6. BAKTERIENSYSTEMATIK phylogenetische Taxonomie
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phylogenetische Taxonomie Nukleinsäuren Zusammensetzung: G+C Gehalt 6. BAKTERIENSYSTEMATIK 6.1 Taxonomie Sequenzähnlichkeit: Hybridisierung phylogenetische Taxonomie Sequenzierung ... 16S rRNA 6. BAKTERIENSYSTEMATIK 6.1 Taxonomie phylogenetische Taxonomie 6. BAKTERIENSYSTEMATIK 6.1 Taxonomie phylogenetische Taxonomie 6. BAKTERIENSYSTEMATIK 6.1 Taxonomie EUBACTERIA phylogenetische numerische Taxonomie 6. BAKTERIENSYSTEMATIK 6.1 Taxonomie Proteobacteriea numerische Taxonomie EUbakterien Gram-NEGATIV Lithoautotrophe ( 5.4.1.1) Phototrophe ( 5.4.3) 6.2.1 chemoheterotrophe Aerobier 6.2.1.1 Pseudomonaden 6.2.1.2 Rhizobien 6.2.1.3 Agrobacterium 6.2.1.4 freilebende N2-Fixierer 6.2.1.5 Spirillen 6.2.1.6 prosthekate Bakterien 6.2.1.7 Essigsäurebakterien 6.2.1.8 Scheidenbakterien 6.2.2 gleitende Bakterien 6.2.3 Enterobakterien (+ Verwandte) 6.2.4 Anaerobier 6.2.5 Spirochaeten Gram-POSITIV 6.2.6 einzellige Sporenbildner 6.2.7 NICHT-sporenbildende einzellige Gärer 6.2.8 Bakterien mit hohem G+C-Gehalt (‘Actinomyceten‘) 6.2.9 Mycoplasmen ARCHAEbakterien extrem Halophile Methanogene Thermo-acidophile Thermoplasma 6. BAKTERIENSYSTEMATIK 6.2 ausgewählte Bakteriengruppen Abbau von Aromaten 6. BAKTERIENSYSTEMATIK 1,3 oder 1,4 di-substituiert mehrfach substituiert 6.2.1 chemoheterotrophe Aerobier 6.2.1.1 Pseudomonas einfach substituiert 1,2 di-substituiert Abbau von Aromaten 6. BAKTERIENSYSTEMATIK 6.2.1 chemoheterotrophe Aerobier 6.2.1.1 Pseudomonas Wurzelknöllchen 6. BAKTERIENSYSTEMATIK 6.2.1 chemoheterotrophe Aerobier 6.2.1.2 Rhizobium Bradyrhizobium Azorhizobium Wurzelknöllchen 6. BAKTERIENSYSTEMATIK 6.2.1 chemoheterotrophe Aerobier 6.2.1.2 Rhizobium Bradyrhizobium Azorhizobium Wurzelknöllchen 6. BAKTERIENSYSTEMATIK 6.2.1 chemoheterotrophe Aerobier 6.2.1.2 Rhizobium Bradyrhizobium Azorhizobium Leghämoglobin Pflanzen-Tumore 6. BAKTERIENSYSTEMATIK 6.2.1 chemoheterotrophe Aerobier 6.2.1.3 Agrobacterium A. tumefaciens A. rhizogenes Pflanzen-Tumore 6. BAKTERIENSYSTEMATIK 6.2.1 chemoheterotrophe Aerobier 6.2.1.3 Agrobacterium Azotobacter 6. BAKTERIENSYSTEMATIK 6.2.1 chemoheterotrophe Aerobier 6.2.1.4 freilebende N2-Fixierer Beijerinckia Azospirillum Schleim Bdellovibrio 6. BAKTERIENSYSTEMATIK 6.2.1 chemoheterotrophe Aerobier 6.2.1.5 Spirillen intestinales Spirillum Lebenszyklen 6. BAKTERIENSYSTEMATIK Caulobacter Hyphomicrobium 6.2.1 chemoheterotrophe Aerobier 6.2.1.6 prosthekate Bakterien Zuckermetabolismus 6. BAKTERIENSYSTEMATIK 6.2.1 chemoheterotrophe Aerobier 6.2.1.7 Essigsäurebakterien nicht phosphorylativ nicht oxidativ Unteroxidierer Überoxidierer Scheiden 6. BAKTERIENSYSTEMATIK 6.2.1 chemoheterotrophe Aerobier 6.2.1.8 Scheidenbakterien Spaerotilus Leptothrix Fe-Oxide MnOxide 6. BAKTERIENSYSTEMATIK EUbakterien Gram-NEGATIV Lithoautotrophe ( 5.4.1.1) Phototrophe ( 5.4.3) 6.2.1 chemoheterotrophe Aerobier 6.2.1.1 Pseudomonaden 6.2.1.2 Rhizobien 6.2.1.3 Agrobacterium 6.2.1.4 freilebende N2-Fixierer 6.2.1.5 Spirillen 6.2.1.6 prosthekate Bakterien 6.2.1.7 Essigsäurebakterien 6.2.1.8 Scheidenbakterien 6.2.2 gleitende Bakterien 6.2.3 Enterobakterien (+ Verwandte) 6.2.4 Anaerobier 6.2.5 Spirochaeten Gram-POSITIV 6.2.6 einzellige Sporenbildner 6.2.7 NICHT-sporenbildende einzellige Gärer 6.2.8 Bakterien mit hohem G+C-Gehalt (‘Actinomyceten‘) 6.2.9 Mycoplasmen 6.2.10 ARCHAEbakterien 6.2.10.1 extrem Halophile 6.2.10.2 Methanogene 6.2.10.3 Thermo-acidophile 6.2.10.4 Thermoplasma 6.2 ausgewählte Bakteriengruppen 6. BAKTERIENSYSTEMATIK 6.2.2 gleitende Bakterien Myxobakterien Schwefel-Oxidierer 6. BAKTERIENSYSTEMATIK 6.2.2 gleitende Bakterien Flavobacterium johnsoniae Myxococcus xanthus Myxobakterien Schwefel-Oxidierer Myxobakterien: Lebenszyklus 6. BAKTERIENSYSTEMATIK 6.2.2 gleitende Bakterien Myxobakterien: Fruchtkörperbildung 6. BAKTERIENSYSTEMATIK 6.2.2 gleitende Bakterien 6. BAKTERIENSYSTEMATIK Enterobacteriaceae Coliforme Escherichia Shigella Salmonella meist freilebend Enterobacter Serratia Proteus Pflanzen-pathogen Erwinia Tier-pathogen Yersinia „Verwandte“ Photobacterium Vibrio 6.2.3 Enterobakterien + Verwandte 6. BAKTERIENSYSTEMATIK Enterobacteriaceae Coliforme Escherichia Shigella Salmonella meist freilebend Enterobacter Serratia Proteus Pflanzen-pathogen Erwinia Tier-pathogen Yersinia 6.2.3 Enterobakterien + Verwandte Proteus „Schwärmen“ Serratia Prodigiosin „Verwandte“ Photobacterium Vibrio Photobacterium Biolumineszenz 6. BAKTERIENSYSTEMATIK obligate Fermentierer Sulfat- und Schwefel-Reduzierer 6.2.4 Gram-negative Anaerobier Fusobacterium Succinivibrio dissimilatorische Sulfat-Reduktion 6. BAKTERIENSYSTEMATIK 6.2.4 Gram-negative Anaerobier Desulfobacter Desulfococcus Desulfomonas Desulfosarcina ... Lactat Acetat → Pyruvat + H2 Lactat- Dehydrogenase → → .... CO2 + H2 CO- Dehydrogenase Axialfilament 6. BAKTERIENSYSTEMATIK 6.2.5 Spirochaeten Borrelia Treponema pallidum Leptospira 6. BAKTERIENSYSTEMATIK EUbakterien Gram-NEGATIV Lithoautotrophe ( 5.4.1.1) Phototrophe ( 5.4.3) 6.2.1 chemoheterotrophe Aerobier 6.2.1.1 Pseudomonaden 6.2.1.2 Rhizobien 6.2.1.3 Agrobacterium 6.2.1.4 freilebende N2-Fixierer 6.2.1.5 Spirillen 6.2.1.6 prosthekate Bakterien 6.2.1.7 Essigsäurebakterien 6.2.1.8 Scheidenbakterien 6.2.2 gleitende Bakterien 6.2.3 Enterobakterien (+ Verwandte) 6.2.4 Anaerobier 6.2.5 Spirochaeten Gram-POSITIV 6.2.6 einzellige Sporenbildner 6.2.7 NICHT-sporenbildende einzellige Gärer 6.2.8 Bakterien mit hohem G+C-Gehalt (‘Actinomyceten‘) 6.2.9 Mycoplasmen 6.2.10 ARCHAEbakterien 6.2.10.1 extrem Halophile 6.2.10.2 Methanogene 6.2.10.3 Thermo-acidophile 6.2.10.4 Thermoplasma 6.2 ausgewählte Bakteriengruppen Endosporen 6. BAKTERIENSYSTEMATIK 6.2.6 einzellige Endosporenbildner Aerobe Bacillus Thermoactinomyces Sporosarcina (Sporolactobacillus) Anaerobe Clostridium Desulfotomaculum Heliobacterium Bacillus thuringiensis Sporen-Keimung Bacillus polymyxa Bacillus polymyxa Thermoactinomyces Bacillus circulans Stickland-Reaktion 6. BAKTERIENSYSTEMATIK 6.2.6 einzellige Endosporenbildner Aerobe Bacillus Thermoactinomyces Sporosarcina (Sporolactobacillus) Anaerobe Clostridium Desulfotomaculum Heliobacterium Clostridium Fermentation von Aminosäuren Morphologie 6. BAKTERIENSYSTEMATIK 6.2.7 NICHT-sporenbildende einzellige Gärer fakultative Gärer Staphylococcus obligate Gärer Milchsäurebakterien Kokken Lactococcus Enterococcus Streptococcus Leuconostoc Stäbchen Lactobacillus Staphylococcus Streptococcus Lactobacillus Gärung 6. BAKTERIENSYSTEMATIK 6.2.7 NICHT-sporenbildende einzellige Gärer fakultative Gärer Staphylococcus obligate Gärer Milchsäurebakterien Kokken Lactococcus Enterococcus Streptococcus Leuconostoc Stäbchen Lactobacillus homo- heterofermentativ pleomorph 6. BAKTERIENSYSTEMATIK 6.2.8 Bakterien mit hohem G+C-Gehalt Coryneforme Bakterien Corynebacterium Arthrobacter Propionibacterium Mycobacterium Streptomyces pleomorph 6. BAKTERIENSYSTEMATIK 6.2.8 Bakterien mit hohem G+C-Gehalt Coryneforme Bakterien Corynebacterium Arthrobacter Propionibacterium Mycobacterium Streptomyces Arthrobacter Mycobacterium Ara-Gal-... Carbolfuchsin Isonicotinsäure-Hydrazid = INH strikt filamentös 6. BAKTERIENSYSTEMATIK 6.2.8 Bakterien mit hohem G+C-Gehalt Coryneforme Bakterien Corynebacterium Arthrobacter Streptomyces Propionibacterium Mycobacterium Streptomyces Kolonie-Querschnitt antibiotisch Sporen zellwand-los 6. BAKTERIENSYSTEMATIK 6.2.9 Mycoplasmen Mycoplasma Ureoplasma Acholeplasma Pleomorphismus Kolonieform Mycoplasma mycoides
