ZytogenetikderNHLdesKindes

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Zytogenetik
der Non-Hodgkin-Lymphome
des Kindes- und Jugendalters
Jochen Harbott, Onkogenetisches Labor, Abt. Pädiat. Hämatol./Onkol., Gießen
Chromosomale Aberrationen bei ALL
pre-pre-B common pre-B
pro-B
common prä-B B-ALL
B-ALL T-ALL
T-ALL AUL
AUL
mixed
mixed
t(9;22)
--
31
5
--
1
1
2
11q23
3
3
2
--
3
--
1
t(1;19)
1
10
11
--
--
--
--
t(4;11)
31
1
--
--
--
--
3
t(8;14)
--
--
1
13
--
--
--
14q11
--
--
--
--
17
--
--
t(11;19)
1
1
--
--
--
--
--
>50
1
244
34
1
2
--
--
Jochen Harbott, Onkogenetisches Labor, Abt. Pädiat. Hämatol./Onkol., Gießen
Chromosomale Aberrationen
bei B-NHL/B-ALL
t(8;14)(q24;q32)
t(2;8)(p11;q24)
t(8;22)(q24;q11)
c-MYC  IgH, Ig, Ig
Jochen Harbott, Onkogenetisches Labor, Abt. Pädiat. Hämatol./Onkol., Gießen
Chromosomale Aberrationen
bei ALCL
5
2
Bruchpunkte der Partnerchromosomen bei varianten
2p23-Translokationen
t(2;5)(p23;q35)
Jochen Harbott, Onkogenetisches Labor, Abt. Pädiat. Hämatol./Onkol., Gießen
Aberrationen in T-Zell-Lymphomen
14q11  TCRa
t(1;14)(p32;q11)
Partnergene
TAL1
 1p32
HOX11  10q24
t(10;14)(q24;q11)
RHOM2  11p13
TCL1
 14q32
MYC
 8q24
LMO1
 11p15
t(11;14)(p13;q11)
inv(14)(q11q32)
Weitere Translokationen
t(8;14)(q24;q11)
t(11;14)(p15;q11)
Jochen Harbott, Onkogenetisches Labor, Abt. Pädiat. Hämatol./Onkol., Gießen
Aberrationen in T-Zell-Lymphomen
7q35  TCRß
Aberration
t(1;7)(p34;q35)
t(7;10)(q35;q24)
t(7;19)(q35;p13)
Partnergen
LCK
HOX11
LYL1
Jochen Harbott, Onkogenetisches Labor, Abt. Pädiat. Hämatol./Onkol., Gießen
Genetische Diagnostik
klassische Zytogenetik
 G-, R-, Q-, C-Bandenfärbung
Molekulare Zytogenetik
Fluoreszenz in situ Hybridisierung (FISH)
 Chromosomen-Painting (WCP)
 Zentromer-Sonden
 YAC and Cosmid-Sonden
 24-Farben-FISH (SKY/M-FISH)
Comparative genomic hybridization (CGH)
 CGH auf Chromosomen
 Array CGH
Molekulargenetik
 Long distance (LD-) PCR
 reverse transcriptase (RT-) PCR
 real time quantitative (RQ-) RT-PCR
Jochen Harbott, Onkogenetisches Labor, Abt. Pädiat. Hämatol./Onkol., Gießen
Zytogenetik
Versand
Zellgewinnung


24 Std.-Kultur
Zugabe von Colchizin
Herstellung der Präparate



Hypotone Phase
Fixieren in Alkohol:Eisessig 3:1
Auftropfen
Färbung

G-Banden-Färbung
Auswertung

Computergesteuerte Bildverarbeitung
Voraussetzung: genügend vitale Zellen
Jochen Harbott, Onkogenetisches Labor, Abt. Pädiat. Hämatol./Onkol., Gießen
Nachweis von 8q24-Aberrationen mit
break-apart-Sonde
MYC-Translokation
MYC normal
Jochen Harbott, Onkogenetisches Labor, Abt. Pädiat. Hämatol./Onkol., Gießen
24-Farben-FISH
43~45,X,-Y,der(1)t(1;5)(q10;?p10),+der(1)t(1;5)(q10;?p10),del(6)(q15),der(8)t(8;13)(p?;
q?)t(8;22)(q24;q11),-10,-15,del(16)(q13),der(22)t(8;22)(q24;q11),+mar,inc[cp4]/43~45,
idem,-der(22)t(8;22)(q24;q11),+mar,inc[cp3]/46,XY[2]
Jochen Harbott, Onkogenetisches Labor, Abt. Pädiat. Hämatol./Onkol., Gießen
Comparative Genomic Hybridization (CGH)
DNA-Verlust
zB Monosomie, Deletion
Referenz-DNA
Nachweis der
Aberration durch
Fluoreszenz-Markierung
normaler Chromosomen
Tumor-DNA
DNA-Zugewinn
zB Trisomie, Duplikation
Jochen Harbott, Onkogenetisches Labor, Abt. Pädiat. Hämatol./Onkol., Gießen
Polymerase Kettenreaktion
Polymerase Chain Reaction (PCR)
94°C
72°C
60°C
Jochen Harbott, Onkogenetisches Labor, Abt. Pädiat. Hämatol./Onkol., Gießen
Alternative Methoden zum Nachweis
Lymphom-spezifischer Aberrationen
Interphase-FISH am Ausstrich/Tupfpräparat oder nach Kultur mit
break-apart-Sonde
 Nachweis einer MYC- oder ALK-Translokation
Metaphase-FISH nach Kultur mit break-apart-Sonde
 Nachweis einer MYC- oder ALK-Translokation (und des Partnerchromosoms)
24-Farben-FISH nach Kultur
 Nachweis der 8q- oder 2p-Translokation und des Partnerchromosoms
 zusätzlich weitere Aberrationen (außer inv, kleinen del oder ins)
Comparative genomic hybridization (CGH)
 Nachweis eines Zugewinns oder Verlustes von Chromosomenstücken oder einzelnen Genen
Polymerase-Kettenreaktion (LD-PCR, RT-PCR)
 Nachweis des MYC- oder ALK-Rearrangements und des Fusionspartners
Jochen Harbott, Onkogenetisches Labor, Abt. Pädiat. Hämatol./Onkol., Gießen
Probleme bei der zytogenetischen
Auswertung von Lymphomen
oft normaler Karyotyp oder kein Ergebnis
mögliche Ursachen:
 keine
Proben eingesandt
 inadäquate Versandbedingungen
 nicht genügend Lymphomzellen
 Knochenmark ohne Befall
 kein Tumormaterial eingesandt
 eingesandtes Material kein Tumor (V.a. Lymphom)
 Lymphomzellen gehen schnell in Apoptose
 inadäquate Kulturbedingungen (Medium/Zeit)
 kryptische Aberrationen
Jochen Harbott, Onkogenetisches Labor, Abt. Pädiat. Hämatol./Onkol., Gießen
Häufigkeit unterschiedlicher
Karyotypen bei B-NHL
963 Patienten aus mehreren BFM-NHL Studien
199 vollständige Karyotypen
199 Patienten
mit vollständigem Karyotyp
101
Karyotyp normal
50,7 %
98
aberrant
49,3 %
mit
8q24-Aberration
n = 82
del(8)(q24)
n=2
t(2;8)
n=2
t(8;22)
n=4
ohne
8q24-Aberration
n = 16
t(8;14
n = 74
Jochen Harbott, Onkogenetisches Labor, Abt. Pädiat. Hämatol./Onkol., Gießen
Warum Zytogenetik?
spezifische Aberrationen kann man auch
mit anderen Methoden nachweisen
Herstellung von Metaphasepräparaten
schwierig (Kultur etc.)
Ergebnis fraglich (z.B. normaler Karyotyp)
Jochen Harbott, Onkogenetisches Labor, Abt. Pädiat. Hämatol./Onkol., Gießen
Häufigkeit von Sekundäraberrationen
199 Patienten
mit vollständigem Karyotyp
98
aberrant
49,3 %
101
Karyotyp normal
50,7 %
ohne
8q24-Aberration
n = 16
mit
8q24-Aberration
n = 82
del(8)(q24)
n=2
t(2;8)
n=2
t(8;22)
n=4
nur
8q24-Aberrationen
n = 36
43,9 %
mit
Sekundäraberrationen
n = 46
56,1 %
Jochen Harbott, Onkogenetisches Labor, Abt. Pädiat. Hämatol./Onkol., Gießen
t(8;14
n = 74
Häufigkeit sekundärer Aberrationen
bei Burkitt-NHL
%
aberration
20
43.5
1q+
1
6.2
der(3q)
3
6.5
der(3q)
1
6.2
6q-
5
10.9
6q-
5
31.3
+7/7q+
7
15.2
+7/7q+
1
6.2
9p-
3
6.5
9p-
0
0
11q23
4
8.7
11q23
5
31.3
+12/12q+
2
4.3
+12/12q+
2
12.5
13q-
8
17.4
13q-
1
6.2
del(17p)
2
4.3
del(17p)
0
0
complex
18
39.1
complex
4
24.8
others
23
50.0
others
13
75.0
aberration
1q+
abs
sekundäre Aberrationen
mit 8q24
abs
%
Aberrationen
ohne 8q24
Jochen Harbott, Onkogenetisches Labor, Abt. Pädiat. Hämatol./Onkol., Gießen
Häufigkeit von 2p23-Aberrationen
bei ALCL
47 Patienten
mit vollständigem Karyotyp
28
Karyotyp normal
59,6 %
19
aberrant
40,4 %
mit
2p23-Aberration
n = 15
mit
2p-Aberrationen
n=1
t(2;5)
n = 14
t(1;2)
n=1
nur
2p23-Aberrationen
n=3
mit
Sekundäraberrationen
n = 12
ohne
2p23-Aberration
n=3
Jochen Harbott, Onkogenetisches Labor, Abt. Pädiat. Hämatol./Onkol., Gießen
Sekundäraberrationen bei NHL im
Kindesalter
prognostische Bedeutung noch
unklar
möglicherweise schlechtere
Prognose für einige Aberrationen
Bedeutung für Lymphomentstehung
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Problemlösung
für ein gutes Ergebnis
 ausreichend
Material verschicken
 gutes Material
 möglichst Tumorgewebe
 Gewebe nicht austrocknen lassen
 vitale Zellen
 adäquate Versandbedingungen
 möglichst sofort versenden
 innerhalb von 24 Std. im Labor
 Kurierdienst (Ankunft bis 10.00 Uhr)
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NHL-BFM-Materialversand
KM-Befall und/oder Pleuraerguss
und/oder Aszites
nur Tumor
Punktion
Biopsie
Diagnosestellung NHL
immunologisch und zytomorphologisch
Diagnosestellung NHL
histologisch und immunhistochemisch
• flüssiges Material
heparinisiert
• Zytospinpräparate
bzw. Ausstriche
• flüssiges Material
heparinisiert
• Zytospinpräparate
bzw. Ausstriche
• Liquor, KM, Blut,
Serum
• Tumormaterial in
Medium
• Tumortupfpräparate
• Liquor, KM, Blut,
Serum
Immunologie
Zytomorphologie / Genetik / Zellbank
Immunologisches
Zellmarkerlabor,
Berlin
Onkogenetisches Labor
und
NHL-BFM-Studienzentrale
Gießen
• Tumormaterial
formalinfixiert
Histologie /
Immunhistochemie
LK-Register, Kiel
oder ein anderes
referenzpathologisches Institut
der NHL-BFM-Studie
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