Definitionen - Grundanforderungen
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Definitionen – Grundanforderungen Definitionen - Grundanforderungen Glukose 1. Entstehung des Lebens und Einleitung für Zellbiologie Disacchariden Ribose Desoxyribose Polysacchariden Stärke Glykogen Cellulose Glykoprotein Fettsäure und Öle Glycerol Phospholipid Amphipathische Moleküle Komplementäre Basenpaarung Zelltheorie 1. Die Zelle Keimzelltheorie Eubakterien Archeobakterien Prokarionten Eukarionten Cyanobakterien RNA-Welt Archeazoa Hypothese Flüssig Mosaik Membrane Modell Glykolipid Cholesterol Integrale Membranproteine Peripheriale Membranproteine Glykokalyx Lipid rafts Membranmikrodomäne Nukleus Nukleolus Chromosom Chromatin Histone Nucleosom Ribosom Endoplasmatisches Retikulum: rough ER, smooth ER Signal Peptide NLS NOS MTS Herbst Semester 2011 Seite: 1 Definitionen – Grundanforderungen PTS Golgi Komplex Endozytose Exozytose Lysosom Phagozytose Peroxisome Peroxide Mitochondrion Kloroplast Klorophyll Endosymbiont Theorie Ubiquitin Zytoskeleton Mikrofilament Aktin Intermedier Filamente Nuklear Lamina Mikrotubule Haploid Diploid N-terminus Ende der Proteine, C-terminus Ende Proteine Glykosylation Nukleotidbasen (ATGGCU) 2. DNA ist das Erbmaterial R und S Typen von Pneumokokken Griffith Transformation Herschey and Chase Radioisotop Bakteriophage 2. Struktur der DNA Purin Pirimidin Nukleosid Nukleotid Nukleotid-Monophosphat, -Diphosphat, -Triphosphat Desoxyribonukleotid Chargaff-Regel Tetranukleotid Hypothe Röntgenkristallographie James Watson und Francis Crick DNA Doppel Helix Templat DNA 2. DNA Synthese (Replikation) Komplementär Strang der DNA in vitro Herbst Semester 2011 Seite: 2 Definitionen – Grundanforderungen Semikonservative Replikation Ultrazentrifuge schweres Medium RNA Primer Primase Helikase DNA Polymerase DNA Lygase Leitstrang Folgestrang 5'-Ende, 3'-Ende Telomer Telomerase Nobel Preise 2. Der genetische Kode genetische Kode Kodon Anticodon Triplett redundante Kode degenerierte Kode wobble-Effekt in Kode (Wackeleffekt) universale Kode 2. Mutationen und Reparatur Mutation somatische Mutation Keimbahn Mutation Punkmutation ORF-Mutation (Leserasterschub-Mutation) Deletion Insertion stille Mutation Missense Mutation Nonsense Mutation Polyploidie Aneuploidie Kariotype Turner-Syndrom Down-Syndrom Klinefelter-Syndrom crossing over Mutagene Tautomere spontane Mutation induzierte Mutation Herbst Semester 2011 Seite: 3 Definitionen – Grundanforderungen loss of function Mutation (Funktionsverlustmutation) gain of function Mutation (Funktionsgewinmutation) DNA repair defect proof-reading repair (Korrekturlesen) mismatch repair (DNA-Basenfehlpaarungsreparatur) Exzision Reparatur Exonuclease Endonuclease 3. RNAs für Proteinsynthese mRNA tRNA rRNA nicht-kodierende RNA 3. Transkription pre-Initiation Komplex Transcriptionsfactor TATA box Transcriptionsinitiation, Elongation und Termination Poly A Signal Poly A Schwanz G-cap Gruppe (G-Kappe) mRNA Reifung 3. Post-transkriptionische Prozesse Spleißen snRNP (small nuclear ribonucleoprotein) SR (Signalerkennungs) Proteine Spleißen Donorstelle und Akzeptorstelle Sequenzen Kappe Polyadenilierung NES (nuclear export signal) REC (RNA export complex) Zip Code (Postleitzahl) Protein struktur: primärstruktur, etc .... 4.Proteine Alpha Helix Beta Faltblätter Disulfidbrücke Chaperone (Ammeproteine) Proteinfaltung Denaturierung Ubiquitin, Ubiquitinierung Proteasom Protease Proteolysis Lebenshalbzeit Herbst Semester 2011 Seite: 4 Definitionen – Grundanforderungen 3. Enzyme Energie: potenzielle and kinetische Energie Metabolische Wege ex-und endergonische Reaktione Energieschwelle Aktivierungsenergie Enzym Katalysierte Rektaion Kofactor, Koenzyme, Prosthetische Gruppe reversibel und irreversibel Hemmung Kompetitive und nicht-Kompetitive Hemmung allosterische Hemmung Inhibitor Substrat Aktives Zentrum ATP-Hydrolase Transmembranproteine 4. Extrazelluläre Matrix Extrazelluläre Matrix Kollagen Elastin Fibrillin Gleitfilamenttheorie Marfan syndrome Ehlers Danlos Syndrome Glukosaminoglykan Proteoglykan Lamin Integrin Keratin Zelladhesion Tight junction Desmosom Gap junction Duchenne-Muskeldystrophie Motorprotein Dynein Kinesin Myosin Aktin 5. Transport of small molecules and ions activer und passiver Transport Osmosis Transporter Uniporter Kotranszporter: Symporter und Antiporter Herbst Semester 2011 Seite: 5 Definitionen – Grundanforderungen fazilitierte Diffusion Aquaporin Ionpumpe chemischer, elektrischer, elektro-chemischer Gradient Kanalprotein Ionkanal ATP-vermittelte aktiver Transport Ion Gradient-vermittelte aktiver Transport Na + / K + Pumpe Ca2 + Pumpe Na + / Ca2 + Pumpe Das Schicksal des neuen Polipeptid (protein sorting) 5. Protein transport Sekretorischer Weg nicht sekretorischer Weg Signalsequenz Signal erkennendesTeilchen (SRP) SRP Rezeptor Translokation Signal Peptidase ER signal sequence NoLS (nucleolus localization signal) PTF (peroxisome targeting signal) CTS (chloroplast target signal) 7SLRNS Ribonukleoprotein (RNP) Die Gruppe der Membranproteine Die integrierenden Membranproteine Signal-Anker Sequenz Stop-Transfer Sequenzen ER lumen amphipathisch Zytosol Translokon 5. Vesikularer Transport Transport Vesikeln Vesikular-Transport cis-Golgi Zisternen trans-Golgi Netzwerk Endozytose Importin 5. Nuklearer Transport Exportin Ran, Ran/GTP, Ran/GEF, Ran Gap Cargo Protein Nuklear Lokalisations-signal (nuclear localizing signal-NLS). NES (nuclear export signal) Nukleares Export Signal NES (nuclear export signal). Abweichung vom universalen-Code 6. Struktur des Genoms Herbst Semester 2011 Seite: 6 Definitionen – Grundanforderungen SNP (single nucleotide polymorphism) CNV (copy number variation) Indel (Insertion-Deletion) Craig Venter Transposon (jumping genes, mobile elements) Retrotransposon, Retroposon DNA Transposon intergenische Sequenzen nicht kodierende Sequenzen UTR Intron Exon ORF (open reading frame), geöffneter Leseraster klassische Genetik (Mendelsche Genetik) Molekulare Genetik Keimbahnzelle LTR retrotransposon and non-LTR retrotransposon HERV (human endogenous retroviruses) Satellit DNA (macrosatellite) Minisatellit Mikrosatellit alpha Satellit Telomer Tandem Repeaten VNTR (variable number tandem repeats) STR (short tandem repeats) Allel 7. Vererbung Genlokus Wild-typ Allel Genotyp Phenotyp Heterozygot Homozygot Hemizygot Dominant Rezessiv Hybrid Uniformitatsregel von Mendel Segregationsregel von Mendel Unabhängigkeitsregel von Mendel Punnet Tabelle Kodominant Vererbung Geschlechtgekoppelte Vererbung Test-Kreuzung Zystische Fibrose Brachydaktylie Herbst Semester 2011 Seite: 7 Definitionen – Grundanforderungen Polydaktylie Stammbaumanalyse Konduktor Dystrophin Lesch-Nyhan syndrome Muscular dystrophie Hemophilie Sichelzellanämie genetische Rekombination Kopplungsgruppe rekombinante Nachkommen genetische Kartierung centi Morgan (cM) Mitosis Meiosis lac Operon 8. Das lac Operon Cistron, policistronische mRNA Operator lacI gene, repressor lacZ Gene, -galactosidase LacA und LacY Gene CAP Laktose Adenylate Zyclase cAMP RNA Polymerase katabolische Repression (Endprodukthemmung) c - s O , I és I Mutationen Lactase Enzym Lactose Intoleranz Promotor, upstream Promotor 8. Transkriptionregulierung in Eukaryonten CAAT box und GC box Promotor Modul (konsensus Sequenzen, konsensus Elemente) Transcriptionale kofaktore Expressionsprofil Enhancer Silencer Strukturmotive der Transkriptionsfaktoren: Helix-Turn Motiv, Zinc Finger, Leucinezipper, Helix-Loop DNA-bindende und aktivierende Domäne Zelltyp-specifische Genexpression induziertes Genexpression Transkription Start und Stop Sequenzen Translation Start und Stop Sequenzen Euchromatin 8. Epigenetische Regulation Herbst Semester 2011 Seite: 8 Definitionen – Grundanforderungen Heterochromatin: konstitutives und facultatives Heterochromatin Chromatinmodifikation (Chromatin remodeling) Histon-acethylatierung, -methylierung CpG Insel HAT (histone acetyl transferase) HDAC (histone deacetylase) HMT (histone methyl transferase) Histon demethylase Dnmt (DNA methyl transferase) de novo Methylierung Hitze Shock faktor (HSF) und HSF bindendes Element (HSE) GAGA faktor Kanalisation (Ontogenese) X-Chromosom Inaktivierung Dosis Kompensation mütterliche Vererbung 9. Nicht mendelsche Genetik mtDNA (mitokondriale DNA) Homoplasmie und Hereroplasmie Keimbahn- und Somatische Mosaiken post-zygotische Mutation Chimären mitotischer Fehler polygenetische Merkmale 9. Polygenische Merkmale quantitative Merkmale QTL (quantitative trait loci) Polygenische Schwellenwert Hypothese Komplex Krankheiten Fossilien 10. Allgemeine Aspekte der Evolution Kontinentaldrift gemeinsame Abstammung natürliche Selektion sexuelle Selektion künstliche Selection Speziation Red Queen Hypothese 10. Molekulare Evolution Exon Duplikation Evolution Exon Shuffling (vermischung) Poliploidisierung Homolog Ortolog Monophyletik Herbst Semester 2011 Seite: 9 Definitionen – Grundanforderungen Polyphyletik Molekulare Phylogenetik molekularer Uhr genetischer Marker VNTR und STR Analyse 11. Viruses-I obligate Parasiten Virion vegetativer Virus Provirus Kapsid und Nucleokapsid ikosaedrische und helikale Kapsid virion membrane (envelope) Eindringen in die Zelle (Penetration) Membranfusion Endozytose Reverse Transkriptase Zusammenbau des Viruses produktive Infektion latente Infektion abortive Infektion natürliches Reservoir OTU (operational taxonomic units) 12. Bakterien auxotroph prototroph Resistenzplasmid Virulenzplasmid F-Plasmid HFR Stamm Escherichia coli lyzogene Phage generelle und spezielle Transduktion Virulenzgen selektive Marker sichtbare Marker Fertilitätsmarker Bakteriophag lytischer Zyklus lysogenischer Zyklus 13. Technologisches Arsenal der Molekularbiologie-I Restriktionsendonuklease Restriktion – Modifikationss Sstem DNA Ligase Plasmid Vektor molekulare Klonierung Elektroporation Herbst Semester 2011 Seite: 10 Definitionen – Grundanforderungen X-Gal und IPTG PCR (polymerase chain reaction) Primer DNA Denaturation Gel-elektrophorese blot-Techniken: Southern, Northern, Western, Eastern Immunohistochemie (IHC), immunocytochemie Immunofluorescenz und Immunoenzym Methoden Epitop Autoradiographie Hierarchieebenen in Biologie Genbibliothek VNTR, STR Analyse 13. Technologisches Arsenal der Molekularbiologie II genomische Bibliothek cDNA Bibliothek DNA Sequenzierung Shotgun Technik DNA Mikrochip Real-time PCR und Real-time RT-PCR 14. Alterung Progeria lamin A Gen Werner Syndrom Freie Radikale Theorie Genetische Uhr Theorie (Telomer Theorie) Accumulativer Abfall Theorie Versäuerung Theorie Lichtmikroskop Mikroskop Praktium Fluoreszenzmikroskop Konfokal Mikroskop Elektron Mikroskop: Transmission und scanning Mikroskopie Phase contrast Mikroskop Feintrieb und Grosstrieb Kondensor Wellenlänge des Lichtes Numerische Apertur Auflösungskeit Fluorochrom Fluoreszierende Poteine Fusionproteine DNA und Protein Isolierung Zentrifugierung DNA und Protein Isolierung Praktikum Trennungsverfahren Praktikum Ultrazentrifugierung Affinitätschromatographie Gelfiltration Herbst Semester 2011 Seite: 11
