protein in tumours has been presented by Scala et al. (2000) who were able to show that an HMGA1 antisense strategy using an adenoviral vector treatment of tumours induced in athymic mice caused a drastic reduction in tumour size. Recently, the canine HMGA1 gene has been mapped to CFA 23. This cytogenetic assignment indicates that the canine HMGA1 gene does not map to a hotspot of chromosomal breakpoints seen in canine tumours (Becker et al., 2003). However, despite the emerging role of HMGA1 gene expression in malignancies, the molecular characterisation of the canine HMGA1 gene had not been carried out before. The characterisation of the molecular structure could permit new therapeutic approaches using the dog as model organism. In this study, we characterised the molecular structure of the canine HMGA1 gene on cDNA level, its splice variants and proteins HMGA1a and HMGA1b, and a basic expression pattern. Furthermore, for 12 different canine breeds the coding sequence(s) (CDS) of both splice variants were characterised and screened for SNPs to find out if changes at protein level exist between the different breeds. 2. Materials and methods 2.1. Tissues The tissues used in this study were provided by the Small Animal Clinic, Veterinary School, Hanover, Germany. The breeds represented were Alsatian, Bull Terrier, Collie, Dachshund, Doberman Pinscher, German Shorthaired Pointer, Golden Retriever, Jack Russell Terrier, Kangal, Munsterland, West Highland Terrier and Yorkshire Terrier. From each breed up to three samples of testis tissue were taken and used for analyses. 2.2. cDNA characterisation Total RNA was isolated from 150 mg canine testis tissue using TRIZOL LS (Invitrogen, Karlsruhe, Germany) following the manufacturer’s protocol. To avoid genomic DNA contamination a DNase digest of each sample was performed using DNA-free (Ambion, Huntingdon, Cambridgeshire, UK). cDNA was synthesised using 3V-RACE adaptor primer AP2 (AAGGATCCGTCGACATC(17)T), 5 Ag total RNA and M-MLV (Invitrogen) reverse transcriptase according to the manufacturer’s instructions. The polymerase chain reactions (PCRs) for the molecular cloning of the cDNA were done using the primer pairs Ex1up and Ex8lo (5V GCTCTTTTTAAGCTCCCCTGA 3V/5V CTGTCCAGTCCCAGAAGGAA 3V) and primer pair Ex8up and 3VUTRlo (5V AGGGCATCTCGCAGGAGTC 3V/5V ATTCAAGTAACTGCAAATAGGA 3V) which were derived from human cDNA sequences (accession no. X14957). The PCR products were separated on a 1.5% agarose gel, recovered with QIAEX II (QIAGEN, Hilden, Germany), cloned in pGEM-T Easy vector system (Promega, Madison, USA) and sequenced. The cDNA contig and the homology alignments were created with Lasergene software (DNAStar, Madison, USA) and various sequences from the NCBI database (GenBank accession nos. X14957, X14958, NM _ 002131, NM _ 145899, NM _ 145900, NM_145901, NM_145902, NM_145903, NM_145904, NM_145905). 2.3. Characterisation of splice variants The splice variants HMGA1a and HMGA1b were detected by amplifying a fragment spanning the CDS with primer pair Up (5V CATCCCAGCCATCACTC 3V) and Lo (5V GCGGCTGGTGTGCTGTGTAGTGTG 3V) using the canine testis cDNA samples as template. The primer pair was designed using the cDNA cloned as described in Section 2.2. The obtained PCR products were separated on a 4.0% agarose gel, recovered with QIAEX II (QIAGEN), cloned in pGEM-T Easy vector system (Promega) and sequenced. The contigs and the homology alignments were created with two sequences from the NCBI database (GenBank accession nos. X14957, X14958). H. Murua Escobar et al. / Gene 330 (2004) 93–99 2.4. CDS comparison between breeds The CDS of both splice variants were characterised for all breeds as described previously in Section 2.3. The contigs and the homology alignments were created using two sequences from the NCBI database (GenBank accession nos. X14957, X14958). In case of single nucleotide exchanges, the samples were sequenced again in both forward and reverse direction. Exchanges causing no amino acid (aa) substitution were not taken into account for further analyses. For all samples with aa substitutions the initial PCR was repeated and the exchange verified by sequencing the product in both forward and reverse direction. If possible, a restriction enzyme digestion was performed additionally. 2.5. Protein sequences The canine HMGA1a and HMGA1b protein sequences were derived from the open reading frames (ORFs) of the characterised cDNA sequences described previously in Section 2.2. The protein homology alignments were created with two sequences from the NCBI database (GenBank accession nos. X14957, X14958). 2.6. Northern blot Total RNAs were isolated from canine heart, lung, muscle, kidney and spleen tissue using RNeasy system (QIAGEN). An additional sample of total RNA was isolated from canine heart tissue by TRIZOL LS acid guanidine isothiocyanate – chloroform method (Invitrogen) in order to figure out whether this isolation method would lead to any difference in hybridisation. Further on poly A RNA was purified from canine spleen total RNA with OLIGOTEX (QIAGEN) and total RNA was prepared from human cultured fibroblasts by RNeasy system (QIAGEN). Spleen poly A RNA was placed on the blot in case that HMGA1 was not detectable in the total RNA samples. For Northern Blot hybridisation, 20 Ag of total RNA from each sample with the exception of 10 Ag of muscle and 3.6 Ag of spleen poly A RNA were separated on a 1.2% denaturing agarose gel containing 0.65% formaldehyde. RNAs were transferred onto Hybond-N+ positive nylon membrane (Amersham Pharmacia Biotech, Freiburg, Germany) by capillary blot. A 489-bp cDNA fragment derived from the canine HMGA1a sequence (exon 5/exon 8) served as a molecular probe for hybridisation. The probe was generated by PCR with the primer set Up and Lo (5V CATCCCAGCCATCACTC 3V/5V GCGGCTGGTGTGCTGTGTAGTGTG 3V) using the cloned cDNA described in Section 2.2. Probe labelling was performed by random primed labelling (Amersham Pharmacia Biotech) as described in the manufacturer’s protocol with 50 ACi(a32P)dCTP (Amersham Pharmacia Biotech). Purification of the labelled probe was performed 95 using Sephadex G-50 Nick Columns (Amersham Pharmacia Biotech) and the probe was stored at 20 jC before use. Using the PERFECTHYB PLUS hybridisation solution (Sigma-Aldrich, Saint Louis, MO, USA) prehybridisation was carried out for 30 min and hybridisation for 2.5 h at 68 jC. The membrane was washed for 5 min at room temperature in 2SSC/0.1% SDS, and twice for 20 min at 68 jC in 0.5SSC/0.1% SDS. Signals were visualised using a STORM phosphorimager (Molecular Dynamics, Sunnyvale, USA). 3. Results and discussion 3.1. The canine HMGA1 cDNA transcripts For the human HMGA1 gene various transcripts were described for both splicing variants (HMGA1a and HMGA1b) that differ in their 5V-UTR. The characterisation of the canine HMGA1 cDNAs revealed that the complete canine HMGA1 cDNA spans six exons and codes for two splicing variants HMGA1a with 1836 bp and HMGA1b with 1803 bp which are similar to the human transcripts (HMGA1a GenBank accession no. AY366390 and HMGA1b GenBank accession no. AY366392). The exon structure, the UTRs and the ORFs of both splice variants were defined and their homologies to their human counterparts analysed (Fig. 1, Table 1). The splicing variants showed the ‘‘typical’’ 33 bp gap which is conserved across various species such as human, mouse, hamster and rat (GenBank accession nos. BC013455, NM _ 016660, A7193763, NM_139327, A7511040). The homology of the canine cDNAs to their human counterparts is 80.6% for both splice variants. The 5V-UTR, CDS and the 3V-UTR showed homologies of 95.6%, 95.1% and 74,7%, respectively (Table 1). Homologies of the canine CDS with the CDS from mouse, hamster and rat on nucleotide level vary from 90.4% to 93.1%. The cDNA sequences were submitted to the NCBI database: HMGA1a, GenBank accession no. AY366390 and HMGA1b, GenBank accession no. AY366392. 3.2. The canine HMGA1a and HMGA1b proteins The canine HMGA1a and HMGA1b protein sequences were deduced from the respective cDNA sequences. The canine HMGA1a protein is a 107-amino acid molecule with a calculated weight of 11,674.97 D and HMGA1b a 96amino acid molecule with a calculated weight of 10,677.85 D (Fig. 2). Homology comparison to the human counterparts (GenBank accession nos. P17096, X14957) showed 100% homology of the molecules including the three ‘‘AThooks’’ and the acidic carboxy-terminal domain. Comparison of the canine and human HMGA1a and HMGA1b proteins with the described mouse, rat and hamster molecules showed aa changes in positions 5, 34, 96 H. Murua Escobar et al. / Gene 330 (2004) 93–99 Fig. 1. Structure of the canine HMGA1a and HMGA1b transcripts and partial genomic structure. 69, 75 and 78 of HMGA1a and positions 5, 34, 58, 64 and 67 of HMGA1b, respectively (Fig. 2) (Johnson et al., 1988, 1989; Friedmann et al., 1993; Aldrich et al., 1999; Sgarra et al., 2000; Strausberg et al., 2002; Sgarra et al., 2003). According to the definition of the AT-hooks (HMGA1a: I aa 21 – 31, II aa 53 –63, III aa 78– 89; HMGA1b: I aa 21– 31, II aa 42– 52, III aa 67 – 78) by Reeves and Nissen (1990) and Reeves (2000), none but the aa exchange at position 78 Table 1 Detailed analysis of the canine HMGA1a and HMGA1b cDNA Element of canine HMGA1 cDNAs Size in bp Homology to human counterpart in % Total cDNA HMGA1a Total cDNA HMGA1b 5V-UTR CDS HMGA1a CDS HMGA1b 3V-UTR Exon 1 Exon 2 Exon 5 HMGA1a Exon 5 HMGA1b Exon 6 Exon 7 Exon 8 1836 1803 231 324 291 1332 94 114 179 146 84 51 1386 80.6 80.6 95.6 95.1 95.1 74.7 97.8 96.5 93.9 93.9 96.4 94.1 75.4 Homology comparison of the cDNA elements of the canine HMGA1 to its human counterpart (characterisation of the UTRs, the ORF and the exon sizes). (HMGA1a) or 67 (HMGA1b), respectively, do affect the AT-hooks in either species. The exchange at position 78 leads to a difference in the third AT-hook of mouse and hamster when compared to the other species. According to the definition of the AT-hooks (HMGA1a: I aa 23– 31, II aa 55– 70, III aa 81– 89; HMGA1b: I aa 23 – 31, II aa 44– 59, III aa 70 – 78) by Huth et al. (1997), this aa exchange does not affect the third AT-hook. Following this definition, the second AT-hook is affected by the aa exchange at position 69 (HMGA1a) or 58 (HMGA1b), respectively. The canine protein sequences were submitted to the NCBI database with GenBank accession nos. HMGA1a AY366390 and HMGA1b AY366392. Due to the identical structure of the canine HMGA proteins to the respective human molecule, therapeutic approaches applied in dogs could be more suitable in terms of transferability for the development of human therapies than to approaches tested in other organisms. 3.3. HMGA1a and HMGA1b CDS comparison between canine breeds For twelve different canine breeds the splicing variants HMGA1a and HMGA1b were detected by amplification of a fragment spanning the CDS using the canine testis cDNA samples as template. The comparison of the characterised protein coding sequences for these twelve canine breeds H. Murua Escobar et al. / Gene 330 (2004) 93–99 97 Fig. 2. Comparison of the canine, human, mouse, rat and hamster HMGA1a and HMGA1b proteins. revealed one amino acid change in a single breed. Nucleotide exchanges causing no amino acid substitution were not taken into account in further analyses. Sample 2 (Teckel) showed in its HMGA1b transcript a nucleotide transition from A to G at the first base of codon 64 leading to an aa replacement from threonine to alanine and a new restriction recognition site for AluI causing four (58, 100, 158 and 176 bp) instead of three fragments (58, 100 and 334 bp) to appear in an AluI digest. (data not shown). The substitution was missing in the corresponding HMGA1a transcript of the dog suggesting a heterozygous genotype. A possible PCR artifact seems rather unlikely since the nucleotide transition was verified as described in Section 2.4. The CDS cDNA sequences of the twelve breeds were submitted to the NCBI database with GenBank accession nos. AY363606, AY 3 6 3 6 0 5 , AY 3 6 3 6 0 7 , AY 3 6 3 6 0 4 , AY 3 6 3 6 0 8 , AY 3 6 3 6 1 0 , AY 3 6 3 6 0 9 , AY 3 6 3 6 0 0 , AY 3 6 3 6 0 3 , AY 3 6 3 5 9 9 , AY 3 6 3 6 0 1 , AY 3 6 3 6 0 2 , AY 3 6 3 9 9 4 , AY 3 6 3 9 9 5 , AY 3 6 3 6 11 , AY 3 6 3 9 9 9 , AY 3 6 4 0 0 0 , AY 3 6 4 0 0 2 , AY 3 6 4 0 0 1 , AY 3 6 3 9 9 8 , AY 3 6 3 9 9 6 , AY363997, AY364003. probe. Except for the kidney total RNA and one of two heart samples (Trizol method) all total RNA samples showed a weak signal of approximately 1.8 kb (Fig. 3, Trizol sample not shown), while the poly A RNA spleen sample revealed a distinct signal. After stripping, rehybridisation with a canine GAPDH probe showed signals corresponding to approximately 1.3 kb in all but the Trizol method (data not shown) samples, indicating a degradation of the Trizol-prepared RNA. In humans, HMGA1 expression in malignant epithelial tumours seems to be associated with an aggressive behaviour of the tumours. Over-expression of HMGA1 was reported for a number of malignancies including thyroid, prostatic, pancreatic, uterus cervical and colorectal cancer (Tamimi et al., 1993; Chiappetta et al., 1995, 1998; Fedele et al., 1996; Bandiera et al., 1998; Abe et al., 1999, 2000). The correlation between HMGA expression and tumour 3.4. Canine HMGA1 expression analysis Expression of human HMGA1 is detectable at very low levels or is even absent in adult tissues whereas it is abundantly expressed in embryonic cells (Chiappetta et al., 1996). To elucidate a basic HMGA1 gene expression pattern in dogs, a canine Northern blot was generated containing total RNA from canine spleen, heart, lung, muscle and kidney tissue samples. In order to detect a possible low level expression of HMGA1 as reported in adult human tissues, a poly A RNA sample from canine spleen was additionally added to the blot. Hybridisation was performed with a a32P-labelled canine HMGA1a cDNA Fig. 3. Northern blot showing 1.8-kb HMGA1 and 1.3-kb GAPDH transcripts. Lanes: (1) canine kidney total RNA, (2) canine spleen total RNA, (3) canine spleen poly A RNA, (4) canine heart total RNA, (5) canine lung total RNA, (6) canine muscle total RNA and (7) human fibroblasts total RNA. 98 H. Murua Escobar et al. / Gene 330 (2004) 93–99 aggressiveness in some of these malignancies has led to the conclusion that HMGA expression may present a powerful prognostic molecular marker. So far no studies analysing the HMGA1 expression pattern in canine tumours have been carried out. Since these tumours occur spontaneously in dogs as well as in humans a canine in vivo analysing system could have significant value for research and drug development. The causal role of HMGA1 expression in the progression of carcinomas has been elucidated by a set of in vitro experiments involving HMGA1 sense and antisense transfection assays (Wood et al., 2000a,b; Reeves et al., 2001). A proof of concept for a therapy aimed at the down-regulation of HMGA protein in tumours has been presented by Scala et al. (2000) who were able to show that an HMGA1 antisense strategy using an adenoviral vector treatment of tumours induced in athymic mice caused a drastic reduction in tumour size. Due to the similarities of human and canine tumours, the transfer of such experimental approaches could benefit cancer research in either species. The comprehension of the canine HMGA1 gene and its gene products could be the precondition for future new experimental approaches and for evaluating the canine gene product as potential target for therapeutic strategies using the dog as model system. 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For Permissions, please email: [email protected]. ‘‘Best Friends’’ Sharing the HMGA1 Gene: Comparison of the Human and Canine HMGA1 to Orthologous Other Species H. MURUA ESCOBAR, J. T. SOLLER, A. RICHTER, B. MEYER, S. WINKLER, J. BULLERDIEK, AND I. NOLTE From the Small Animal Clinic, School of Veterinary Medicine, Bischofsholer Damm 15, 30137 Hanover, Germany (Murua Escobar, Soller, and Nolte), and Center for Human Genetics, University of Bremen, Leobener Str ZHG, 28359 Bremen, Germany (Meyer, Winkler, Richter, and Bullerdiek). Address correspondence to Ingo Nolte at the address above, or e-mail: [email protected]. Abstract HMGA1 nonhistone proteins are reported to participate in various cellular processes including regulation of inducible gene transcription, integration of retroviruses into chromosomes, and the induction of neoplastic transformation and promotion of metastatic progression of cancer cells. Overexpression of HMGA1 was shown to be characteristic for various malignant tumors, suggesting a relation between the neoplastic phenotype and a high titer of the protein. Also chromosomal aberrations affecting the human HMGA1 gene at 6p21 were described in several tumors, e.g., uterine leiomyomas, pulmonary chondroid hamartomas, and follicular thyroid adenomas. We characterize the molecular structure of the canine HMGA1 cDNA, its splice variants, and predicted proteins HMGA1a and HMGA1b. Furthermore, we compared the CDS of both splice variants for 12 different breeds, screened them for SNPs, characterised a basic expression pattern, and mapped the gene via FISH. Additionally, we compared the known human, canine, murine, rat, hamster, bovine, pig, Xenopus, and chicken HMGA1 transcripts. High mobility group proteins named according to their characteristic mobility in gel electrophoresis are small chromatin-associated nonhistone proteins, which can be subdivided into three families because of their functional sequence motives: the HMGA (functional motive ‘‘AThook’’), HMGB (functional motive ‘‘HMG-box’’), and HMGN (functional motive ‘‘nucleosomal binding domain’’) protein families (for review see Bustin 2001). By binding DNA with their functional motives, the HMG proteins induce DNA conformation changes influencing the binding of various transcription factors and thus taking indirect influence on transcription regulation as so-called architectural transcription factors (for detail see Bustin and Reeves 1996). The proteins HMGA1a, HMGA1b, and HMGA2 of the human HMGA genes are associated with various human diseases, including cancer. Members of the human HMGA1 protein family presently known are HMGA1a and HMGA1b, which by modifying chromatin structure take influence on transcription and up- and down-regulation of a number of target genes, for example, ATF2, IFN-b, NFjB, Interleukin-2 receptor, E-Selektin, Interleukin-4, Interfeone-A, ERCC1, and Cyclin A (Chuvpilo et al. 1993; Du and Maniatis 1994; Thanos and Maniatis 1992; Lewis et al. 1994; John et al. 1995, 1996; Klein-Hessling et al. 1996; Yie et al. 1997; Borrmann et al. 2003). The expression pattern of the HMGA genes in human adult tissues shows only very low levels or even absent expression, whereas it is abundantly expressed in embryonic cells (Rogalla et al. 1996; Chiappetta et al. 1996). In humans the HMGA1 gene is located on HSA 6p21, a region often affected by aberrations leading to an up-regulation of this gene in various benign mesenchymal tumors, for example, endometrial polyps, lipomas, pulmonary chondroid hamartomas, and uterine leiomyomas (Williams et al. 1997; Kazmierczak et al. 1998; Tallini et al. 2000). This suggests that transcriptional activation due to these chromosomal alterations is probably an early and often even primary event of cancer development. Recently, the canine HMGA1 gene has been mapped to CFA 23. This cytogenetic assignment 777 Journal of Heredity 2005:96(7) Figure 1. Species comparison of HMGA1a and HMGA1b transcripts. Exon 5 is enlarged by factor fife for better visualization. indicates that the canine HMGA1 gene does not map to a hotspot of chromosomal breakpoints seen in canine tumours (Becker et al. 2003). 778 HMGA1 expression in human malignant epithelial tumors is reported to be associated with an aggressive behavior of the tumors. Overexpression of HMGA1 was Murua Escobar et al. Human and Canine HMGA1 Gene detected in a number of malignancies, including thyroid, prostatic, pancreatic, uterine cervical, and colorectal cancer (Tamimi et al. 1993; Chiappetta et al. 1995; Fedele et al. 1996; Bandiera et al. 1998; Abe et al. 1999, 2000; Czyz et al. 2004; Takaha et al. 2004). The correlation between HMGA expression and tumor aggressiveness in some of these malignancies has led to the conclusion that HMGA expression may present a powerful diagnostic and prognostic molecular marker. Due to the similarities of various human and canine cancer entities, the characterization of the canine HMGA genes could open new fields for experimental and therapeutic approaches. We recently characterized the canine HMGA1a and HMGA1b transcripts, deduced their proteins, evaluated them as targets for therapeutic approaches, and characterized a basic expression pattern in healthy tissues (Murua Escobar et al. 2004). Sequence comparison showed a 100% identity between the human and canine protein molecules. Although both species showed the identical two proteins, the number of found cDNA transcripts varies. For the human HMGA1 seven different cDNA transcripts (Figure 1: SPV1–SPV7) were described (Johnson et al. 1988) of which SPV1 and SPV2 are the commonly found variants. The characterized dog variants showed the same composition structure as the mentioned human variants SPV1 and SPV2. Canine counterparts of the human transcript variants SPV3–SPV7 could not be detected using polymerase chain reaction (PCR) amplification approaches. Comparison of the human cDNAs to the known transcripts of other species shows that the dog is the only species showing similar transcripts to those commonly found in humans referring to exon structure and distribution. In detail, human and dog are the only known species showing the presence of exon one and two in both HMGA1a or HMGA1b transcripts, respectively (Figure 1). Both isoforms (HMGA1a and HMGA1b) were found in mouse (BC013455, NM_016660), hamster (AF1893762, AF193763), and rat (NM_139327, AF511040), of which for the last two species the described transcripts are limited to the protein coding sequences and the mouse transcripts show either exon one (HMGA1a) or exon two (HMGA1b) in the respective transcripts (Figure 1). For the HMGA1 transcripts of horse (CD535395), pig (AU296646), chicken (AY303673), bovine (CK951567), and Xenopus (BC084025), either the HMGA1a or the HMGA1b isoform are currently (2004) present at the NCBI database. For CDS (coding sequence) and protein identity analysis, we used the described sequences and deduced, if necessary, the corresponding parts for analyses. The in silico analyses were done using Lasergene software programs (DNASTAR, Madison). The coding sequence identities of the canine HMGA1 transcripts to the sequences from other species vary between 72.0% (chicken AY303673) and 95.7% (pig AU296646, horse CD535395) (Table 1). Identity comparison of the deduced proteins revealed similarities between 69.7% (chicken AY303673) and 100.0% (human: P17096, X14957, horse CD535395) (Table 1). The proteins of all species showed strong conservation in the functional AT-Hook DNA binding domains. Common for all species analysed is that the protein coding sequences are composed of four Table 1. HMGA1 identity comparison (CDS and protein) of various species to the canine transcripts and proteins Identity (%) to C. familiaris Species Isoform CDS Protein Human (H. sapiens) Human (H. sapiens) Mouse (M. musculus) Mouse (M. musculus) Rat (R. norvegicus) Rat (R. norvegicus) Hamster (C. griseus) Hamster (C. griseus) Pig (S. scrofa) Horse (E. caballus) Cattle (B. taurus) Chicken (G. gallus) African clawed frog (X. laevis) HMGA1a HMGA1b HMGA1a HMGA1b HMGA1a HMGA1b HMGA1a HMGA1b HMGA1a HMGA1b HMGA1b HMGA1b 95.1 95.1 90.1 90.1 90.4 90.4 92.6 92.6 95.7 95.7 94.4 72.0 100.0 100.0 96.3 96.9 96.3 95.8 98.1 97.9 99.1 100.0 99.0 69.7 HMGA1a 90.4 97.2 exons (Figure 1). The described proteins of the different species are composed of 107 amino acids and 96 amino acids, respectively, for HMGA1a and HMGA1b. Also common for those species where both protein isoforms were described is that the difference between the splicing variants is the ‘‘typical’’ 33-bp deletion in the HMGA1b transcripts resulting in the lack of 11 amino acids. Previous results describing the comparison of the protein coding sequences in 12 canine breeds revealed that the mentioned deletion is also conserved in the analyzed breeds. SNP screening in these breeds resulted in detection of oneamino-acid change in a single breed. A Teckel showed a nucleotide transition from A to G at the first base of codon 64 in its HMGA1b transcript leading to an amino acid replacement from threonine to alanine (Murua Escobar et al. 2004). As far as we know, no other canine HMGA1 polymorphisms have been described. Summarizing the HMGA1 transcript and protein comparison data emphasizes the relevance of the canine species as a model organism for the research and development of therapeutic approaches for human disorders. Due to the mentioned properties of the HMGA1 gene, its proteins HMGA1a/HMGA1b, and its reported role in development of cancer, future studies targeting HMGA1 proteins could be of significant value. Acknowledgments This paper was delivered at the 2nd International Conference on the ‘‘Advances in Canine and Feline Genomics: Comparative Genome Anatomy and Genetic Disease,’’ Universiteit Utrecht, Utrecht, The Netherlands, October 14–16, 2004. References Abe N, Watanabe T, Masaki T, Mori T, Sugiyama M, Uchimura H, Fujioka Y, Chiappetta G, Fusco A, and Atomi Y, 2000. Pancreatic duct cell carcinomas express high levels of high mobility group I(Y) proteins. Cancer Res 60: 3117–3122. 779 Journal of Heredity 2005:96(7) Abe N, Watanabe T, Sugiyama M, Uchimura H, Chiappetta G, Fusco A, and Atomi Y, 1999. Determination of high mobility group I(Y) expression level in colorectal neoplasias: a potential diagnostic marker. Cancer Res 59:1169–1174. John S, Robbins CM, and Leonard WJ, 1996. 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HMGI-C and HMGI(Y) immunoreactivity correlates with cytogenetic abnormalities in lipomas, pulmonary chondroid hamartomas, endometrial polyps, and uterine leiomyomas and is compatible with 780 Murua Escobar et al. Human and Canine HMGA1 Gene rearrangement of the HMGI-C and HMGI(Y) genes. Lab Invest 80: 359–369. from equine (Equus caballus) unstimulated peripheral blood leukocytes. Sequence at NCBI CD535395. Unpublished manuscript. Tamimi Y, van der Poel HG, Denyn MM, Umbas R, Karthaus HF, Debruyne FM, and Schalken JA, 1993. Increased expression of high mobility group protein I(Y) in high grade prostatic cancer determined by in situ hybridization. Cancer Res 53:5512–5516. Williams AJ, Powell WL, Collins T, and Morton CC, 1997. HMGI(Y) expression in human uterine leiomyomata. Involvement of another highmobility group architectural factor in a benign neoplasm. Am J Pathol 150:911–918. Thanos D and Maniatis T, 1992. 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An EST database Corresponding Editor: Francis Galibert 781 IV) Molecular characterization of the canine HMGB1 Murua Escobar H, Meyer B, Richter A, Becker K, Flohr AM, Bullerdiek J, Nolte I Cytogenet Genome Res 101: 33-38 (2003) Eigenanteil: - Charakterisierung der cDNA - Charakterisierung der genomischen Gensequenz - Sequenzanalyse - Erstellen der DNA-Sonde für BAC-Screening und BAC-Verifizierung - Herstellung der Northern Blot-Sonde V) HMGA2 overexpression in non-small cell lung cancer Meyer B, Loeschke S, Schultze A, Weigel T, Sandkamp M, Goldmann T, Vollmer E, Bullerdiek J Molecular Carcinogenesis (im Druck) Eigenanteil: - Planung, Durchführung und Auswertung der Studie mit Ausnahme der immunhistochemischen Untersuchungen, die von S. Loeschke durchgeführt wurden - Verfassen der Veröffentlichung Author Proof MOLECULAR CARCINOGENESIS 9999:1–9 (2006) HMGA2 Overexpression in Non-Small Cell Lung Cancer A Britta Meyer,1 Siegfried Loeschke,1 Anke Schultze,1 Thomas Weigel,2 Martin Sandkamp,2 Torsten Goldmann,3 Ekkehard Vollmer,3 and Jörn Bullerdiek1* 1 Centre for Human Genetics, University of Bremen, Bremen, Germany Laboratory Dr. M. Sandkamp, B. Köster, Dr. R. Hiller, Bremen, Germany 3 Clinical and Experimental Pathology, Research Centre Borstel, Borstel, Germany 2 Lung cancer is still the leading cause of death from cancer worldwide primarily because of the fact that most lung cancers are diagnosed at advanced stages. Overexpression of the high mobility group protein HMGA2 has been observed in a variety of malignant tumors and often correlates with poor prognosis. Herein, HMGA2 expression levels were analyzed in matching cancerous and non-cancerous lung samples of 17 patients with adenocarcinoma (AC) and 17 patients with squamous cell carcinoma (SCC) with real-time quantitative RT-PCR (qRT-PCR). Transcript levels were compared to the results obtained by immunohistochemistry (IHC). HMGA2 expression was detectable by qRT-PCR in all samples tested and varied from 5422 to 16 991 545 copies per 250 ng total RNA in the carcinoma samples and from 289 to 525 947 copies in the non-cancerous tissue samples. In 33/34 non-small cell lung cancer (NSCLC) samples tested, an overexpression of HMGA2 was revealed with statistically highly significant differences between nonneoplastic and tumor samples for both AC (P < 0.0001) as well as for SCC (P < 0.0001). Overexpression varies strongly and is increased up to 911-fold for AC and up to 2504-fold for SCC, respectively, with statistically significant higher increase in SCC (P < 0.05). The results presented herein indicate that HMGA2 overexpression is a common event in NSCLC and could serve as molecular marker for lung cancer. ß 2006 Wiley-Liss, Inc. Key words: non-small cell lung cancer; HMGA2; quantitative real-time RT-PCR; immunohistochemistry INTRODUCTION The high mobility group A (HMGA) proteins are small non-histone chromosomal proteins which are characterized by three highly conserved DNA binding motifs called ‘‘AT-hooks‘‘ and an acidic tail. They preferentially bind to the minor groove of AT-rich Bform DNA by recognizing a particular DNA structure rather than a specific nucleotide sequence [1]. Members of the HMGA protein family are often referred to as ‘‘architectural transcription factors’’ [2] because of their ability to regulate expression of a large number of target genes through alteration of chromatin structure [3]. The human HMGA protein family comprises three major members: HMGA1a, HMGA1b, and HMGA2. The proteins HMGA1a and HMGA1b are splicing variants derived from the same gene located at chromosomal locus 6p21 [4,5]. The related HMGA2 protein is encoded by a separate gene assigned to chromosomal locus 12q14-15 [6,7]. The HMGA expression level is maximal during embryonic development but is low, or even undetectable, in fully differentiated or non-dividing adult cells and tissues [8–11]. However, in a variety of neoplasms, re-expression of the HMGA genes has been detected. Recent findings suggest that overexpression of HMGA proteins is associated with enhanced sensitivity to UV-light and several cytoß 2006 WILEY-LISS, INC. static drugs because of diminished cellular DNA repair activity. The inhibition of DNA repair conferred by HMGA might lead to accumulation of mutations and genomic instabilities frequently observed in many types of human cancers [12–15]. Transcriptional reactivation of the HMGA genes because of chromosomal translocations was found in many human benign tumors mostly of mesenchymal origin, as for example lipomas, uterine leiomyomas, pleomorphic adenomas of the salivary glands, and pulmonary chondroid hamartomas [6,11,16– 20]. As for HMGA2, translocations often affect the third intron leading to expression of fusion transcripts containing the three AT-hooks and ectopic sequences from different origin [21]. Transgenic mice expressing a truncated form of the HMGA2 protein comprising the first three binding domains Abbreviations: NSCLC, non-small cell lung cancer; AC, adenocarcinoma; SCC, squamous cell carcinoma; HMGA, high mobility group protein A; qRT-PCR, real-time quantitative reverse transcriptase polymerase chain reaction; IHC, immunohistochemistry. *Correspondence to: Centre for Human Genetics, University of Bremen, Leobener Str. ZHG, D-28359 Bremen, Germany. Received 9 November 2005; Revised 28 February 2006; Accepted 15 March 2006 DOI 10.1002/mc.20235 Published online 00 Month 2006 in Wiley InterScience (www.interscience.wiley.com) MC/05-0176(20235) 2 Author Proof MEYER ET AL. exhibit a giant phenotype with high incidence of lipomas. These results indicate that primarily truncation and/or aberrant expression of HMGA2 rather than its fusion to other genes is responsible for cell transformation [22,23]. In contrast, it was shown that inactivation of the HMGA2 gene causes reduced growth (‘‘pygmy phenotype’’) in mice [24]. In malign tumors, gene regulatory mechanisms seem to be involved in reactivation of HMGA expression. Overexpression of HMGA1 was observed in a variety of cancers, as for example, in colorectal cancer [25], prostate cancer [26], thyroid cancer [27], breast cancer [28], and cervical cancer [29]. Examples of malignant tumors showing HMGA2 overexpression are breast cancer [30], pancreatic cancer [31], non-small cell lung cancer (NSCLC) [32], and leukemia [33]. Nevertheless, so far to the best of our knowledge, only one study has used real-time quantitative reverse-transcriptase polymerase chain reaction (qRT-PCR) to quantitate HMGA2 expression in human malignancies. Miyazawa et al. (2004) [34] detected a 84–315-fold higher HMGA2 expression level in five squamous cell carcinoma (SCC) tissues of the oral cavity than in normal gingival. As to benign tumors, there is also one study by qRT-PCR. Gross et al. (2003) [35] detected strongly elevated HMGA2 levels in 10 uterine leiomyomata (UL) with 12q15 rearrangement compared to karyotypically normal UL and normal myometrium. Re-expression of HMGA in malign neoplasias is frequently correlated with an increased degree of malignancy, for example, a higher metastatic potential, and is therefore considered as valuable diagnostic and prognostic marker [27–29,34]. Moreover, HMGA proteins seem to be causally involved in neoplastic transformation [36,37]. As mentioned above, in previous work from our group with conventional RT-PCR, HMGA2 expression was detected in 14/19 NSCLC cases examined whereas in the surrounding non-malignant tissue, HMGA2 was undetectable [32]. In NSCLC, some recurrent molecular genetic changes have been identified, such as deregulation of myc[38], activation of the MET/HGF pathway [39], and inactivation of the RB1/TP16/CCND1 pathway [40,41]. Furthermore, the different types of NSCLC show characteristic genetic modulations as for instance EGFR and TP53 co-expression in SCC [42] and HER2/neu overexpression [43] and recurrent KRAS mutations frequently observed in AC [44]. Because most of these genetic changes are detected only in a limited number of lung cancer cases, a more common molecular marker would be most valuable for early diagnosis of lung cancer necessary to achieve higher survival rates and for predictions concerning postoperative outcome in resectable tumors. Aim of this study was to quantitate HMGA2 expression levels in NSCLC samples with the sensitive quantitative real-time RT-PCR (qRT-PCR). A total of 34 lung cancer samples (17 ACs and 17 SCCs) and the matching non-neoplastic lung tissue samples from the same patients were analyzed for HMGA2 expression and transcript levels were compared to results obtained by immunohistochemistry (IHC). A Molecular Carcinogenesis DOI 10.1002/mc MATERIALS AND METHODS Tissue Samples All cancerous and matching non-cancerous samples used for this study (Tables 1 and 2) were provided by the Clinical and Experimental Pathology of the Research Centre Borstel, Borstel, Germany where initial H&E staining and histologic diagnoses were performed. Samples were frozen in liquid nitrogen and stored at 808C until use. RNA-Isolation Total RNA was purified according to the ‘‘RNeasy mini protocol for isolation of total RNA from heart, muscle, and skin tissue’’ (Qiagen, Hilden, Germany) including Proteinase K and on-column DNase I digestion. RNA was quantitated spectrophotometrically in triplicate. Reverse Transcription cDNA-syntheses were performed with 2 pmol gene-specific reverse primer (50 GCCATTTCCTAGGTCTGCCTC 30 ) [35] with 250 ng of total RNA and 200 units M-MLV Reverse Transcriptase (Invitrogen, Karlsruhe, Germany) according to the manufacturer’s instructions. Real-Time Quantitative RT-PCR RT-PCR amplifications were carried out with the ABI Prism 7000 Sequence Detection System (Applied Biosystems, Darmstadt, Germany) or the Applied Biosystems 7300 Real-Time PCR System (Applied Biosystems), respectively. HMGA2 expression analyses were performed in triplicate in a total volume of 25 mL using 2 mL of each cDNA corresponding to 25 ng of total RNA. cDNA was amplified using 600 nM of forward primer (50 -AGTCCCTCTAAAGCAGCTCAAAAG-30 ) and reverse primer (see above), 200 nM fluorogenic probe (50 6-FAM-AGAAGCCACTGGAGAAAAACGGCCA-TAMRA-30 ) [35] in conjunction with universal PCR Mastermix (Applied Biosystems). For each run, non-template controls and no reverse transcriptase reactions were included. PCR conditions were as follows: 2 min at 508C and 10 min at 958C, followed by 40 cycles with 15 s at 958C and 1 min at 608C. RNA levels were quantitated relative to amplicon-specific standard curves (absolute quantification) and copy numbers were normalized to total RNA concentration and expressed as copy number per 250 ng total RNA [45]. Author Proof 3 HMGA2 OVEREXPRESSION IN LUNG CANCER Table 1. HMGA2 Expression in Matching Adenocarcinoma and Non-Neoplastic Samples of Lung Cancer Patients Case No. 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 Histologic type Sex Age Grade TNM Stage Copy no. qRT-PCR{ IHC{ A AC* Non-neoplastic AC Non-neoplastic AC Non-neoplastic AC Non-neoplastic AC Non-neoplastic AC Non-neoplastic AC Non-neoplastic AC Non-neoplastic AC Non-neoplastic AC Non-neoplastic AC Non-neoplastic AC Non-neoplastic AC Non-neoplastic AC Non-neoplastic AC Non-neoplastic AC Non-neoplastic AC Non-neoplastic M 61 1 T2N2M0 3A M 73 3 T2N2MX 3A M 70 3 T2N2M0 3A M 62 2 T2N1M0 2B W 63 3 T2N2M0 3A W 70 2 T2N0M0 1B M 57 3 T1N1MX 2A M 61 2 T2N1M1 4 W 61 3 T3N1M0 3A M 65 2 T2N0MX 1B M 71 2 T2N1MX 2B M 60 3 T4N1MX 3B W 52 3 T2N0MX 1B M 56 3 T3N1MX 3A M 62 2 T2N0MX 1B M 66 3 T2N3MX 3B W 64 1 T2N0MX 1B 3.85E þ 05 7.52E þ 03 7.15E þ 03 2.89E þ 02 8.32E þ 06 5.26E þ 05 6.16E þ 05 6.95E þ 04 5.42E þ 03 1.66E þ 03 1.24E þ 05 8.20E þ 03 1.27E þ 05 2.33E þ 03 1.65E þ 04 2.54E þ 03 5.58E þ 06 1.92E þ 05 3.13E þ 04 4.09E þ 04 1.89E þ 06 4.17E þ 04 1.15E þ 07 9.07E þ 03 5.92E þ 05 3.87E þ 04 3.76E þ 06 4.13E þ 3 1.11E þ 07 1.30E þ 05 4.67E þ 06 2.92E þ 04 4.03E þ 05 3.95E þ 05 þ þ n.d. n.d. n.d. n.d. n.d. n.d. n.d. n.d. n.d. n.d. n.d. n.d. n.d. n.d. n.d. n.d. *AC, adenocarcinoma. { Expression results of quantitative real-time RT-PCR (qRT-PCR) are presented as copies per 250 ng total RNA. { Immunohistochemistry (IHC) staining was determined using the modified ‘‘Remmele-Score’’: , no intranuclear staining; þ, intranuclear staining in 10–50% of the tumor cells; þþ, intranuclear staining in more than 80% of the tumor cells; n.d., not determined. HOPE-Fixation A part of each frozen tissue sample was incubated in HOPE I solution (DCS, Hamburg, Germany) overnight on ice. Subsequent incubation in acetone with 1:1000 HOPE II solution (DCS) was carried out on ice for 2 h, followed by three successive incubations in pure acetone on ice for 2 h. Afterwards, the tissue samples were incubated overnight in pure paraffin wax (Medite, Burgdorf, Germany) at 578C, subsequently embedded in paraffin, and stored at 48C. H&E Staining of the Embedded Tissue From the HOPE-fixed paraffin embedded tissue, 5 mm sections were cut and deparaffinized twice in diethylether (Riedel de Haen, Seelze, Germany) for 30 s. Rehydration was carried out in 95%, 90%, 80% acetone, 10 min each, and 70% acetone for 20 min. Molecular Carcinogenesis DOI 10.1002/mc Sections were then incubated in bidest. water/ TritonX 100 (Merck, Darmstadt, Germany), 1:5000, for 10 min followed by another 10 min incubation in bidest. water. After air drying, samples were stained for 30 s in Mayer’s Hemalaun (Merck) and washed in bidest. water for 30 s. ‘‘Blueing’’ took place for 1– 2 min in running tap water. Subsequently samples were incubated in alcoholic eosin-solution for 1 min and washed in bidest. water for 1 min. After dehydration in 70%, 80%, and 96% ethanol for 2 min each, agitated washing in xylol for 1 min, and another washing in xylol for 5 min, sections were mounted with Histokitt II (Roth, Karlsruhe, Germany). Immunohistochemistry Sections were cut and rehydration was performed as described above (H&E staining). After the bidest. 4 Author Proof MEYER ET AL. Table 2. HMGA2 Expression in Matching Squamous Cell Carcinoma and Non-Neoplastic Samples of Lung Cancer Patients Case No. Histologic type Sex Age Grade TNM Stage Copy no. qRT-PCR{ IHC{ A 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 SCC* Non-neoplastic SCC Non-neoplastic SCC Non-neoplastic SCC Non-neoplastic SCC Non-neoplastic SCC Non-neoplastic SCC Non-neoplastic SCC Non-neoplastic SCC Non-neoplastic SCC Non-neoplastic SCC Non-neoplastic SCC Non-neoplastic SCC Non-neoplastic SCC Non-neoplastic SCC Non-neoplastic SCC Non-neoplastic SCC Non-neoplastic M 70 2 T2N1M0 2B M 68 2 T4N1M0 3B M 64 3 T1N0M0 1A W 62 1 T4N1M0 3B M 62 2 T3N0M0 2B M 74 1 T4N1M0 3B M 69 1 T2N0M0 1B W 62 3 T4N0M0 3B M 59 1 T2N1MX 2B M 68 1 T2N0MX 1B M 60 1 T2N0MX 1B M 63 3 T2N2MX 3A M 75 3 T2N0MX 1B M 68 2 T2N0MX 1B M 65 2 T2N0MX 1B M 73 2 T2N2MX 3A M 50 2 T2N1MX 2B 3.53E þ 06 3.37E þ 05 7.78E þ 06 8.95E þ 03 3.62E þ 05 8.61E þ 03 1.37E þ 07 5.53E þ 04 1.64E þ 05 1.59E þ 04 1.32E þ 06 1.18E þ 04 1.15E þ 07 1.49E þ 04 3.14E þ 04 5.80E þ 03 1.24E þ 06 4.42E þ 03 2.09E þ 05 1.01E þ 03 7.43E þ 06 6.99E þ 04 8.31E þ 06 2.23E þ 04 1.70E þ 07 6.79E þ 03 3.32E þ 06 3.35E þ 04 1.17E þ 06 2.70E þ 05 1.87E þ 05 4.49E þ 03 5.01E þ 06 1.70E þ 05 þþ þþ þþ þþ n.d. n.d. n.d. n.d. n.d. n.d. n.d. n.d. n.d. n.d. n.d. n.d. n.d. n.d. n.d. n.d. *SCC, squamous cell carcinoma. { Expression results of quantitative real-time RT-PCR (qRT-PCR) are presented as copies per 250 ng total RNA. { Immunohistochemistry (IHC) staining was determined using the modified ‘‘Remmele-Score’’: , no intranuclear staining; þ, intranuclear staining in 10–50% of the tumor cells; þþ, intranuclear staining in more than 80% of the tumor cells; n.d., not determined. water bath, sections were incubated in 0.3% H2O2 for 10 min and rinsed for at least 20 min in 1 PBS. In a humid chamber, they were incubated for 1 h with 1:50 in Ab-dilution buffer (DCS) diluted primary anti-HMGA2 antibody (goat polyclonal antibody raised against a peptide mapping within an internal region of human HMGA2, S-15, sc-23684, Santa Cruz Biotechnology, Santa Cruz, CA). After washing in 1 PBS for 2 min, incubation with the secondary biotinylated anti-goat antibody (Biogenex, San Ramon, CA) was carried out for 20 min in a humid chamber. Sections were then washed for 2 min in PBS and incubated for another 20 min with StreptavidinHRP label (DCS). After three further washing steps for 2 min each in PBS, sections were transferred to readyto-use AEC substrate solution (DCS) for 10 min and then washed for 2 min in PBS. Counterstaining was performed with Mayer’s Hemalaun and slides were Molecular Carcinogenesis DOI 10.1002/mc mounted with Aquamount (Merck). Positive and negative controls were run as usual. Statistical Analysis The paired t-test was performed to analyze the expression differences between cancerous and noncancerous tumor samples because the expression data did not show normal distribution, data were transformed by logarithmic transformation prior to analysis. Correlation analyses were performed with Pearson correlation coefficients. P-values below 0.05 were considered significant. RESULTS Histological Examination of Tissue Samples Despite initial freezing of the material, morphology was excellent after HOPE-fixation and H&E Author Proof HMGA2 OVEREXPRESSION IN LUNG CANCER staining of the tumor and non-tumor specimens. The tumor specimens consisted of varying rates of tumor- and non-tumor-cells. The non-tumor specimens were all completely tumor-free. Sometimes, a mild activation of type II pneumocytes was observed. 5 AC samples (P < 0.05). Comparison of the copynumber of HMGA2 mRNA in the tumor samples alone or the ratio of copies in the tumor/copies in the corresponding non-neoplastic tissue to clinicopathologic findings (Tables 1 and 2) revealed no clear relationship of HMGA2 expression level with tumor classification, stage, or grading. However, concerning the ACs, highest expression (1 148 7392 copies per 250 ng total RNA) was found in the sole malignancy classified as T4. A HMGA2 Expression Analyses by Real-Time Quantitative RT-PCR Cancerous and matching non-cancerous samples were obtained from 17 patients with adenocarcinoma (AC) and 17 patients with SCC of the lung. By quantitative real-time RT-PCR, HMGA2 expression could be detected in all samples tested (Tables 1 and 2). The expression varied from 5 422 to 16 991 545 copies per 250 ng total RNA in the carcinoma samples and from 289 to 525 947 copies for the non-cancerous tissue samples. Comparing matching cancerous and non-cancerous lung specimens, a statistically significant overexpression of HMGA2 was apparent in the ACs (Figure 1A) (P < 0.0001) as well as in the SCC tested (Figure 1B) (P < 0.0001). Apart from one sample were the expression in the normal tissue exceeded the level observed in the matching AC 1.3-fold, the increase detected between non-neoplastic and malign tissue in the AC and SCC ranged from 1.02- to 911.02-fold (mean 158.41-fold) and from 4.34- to 2503.68-fold (mean 336.26-fold), respectively. Statistical analysis revealed a significantly higher increase in the SCC samples than in the HMGA2 Expression Analysis by Immunohistochemistry The immunohistochemical staining for HMGA2 was analyzed after HOPE-fixation in the specimens AC 1–9 and SCC 1–9. The results confirmed the expression pattern obtained by real-time quantitative RT-PCR as immunostaining of HMGA2 was identified in two AC and four SCC samples representing six of the seven tumor samples with highest copy-number levels (Tables 1 and 2). All nonneoplastic tissues were negative (Figure 2A). The positive AC samples showed moderate intranuclear staining in 10–50% of the tumor cells (Figure 2B) while strong intranuclear staining was detected in more than 80% of the tumor cells seen in positive SCC samples (Figure 2C). The intensity of staining was determined with the modified ‘‘Remmele-Score’’ [46]. Figure 1. Results of the HMGA2 expression analyses obtained by real-time quantitative RT-PCR in (A) adenocarcinomas (AC) and (B) squamous cell carcinomas (SCC) of the lung. Dark gray bars represent HMGA2 copyno. per 250 ng total RNA for cancerous and light gray bars for the matching non-cancerous samples. Molecular Carcinogenesis DOI 10.1002/mc 6 Author Proof MEYER ET AL. A COLOR Figure 1. (Continued ) Figure 2. Immunohistochemical staining results using a goat polyclonal antibody raised against a peptide mapping within an internal region of human HMGA2, S-15, sc-23684, Santa Cruz Biotechnology hybridized to the matching non-cancerous and cancerous tissue of adenocarcinoma patient AC 3 and squamous cell carcinoma patient SSC 6. No intranuclear staining was seen in Molecular Carcinogenesis DOI 10.1002/mc non-neoplastic lung tissue of adenocarcinoma (A) and squamous cell carcinoma patients (C), while intranuclear staining was observed in 10–50% of tumor cells of the positive adenocarcinoma sample (B) and more than 80% of tumor cells of the positive squamous cell carcinoma sample (D) of the lung. Magnification: 200. Author Proof 7 HMGA2 OVEREXPRESSION IN LUNG CANCER DISCUSSION To the best of our knowledge this is the first study describing the results of quantitation of HMGA2 expression in lung cancer and in a larger series of malignant tumors at all. Lung cancer is still the leading cause of death from cancer primarily because of the fact that the majority of lung cancers are diagnosed at advanced stages [47]. Elucidation of the molecular mechanisms underlying its development and progression could lead to an earlier diagnosis and more effective therapeutic approaches [48]. As previously reported by our group, HMGA2 expression was detected by conventional RT-PCR in 14/19 NSCLC samples while no expression was found in the non-malignant adjacent lung or pleural tissues examined, suggesting HMGA2 expression as potential indicator for lung cancer [32]. Aim of this study was to quantitate the HMGA2 expression in NSCLC. Real-time quantitative RT-PCR was conducted on a total of 68 tissue samples representing matching cancerous and non-cancerous samples from 17 AC and 17 SCC patients. The qRT-PCR results were confirmed by results from IHC. The comparison between qRT-PCR and IHC shows that the PCR approach is far more sensitive than the IHC. In this series, 289 copies of HMGA2 could be detected in 250 ng total RNA by PCR, whereas positive IHC results were obtained only in samples showing more than 1.3 106 HMGA2 mRNA copies per 250 ng total RNA. In contrast to the previous study [32], herein HMGA2 expression was detected not only in all cancerous samples but also in the nonneoplastic lung tissues. This is probably because of the higher sensitivity of the real-time quantitative RT-PCR compared to the hemi-nested RT-PCR approach used in the former study. Consistent with the present results, HMGA2 could be detected by qRT-PCR in normal myometrium [35] and in normal keratinocytes of the oral cavity [34] indicating a basal HMGA2 expression in these non-neoplastic tissues as well. Because all non-cancerous specimens were completely tumor-free, the strong variation of HMGA2 expression levels from 289 to 525 947 copies per 250 ng total RNA measured in the normal tissue is remarkable. As described by several groups, multiple genetic alterations similar to those found in lung cancer have frequently been detected in histologically normal lung tissue of smokers and/or lung cancer patients [50,51]. Hence, the elevated HMGA2 expression levels measured in several non-cancerous samples could result from these genetic changes which might represent early stages in the tumorigenesis of lung cancer. To date, TNM stage is still the most important prognostic factor for prediction of survival rates in NSCLC [52]. However, to explain the large variability in postoperative outcome of patients with clinically resectable tumors, the identification of new prog- nostic parameters is required. Comparing matching tumor and non-tumorous samples from the same NSCLC patient the quantitative analysis revealed a statistically highly significant overexpression in 33/ 34 lung cancer cases with a significantly higher increase in SCC than in AC samples. A strong intertumoral variance of HMGA2 expression levels was detected and for the ACs, highest expression was found in the sole malignancy classified as T4. Because the HMGA2 gene has shown to be of prognostic relevance in several other cancer entities [30,34,53], these findings indicate that HMGA2 overexpression is a common event in NSCLC and HMGA2 expression can be considered as molecular biological factor for NSCLC. A Molecular Carcinogenesis DOI 10.1002/mc ACKNOWLEDGMENTS We thank W. Wosniok for careful statistical examination of the expression data. REFERENCES 1. Reeves R, Nissen MS. The A.T-DNA-binding domain of mammalian high mobility group I chromosomal proteins. A novel peptide motif for recognizing DNA structure. 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A Molecular Carcinogenesis DOI 10.1002/mc VI) HMGA2 expression in canine prostatic tissues – a potential prognostic tool Winkler S, Murua Escobar H, Meyer B, Loeschke S, Eberle N, Simon D, Baumgartner W, Nolte I, Bullerdiek J (in Vorbereitung) Eigenanteil: - Isolierung der Gesamt-RNA aus caninem Prostatagewebe und Xenotransplantaten - Etablierung und Durchführung der quantitativen HMGA2-Expressionsanalysen mittels Real-Time RT-PCR beim Hund HMGA2 Expression in Canine Prostatic Tissues – A Potential Prognostic Tool Susanne Winkler1, Hugo Murua Escobar2, Britta Meyer1, Siegfried Loeschke1, Nina Eberle2, Daniela Simon2, Wolfgang Baumgartner3, Ingo Nolte2 and Jörn Bullerdiek1 1 Center for Human Genetics, University of Bremen, Leobener Strasse ZHG, 28359 Bremen, Germany 2 Small Animal Clinic, University of Veterinary Medicine, Bischofsholer Damm 15, 30173 Hannover, Germany 3 Department of Pathology, University of Veterinary Medicine, Bunteweg 17, 30559 Han- nover, Germany Correspondence to: Prof. Dr. Jörn Bullerdiek: Center for Human Genetics, University of Bremen, Leobener Strasse ZHG, D-28359 Bremen, Germany, Phone:+49-(0)421-218-4239, Fax: +49-(0)421-218-4239, Email: [email protected] Running title: HMGA2 Expression in Canine Prostatic Tissues Key Words: Prostate cancer, HMGA2, Overexpression, Animal model, Real-Time quantitative PCR 1 Abstract BACKGROUND: Prostate cancer is the most prevalent cancer in western countries, being the third leading cause of male cancer death. Searching for molecular markers allowing a better prognosis of the tumor, we analyzed the High-Mobility-Group-Protein-A2 (HMGA2) expression level because HMGA2 overexpression has been shown to correlate with malignant potential of various neoplasias. As the dog is the only species showing spontaneously occurring prostate carcinomas with striking similarities to cancer growth and progression in man it is an adequate animal model for this neoplasia. METHODS: Real-Time quantitative RT-PCR for HMGA2 expression analyses in a subset of canine prostate tissue samples. RESULTS: HMGA2 expression levels in all carcinomas were higher than those of any of the nonmalignant tissues. CONCLUSION: As we assume that our investigations are comparable to the situation in man, our study provides a potential tool for better differentiation between varying degrees of malignancy in prostate carcinomas. 2 Introduction Beside humans the dog is the only mammalian species that spontaneously develops prostate cancer with a considerably high frequency (1). In addition, both species show striking similarities in the development and clinical course of the disease. The average age in which prostate carcinomas appear in dogs is ten years (2). In both species, adenocarcinomas of the prostate show the same histopathology and represent a locally invasive disease. Also in both species, the tumors are likely to metastasize to the same distant regions by blood or lymphatic system (3) and akin to their human counterparts canine prostatic cancers vary over a broad range with respect to their clinical behavior. Currently, there is no widely accepted grading for canine prostate cancer. Thus, molecular indicators allowing for a valid prognosis of these cancers are of considerable interest. In humans a type of genes overexpressed in prostate carcinomas are members of the High Mobility Group Protein A (HMGA) family (4). The HMGA family consists of three proteins known so far: HMGA1a, HMGA1b and HMGA2. HMGA1a and HMGA1b are due to alternatively spliced mRNA of the same gene, mapping to 6p21 in man (5) and to CFA 23 in dogs (6). The related HMGA2 protein is encoded by a separate gene, mapping to 12q14-15 in man (7). All three proteins show a high amino acid sequence homology in particular among their three highly conserved AT-hooks, representing the DNA-binding domains (5). The human and canine HMGA1 and HMGA2 proteins are highly conserved during evolution (8 and unpublished data). HMGA proteins are abundantly expressed during embryogenesis and expressed at very low levels in most normal adult tissues (9,10). HMGA1 overexpression was first described in transformed rat thyroid cells and in experimental thyroid tumors (11). Subsequent studies addressed its role in human malignant neoplasias (12-17). Generally, the level of overexpression correlates with the degree of neoplastic cell transformation and metastatic tumor progression (17,18). Based on this correlation it has been suggested that the elevated level of HMGA expression is a characteristic and diagnostic feature of the transformed pheno3 type (5). However, HMGA2 is frequently involved in chromosomal translocations occurring in benign human tumors, such as lipomas, uterine leiomyomas, lung hamartomas, and fibroadenomas and adenolipomas of the breast (19-25). It could be demonstrated, that truncated transcripts are able to induce cell transformation (26). The ability of both HMGA2 and HMGA1 to neoplastically transform mammalian cells and the similarity between both proteins make it likely to assume that the overexpression of HMGA2 may also lead to tumor progression. Because the dog is the only animal model for spontaneously occurring prostate cancers we analyzed neoplastic tissues as well as nonneoplastic tissues of the canine prostate in respect of their expression of HMGA2. Herein we report on the HMGA2 expression patterns in prostatic tissues from 16 dogs with different histological findings ranging from non-neoplastic tissues to carcinomas. 4 Materials and Methods Tissue samples: All canine tissues samples used in this study were taken from dogs of different breeds admitted to the Small Animal Clinic, University of Veterinary Medicine, Hanover because of different medical conditions. All samples were taken during surgery or autopsy, immediately frozen in liquid nitrogen and stored at –80°C. Additionally, pathohistological examination was carried out. Examples of two adenocarcinomas are given in Figure 2 and Figure 3. RNA isolation: Total RNA extraction of the canine prostatic tissue samples was performed according to the RNeasy midi protocol for isolation of total RNA from animal tissues (Qiagen, Hilden, Germany), following the manufacturer’s instructions. cDNA-synthesis: 250 ng of total RNA was reverse transcribed using M-MLV-Reverse Transcriptase and RNase Out (Invitrogen, Karlsruhe, Germany) with HMGA2dog Reverse Primer (5’GCCATTTCCTAGGTCTGCCTC3’) and 10 mM dNTPs. Each sample was prepared in triplicate for Real-Time Quantitative RT-PCR. Negative controls were prepared by adding distilled water instead of RNA. Standard curves: mRNA levels were measured using an “absolute” quantification method, which is relative to amplicon specific standard curves. The standard curve resulted from seven dilution steps from 102 to 108 copies; each dilution step was measured in triplicate. The sequence for this standard was (5’ to 3’): AGAGTCCCTCCAAAGCAGCTCAAAAGAAAGCAGAAGCCAATGGAGAAAAACGG CCAAGAGGCAGACCTAGGAAATGGCCA. Copy numbers were normalized relative to total RNA concentration and expressed as copy numbers/250 ng RNA. Real-Time Quantitative RT-PCR: For quantitative analysis of canine HMGA2 expression levels 2µl of each of the cDNA triplicates were subjected to real time RT-PCR, using the ABI Prism 7000 Sequence Detection System (Applied Bioystems, Warrington, UK). To minimize the risk of false positives, the dilutions for the standard curve were dispensed after the sam5 ples of interest had been dispensed and sealed. An additional negative control was prepared using water with the PCR-reaction mix. Nucleotide sequences for the canine primers and probe were designed according to Gross et al. (27) with slight modifications to the lower primer: HMGA2dog up (5’ to 3’): AGTCCCTCCAAAGCAGCTCAAAAG, HMGA2dog lo (5’ to 3’): GCCATTTCCTAGGTCTGCCTC, HMGA2 probe (5’ to 3’): 6FAMAGAAGCCACTGGAGAAAAACGGCCA-TAMRA. PCR-conditions were as follows: 50°C for 2 minutes, initial denaturation at 95°C for ten minutes, followed by 45 cycles at 95 °C for 15 seconds and 60°C for 1 minute. 6 Results Histopathological findings are listed in Table 1. The expression levels of all carcinomas were higher than those of any of the non malignant tissues. All ten non malignant prostatic tissues showed mean quantities lower than 50,000 transcripts per 250 ng total RNA. One prostatic tissue (sample No. 16) designated as a carcinoma showed a mean quantity below this quantity, too. Histopathological examination of this tissue shows that the tumor consisted of large areas of non-tumorigenic connective tissue. In respect of the fact that only small fragments of the tumor were used for isolation of RNA it seems possible, that the sample used for preparation of total RNA consisted mostly of this benign tissue, explaining the low expression of HMGA2. Additionally, the integrity of the cDNA was tested by PCR for the house-keeping gene FUT6 (data not shown). Different from all other tissue samples investigated in this study, there was no visible band for the gene product in tissue sample 16. Thus, the actual HMGA2 transcript level of this tumor may be higher than revealed by our investigations. The mean quantities among the investigated tissue samples, as indicated in Figure 1, showed a broad range from 126.78 transcripts for the lowest level in non-neoplastic tissues and 4,239,000 transcripts as the highest level in adenocarcinomas. There was also some variety observed between tissues with the same histopathological findings: non-neoplastic tissues showed transcript levels from 126.78 to 1,432.75 whereas benign lesions presented transcript levels from 962.54 to 20,754.81. Adenocarcinomas exhibited a much broader range than the non-neoplastic tissues and benign lesions from 27,214.71 to 4,239,000.00 transcripts. Nevertheless, even when comparing the highest transcript level of non-neoplastic tissues to the lowest transcript level of adenocarcinomas, there is a nearly 19-fold increase of expression of HMGA2. 7 Discussion The results of this study clearly show that HMGA2 is overexpressed in canine prostatic cancer. It has been demonstrated previously that overexpression of HMGA-proteins is associated with tumor progression in a variety of human tumors as e.g. colon cancers, squamous cell carcinomas of the oral cavity, liposarcomas, and cervical cancers (9,28,29). The expression of an embryonic protein in tumors of adults, as demonstrated in this study, suggests that HMGA2 is associated with the malignant potential in the oncogenic process (30). Presumably, the neoplastic transformation of cells expressing high levels of HMGA proteins takes part in a multi-step process, starting with an initial lesion in a tumors suppressor gene resulting in the aberrant expression of factors able to induce the continuous expression of HMGA proteins. These elevated levels of HMGA proteins may then lead to neoplastic transformation of the cells (7). The correlation between elevated levels of HMGA expression and the malignancy and metastatic potential of tumors is so striking that the overexpression of HMGA proteins has been suggested to be a diagnostic and prognostic feature (5,31). Thus, some efforts have been made to establish HMGA2 expression as a tool to classify subsets of malignant tumors with poor prognosis (32). Herein we report on HMGA2 expression in canine prostate cancer, a disease in a companion animal which closely resembles the situation in man. Our data clearly show that expression of HMGA2 is low in non-neoplastic tissues, rises in benign lesions with intermediate values for cysts and hyperplasias and increases at least 19 fold in carcinomas (Figure 1). In our study, all malignant neoplasias showed expression levels beyond a quantity of 50,000 transcripts per 250 ng total RNA, whereas none of the nonmalignant tissues showed expression levels beyond this dimension. Possibly the broad intratumoral range of transcript levels reflects the more aggressive potential of tumors with high levels of HMGA2. As far as we know, no investigations have been performed so far using real-time PCR for the detection of HMGA2 in human prostate cancers. 8 Conclusions: As we assume that our investigations in dogs are comparable to the situation in man, because of the striking similarities between both species, our study provides a potential tool for better differentiation between varying degrees of malignancy in prostate carcinomas. Thus, real-time PCR might be a tool to accomplish a more reliable prognosis for both species, because of the much more precise information provided by the results of real-time PCR compared to the results of histopathological examination. 9 References 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. 9. 10. 11. 12. 13. 14. 15. 16. Boutemmine D, Bouchard N, Boerboom D, Jones HE, Goff AK, Dore M, Sirois J. Molecular characterization of canine prostaglandin G/H synthase-2 and regulation in prostatic adenocarcinoma cells in vitro. Endocrinology 2002;143(3):1134-1143. Nolte I, Nolte M. 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Additionally, information about breed and age of the related dogs is given. Sample Breed No. Age Tissue Metastatic behavior (years) 1 Golden Retriever 4 Non-neoplastic 2 Engl. Setter 9 Adenocarcinoma Bone metastases 3 Mixed breed 11 Adenocarcinoma Infiltration of blood vessels 4 Mixed breed 14 Hyperplasia 5 Golden Retriever 11 Hyperplasia 6 Hovavart 10 Anapl. Carcinoma Lymph node metastases 7 Munsterlander 10 Non-neoplastic 8 Briard 10 Adenocarcinoma 9 Rottweiler 8 Hyperplasia 10 Mixed breed 10 Non-neoplastic 11 Mixed breed 11 Cyst 12 Mixed breed 13 Cyst 13 Pinsher 7 Cyst 14 Mixed breed 9 Adenocarcinoma 15 Mixed breed 16 Non-neoplastic 16 Mixed breed 10 Adenocarcinoma Mesentery metastases Not tested Not tested 13 Figure legends: Figure 1: HMGA2 Expression in canine prostatic tissues Figure 2: Sample No 14: moderately to poor differentiated adenocarcinoma of the canine prostate Figure 3: Sample No 8: poor differentiated adenocarcinoma of the canine prostate with mucus filled atypical glands on the left and several mitoses on the right. 14 Figure 1 15 Figure 2 Figure 3 16 VII) Quantitative expression analysis in peripheral blood of CML patients: correlation of HMGA2 expression and WBC status Meyer B, Krisponeit D, Junghanss C, Murua Escobar H, Bullerdiek J (in Vorbereitung) Eigenanteil: - Alle Arbeiten außer Probenentnahme und routinemäßig durchgeführte Blutuntersuchungen, welche unter Leitung von D. Krisponeit bzw. C. Junghanß im Zentralkrankenhaus Bremen-Mitte bzw. in der Klinik für Innere Medizin der Universität Rostock durchgeführt wurden Quantitative expression analysis in peripheral blood of CML patients: correlation of HMGA2 expression and WBC status B. Meyera, D. Krisponeitb, C. Junghanssc, H. Murua Escobard, J. Bullerdieka a Centre for Human Genetics, University of Bremen, Leobener Str. ZHG, D-28359 Bremen, Germany b Klinikum Bremen Mitte, Zentrum für Innere Medizin, Hämatologie und Onkologie, St.-Jürgen-Str. 1, D-28177 Bremen, Germany c Department of Internal Medicine, Devision of Hematology and Oncology, University of Rostock, Ernst-Heydemann-Str. 6, D-18057 Rostock, Germany d Small Animal Clinic, University of Veterinary Medicine, Bischofsholer Damm 15, D- 30173 Hannover, Germany Corresponding author: Prof. Dr. Jörn Bullerdiek Centre for Human Genetics University of Bremen Leobener Str. ZHG D-28359 Bremen Keywords: chronic myeloid leukaemia, high mobility group protein A2, quantitative real-time RT-PCR Abstract The architectural transcription factor HMGA2 is highly expressed during embryogenesis but scarcely detectable in non-dividing adult cells. Previously, HMGA2 re-expression was detected in blood from CML patients by conventional RTPCR, while blood samples from healthy volunteers were HMGA2-negative. Using the sensitive method of qRT-PCR, herein HMGA2 expression was detectable not only in peripheral blood from leukaemia patients but also in blood from healthy donors. Statistical analysis revealed a highly significant correlation between white blood cell count and HMGA2 transcript levels. Results indicate that HMGA2 expression is upregulated in undifferentiated leukaemic cells accumulating during progression of chronic phase to blast crisis. 1. Introduction The high mobility group protein HMGA2 is a small nuclear chromatin-associated protein characterised by three DNA-binding domains called AT-hooks and an acidic tail [1]. Binding of HMGA2 to AT-rich stretches in the minor groove of DNA induces conformational changes on DNA influencing the recruitment of diverse transcription factors. Thus, HMGA2 affects transcription of a variety of genes as architectural protein [2]. The HMGA2 gene is located on 12q13-15, a region frequently rearranged in human benign tumours mostly of mesenchymal origin [3-6]. Expression of HMGA2 is high during embryogenesis but low or even absent in non-dividing adult cells [5,7,8]. In mice inactivation of the Hmga2 gene causes reduced growth (“pygmy phenotype”) [9] while transgenic mice expressing a truncated Hmga2 gene develop gigantism associated with lipomatosis [10]. A similar phenotype including extreme somatic overgrowth was reported for an 8-year old boy with a germline mutation affecting the HMGA2 gene showing the important role of HMGA2 for growth and development [11]. Re-expression of HMGA2 was detected in several human malignancies, such as squamous cell carcinomas of the oral cavity [12], breast cancer [13], pancreatic cancer [14], and non-small cell lung cancer [15,16] often correlated with a highly malignant phenotype. In the peripheral blood of breast cancer patients HMGA2 expression was restricted to patients with metastatic disease. Statistical analyses revealed a positive correlation between HMGA2 expression and disease-free survival, suggesting HMGA2 expression as independent marker for poor prognosis [17,18]. However, on that point conflicting data exist in that recent quantitative analyses using real-time RT-PCR detected HMGA2 expression in peripheral blood from breast cancer patients as well as from healthy donors. Furthermore, no correlation of HMGA2 expression with any clinical or histopathological data could be found [19]. In previous work from our group using conventional RT-PCR, CD34+ stem cells from healthy donors and blood from patients with myeloid leukaemia was HMGA2 positive while peripheral blood samples from healthy volunteers were negative [20]. Several studies have demonstrated HMGA2 re-expression and/or chromosomal rearrangements affecting the chromosomal region 12q13-15 in patients with haematologic malignancies. Submicroscopic deletions were detected in 20 of 78 acute lymphocytic leukaemias (ALL) [21] and rearrangements of the HMGA2 gene have been reported in a case of Richter transformation of chronic lymphocytic leukaemia (CLL) [22], a case of ALL [23] and two cases of myeolofibrosis with myeloid metaplasia [24]. In the latter study HMGA2 expression was detected in both cases affected by translocation and in ten additional patients bearing no 12q anomalies, while HMGA2 was not expressed in normal subjects. Odero et al. (2005) reported expression in 6 patients with myeloid leukaemia showing 12q13-15 rearrangements [25]. Accordingly, expression of several HMGA2 isoforms lacking the acidic tail was found in 2 cases of acute myelogenous leukaemia (AML) with translocations of chromosome 12q. Furthermore, an aberrant HMGA2 transcript was detected in the CML cell line BV173 lacking apparent chromosomal anomalies of the 12q14-15 region [26]. Recently, it was suggested that aberrant HMGA2-expression, in concert with mutant PIGA (phosphatidylinositol glycan, class A) accounts for clonal expansion of haepoietic stem cells in two PNH (paroxysmal nocturnal hemoglobinuria) patients with acquired rearrangement of chromosome 12 in PIGAmutant cells [27]. In addition, aberrant HMGA2 expression was detected in CD34positive stem cells of patients with idiopathic myelofibrosis (IM) representing a Philadelphia chromosome-negative chronic myeloproliferative disorder [28]. Herein, the results of quantitative analysis of HMGA2 expression in the peripheral blood of 14 CML patients and of 7 healthy donors are reported. The findings indicate that up-regulation of HMGA2-expression is correlated to the undifferentiated phenotype of leukaemic cells 2. Material and methods 2.1. Blood samples Blood samples from 14 CML patients and 7 healthy individuals were taken at the Central Hospital Bremen Mitte, Bremen, Germany and at the Department of Internal Medicine, Division of Hematology and Oncology, University of Rostock, Germany. Of each donor 2.5 ml of whole blood were collected in PAXgene Blood RNA Tubes (Qiagen, Hilden, Germany) containing RNA stabilising agent and stored until use at 4°C (for up to 6 days) or at -20°C. 12 out of 14 CML patients received medical treatment, one patient was untreated (C3) and one patient abandoned therapy (45). Blood from CML patients were routinely karyotyped and checked by RT-PCR for the presence of BCR-ABL fusion transcripts. As revealed by cytogenetic analyses apart from patient B22 all CML patients were Philadelphia chromosome-positive, which was confirmed by the detection of the BCR-ABL fusion transcript via RT-PCR. 2.2. RNA-isolation Total RNA was extracted using the PAXgene Blood RNA kit (Qiagen) according to the manufacturer’s instructions. To ensure complete mechanical disruption of genomic DNA QIAshredder spin columns were used. The optional on-column DNase I treatment was included to eliminate any residual DNA in the RNA samples. RNA was quantitated spectrophotometrically in triplicate. 2.3. Reverse transcription For cDNA-syntheses 250 ng of total RNA were reverse transcribed using 2 pmol of gene specific reverse primer (5’ GCCATTTCCTAGGTCTGCCTC 3’) [29] and 200 units M-MLV Reverse Transcriptase (Invitrogen, Karlsruhe, Germany) according to the manufacturer’s instructions. 2.4. Quantitative real-time RT-PCR For absolute quantification of HMGA2 transcript levels RT-PCR amplifications were carried out using the Applied Biosystems 7300 Real-Time PCR System (Applied Biosystems, Darmstadt, Germany). 2 µl of each cDNA corresponding to 25 ng of total RNA were amplified in a total volume of 25 µl using universal PCR Mastermix (Applied Biosystems) with 600 nM of each primer (forward primer: 5’ AGTCCCTCTAAAGCAGCTCAAAAG 3’, reverse primer: see above) and 200 nM fluorogenic probe (5’ 6-FAM-AGAAGCCACTGGAGAAAAACGGCCA-TAMRA 3’) [29]. PCR conditions were as follows: 2 min at 50°C and 10 min at 95°C, followed by 40 cycles with 15 s at 95°C and 1 min at 60°C. All samples were measured in triplicate and for each run non-template controls and no reverse transcriptase reactions were included. Expression levels of HMGA2 mRNA transcripts were calculated using an amplicon-specific standard curve. Transcript levels were normalised to total RNA concentration and expressed as copy number / 250 ng total RNA. 2.5. Statistical analysis Correlation analyses were done using Spearman’s correlation test. p values below 0.05 were considered significant. 3. Results and discussion In previous work from our group using conventional RT-PCR, HMGA2 expression was detected in peripheral blood of all leukaemia patients tested (11 CML and 3 AML patients) and in CD34 positive haematopoietic stem cells from healthy donors, while no expression was found in normal blood samples [20]. To the best of our knowledge this is the first study presenting quantitative analysis of HMGA2 expression in blood from CML patients compared to blood from healthy donors. In contrast to the previous investigation herein HMGA2 expression was detectable not only in peripheral blood from leukaemia patients but also in normal blood due to the sensitive method of quantitative real-time RT-PCR. For healthy individuals transcript levels varied between 4,441 and 9,076 copies / 250 ng total RNA. This result is in accordance with findings by Fabjani et al. (2005) who detected a background HMGA2 expression in blood specimens from healthy donors as well. However, the variation of transcript levels measured in the present study in blood from normal individuals was very small (about 2-fold) compared to the difference of up to 170-fold detected by Fabjani et al. Most likely the small variance could result from the utilization of RNA stabilisation reagent, which prevents changes in gene expression that normally take place in vitro, after blood collection. In the peripheral blood of CML patients tested HMGA2 expression levels varied strongly from 4,392 up to 6,360,200 copies per 250 ng total RNA (Table 1, Figure 1) corresponding to a variance of up to 1,448-fold. Lowest transcript levels were measured in patients in chronic phase or in remission, elevated levels were detected for CML patients in acceleration and the highest level was measured for patient B22 with blast crisis representing the only patient with Philadelphia-negative (Ph-) and BCR-ABL-negative CML. Statistical analysis revealed highly significant correlations between white blood cell (WBC) count and HMGA2 transcript levels for all CML patients tested (Spearman’s correlation test: r = 0.899; p < 0.0001) as well as only for those patients with Ph+ and BCR-ABL+ CML (Spearman’s correlation test: r = 0.879; p < 0.0001), respectively. However, since the HMGA2 expression increases disproportionately to the WBC count, HMGA2 expression is clearly up-regulated in leukaemic cells. The question arises what cells are responsible for up-regulation of HMGA2 expression and how HMGA2 expression could be linked to the malignant phenotype of CML. CML is characterised by increased and unregulated clonal production of predominantly myeloid cells. While chronic phase CML cells retain their capacity for complete maturation, blast crisis is characterised by enhanced proliferation and survival of cells and impaired differentiation resulting in an accumulation of premature undifferentiated leukaemic blast cells [30,31]. Since HMGA2 is reported to be highly expressed in undifferentiated mesenchymal and in proliferating cells [7,32,33] the elevated HMGA2 expression shown herein is likely to result from the immature leukaemic cells representing rapidly dividing cells of mesenchymal origin. Progression of CML to blast crisis is generally accompanied by an increased BCRABL expression and accumulation of genetic and chromosomal abnormalities, suggesting a genetic instability in Philadelphia-positive (Ph+) cells [31]. This genetic instability could be causally linked to elevated HMGA2-expression levels, since it was recently shown that HMGA2-expressing cells lose their ability to activate DNA repair pathways in response to double-strand break damages [34]. Furthermore, in previous work we were able to show that by binding to the promoter of ERCC1, an important gene in the regulation of nucleotide excision repair, HMGA2 modulates its activity leading to an altered genomic stability [35]. Further quantitative analyses studying HMGA2 expression in stem cells as well as myeloid progenitors of healthy donors and of CML patients will be helpful to understand the significance of HMGA2 expression changes during normal and abnormal myelopoesis. References 1. Reeves R, Nissen MS. The A.T-DNA-binding domain of mammalian high mobility group I chromosomal proteins. A novel peptide motif for recognizing DNA structure. J Biol Chem 1990;265:8573-8582. 2. Bustin M, Reeves R. 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Tables Table 1: Results of the HMGA2 expression analyses in the peripheral blood of CML patients using quantitative real-time RT-PCR. Patient Diagnosis Age [y] Philadelphia Chr. / WBC count HMGA2 BCR-ABL [G/l] [Copy-no. / 250 ng total RNA] 45 CML in acceleration 36 positive 18.3 157,506 B5 CML in remission 61 positive 8.9 29,062 B14 CML 66 positive 13.1 49,718 B22 CML blast crisis 64 negative 40.0 6,360,200 B25 CML in remission 68 positive 5.5 6,037 B57 CML in remission 68 positive 6.5 12,949 B60 CML in remission 54 positive 3.0 7,918 C1 CML in remission 55 positive 6.2 11,731 C2 CML in chronic phase 41 positive 1.4 4,392 C3 CML in acceleration 18 positive 165.0 251,210 C4 CML in remission 62 positive 4.8 6,453 C5 CML in chronic phase 45 positive 6.2 8,189 C6 CML in chronic phase 53 positive 4.4 4,985 C7 CML in remission 47 positive 3.9 8,640 Figure 1: 1.00E+07 CML patients Healthy donors HMGA2 Copy-no. / 250 ng total RNA 1.00E+06 1.00E+05 1.00E+04 1.00E+03 1.00E+02 1.00E+01 1.00E+00 C2 31 34 33 C6 32 35 B25 C4 30 B60 Sample no. C5 C7 36 C1 B57 B5 B14 45 C3 Figure legend Figure 1: HMGA2 copy-no. per 250 ng total RNA as revealed by quantitative real-time RT-PCR in peripheral blood from CML patients (black bars) and from healthy donors (light grey bars) on logarithmic scale. Plain black bars represent CML patients in chronic phase or in remission, horizontally striped bars represent patients with CML in acceleration and the vertically striped bar represents a patient with CML in blast crisis. VIII) Expression pattern of the HMGB1 gene in sarcomas of the dog Meyer B, Murua Escobar H, Hauke S, Richter A, Winkler S, Rogalla P, Flohr AM, Bullerdiek J, Nolte I Anticancer Res 24: 707-710 (2004) Eigenanteil: - Isolierung der Gesamt-RNA aus caninen Sarkomen - Erstellung des Northern Blot - Herstellung der Northern Blot-Sonde - Etablierung und Durchführung der semi-quantitativen RT-PCR - Auswertung der Ergebnisse - Verfassen der Veröffentlichung ANTICANCER RESEARCH 24: 707-710 (2004) Expression Pattern of the HMGB1 Gene in Sarcomas of the Dog BRITTA MEYER1, HUGO MURUA ESCOBAR2,3, SVEN HAUKE1, ANDREAS RICHTER1, SUSANNE WINKLER3, PIERE ROGALLA1, ALJOSCHA M. FLOHR3, JÖRN BULLERDIEK3 and INGO NOLTE2 1alcedo biotech GmbH, Leobener Strasse ZHG, D-28359 Bremen; for Small Animals, School of Veterinary Medicine, Bischofsholer Damm 15, D-30173 Hannover; 3Center for Human Genetics, University of Bremen, Leobener Strasse ZHG, D-28359 Bremen, Germany 2Clinic Abstract. Background: The human high mobility group protein B1 (HMGB1) has attracted considerable interest among oncologists because it sensitises cancer cells to the anticancer drug cisplatin by shielding cisplatin-DNA adducts from nucleotide excision repair. Materials and Methods: Since cisplatin is the cornerstone of adjuvant systemic therapy for osteosarcomas, in both humans and dogs, the expression pattern of the HMGB1 gene in seven canine sarcomas was investigated by Northern blot analysis and semi-quantitative RT-PCR. Results: A strong intertumoural variation of HMGB1 expression was detected by Northern blot analysis and confirmed by the semi-quantitative RT-PCR established herein. Conclusion: The observed variations of HMGB1 expression in canine sarcomas emphasises the role of HMGB1 as a potential marker of clinical interest as its expression level may predict the clinical outcome of therapies based on cisplatin. The semi-quantitative RT-PCR established allows a quick and convenient determination of the HMGB1 expression level as necessary for clinical applications. are chromatin-associated non-histone proteins characterised by low molecular weight, acid-solubility and a high content of charged amino acids. According to their molecular size, sequence and DNA binding capacity, three families have been distinguished: HMGB (formerly HMG1/2), HMGN (formerly HMG14/17) and HMGA (formerly HMGI(Y)) (2,3). The HMGB family, comprising HMGB1, HMGB2 and HMGB3, is characterised by its two DNA-binding domains called the "HMG-Box" (4,5). One of the best analysed members of the group of HMGBox proteins is HMGB1 (synonymously known as HMG1 or amphoterin). Both DNA-binding domains selectively bind with a very high affinity to major cisplatin-DNA adducts (68) and interaction between HMGB1 and cisplatin-damaged DNA contributes to its biological activity, as it sensitises cancer cells to cisplatin by shielding its major DNA adducts from nucleotide excision repair (9,10). Interestingly, HMGB1 gene expression can be induced by oestrogens in breast cancer cells probably due to an upregulation of the gene, so that HMGB1 itself can be considered an oestrogen-responsive gene (11). Recently, we were able to explain this observation by the identification of two oestrogen responsive elements within the first intron of HMGB1 (12). He et al. (10) have shown that, in oestrogen receptor-positive human breast cancer cells, oestrogen can significantly increase the effect of cisplatin by causing an overexpression of HMGB1. This finding has led to the conclusion that oestrogen treatment prior to cisplatin therapy may sensitise the cancer cells against that drug. Accordingly, a clinical trial for the treatment of gynaecological tumours with cisplatin has already been approved by the Food and Drug Administration (FDA) (10). On the other hand, the former experiment clearly shows that the quantitation of the intratumoural HMGB1 expression level may be of high impact for a cisplatin/carboplatin therapy for two reasons. Firstly, it may predict the clinical outcome of the therapy; secondly, it may influence the therapy protocol as, for example, tumours AR The related platinum compounds cisplatin and carboplatin are widely used antitumour drugs for the treatment of a number of malignancies. The main cytotoxic effect of cisplatin/carboplatin is the formation of cisplatin/carboplatinDNA adducts characterised by intrastrand cross-links and significantly bended and distorted DNA. Gel mobility shift assays revealed a selective affinity of high mobility group (HMG) proteins for cisplatin-DNA adducts (1). The recognition of cisplatin damage by HMG is assumed to mediate cisplatin cytotoxicity. HMG proteins Correspondence to: Prof. Dr. Ingo Nolte, Clinic for Small Animals, School of Veterinary Medicine, Bischofsholer Damm 15, D-30173 Hannover, Germany. Tel: +49-511-8567251, Fax: +49-5118567686, e-mail: [email protected] Key Words: Osteosarcoma, cisplatin, HMGB1 expression, semiquantitative RT-PCR. 0250-7005/2004 $2.00+.40 707 ANTICANCER RESEARCH 24: 707-710 (2004) Table I. Sarcoma samples analysed in this study. Sarcoma sample OS1 OS2 OS3 OS4 OS5 FS LMS 1n.r. Tumour Osteosarcoma Osteosarcoma Osteosarcoma Osteosarcoma Osteosarcoma Fibrosarcoma Leiomyosarcoma Breed Sex Rottweiler Crossbreed German Shepherd Crossbreed German Shepherd Bobtail Crossbreed f f m m m m f Age 1 yr 4 yrs 6 yrs 9 yrs n.r.1 5 yrs 10 yrs = not reported TCTTCCTCCTCCTCCTCATCC 3’). A 445 bp cDNA probe detecting the 1.3 kb transcript of the canine GAPDH gene was amplified by PCR with the primer set GAPDH2up (5’ GTGAAGGTCGGAGTCAAC 3’) and GAPDHdog5do (5’ AGGAGGCATTGCTGACAAT 3’). Probes were labelled with 50 ÌCi(·-32P)dCTP (Amersham Biosciences) using the Megaprime Labelling Kit (Amersham Biosciences) for random-primed labelling (14). Hybridisation was performed for 3 h at 68ÆC in 10 ml of PerfectHyb Plus Hybridisation Buffer (Sigma-Aldrich, Saint Louis, USA). The membranes were washed for 5 min with low stringency at RT in 2x SSC, 0.1% SDS and twice for 20 min with high stringency at 68ÆC in 0.5x SSC, 0.1% SDS. Signals were visualised using a Storm PhosphorImager (Molecular Dynamics, Sunnyvale, USA). Quantitation of the transcripts of HMGB1 and GAPDH was performed using the software program ImageQuant (Molecular Dynamics). showing a high HMGB1 expression level may be treated with a lower amount of this antitumour drug. Due to the close similarities of numerous canine diseases to their human counterparts, the role of the dog as a model organism for therapeutic approaches is justified. Furthermore, genes and proteins known to be of high diagnostic and therapeutic impact in man can also be considered to play an important role in the dog. Osteosarcomas and several types of carcinomas belong to the group of canine malignancies often treated with cisplatin or carboplatin. So far no data are available analysing the expression pattern of the HMGB1 gene in canine sarcomas. Thus, in this study we analysed the HMGB1 expression level in five canine osteosarcomas, one fibrosarcoma and one leiomyosarcoma by Northern blot experiments. Based on the observed strong intertumoural variation of HMGB1 expression, we further established a quick RT-PCR-based diagnostic system for future studies. Semi-quantitative RT-PCR. cDNA synthesis was performed using primer AP2 (5’ AAGGATCCGTCGACATCT(17) 3’) with 500 ng of mRNA with SuperScript Reverse Transcriptase (Invitrogen, Karlsruhe, Germany) according to the manufacturer’s instructions. In order to determine the expression of HMGB1 in relation to that of the housekeeping gene GAPDH, a duplex PCR was established using the primer sets ToastUP/Ex5lo and GAPDH2up/GAPDHdog5do (see above). PCR reactions were set up according to the "basic PCR protocol" of Taq DNA Polymerase (Invitrogen) using the following PCR program: initial denaturation for 5 min at 94ÆC, 28 cycles of denaturation for 30 sec at 94ÆC, primer annealing for 30 sec at 55ÆC and extension for 45 sec at 72ÆC, followed by a final extension for 10 min at 72ÆC. The appropriate number of cycles was previously determined so that for both PCR-products amplification was in the exponential range (data not shown). PCR-products were separated on a 1.2% agarose gel stained with VistraGreen (Amersham) and visualised using a Storm PhosphorImager (Molecular Dynamics). Quantitation of the PCR-fragments of HMGB1 and GAPDH was performed using the software program ImageQuant (Molecular Dynamics) measuring pixel intensities. Materials and Methods Results AR Tissue samples. All canine tumour samples used in this study (Table I) were provided by the Clinic for Small Animals, Hanover, Germany. Samples were taken during surgery, immediately frozen in liquid nitrogen and stored at -80ÆC. RNA isolation. Total RNA extraction of the canine sarcoma samples was performed according to the RNeasy midi protocol for isolation of total RNA from heart, muscle and skin tissue (Qiagen, Hilden, Germany) including a Proteinase K digest. Enrichment of poly A+ mRNA was carried out using the Oligotex mRNA kit (Qiagen). Northern blot hybridisation. For Northern blot analysis, 5 Ìg of mRNA from each sample were separated on a 1.2% denaturing agarose gel containing 0.65% formaldehyde. RNAs were transferred onto a Hybond-XL charged nylon membrane (Amersham Biosciences, Buckinghamshire, England) by capillary blot overnight. As a probe for hybridisation, a 603 bp cDNA fragment derived from the ORF (exon 2-5) of the canine HMGB1 gene was generated by PCR using the primer pair ToastUP (5’ GGGCAAAGGAGATCCTAAGAAG 3’) (13) and Ex5lo (5’ 708 Northern blot hybridisation on a series of 5 osteosarcomas, one fibrosarcoma and one leiomyosarcoma sample of the dog (Table I), using a cDNA probe derived from the ORF (Exon 2-5) of the canine HMGB1 gene, resulted in the detection of two HMGB1 mRNA transcripts of approximately 1.4 and 2.4 kb (Figure 1), which are similar to that observed in human tissues (15-17) and various canine tissues (18). In order to quantify the expression of HMGB1, the blot was rehybridised with a canine GAPDHspecific cDNA probe (Figure 1). Summing up the intensities of the 1.4 and 2.4 kb HMGB1 signals, the HMGB1-RNA / GAPDH-RNA ratios were calculated. As shown in Figure 1, the analysed canine sarcoma samples revealed a strong intertumoural variation in the relative expression of HMGB1. Values obtained by Northern blot analysis for the osteosarcoma samples varied between 0.52 and 1.31, while the fibrosarcoma and the leiomyosarcoma showed ratios of 0.73 and 0.24, respectively (Table II). Meyer et al: HMGB1 and Canine Sarcomas Figure 2. Semi-quantitative duplex RT-PCR products of HMGB1 (603 bp) and GAPDH (445 bp) using canine cDNAs of five osteosarcomas, one fibrosarcoma and one leiomyosarcoma after electrophoresis and VistraGreen staining (Amersham Biosciences). Lane 1: DNA molecular weight standard 1 Kb Plus DNA Ladder (Invitrogen). Lanes 2-6: osteosarcoma samples 1-5 (OS1-5). Lane 7: fibrosarcoma sample (FS). Lane 8: leiomyosarcoma sample (LMS). Lane 9: H2O, negative control. Figure 1. Northern blot analysis of five osteosarcomas (OS1-5), one fibrosarcoma (FS) and one leiomyosarcoma (LMS) of the dog hybridised with a HMGB1-specific cDNA probe detecting the two canine HMGB1 transcripts of approximately 1.4 and 2.4 kb (upper part). Co-hybridisation of the same membrane with a GAPDH-specific cDNA probe detecting a 1.3 kb transcript (lower part). obtained by the Northern blot hybridisation and RT-PCR analyses, mean values for each test series were calculated, set to one, and relative expression levels were determined (Table II, Figure 3). Statistical analysis using the Pearson’s Correlation Test revealed a significant correlation between the relative HMGB1 expression level obtained by Northern blot hybridisation and the level obtained by the established RT-PCR (r=0.8919, p=0.0071). Table II. Absolute and relative HMGB1-mRNA / GAPDH-mRNA ratios. Discussion Sarcoma sample Absolute HMGB1 / GAPDH-RNA ratios RT-PCR Northern blot Relative HMGB1 / GAPDH-RNA ratios1 RT-PCR Northern blot OS1 OS2 OS3 OS4 OS5 FS LMS 0.95 0.99 1.02 1.28 0.72 0.73 0.42 0.52 0.79 1.05 1.31 0.60 0.73 0.24 1.09 1.13 1.17 1.47 0.83 0.84 0.48 0.7 1.06 1.41 1.75 0.79 0.97 0.32 Mean value 0.87 0.75 1.0 1.0 1 Calculated with the mean values of the absolute HMGB1 / GAPDHRNA ratios set to one. In order to confirm the results and to develop a less timeand material-consuming technique, we established a semiquantitative duplex RT-PCR suitable for detecting intertumoural variation of HMGB1 expression in relation to expression of the house-keeping gene GAPDH (Figure 2). After quantitation of the signals obtained by RT-PCR, the HMGB1-RNA / GAPDH-RNA ratios were calculated. The values for the osteosarcoma samples varied between 0.72 and 1.28, while the ratios for the fibrosarcoma and the leiomyosarcoma were 0.73 and 0.42, respectively (Table II). In order to determine the comparability of the results Cisplatin and carboplatin are widely used anticancer drugs, manifesting their cytotoxicity to tumour cells by damaging DNA, generating a distorted DNA duplex. HMGB1 proteins selectively bind with high affinity to cisplatin or carboplatinDNA adducts and several investigations revealed that this interaction contributes to tumour death by blocking excision repair of the major cisplatin-DNA adducts (9,10). No features have been identified yet allowing clinicians to predict the response to cisplatin or carboplatin therapies in dogs with osteosarcomas at the time of diagnosis or during treatment (19). Hence, it was the aim of this study to analyse the expression level of HMGB1 in canine sarcomas. Based on Northern blot and RT-PCR analyses, we were able to show an intertumoural variation of HMGB1 expression levels among canine sarcomas. Very recently, comparable results were obtained for human breast cancer samples (17,20) and a clinical trial designed to increase HMGB1 expression by oestrogen treatment has been approved by the FDA (10). The observed intertumoural variances of HMGB1 expression in seven sarcomas analysed in this study may be of importance for therapeutic approaches based on cisplatin/carboplatin treatment as, for example, tumours showing a high HMGB1 expression level may be treated with a lower amount of this antitumour drug. However, future clinical studies including a greater number of tumours have to be performed to correlate the 709 ANTICANCER RESEARCH 24: 707-710 (2004) Figure 3. Variation of relative HMGB1 expression in five osteosarcomas (OS1-5), one fibrosarcoma (FS) and one leiomyosarcoma (LMS) of the dog as revealed by Northern blot analysis (dark grey bars) and semiquantitative RT-PCR (light grey bars). In order to compare the results obtained by the two methods, mean values for each test series were calculated, set to one and relative expression levels were determined. HMGB1 expression level with clinical outcome of cisplatin/carboplatin chemotherapy. The statistically significant correlation of the relative HMGB1 expression levels obtained by Northern blot analyses as well as duplex RT-PCR makes the established PCR approach a quick and convenient method to determine the intratumoural HMGB1 expression. References AR 1 Kartalou M and Essigmann JM: Recognition of cisplatin adducts by cellular proteins. Mutat Res 478: 1-21, 2001. 2 Bustin M, Lehn DA and Landsman D: Structural features of the HMG chromosomal proteins and their genes. Biochim Biophys Acta 1049: 231-243, 1990. 3 Bustin M and Reeves R: High-mobility-group chromosomal proteins: architectural components that facilitate chromatin function. Prog Nucleic Acid Res Mol Biol 54: 35-100, 1996. 4 Jantzen HM, Admon A, Bell SP and Tjian R: Nucleolar transcription factor hUBF contains a DNA-binding motif with homology to HMG proteins. Nature 344: 830-836, 1990. 5 Landsman D and Bustin M: A signature for the HMG-1 box DNA-binding proteins. Bioessays 15: 539-546, 1993. 6 Pil PM and Lippard SJ: Specific binding of chromosomal protein HMG1 to DNA damaged by the anticancer drug cisplatin. Science 256: 234-237, 1992. 7 Jung Y and Lippard SJ: Nature of full-length HMGB1 binding to cisplatin-modified DNA. Biochemistry 42: 2664-2671, 2003. 710 8 Kasparkova J, Delalande O, Stros M, Elizondo-Riojas M-A, Vojtiskova M, Kozelka J and Brabec V: Recognition of DNA interstrand cross-link of antitumor cisplatin by HMGB1 protein. Biochemistry 42: 1234-1244, 2003. 9 Zamble DB, Mu D, Reardon JT, Sancar A and Lippard SJ: Repair of cisplatin-DNA adducts by the mammalian excision nuclease. Biochemistry 35: 10004-10013, 1996. 10 He Q, Liang CH and Lippard SJ: Steroid hormones induce HMG1 overexpression and sensitize breast cancer cells to cisplatin and carboplatin. Proc Natl Acad Sci USA 97: 57685772, 2000. 11 Chau KY, Lam HY and Lee KL: Estrogen treatment induces elevated expression of HMG1 in MCF-7 cells. Exp Cell Res 241: 269-272, 1998. 12 Borrmann L, Kim I, Schultheiss D, Rogalla P and Bullerdiek J: Regulation of the expression of HMG1, a co-activator of the oestrogen receptor. Anticancer Res 21: 301-305, 2001. 13 Jiang Z, Priat C and Galibert F: Traced orthologous amplified sequence tags (TOASTs) and mammalian comparative maps. Mamm Genome 9: 577-787, 1998. 14 Feinberg AP and Vogelstein B: A technique for radiolabeling DNA restriction endonuclease fragments to high specific activity. Anal Biochem 132: 6-13, 1983. 15 Wen L, Huang JK, Johnson BH and Reeck GR: A human placental cDNA clone that encodes nonhistone chromosomal protein HMG-1. Nucleic Acid Res 17: 1197-1214, 1989. 16 Rogalla P, Kazmierczak B, Flohr AM, Hauke S and Bullerdiek J: Back to the roots of a new exon--the molecular archaeology of a SP100 splice variant. Genomics 63: 117-122, 2000. 17 Flohr AM, Rogalla P, Meiboom M, Borrmann L, Krohn M, Thode-Halle B and Bullerdiek J: Variation of HMGB1 expression in breast cancer. Anticancer Res 21: 3881-3885, 2001. 18 Murua Escobar H, Meyer B, Richter A, Becker K, Flohr AM, Bullerdiek J and Nolte I: Molecular characterization of the canine HMGB1. Cytogenet Genome Res 101: 33-38, 2003. 19 Hahn KA, Legendre AM and Talbott JR: The frequency of micronuclei in lymphocytes of dogs with osteosarcomas: a predictive variable for tumor response during cisplatin chemotherapy. Cancer Epidemiol Biomakers Prev 5: 653-656, 1996. 20 Brezniceanu M-L, Völp K, Bösse S, Solbach C, Lichter P, Joos S and Zörnig M: HMGB1 inhibits cell death in yeast and mammalian cells and is abundantly expressed in human breast cancer carcinoma. FASEB J 17: 1295-1297, 2003. Received July 9, 2003 Revised November 4, 2003 Accepted December 12, 2003 IX) Angiogenetic signaling through hypoxia. HMGB1: an angiogenetic switch molecule Schlueter C, Weber H, Meyer B, Rogalla P, Röser K, Hauke S, Bullerdiek J Am J Pathol 166: 1259-1263 (2005) Eigenanteil: - Expression und Aufreinigung der rekombinanten HMGB1-Proteine American Journal of Pathology, Vol. 166, No. 4, April 2005 Copyright © American Society for Investigative Pathology Vascular Biology, Atherosclerosis and Endothelium Biology Angiogenetic Signaling through Hypoxia HMGB1: An Angiogenetic Switch Molecule Claudia Schlueter,* Holger Weber,† Britta Meyer,* Piere Rogalla,* Kerstin Röser,‡ Sven Hauke,* and Jörn Bullerdiek* From the Center for Human Genetics,* University of Bremen, Bremen; the Tumor Biology Center,† Institute of Molecular Medicine, Freiburg; and the Department of Gynecopathology,‡ Institute of Pathology, University Hospital Eppendorf, Hamburg, Germany The initiation of angiogenesis, called the angiogenetic switch, is a crucial early step in tumor progression and propagation, ensuring an adequate oxygen supply. The rapid growth of tumors is accompanied by a reduced microvessel density, resulting in chronic hypoxia that often leads to necrotic areas within the tumor. These hypoxic and necrotic regions exhibit increased expression of angiogenetic growth factors, eg, vascular endothelial growth factor, and may also attract macrophages, which are known to produce a number of potent angiogenetic cytokines and growth factors. A group of molecules that may act as mediators of angiogenesis are the so-called high-mobility group proteins. Recent studies showed that HMGB1, known as an architectural chromatin-binding protein, can be extracellularly released by passive diffusion from necrotic cells and activated macrophages. To examine the angiogenetic effects of HMGB1 on endothelial cells an in vitro spheroid model was used. The results of the endothelial-sprouting assay clearly show that exogenous HMGB1 induced endothelial cell migration and sprouting in vitro in a dose-dependent manner. Thus, this is the first report showing strong evidence for HMGB1-induced sprouting of endothelial cells. (Am J Pathol 2005, 166:1259 –1263) Cell death mediated by hypoxia is a frequent event during the proliferation of tumor cell populations.1 Hypoxia may induce apoptosis of areas of the growing tumor but it can also lead to necrotic death of the corresponding cells.2,3 Tumor propagation and progression depends on the induction of tumor vascularization, ie, the angioge- netic switch.4 Although it is now well documented that tumor cells have the ability to induce angiogenesis by secretion of extracellular molecules promoting the outgrowth of small vessels, the stimulation of angiogenesis mediated by the necrotic cells themselves may be a very efficient mechanism by which tumors can escape growth limiting because of hypoxia.5 A group of molecules that may act as mediators of angiogenesis released by necrotic cells are members of the so-called high-mobility group protein family. High-mobility group proteins are small DNA-binding proteins playing an important role in transcriptional regulation.6 In addition, there is now increasing evidence that besides their role as regulators of transcription at least some members of that group of proteins can also exert extracellular functions. Of these proteins, HMGB1 currently has been investigated most intensively.7,8 It can be secreted by certain cells and plays an important role in inflammation, cell migration, differentiation, and tumorigenesis and has been identified as one of the ligands binding to the receptor for advanced glycation end products (RAGE).9,10 HMGB1 binding to RAGE activates key cell-signaling pathways such as MAP kinases and nuclear factor-B.11 In vivo, two potential sources of circulating HMGB1 exist: HMGB1 released from damaged or necrotic cells and HMGB1 secreted from activated macrophages in response to, eg, oxygen stress, endotoxin, tumor necrosis factor␣, or interleukin-1.12–14 Scaffidi and colleagues15 showed that HMGB1 rapidly leaked out from permeabilized necrotic cells, but not from permeabilized apoptotic cells. Through its secretion by activated macrophages HMGB1 again activates macrophages, resulting in secretion of angiogenetic factors, eg, vascular endothelial growth factor (VEGF), tumor necrosis factor-␣, and interleukin-8.16,17 Supported by the Deutsche Forschungsgemeinschaft (grant Bu 592/4-3). C.S. and H.W. contributed equally to this work. Accepted for publication November 30, 2004. Address reprint requests to Dr. J. Bullerdiek, Center for Human Genetics, University of Bremen, Leobenerstr. ZHG, D-28359 Bremen, Germany. E-mail: [email protected]. 1259 1260 Schlueter et al AJP April 2005, Vol. 166, No. 4 It is well documented that advanced glycation end products (AGEs) can promote angiogenesis.18,19 Okamoto and colleagues19 have cultured skin microvascular endothelial cells with AGE resulting in a stimulated growth and tube formation. This effect was enlarged with increased expression of RAGE. Similar results were obtained by Yonekura and colleagues20 who were able to show that the formation of the cord-like structure of endothelial cells induced by AGE was completely abolished by soluble RAGE. As for the molecular mechanism of AGE-induced angiogenesis the up-regulation of VEGF because of signaling via nuclear factor-B seems to be the key effect.19 Nevertheless, Taguchi and colleagues11 have attempted to exclude an angiogenetic effect of that protein by placing basic fibroblast growth factor-laden pellets into a corneal pocket. In these experiments, no differences in capillary outgrowth from the corneal limbus compared to that after treatment with the competitive inhibitor sRAGE were observed. sRAGE is a truncated variant of the RAGE receptor that binds HMGB1 and blocks the interaction with its receptor. Based on their results Taguchi and colleagues11 have concluded that RAGE blockade does not impair the process of neovascularization at all. However, the latter experimental design does not allow drawing a general conclusion about possible angiogenetic effects of HMGB1. Therefore we used a spheroid model to re-examine the effects of HMGB1 on human endothelial cells. Materials and Methods Expression and Purification of HMGB1 The full-length HMGB1 cDNA-coding region was inserted into the glutathione S-transferase (GST) fusion protein expression vector pGEX-6P1 (Amersham Biosciences, Freiburg, Germany) by ligation to SmaI and NotI restriction sites. Escherichia coli BL21, transformed with the recombinant plasmid, were grown in LB medium supplemented with 100 g/ml of ampicillin for 6 hours at 37°C as preparatory culture and 17 hours at 18°C as main culture. Expression of the GST-HMGB1 fusion protein was induced by incubation with 0.1 mmol/L IPTG for 2 hours at 18°C. The bacterial pellet was resuspended in phosphate-buffered saline (PBS) and lysed by nitrogen and lysozyme. A crude extract was separated by centrifugation and added to a 50% slurry of glutathione-Sepharose 4B equilibrated with PBS. After gentle agitation at 6°C for 45 minutes the matrix was sedimented and washed with PBS. To obtain HMGB1 fragments without GST, fusion protein was cleaved with PreScission Protease (Amersham Biosciences) at 6°C overnight with gentle agitation. The cleaved GST, bonded to the slurry, was then removed by centrifugation. The identity of HMGB1 was confirmed by sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis. As a control to exclude any sprouting activity from contaminating proteins obtained during the purification process, proteins were isolated using GST fusion protein expression vector pGEX-6P1 (Amersham Biosciences) without any cloned insert. Purification was performed as mentioned above. Cell Culture Human umbilical vein endothelial cells (Promocell, Heidelberg, Germany) were cultured according to the manufacturer’s instructions at 37°C using endothelial cell growth media and endothelial cell growth supplement. Only human umbilical vein endothelial cells cultured from passages 4 to 5 were used for experiments. Endothelial cell growth medium, endothelial cell growth supplement, and endothelial cell basal medium were purchased from Promocell. Fetal calf serum was obtained from Biochrom (Berlin, Germany). Preparation of a Collagen Stock Solution A collagen stock solution was prepared from rat tail by isolating the tendons without attached connective tissue. The tendons were transferred into 0.1% acetic acid (v/v in H2O) and stored for 48 hours at 4°C. The final solution was centrifuged at 17,000 ⫻ g, 4°C, for 1 hour and the clear supernatant was diluted to an OD 280 nm of 0.25. In Vitro Angiogenesis Assay Endothelial cells were harvested and a defined cell number (400 cells/100 l) was suspended in endothelial cell growth medium containing 0.25% (w/v) methylcellulose (Sigma, Taufkirchen, Germany) for the generation of spheroids. One hundred l/well of the cell suspension was seeded into nonadherent round-bottom 96-well plates (Greiner, Frickenhausen, Germany). Nearly all cells per well contributed to the formation of a single spheroid (400 cells/spheroid) during the 24-hour culture at 37°C. The spheroids were harvested and embedded in collagen.21 In brief, at room temperature 48 spheroids were suspended in 0.5 ml of endothelial cell basal medium containing 20% fetal calf serum and 1% (w/v) methylcellulose to prevent sedimentation of spheroids before polymerization of the collagen gel. The ice-cold collagen stock solution (8 vol) was mixed with 10⫻ M199 (1 vol; Sigma) and 0.1 N of NaOH (⬃1 vol) to adjust the pH to 7.4. Then 0.5 ml of the neutralized collagen solution was rapidly mixed with 0.5 ml of spheroid suspension and transferred into prewarmed 24-well plates. After polymerization 100 l of basal medium with 10⫻ concentrated test substance was added on top of each gel. The gels were incubated at 37°C in 5% CO2 at 100% humidity. After 24 hours and fixation with 1 ml of 10% paraformaldehyde, in vitro angiogenesis was digitally quantitated by measuring the length of the sprouts that had grown out of each spheroid (ocular grid at ⫻40 magnification, cumulative sprout length) using the digital imaging software analySIS (Soft Imaging System, Muenster, Germany). The mean and SD of the cumulative sprout length from 10 randomly selected spheroids per gel was determined (correspond- HMGB1: A Potential Angiogenetic Factor 1261 AJP April 2005, Vol. 166, No. 4 ing to one test substance). All experiments were performed twice. Statistics Statistical significance was tested using the t-test and was set at P ⬍ 0.001. Tissue Samples In the present study breast cancer samples taken directly after surgery were immunohistochemically analyzed. All patients signed an informed consent. Immunohistochemistry Immunohistochemical examination of 5-m sections of human breast cancer was performed with a goat polyclonal antibody raised against a peptide mapping within an internal region of the HMGB1 protein of human origin (sc-12523; Santa Cruz Biotechnology, Santa Cruz, CA). Immunostaining was achieved by a three-step procedure (primary antibody, secondary antibody, and avidin-biotin-complex) using the Vectastain ABC method (Vector Laboratories, Burlingame, CA). Briefly, sections of paraffin-embedded tissue were dewaxed in xylene and rehydrated in an ethanol series and finally resuspended in PBS (pH 7.4). Endogenous peroxidase activity was quenched by incubation in 0.75% H2O2 in methanol followed by a microwave pretreatment for 15 minutes with citric acid buffer (pH 6.0). After washing two times in tap water and PBS, tissue sections were incubated for 20 minutes in rabbit serum followed by incubation with the goat polyclonal HMGB1 antibody (1:100 diluted in 2% bovine serum albumin in PBS). After incubation overnight at 4°C, tissue sections were washed three times in PBS and incubated with biotin-conjugated rabbit anti-goat IgG for 30 minutes at room temperature. After further washing in PBS, they were incubated for 30 minutes with ABComplex and freshly prepared according to the manufacturer’s instructions. After final washing in PBS, the peroxidase reaction was initiated by application of diaminobenzidine solution (prepared according to the manufacturer’s instructions). The reaction was stopped after 10 minutes by washing in tap water and tissue sections were counterstained with Meyer’s hematoxylin, dehydrated, cleared, and mounted. Immunohistochemistry was evaluated using a digital camera (AxioCam; Zeiss, Göttingen, Germany). Results Immunohistochemical analysis confirmed HMGB1 expression in all macrophages within necrotic areas of the tumors tested (Figure 1). To check the specificity of secondary antibody, staining controls without the primary antibody were performed. No immunostaining for HMGB1 was visible in these controls. Furthermore, we examined possible angiogenetic effects of HMGB1 in a three-dimensional Figure 1. Immunohistochemical analysis of a necrotic area of breast cancer sample using an antibody raised against the human HMGB1 protein. a: HMGB1 is present in the nuclei and cytoplasm of the breast cancer cells next to the necrotic area. b: Magnification of boxed area of a. HMGB1 is detectable in the nuclei as well as in the cytoplasm of macrophages. Original magnifications: ⫻100 (a); ⫻400 (b). spheroid model of endothelial cell differentiation. For a better comparison of the HMGB1 sprouting effects the results were compared to the effects of VEGF, which is known to be one of the key regulators of angiogenesis. Endothelial cell spheroids of defined cell number (400 cells/spheroid) were seeded in collagen gels, stimulated with HMGB1 in different concentrations (2 g/ml, 0.4 g/ml, and 0.08 g/ml) and compared to a VEGF stimulation (25 ng/ml). The cumulative length of outgrowing capillary-like sprouts was quantitated after 24 hours. For every concentration the mean ⫾ SD measuring the average cumulative sprout lengths of 10 randomly selected spheroids per experimental group were determined. The results clearly point out that HMGB1 induces endothelial cell migration and sprouting in vitro in a dosedependent manner. In detail, there is no endothelial cell sprouting activity without HMGB1 measurable, reflecting the quiescent phenotype of the human umbilical vein endothelial cells. In contrast, sprouting activity can be stimulated strongly by exogenous HMGB1. A concentra- 1262 Schlueter et al AJP April 2005, Vol. 166, No. 4 Figure 3. A proposed model for the angiogenetic effects of HMGB1. Solid lines, released factors; dashed lines, their effects. Figure 2. Quantitative three-dimensional in vitro angiogenesis assay based on collagen gel-embedded endothelial cell spheroids treated with VEGF and HMGB1, respectively. Capillary sprouting originating from the spheroids was quantified after 24 hours using digital imaging software analysis. The average cumulative length of 10 randomly selected sprouts was calculated. tion of 2 g/ml of HMGB1 induced the outgrowth of capillary-like sprouts with an average length of 394 m. HMGB1 (0.4 g/ml) induced an average sprouting activity of 242 m and 0.08 g/ml HMGB1 an average sprouting of 221 m, respectively (Figure 2). In general, relative potency in sprouting formation produced by HMGB1 was lower than that produced by VEGF (average sprouting of 552 m), but highly significant (P ⬍ 0.0001) compared to the negative control. Comparing the HMGB1 angiogenetic effects with those of VEGF, 2 g/ml of HMGB1 induced an endothelial cell sprouting of 70%, 0.4 g/ml HMGB1 44%, and 0.08 g/ml HMGB1 40% activity, respectively. Additionally, to exclude any sprouting activity from contaminating proteins obtained during the purification process, proteins were isolated using a pGEX-6P1 vector without any cloned insert. These proteins did not show sprouting activity at all (data not shown). Discussion The initiation of angiogenesis, called the angiogenetic switch, is a crucial early step in tumor progression and propagation, ensuring an adequate oxygen supply.4,5 The rapid growth of tumors is accompanied by a reduced microvessel density, resulting in chronic hypoxia, often leading to necrotic areas within the tumor.22 These hypoxic and necrotic regions correspond to an increased expression of angiogenetic growth factors, eg, VEGF, which are capable to turn what is called the angiogenetic switch, ie, to stimulate endothelial cell growth as a step in angiogenesis.1,23 Recent studies showed that necrotic cells may attract macrophages into the tumor, which then contribute to the angiogenetic process.2 Macrophages have been shown to produce a number of potent angiogenetic cytokines and growth factors, eg, VEGF, tumor necrosis factor-␣, and interleukin-8 and constitute a key type of angiogenetic effector cells.16,24 Necrotic cells as well as activated macrophages are a source for a novel type of chemokines, the high-mobility group proteins. As to its proinflammatory activity HMGB1 is the currently best-investigated high-mobility group protein.17 Recent studies showed that HMGB1, known as an architectural chromatin-binding protein, can be extracellularly released by passive diffusion from necrotic cells and is secreted by activated macrophages.8,15,25 Further studies revealed that extracellular HMGB1 may act as a strong macrophage-activating factor when binding to the receptor for advanced glycation end products (RAGE).17 RAGE is a multiligand receptor with advanced glycation end products (AGEs) constituting a major group of ligands. Among the effects of an engagement of RAGE by AGEs are proangiogenetic effects on vascular endothelial cells as for example, their tube formations. This effect is mediated by the induction of VEGF via nuclear factor-B signaling.19 Accordingly, it seems well reasonable to assume that yet another ligand of RAGE, HMGB1, can also act as an angiogenetic switch molecule. This is the first report showing that HMGB1 can induce sprouting of endothelial cells. To examine the angiogenetic effects of HMGB1 on endothelial cells a spheroid model of endothelial cells in vitro was used. The results of the endothelial-sprouting assay clearly show that exogenous HMGB1 induces endothelial cell migration and sprouting in vitro in a dose-dependent manner. In vivo two sources of HMGB1 exist: necrotic cells and macrophages. Two different ways for the angiogenetic function of HMGB1 can be postulated. One mechanism could be an indirect effect via the activation of macrophages, resulting in secretion of angiogenetic factors as, for example, VEGF, tumor necrosis factor-␣, and interleukin-8.16,17 Secondly, HMGB1, acting as an angiogenetic factor itself, can actively be released by activated macrophages and necrotic cells (Figure 3).8,25 Our knowledge of the signaling mechanism by which HMGB1 activates endothelial cells and macrophages is still incomplete.17 One possible signaling way could be through its receptor for advanced glycation end products, RAGE, which is expressed, for example, in endothelial cells.26,27 Apart from HMGB1-receptor interactions, it has been demonstrated that HMGB1 binds to many membrane molecules, possibly stimulating angiogenetic effects.28,29 Our results, revealing an angiogenetic effect of HMGB1, are in contrast to an interpretation by Taguchi and colleagues11 placing basic fibroblast growth factorladen pellets into a corneal pocket, and observing capillary growth from the corneal limbus compared to that after treatment with sRAGE. Taguchi and colleagues11 showed that the interaction between HMGB1 and its receptor RAGE has no effect on neovascularization in the fibroblast growth factor-mediated angiogenesis pathway. HMGB1: A Potential Angiogenetic Factor 1263 AJP April 2005, Vol. 166, No. 4 Either it could be that the RAGE/HMGB1 interaction does not play a significant role in fibroblast growth factormediated angiogenesis or the angiogenetic effect of HMGB1 is masked in this case by stronger effects of other angiogenetic factors not examined in that study. Nevertheless this is the first report that shows an angiogenetic effect of HMGB1. It remains to be investigated if this is solely because of the induction of VEGF or if there are other effects supporting the role HMGB1 as an angiogenetic switch molecule. 14. 15. 16. 17. References 1. Pugh CW, Ratcliffe PJ: Regulation of angiogenesis by hypoxia: role of the HIF system. Nat Med 2003, 9:677– 684 2. 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Exp Cell Res 1992, 200:444 – 451 Bianchi ME: Interaction of a protein from rat liver nuclei with cruciform DNA. EMBO J 1988, 7:843– 849 X) Molecular characterization and mapping of the canine cyclin D1 (CCND1) gene Meyer B, Murua Escobar H, Winkler S, Dolf G, Schelling C, Bullerdiek J, Nolte I Anim Genet 35: 413 (2004) Eigenanteil: - Planung, Durchführung und Auswertung der Studie mit Ausnahme des BACScreenings, welches von G. Dolf und C. Schelling durchgeführt wurde, und des FISH-Mappings, welches von S. Winkler durchgeführt wurde - Verfassen der Veröffentlichung Brief notes doi:10.1111/j.1365-2052.2004.01172.x Molecular characterization and mapping of the canine cyclin D1 (CCND1) gene B. Meyer*, H. Murua Escobar*,†, S. Winkler*, G. Dolf‡, C. Schelling§, J. Bullerdiek* and I. Nolte† *Center for Human Genetics, University of Bremen, Bremen, Germany. †Small Animal Clinic, School of Veterinary Medicine, Hanover, Germany. ‡Institute of Animal Genetics, Nutrition and Housing, University of Berne, Berne, Switzerland. §Department of Animal Science, Swiss Federal Institute of Technology Zurich and Faculty of Veterinary Medicine, University of Zurich, Zurich, Switzerland Accepted for publication 23 June 2004 Introduction: Cyclin D1, also known as PRAD1 or BCL-1, acts as regulator of progression through the G1 phase during the cell cycle by activation of cyclin-dependent kinases CDK4 and CDK6. In humans overexpression of cyclin D1, partially due to gene amplification, has been found in a wide variety of cancers, including breast cancer.1 Sequence analysis: For characterization of the canine CCND1 gene and the corresponding protein, cDNA from a canine osteosarcoma was screened with primers specific for the ORF of human cyclin D1 (GenBank accession no. NM_053056; primer pair CYCup: CGA TGC CAA CCT CCT CAA CGA, CYClo: TGT GGC ACA AGA GGC AAC GAA). After cloning and sequencing of the amplification product two additional primer sets were used to amplify the complete ORF (primer pairs Cyc1up: CAC ACG GAC TAC AGG GGA GT, Cyc333doglo: GCA CAC ACT TGA AGT AGG ACA C and Cyc695dogup: ACA CTT CCT CTC CAA GAT GCC, AP2: AAG GAT CCG TCG ACA TCT TTT TTT TTT TTT TTT T). Sequence analyses allowed the composition of a 1246 bp cDNA contig (GenBank accession no. AY620434), showing 90.4% sequence identity of the canine ORF compared with the human counterpart. In accordance with the human orthologue the deduced canine protein comprises 295 AA with 93.3% similarity between the two species. BAC library screening: For use as FISH probe, a BAC clone was PCR-screened from the DogBAC library (http://www.dogmap.ch) with primers designed using human CCND1 DNA sequence GenBank accession no. L09054 (primer pair CYCup: CGA TGC CAA CCT CCT CAA CGA, CYCint1lo: GAA ACG TGG GTC TGG GCA ACA). The obtained positive BAC clone (DogBAC library ID S041P23D08) was verified by PCR, cloning and subsequent sequencing. Gene mapping: For mapping of the chromosomal location of the canine CCND1 gene, metaphase preparations and fluorescence in situ hybridization (FISH) were performed as described previously.2 G-banded chromosomes were identified according to Reimann et al.3 Ten well-spread metaphases were analysed exhibiting a signal on CFA17 on both chromatids of both chromosomes (Fig. 1). Comments: During the last decade the dog has gained in importance as a model organism for the investigation of mechanisms underlying human genetic disease, including cancer. Immunohistochemical analyses of cyclin D1 expression in canine mammary tumours using a polyclonal antibody against human cyclin D1 revealed contradictory data. Murakami et al.4 found cyclin D1 expression in only two adenocarcinomas of 75 mammary lesions tested whereas Sfacteria et al.5 detected cyclin D1 in 60% of pre-cancerous lesions and 44% of cancerous lesions of the canine mammary gland with correlation of proliferative ratio and cyclin D1 expression. Mapping and sequencing of the canine CCND1 gene and corresponding protein could help to elucidate the role of cyclin D1 in dogs and its usefulness as model organism concerning this matter. Yang et al.6 found no conservation of synteny between HSA11, where the human CCND1 maps, and CFA17. This discordance could be due to small rearrangements, deletions and insertions existing in the dog.7 References 1 Ormandy C. J. et al. (2003) Breast Cancer Res Treat 78, 323– 35. 2 Murua Escobar H. et al. (2001) Cytogenet Cell Genet 94, 194–5. 3 Reimann N. et al. (1996) Cytogenet Cell Genet 73, 140–4. 4 Murakami Y. et al. (2000) J Vet Med Sci 62, 743–50. 5 Sfacteria A. et al. (2003) J Comp Pathol 128, 245–51. 6 Yang F. et al. (1999) Genomics 62, 189–202. 7 Guyon R. et al. (2003) Cold Spring Harb Symp Quant Biol 68, 171–8. Correspondence: Prof. Dr Ingo Nolte (inolte@klt. tiho-hannover.de) Figure 1 Canine metaphase spread after GTGbanding (a) and the same metaphase after FISH with BAC S041P23D08 showing signals on both chromosomes 17 (b). 2004 International Society for Animal Genetics, Animal Genetics, 35, 408–423 413 XI) The canine NRAS gene maps to CFA 17 Richter A, Murua Escobar H, Günther K, Meyer B, Winkler S, Dolf G, Schelling C, Nolte I, Bullerdiek J Anim Genet 35: 355-356 (2004) Eigenanteil: - Klonierung eines NRAS PCR-Produktes für das BAC-Screening Brief notes canine AKT3 gent to CFA 7q17 and defined the chromosomal band following the nomenclature established by Reimann et al.6 References 1 Masure S. et al. (1999) Eur J Biochem 265, 353–60. 2 Nicholson K. M. et al. (2002) Cell Signal 14, 381–95. 3 Schelling C. et al. (2002) J Anim Breed Genet 119, 400–1. 4 Murua Escobar H. et al. (2001) Cytogenet Cell Genet 94, 194–5. 5 Yang F. et al. (1999) Genomics 62, 189–202. 6 Reimann N. et al. (1996) Cytogenetics Cell Genetics 73, 140–4. Correspondence: J. Bullerdiek ([email protected]) doi:10.1111/j.1365-2052.2004.01158.x The canine NRAS gene maps to CFA 17 A. Richter*, H. Murua Escobar*,†, K. Günther*, B. Meyer*, S. Winkler*, G. Dolf‡, C. Schelling§, I. Nolte† and J. Bullerdiek* *Centre for Human Genetics, University of Bremen, Bremen, Germany. †Small Animal Clinic, School of Veterinary Medicine Hanover, Hanover, Germany. ‡Institute of Animal Genetics, Nutrition and Housing, University of Berne, Berne, Switzerland. § Department of Animal Science, Swiss Federal Institute of Technology Zurich, Faculty of Veterinary Medicine, University of Zurich, ETH-Zentrum, Zurich, Switzerland Accepted for publication 1 May 2004 Figure 1 Metaphase spread after fluorescence in situ hybridization with signals on both chromosome 7s (above) and GTG- banding (below). cloned and sequenced for verification of AKT3 with BAC clone 10C05-4. Fluorescence in situ hybridization: Metaphase preparations and fluorescence in situ hybridization (FISH) were performed as described previously.4 Ten metaphases were examined and all demonstrated hybridization of the AKT3 probe on both chromatids of canine chromosome 7 (Fig. 1). Comments: It has been reported that canine chromosome 7 shares homology with human chromosomes (HSA) 1 and 18. The long (q) arm of CFA7 corresponds to the homologous region on HSA1, whereas the homologous regions with HSA18 are distributed over both arms of CFA7.5 The human AKT3 gene is located at HSA 1q43–44. According to Yang et al.,5 this region shares homology with CFA7. We mapped the Introduction: The dog is an emerging model organism for the investigation of mechanisms involved in human disease, including cancer. Several parallels in human and canine tumours have been described, with comparable environmental living conditions and age of tumour onset in both human and canine patients as well as similarities in development and histology of tumours in both species.1 NRAS is a member of the ras proto-oncogene family of proteins that act in growth-related signal transduction and are frequently involved in the development of human tumours, with ras point mutations being one of the most important alterations in the onset of malignancies.2 Ras genes show high sequence similarity across different mammalian species such as human, cat, dog, cattle and rodents, with most nucleotide differences representing synonymous changes not affecting the amino acid sequence.3 In malignancies, most amino acid exchanges in ras genes are caused by alterations of the so-called hot spot codons 12, 13, and 61 in exons 1 and 2, respectively, leading to constitutively active ras proteins that bring about constant signal transduction, facilitating uncontrolled cell division. These hot-spot codons have been described to be affected in other mammalian species as well. In dogs, NRAS mutations were found in lymphomas4 and malignant melanomas.5 The canine NRAS gene had not been mapped so far, therefore, in this study we localized the chromosomal location of the canine NRAS gene by fluorescence in situ hybridization (FISH). 2004 International Society for Animal Genetics, Animal Genetics, 35, 350–359 355 356 Brief notes Figure 1 Metaphase spread after fluorescence in situ hybridization showing signals on both chromosomes 17 (right) and the same metaphase after GTG-banding (left). BAC library screening: In order to isolate a FISH probe, the DogBAC canine BAC library6 (http://www.dogmap.ch/) was polymerase chain reaction (PCR)-screened. Primers were designed using canine mRNA sequence GenBank accession no. U62093 (primer UP: GACTGAGTACAAACTGGTGG and primer LO: GGGCCTCACCTCTATGGTG). The PCR conditions were established on canine blood genomic DNA, the corresponding PCR product cloned and verified by sequencing. The positive BAC clone (DogBAC library ID S050P24H09) was verified by PCR and sequencing. Gene mapping: For mapping the chromosomal location of the canine NRAS gene, metaphase preparations and FISH were performed as described previously.7 Ten well spread metaphases exhibited a signal on CFA 17 on both chromatids of both chromosomes (Fig. 1), following the nomenclature of the canine karyotype as established by Reimann et al.8 Comments: NRAS mutations in humans have been found in 30% of liver tumours, 40% of myelodysplastic syndrome, 30% of acute myelogenous leukaemia, 13% of brain tumours and in 53% of follicular and 60% of undifferentiated papillary thyroid tumours.9 In dogs, depending on tumour type, comparable occurrences exist in malignant melanomas,5 while fibrosarcomas showed no amino acid alteration of the NRAS protein (H. Murua Escobar, K. Günther, A. Richter, J. T. Soller, S. Winkler, I. Nolte & J. Bullerdiek 2004, personal communication). Overall, data available on involvement of ras protooncogenes in tumours of dogs are still insufficient. Knowledge of the cytogenetic properties of NRAS will further the understanding of this important gene. The mapping results obtained in this study are in accordance with the known homology between canine chromosome 17 and the centromer-proximal regions 11.1–13.3 of the p-arm of human chromosome 1.10 References 1 Hahn K A. et al. (1994) In Vivo 8, 133–43. 2 Arber N. (1999) Apoptosis 4, 383–8. 3 Watzinger F. et al. (1998) Mamm Genome 9, 214–9. 4 5 6 7 8 9 10 Mayr B. et al. (2003) Acta Vet Hung 51, 91–4. Mayr B. et al. (2003) Vet J 165, 169–71. Schelling C. et al. (2002) J Anim Breeding Genet 119, 400–1. Becker K. et al. (2003) Anim Genet 34, 68–9. Reimann N. et al. (1996) Cytogenet Cell Genet 73, 140–4. Spandidos D. A. et al. (2002) Int J Oncol 21, 237–41. Yang F. et al. (1999) Genomics 62, 189–202. Correspondence: J. Bullerdiek ([email protected]) doi:10.1111/j.1365-2052.2004.01159.x Linkage mapping of chicken ovoinhibitor and ovomucoid genes to chromosome 13 K. Kinoshita*, T. Shimogiri†, S. Okamoto†, K. Yoshizawa‡, H. Mannen‡, H. R. Ibrahim†, H. H Cheng§ and Y. Maeda† *The United Graduate School of Agricultural Sciences, Kagoshima University, Korimoto, Kagoshima 890-0065, Japan. †Faculty of Agriculture, Kagoshima University, Korimoto, Kagoshima 8900065, Japan. ‡Faculty of Agriculture, Kobe University, Nada-ku, Kobe 657-8501, Japan. §United States Department of Agriculture, Agriculture Research Service, East Lansing, MI 48823, USA Accepted for publication 10 May 2004 Source/description: Ovoinhibitor (OIH) and ovomucoid (OVM) are the major proteinase inhibitors constituting 1.5 and 11% of the total proteins in hen egg white, respectively. Although OVM exerts its antiprotease activity only against trypsin, OIH has a wide spectrum of inhibitory activity for other proteinases that occur in chicken egg white and blood plasma.1 They are functionally similar proteins and having multiple domains with a characteristic pattern of disulphide bridges.1 From the analysis of DNA sequences and the positions of exons and introns, it 2004 International Society for Animal Genetics, Animal Genetics, 35, 350–359 Anhang 154 10 Anhang 10.1 Tabellen Tab. 1: Klinische Daten der 22 Mammakarzinompatientinnen, deren peripheres Blut vor (-1) und während (-2) der Therapie mittels Real-time RT-PCR auf ihre HMGA2-Expression untersucht wurde. n.d. - not determined (Daten nicht bekannt); PR - partial response (Teilremission), CR - complete response (Vollremission), SD - stable disease (Stabilisierung). Patient 01-1 01-2 02-1 02-2 03-1 03-2 04-1 04-2 05-1 05-2 06-1 06-2 07-1 07-2 08-1 08-2 09-1 09-2 10-1 10-2 11-1 11-2 12-1 12-2 13-1 13-2 14-1 14-2 15-1 15-2 16-1 16-2 17-1 17-2 18-1 18-2 19-1 19-2 20-1 20-2 21-1 21-2 22-1 22-2 Alter 38 42 38 62 67 68 76 62 54 59 73 67 42 51 54 49 58 60 44 51 74 85 Tumor invasiv duktal invasiv duktal invasiv duktal invasiv duktal szirrhös invasiv duktal invasiv duktal invasiv duktal invasiv duktal invasiv duktal Adeno-Ca invasiv papillär invasiv duktal invasiv duktal invasiv duktal invasiv duktal invasiv duktal invasiv duktal invasiv duktal invasiv duktal invasiv lobulär invasiv duktal Grade TNM (initial) ER PR Her2 Stadium Ansprechen 3 n.d. n.d. n.d. nd neoadjuv PR neg 3+ neoadjuv CR neg 3+ neoadjuv CR pos 3+ metast PR ypT1a ypN0 (0/12) neg cM0 pL0 pV0 ypTx ypN0 (0/14) neg 3 cM0 pL0 pV0 GX RX pT3 pN1biii (4/12) M0 pos 2 bis 3 G2-3 3 2 pT1 N1 (5/8) M0 G2 pos pos 3+ metast SD n.d. ypT3 pN2a (5/5) M0 L0 V0 R0 pos neg 2+ neoadjuv PR 3 pT2 pN1biii M0 pos pos 3+ metast SD n.d. pT2 pN0 M0 pos pos 1+ metast SD 3 pT4 pN1biii G3 pos neg neg metast SD n.d. pT1 pN1 (3/10) M0 neg neg 1+ metast SD n.d. n.d. pos neg 3+ metast SD neg neg 1+ metast SD neg neg neg neoadjuv PR neg neg 3+ metast SD neg neg 3+ neoadjuv PR pos pos 3+ metast PR pos pos 1+ metast CR pos n.d. neoadjuv PR pos 1+ neoadjuv SD neg 1+ metast PR pT1c R0 G2 pN1bi (1/21) M0 ypT1b ypN3a (22/23) 3 M0 G3 R0 pt1c(m) pN1bii (5/18) 3 M0 G3 ypT0 N1a (1/8) R0 2 bis 3 M0 ypT4d pN1biii (2/22) 2 G2 L1 R0 2 n.d. 2 2 3 pT2 N1b N0 pT3 pN0 M0 G1-2 L1 pos R1 ypT3, pN2a (6/11) R0 pos G2 M0 pT2 (1c) pN0 M0 G3 neg L1 2 cT4 Nx M1 G2 neg neg neg metast PR 2 pT1 pN1b M0 G2 n.d. n.d. n.d. metast PR Anhang 155 Tab. 2: Patientendaten und Ergebnisse der HMGA2-Expressionsanalyse mittels quantitativer Real-time RT-PCR im peripheren Blut von Patienten mit unterschiedlichen Diagnosen sowie von gesunden Probanden (Z.n. - Zustand nach). Diagnose Transkriptmenge / 250 ng Gesamt-RNA 5.809 Probe Alter 01 59 03 73 04 72 CLL unter Endoxan-Behandlung Glomerulonephritis unter Cortison-Behandlung, Z.n. geheiltem Merkelzelltumor progredientes follikuläres Lymphom, Z.n. Kolonkarzinom 06 60 Lupus erythematodes 4.174 07 58 Lupus erythematodes unter MTX- u. Cortisonbehandlung 5.279 09 67 diffuse Knochenmetastasierung 6.609 10 64 Pankreaskarzinom 4.073 11 56 kongenitales gemischtes variables Immundefektsyndrom 1.126 12 86 Z.n. geheiltem hochmalignen Lymphom 3.183 13 71 MDS 8.221 14 61 follikuläres Lymphom 6.018 15 58 follikuläres Lymphom 5.681 16 67 rheumatoide Arthritis, Z.n. M.Hodgkin geheilt 8.701 17 33 Lymphom, bisher unklassifiziert 4.361 18 31 Immunthrombozytopenie 15.131 19 41 familiäres Immundefektsyndrom (B-Zell-Defekt) 7.380 20 18 familiäres Immundefektsyndrom (B-Zell-Defekt) 9.734 21 69 hochmalignes Lymphom in Remission 6.247 22 24 Sarkoidose 5.427 23 79 ossär metastasiertes Mammakarzinom 8.277 24 70 Autoimmunthrombozytopenie 5.097 25 58 ossär metastasiertes Mammakarzinom 9.580 26 45 Langerhanshistiozytose 7.393 27 54 Lupus erythematodes mit Myositis 6.845 28 58 follikuläres Lymphom Grad II 8.556 30 47 gesund 6.940 31 51 gesund (Asthma bronchiale) 4.441 32 43 gesund (Diabetes mellitus) 5.202 33 57 gesund (Hepatitis B nicht aktiv) 4.779 34 31 gesund 4.702 35 28 gesund 5.599 36 43 gesund (Mammakarzinom geheilt) 9.076 40 33 Takayasu-Syndrom 6.126 41 66 cutanes B-Zell-Lymphom 5.363 42 71 gemischtes variables Immundefektsyndrom 10.608 43 18 Z.n. geheiltem M. Hodgkin 6.988 44 31 M. Behçet 4.731 45 36 CML in Akzeleration 46 63 Lupus erythematodes 7.705 12.070 157.506 4.187 Anhang 156 Diagnose Transkriptmenge / 250 ng Gesamt-RNA 5.034 Probe Alter 47 65 sekundäres hochmalignes Lymphom 48 58 follikuläres Lymphom Grad I 5.285 49 68 metastasiertes Mammakarzinom 9.773 50 69 Merkel-Zellkarzinom 3.340 Anhang 157 Tab. 3: Klinische Daten zu den mittels quantitativer Real-time RT-PCR auf ihre HMGA2-Expression untersuchen Blutproben von Patienten mit Erkrankungen des hämatopoetischen und lymphatischen Systems. Probe Alter Diagnose B1 29 ALL nach Transplantation, jetzt: GvH Zellzahl [109/l] 11,1 B2 66 Haarzellleukämie 1,7 B3 59 CLL 30,9 B4 56 5,9 B5 61 AML M5a, später Rezidiv mit 85,5 G/l CML 8,9 B6 B8 44 34 ALL L2 ALL/AML (M6/c-ALL) 5,8 7,0 B13 B14 70 66 4,5 13,1 B15 B16 B17 66 69 61 B18 B21 65 84 MDS (refraktäre Anämie) CML, später verstorben im septischen Schock AML M2 AML M4 nach MDS, niedrigzellig ALL (Burkitt-Typ/c-ALL mit schwacher Expression Myeloperoxidase) CLL mit Hämolyse AML nach MDS 13,2 2,2 B22 B24 B25 64 72 68 CML in Blastenkrise, später verstorben MDS mit Panzytopenie CML 40,0 2,4 5,5 B26 B28 B29 68 96 69 AML M2 AML M1, später verstorben AML M2, später verstorben 9,6 10,0 2,2 5,8 1,4 2,9 Art der Therapie Therapiedauer a) Polychemotherapie b) Hochdosistherapie mit allogener Stammzelltransplantation c) Glukokortikoide und Cyclosporin a) α-Interferon b) α-Interferon c) Cladribin (=Leustatin) a) Chlorambucil b) Cyclophosphamid (=Endoxan), Oncovin, Prednisolon c) Fludarabin a) Polychemotherapie a) ab 02/03 b) 08/03 c) jetzt a) 11/95-11/96 b) 06/97-12/98 c) seit 01/00 a) 06/03-11/03 b) 02/04-06/04 c) 10/04-12/04 a) 04/04-08/04 a) α-Interferon + Hydroxyurea b) Hydroxyurea a) Polychemotherapie a) Polychemotherapie b) ZNS- Bestrahlung a) Cyclosporin a) Hydroxyurea b) Imatinib (=Glivec) a) Polychemotherapie vor Therapie vor Therapie a) 02/95-02/00 b) seit 02/00 a) 03/91-12/93 a) 02/99- 02/01 b) 04/99-06/99 a) seit 08/04 a) 10(04-11/04 b) seit 18.1.04 a) seit 08/03 a) Fludarabin a) bei MDS b) nach Übergang in AML: Idarubicin a) Hydroxyurea vor Therapie a) Hydroxyurea b) Imatinib (=Glivec) vor Therapie vor Therapie vor Therapie a) 10/04-12/04 a) 01/04-05/04 b) seit 11/04 a) seit 03/04 a) 12/02-02/03 b) seit 02/03 Anhang 158 Probe Alter Diagnose Art der Therapie 39 67 80 67 44 68 AML M5a nach Polyzythämie, später verstorben c-ALL AML nach MDS AML M5, später verstorben prä-B-ALL AML M4 AML M5 Zellzahl [109/l] 1,8 B31 71 B32 B33 B34 B35 B36 B37 4,8 1,2 2,9 2,5 17,0 6,2 B41 B43 B46 B47 B49 B50 B52 24 68 61 83 62 57 85 Morbus Hodgkin großzelliges B-Zell-Lymphom Plasmozytom extranodales Marginalzonen-B-Zelllymphom Hochmalignes B-Zelllymphom Plasmozytom AML nach MDS 12,4 6,1 3,8 9,8 3,7 11,5 70,0 B53 B54 74 57 AML M4 CLL 1,3 5,0 B57 B58 B60 B61 B62 B64 68 75 54 66 51 42 CML Polycythämie CML IgG-Gammopathie AML M1 hochmalignes Lymphom 6,5 76,1 3,0 4,2 8,0 9,1 B65 B66 B68 C1 48 57 74 55 IgG-Plasmozytom Polycythämie primäre Thrombozythämie CML in Remission 3,0 3,4 4,1 6,2 C2 41 CML in chronischer Phase 1,4 vor Therapie vor Therapie vor Therapie vor Therapie vor Therapie a) Polychemotherapie b) Rezidiv:keine Therapie vor Therapie vor Therapie a) Melphalan vor Therapie a) Polychemotherapie vor Therapie a) Cyclosporin b) Idarubicin vor Therapie a) Fludarabin b) Cyclophosphamid, Vincristin, Prednison a) Hydroxyurea a) Hydroxyurea a) α-Interferon a) Melphalan a) Polychemotherapie a) Polychemotherapie mit Stammzelltransplantation b) Polychemotherapie mit Stammzelltransplantation (Rezidiv) a) Idarubicin und Dexamethason a) Hydroxyurea a) Hydroxyurea a) Hydroxyurea b) Imatinib a) Hydroxyurea b) Imatinib c) AMN 107 Therapiedauer vor Therapie a) 11/96-11/99 b) jetzt a) bis 06/05 a) 05-10/04 a) 01-05/04 b) seit 11/04 a) 12/02-03/03 b) 04/03-09/03 a) seit 08/04 a) seit 05/01 a) seit 10/02 a) seit 05/05 a) 01/95-02/96 a) 04-08/94 b) 05-08/03 a) seit 09/05 a) seit 08/05 a) seit 04/05 a) 04/03-06/03 b) seit 07/03 a) 06/04 b) 07/04-03/06 c) seit 03/06 Anhang 159 Probe Alter Diagnose C3 C4 18 62 CML in Akzeleration CML in Remission Zellzahl [109/l] 165,0 4,8 C5 45 CML in chronischer Phase 6,2 C6 53 CML in chronischer Phase 4,4 C7 47 CML in Remission 3,9 Art der Therapie Therapiedauer vor Therapie a) Hydroxyurea b) Imatinib a) Hydroxyurea b) Imatinib a) Hydroxyurea b) Imatinib a) Imatinib a) seit 09/05 b) seit 09/05 a) seit11/05 b) seit 11/05 a) 01/06-02/06 b) seit 02/06 a) seit 03/03 Anhang 160 Tab. 4: Daten zu mittels FACS aufgereinigten mononukleären Zellen (MC) aus peripherem Blut (PBMC) oder aus Knochenmark (KM) von fünf AML-Patienten und zwei APL- (NB4) bzw. AML- (HL-60) Zelllinien Patient 2811 2555 2521 2440 2439 NB4 HL-60 Alter 78 51 76 69 - Art der Zellen PBMC PBMC PBMC MC (aus KM) PBMC akute Pomyelozyten Leukämie (APL) akute myeloische Leukämie (AML) FACS-Reinheit CD34+ 48%, CD33+ 37% CD34+ 90% CD34+ 25%, CD33+ 30% CD33+ 90% CD34+ 33% - Anhang 10.2 161 Abbildungen Abbildung 1: 8.00 7.00 Relative Transkriptmenge 6.00 5.00 4.00 3.00 2.00 1.00 22-2 22-1 19-2 19-1 18-2 18-1 16-2 16-1 15-2 15-1 14-2 14-1 13-2 13-1 12-2 12-1 09-2 09-1 08-2 08-1 07-2 07-1 05-2 05-1 04-2 04-1 03-2 03-1 02-2 02-1 01-2 01-1 0.00 Proben-Nr. Abb. 1: Relative HMGA2-Transkriptmengen im peripheren Blut von 22 Mammakarzinompatientinnen vor (-1, in gelb dargestellt) und während (-2, in rot dargestellt) der Therapie. Als Kalibrator dient jeweils die Probe vor Therapiebeginn. Anhang 162 Abbildung 2: 180000 Absolute Transkriptmenge / 250 ng Gesamt-RNA 160000 140000 120000 100000 80000 60000 40000 20000 0 1 3 4 6 7 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 30 31 32 33 34 35 36 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 Probennummer Abb. 2: Absolute HMGA2-Transkriptmengen pro 250 ng Gesamt-RNA im peripheren Blut von Patienten mit unterschiedlichen Diagnosen (rot dargestellt) und von gesunden Probanden (gelb dargestellt). ne sL y Po mph AM lyzy om t B6 CL L na häm ie 4 L m ch B M 66 it D CM Häm S B 21 L c oly se Mo h rbu ronis B18 CM s Ho ch C L c dgk 02 in h Pla ronis B41 ch sm Pla ozy C06 sm tom ex oz tra yto B50 IgG no m da Ga B C les CM mm ML 46 Ma L op B2 in rgi a 5 th Re na lzo mi ie B ss 61 ne i o n-B AM n C -Z L M 04 IgG ell-L 1 ho ch Pla ymp B62 ma ho sm m lign oz yto B4 7 es m B-Z B ell -Ly CLL 63 B5 mp 4 h AM om L M B49 MD 4B CM S, 3 ref L ch CML 6 ron ra k B6 t CM äre isch 0 Li n R Anäm C05 em ie B1 iss 3 AM ion C MD L M 07 Sm it P AM 1 B2 L an 8 pri zy M 5 mä top B3 re 7 e n Th i A gro rom ML e B2 ßz 4 M2 elli Haa ozyt B2 ge h 9 s B rzelll ämi -Ze euk e B 68 ll-L äm ym ie B ph 0 2 o AL m B 43 LL 2 AM B0 L 6 CM AM M4 B Li 5 L n M2 3 Re AL Ln mi ss B15 ac ion hT C ran sp CML 01 lan B 5 t AM ation 7 L M B0 IgG 5a 1 B0 Pla sm CLL 4 oz B0 y AL tom 3 L/A B ML 65 B CM 08 LB Po 0 lyz ALL 5 yth B AM äm 17 LM ie B5 4n C 8 ac ML h M B1 4 AM DS B CM 1 L L i prä- M5 6 nA B B kz -ALL 34 ele rat B35 AM ion C AM L M 03 LM 2B A 5 n ML n AL 2 6 ac a L c hP h B oly MD 32 S CM AML zythä B5 2 m L m nac it B h M ie B3 1 DS las ten B3 kri 3 se B2 2 ho ch ma lig Absolute HMGA2 -Transkriptmenge / 250 ng Gesamt-RNA Anhang 1.00E+06 163 Abbildung 3: 1.00E+07 vor Therapie unter Therapie nach Therapie 1.00E+05 1.00E+04 1.00E+03 1.00E+02 1.00E+01 1.00E+00 Diagnosen Abb. 3: Logarithmische Darstellung der absoluten HMGA2-Transkriptmengen pro 250 ng Gesamt-RNA in Blutproben von Patienten mit Erkrankungen des hämatopoetischen und lymphatischen Systems. Blau dargestellt sind Patienten, welche noch keine Therapie erhalten haben, rot markiert sind Patienten unter Therapie und grau solche Patienten, welche sich zur Zeit der Blutentnahme nicht mehr in Therapie befanden. AM Ln CL L m ach M it H DS B2 CM ämo 1 lys Lc eB h ro 18 nis ch ge C02 su n ge d 31 su n CM ge d 34 Lc su nd h ro 3 nis ch 3 ge C06 su n ge d 32 su CM nd Li CM 35 nR L em iss B25 i AM on C L M 04 1B 62 ge su nd CL 30 AM L B5 LM 4 4B CM 3 CM 6 CM L ch LB ro Li n R nisc 60 h em iss C05 ion AM C L M 07 1B 28 ge s AM und L M 36 AM 5 B L M 37 2B AL L L 29 AM 2 B L M 06 CM AM 4 B Li n R L M 53 2 AL em Ln iss B15 ac i o n hT C ran CM 01 sp lan L B5 ta 7 AM tion L M B01 5a B CL 04 LB AL L/A 0 ML 3 B0 CM 8 LB 0 5 AL AM LB LM CM 17 4n L ac h M B14 DS AM B L M 16 CM p r ä -B 5 B Li 34 nA -A LL kz ele B 35 rat i AM on C L M 03 AM 2B LM AM Ln AL 2 6 5n L a ac h P ch M B32 oly DS zy A thä B52 CM ML mi L m nac eB it B h M 31 DS las ten B3 3 kri se B2 2 Absolute HMGA2 -Transkriptmenge / 250 ng Gesamt-RNA Anhang 164 Abbildung 4: 1.00E+07 1.00E+06 vor Therapie unter Therapie nach Therapie Gesunde 1.00E+05 1.00E+04 1.00E+03 1.00E+02 1.00E+01 1.00E+00 Diagnosen Abb. 4: Logarithmische Darstellung der absoluten HMGA2-Transkriptmengen pro 250 ng Gesamt-RNA in Blutproben von Leukämiepatienten im Vergleich zu gesunden Probanden (gelb). Blau dargestellt sind Patienten, welche noch keine Therapie erhalten haben, rot markiert sind Patienten unter Therapie, grau solche Patienten, welche sich zur Zeit der Blutentnahme nicht mehr in Therapie befanden. ge su nd 31 ge su nd 34 ge C M s un L ch d ro 33 ni sc h C 06 ge su nd 32 ge su nd C M 35 L C in M L Re B2 m 5 iss io n C 04 ge su nd 30 C C M M L L ch C B6 M ro 0 L ni in sc h Re C m 05 iss io n C C M 07 ge L in su Re nd m 36 iss io n C 01 C M L B5 7 C M L C B0 M 5 L C in M L Ak C M B1 ze L 4 le in ra Ak C tio M ze n L l 45 e m ra it t i Bl on as C te 03 nk ris e B2 2 Absolute HMGA2 -Transkriptmenge / 250 ng Gesamt-RNA Anhang 165 Abbildung 5: 1.00E+07 1.00E+06 Patienten Gesunde 1.00E+05 1.00E+04 1.00E+03 1.00E+02 1.00E+01 1.00E+00 Diagnosen Abb. 5: Logarithmische Darstellung der absoluten HMGA2-Transkriptmengen pro 250 ng Gesamt-RNA von CML-Patienten (rot) im Vergleich zu gesunden Probanden (gelb). Anhang 166 1.00E+07 1.00E+06 1.00E+05 vor Therapie unter Therapie nach Therapie Gesunde 1.00E+04 1.00E+03 1.00E+02 1.00E+01 M D S B2 ge 1 su nd 31 ge su nd 34 ge su nd 33 ge su nd 32 ge su AM nd 35 L M 1 B6 ge 2 su AM nd 30 L M AM 4 B 36 L M 1 B2 ge 8 su AM nd 36 L M AM 5 B 37 L M AM 2 B 29 L M AM 4 B 53 L M 2 AM B1 L 5 M 5a AM AL B0 L L/ M AM 4 4 na L ch B0 8 M D S AM B1 6 L M AM 5 B3 L AM AM M 4 L L 5 M na na 2 ch B2 ch 6 M Po D ly S zy B AM th äm 52 L na ie B3 ch 1 M D S B3 3 1.00E+00 AM L na ch Absolute HMGA2 -Transkriptmenge / 250 ng Gesamt-RNA Abbildung 6: Diagnosen Abb. 6: Logarithmische Darstellung der absoluten HMGA2-Transkriptmengen pro 250 ng Gesamt-RNA in Blutproben von AML-Patienten im Vergleich zu gesunden Probanden (gelb). Blau dargestellt sind Patienten, welche noch keine Therapie erhalten haben, rot markiert sind Patienten unter Therapie und grau solche Patienten, welche sich zur Zeit der Blutentnahme nicht mehr in Therapie befanden. 167 Abbildung 7: Absolute HMGA2 -Transkriptmenge / 250 ng Gesamt-RNA 1,20E+06 1.027.741 1,00E+06 938.769 827.466 8,00E+05 574.453 6,00E+05 494.370 4,00E+05 2,00E+05 144.781 7.251 0,00E+00 2811 2555 2521 2440 2439 NB4 HL-60 Mononukleäre Zellen und Zelllinien Abb. 7: Absolute HMGA2-Transkriptmengen pro 250 ng Gesamt-RNA in mittels FACS aufgereinigten mononukleären Zellen von fünf AML-Patienten bzw. in einer APL- (NB4) und einer AML-Zelllinie (HL60).