Tutorium 14 - B CUBE Dresden

Mathematik und Naturwissenschaften, Biologie, Biochemie
Biochemie II - Tutorium
Dresden, 25.01.2016
Ablauf des Tutoriums
• Einführung und Wiederholung
• Vorlesungszusammenfassung
• Übungsaufgaben
• Selbststudium
TU Dresden, 26.01.2017
BCII-Tutorium
Modul Biochemie
• Praktikum unbenotet, muss nur bestanden werden
• Die Note der BCI und BCII Klausur zählen jeweils 50% der
Gesamtnote
• BCII Nachschreibe Klausur ist gleich schwer
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BCII-Tutorium
Wiederholung
•
Nr. 1. Nennen Sie die Funktionsweise der Klassen von Enzymen, die
Subklassen und je drei uns bekannte Beispiele
Enzymklassen
Subklassen
Oxidoreduktase
Dehydrogenase Elektronentransfer
Oxidasen
Reduktasen
Transferase
Kinasen
Transferasen
Polymerasen
Transfer chemischer Hexokinase
Gruppen
Phosphofructokin.
Asparateaminotransferase
Hydrolasen
Proteasen
Esterasen
Nucleasen
Glucosidasen
ATPasen
Hydrolysen
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Reaktionstyp
BCII-Tutorium
Beispiel
Ribonukleotidreduk.
Isocitrate DH
NADH-UbichinonOxidoreduktase
Glucose-6phosphatase
Arginase
Pyrophosphatase
Nr. 1. Nennen Sie die Funktionsweise der Klassen von Enzymen, die Subklassen
und je drei uns bekannte Beispiele!
Enzymklassen
Subklassen
Reaktionstyp
Beispiel
Lyasen
Decarboxylase
Aldehydlyasen
Hydrolasen
Synthasen
Abspalten oder
Hinzufügen von
chemischen
Gruppen
Aldolase
Citrate synthase
Pyruvatecarboxylase
Isomerasen
Racemasen
Epimerasen
Isomerasen
Mutasen
Transfer von
Gruppen innerhalb
von Molekülen
Phosphofructoisomerase
Phosphoglucomutase
Ligasen
Synthetasen
Bildung von C-C, CS, C-O oder C-N
Bindungen durch
Kondensation unter
NTP-Spaltung
Succinyl-CoAsynthetase
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Nr.2. Nennen Sie die „wichtigsten“ Formeln der
Biochemie und ihre Hauptfunktion!
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BCII-Tutorium
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BCII-Tutorium
Nr.2. Nennen Sie die „wichtigsten“ Formeln der Biochemie und
ihre Hauptfunktion!
•
•
Freie Enthalpie aus Enthalpie und Entropie:
Freie Enthalpie, Aussage über Reaktionsablauf:
•
•
Freie Standardenthalpie, Rückschluss auf GW:
Frei Standardenthalpie mit Reduktionspotential:
•
Formel der Reaktionsgeschwindigkeit:
•
•
Arrhenius-Gleichung, Proportionalitätsfaktor:
Freie Enthalpie bei membranpotential:
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3. Wie bezeichnet man den Vorgang der
Elektronenabgabe auf einen anderen Stoff
auch, wie bezeichnet man den
elektronenaufnehmenden Stoff, was hat das mit
Sauerstoff zu tun?
•
•
•
Man bezeichnet den Vorgang als Oxidation.
Den elektronenaufnehmenden Stoff bezeichnet man als Oxidationsmittel
Sauerstoff ist das zweitstärkste Oxidationsmittel.
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Nr .4. Geben Sie die Lipasereaktion beim
Fettsäureabbau an! (3 Schritte)
Monoacylglycerollipase (MGL)
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Nr.5. Höcker von Kamelen speichern Fette und
kein reines Wasser. Wie viele Wassermoleküle
werden pro Speicherfettmolekül erhalten?
Erläutere die Berechnungen! Gehe von einem
Triacylglycerid mit 3 C-18 Einheiten aus.
•
•
•
Info:
NADH2 und FADH2 liefern bei oxidativer Phosphorylierung beide 1 H2O
Betrachtet folgende Schritte:
• Lipasereaktion
• Glykolyse (Enolase verbraucht 1 H2O)
• PDH
• ß-Oxidation |FADH2 | =|NADH2| = |H2O| = |n/2-1|, Acetyl-CoA=n/2
 Ein beteiligtes Enzym heißt Hydratase (Lyase)
• Citratzyklus verbraucht je Durchlauf 2 H2O, liefert 3 NADH2 und FADH2
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5. Höcker von Kamelen speichern Fette und
kein reines Wasser. Wie viele Wassermoleküle
werden pro Speicherfettmolekül erhalten?
Erläutere die Berechnungen! Gehe von einem
Triacylglycerid mit 3 C-18 Einheiten aus.
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Nr. 6. Was sind essentielle Aminosäuren? Was
sind „glucogenic“ und was sind „ketogenic“
Aminosäuren?
•
•
Essentielle Aminosäure bezeichnen die Aminosäuren, die man als Säuger
nicht selber synthetisieren kann, sondern über die Nahrung aufnehmen muss.
Methionine, Threonine, Lysine, Valine, Leucine, Isoleucine, Tryptophan,
Phenylalanine, Histidine, Tyrosine
•
Glucogenic amino acids:
•
Ketogenic amino acids:
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Werden bei ihrem Abbau in Pyruvat oder ein
Intermediat des Citratzyklus abgebaut
Werden direkt in Acetyl-CoA oder Ketonkörper
abgebaut.
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Nr.7. Welche CoFaktorenwangen mit folgenden
Buchstaben an? Pyrido Bio Phos
Welche Funktionen haben sie? Nennen Sie ein
wichtiges Beispielenzym
•
Pyridoxalphosphat, Cofaktor bei der Übertragung von Aminogruppen
• Glycogen Phosphorylase
•
Biotin, ist verantwortlich Carboxylasereaktionen
• Pyruvat Carboxylase
•
Phosphopantethein, bildet Thioester mit Acetat (ACP-Bestandteil)
• Fettsäure Synthase
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Nr. 8. Welche Ausgangsstoffe bilden den
Ausgangsstoff der Purin bzw.
Pyrimidinnukleotide?
•
•
Purin-Nukleotide: IMP
Pyrimidin-Nukleotide: UMP
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Nr. 9. Welche reaktionsschritte sind notwendig
um IMP und UMP in die 3 weiteren Nucleotide
der RNA umzuwandeln?
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Nr. 10. Welche Moleküle bilden Bestandteile
von IMP und UMP?
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Nr. 11. Während der IMP-Biosynthese wird 5Aminoimidazole ribotide (AIR) durch AIR
Carboxylase carboxyliert. Welcher CoFaktor
könnte dabei eine Rolle spielen?
•
Biotin, ist verantwortlich Carboxylasereaktionen
• Pyruvat Carboxylase
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Nr. 12 Zeichnen Sie Acetat und Formiat
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