Praktikum: Angewandte Bioinformatik

F2-Modul Angewandte Bioinformatik
(Modulcode: Modul Bio2205, Biologie; Credit Points: 7)
Praktikum: Angewandte Bioinformatik
Lehrender: PD Dr. F. Hartung
Dauer: 4 SWS
Empfohlene Einordnung in den Studienplan: 6. oder 8. Semester (WS)
Zeit: 3. Blockperiode des WS, praktikumsbegleitend
Ort: Chemieturm 1 (Geb.-Nr. 30.43), 6. OG, Seminarraum 607.4 und andere Räume
Lernziel:
Durch praktische und theoretische Experimente, die aktuelle Forschungsschwerpunkte betreffen, sollen
den Teilnehmern Techniken und Fragestellungen der aktuellen Molekularbiologie in Bezug auf die
Bioinformatik vermittelt werden. Dabei werden Labor- und Computer Experimente selbständig
durchgeführt und ausgewertet. Dazu zählt auch die theoretische Nachbereitung der Experimente und das
Verfassen eines ausführlichen Protokolls.
Kursprogramm:
DNA-Sequenzierung und Analyse der erstellten Sequenz am Beispiel der in der Rekombination
involvierten RecQ-Helikase Gene, Analyse der abgeleiteten Proteinsequenzen, Genom- und
Proteomanalyse bei Pflanzen und Tieren, Anwendung von bioinformatischen Werkzeugen zur Analyse
biologisch relevanter Sequenzen und Fragestellungen (z.B. Klonierung, Restriktion, Mutagenisierung),
Feinanalyse verschiedener Gene bezüglich ihrer Exon-/Intronstruktur und deren Konservierung in
evolutionärem Maßstab.
Teilnahmevoraussetzungen: Vordiplom, bestandenes F1-Modul
Verwendbarkeit in anderen Studiengängen: Biologie Lehramt
Anrechenbarkeit: Botanik, Molekularbiologie, Genetik
Angebotene bzw. empfohlene Lernhilfen:
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Praktikumsskript
Selzer, Marhöfer, Rohwer Angewandte Bioinformatik, Springer 2004
Lehrmethoden: Praktikum 100%
Leistungsnachweis: Klausur (siehe oben), ausführliche Protokolle