actaacgtcctagctcttctacttatactaacctaccgtc

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Übungsaufgabe - Sequenz-Übereinstimmung
1.1
Ausgangssituation
Bei der Sequenzierung eines DNA-Abschnitts beim Menschen und beim dazu passenden Abschnitt bei
einem Schimpansen wurden folgende Sequenzen gefunden:
Mensch:
ACTAACGTCCTAGCTCTTCTACTTATACTAACCTACCGTC
Schimpanse: ATTAGCATTCTGGAGCTCCTCTTATGCTAGCCCACCGTT
1.2
Mutationsarten
• Substitutionen: ein einzelnes Nukleotid wird durch ein Nukleotid anderen Typs ersetzt (”substituiert”).
• Insertion: Ein aus einem einem oder mehreren Nukleotiden bestehendes Stück DNA wird eingefgt
(”inseriert”).
• Deletion: Ein aus einem einem oder mehreren Nukleotiden bestehendes Stück DNA wird entfernt
(”deletiert”).
1.2.1
Hinweis
Beachten Sie dabei, dass Substitutionen im Allgemeinen deutlich häufiger auftreten als Insertionen
und Deletionen.
1.3
Aufgabe
Finden Sie die wahrscheinlichsten Übereinstimmungen und Mutationen. Zeichnen Sie diese ein. Verwenden Sie dazu unterschiedliche Farben.
ACTAACGTCCTAGCTCTTCTACTTATACTAACCTACCGTC
ATTAGCATTCTGGAGCTCCTCTTATGCTAGCCCACCGTT
ACTAACGTCCTAGCTCTTCTACTTATACTAACCTACCGTC
ATTAGCATTCTGGAGCTCCTCTTATGCTAGCCCACCGTT
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Übungsaufgabe - Kopplungskarten
2.1
Ausgangssituation
Für eine Pflanze, deren Genom wir nicht kennen, sind die Marker A, B, C und D bekannt. Die Eltern
P1 und P2 haben folgende Genotypen:
Marker P1
A
aa
B
bb
cc
C
D
dd
P2
Aa
Bb
Cc
Dd
Die paarweise Analyse der F1-Generation hat die folgenden Anzahlen von Genotypen ergeben:
Marker B
A
AaBb-116
Aabb-83
aaBb-84
aabb-117
B
C
AaCc-177
Aacc-19
aaCc-23
aacc-181
BbCc-104
Bbcc-97
bbCc-98
bbcc-101
C
2.2
D
AaDd-154
Aadd-46
aaDd-43
aadd-157
BbDd-170
Bbdd-32
bbDd-30
bbdd-168
CcDd-127
Ccdd-66
ccDd-81
ccdd-126
Aufgabe
1. Wie ist die Reihenfolge der Marker im Chromosom?
Stellen Sie sich dabei folgende Fragen:
• Bei welchen Paaren sind die Zahlen auffallend groß oder klein?
• Welche Marker könnten benachbart sein?
• Welche Marker sind am weitesten voneinander entfernt?
2. Sind die Distanzen zwischen allen Markern gleich groß?
3. Gibt es mehr als eine Lösung?
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