Diss. ETH No. 17445 Characterization of TMX4, a Novel ER Oxidoreductase with an unusuallocalization signal A dissertation submitted to ETHZURlCH far the degree of Doctor of Sciences presented by DORIS ROTH Dip!. Natw. ETH, ETH Zurich born 27.01.1979 citizen of Germany accepted on the recommendation of examiner: Prof. Dr. Ari Helenius co-examiner: Assoe. Prof. Dr. Lars Ellgaard co-examiner: Prof. Dr. Hans-Peter Hauri co-examiner: Prof. Dr. Yves Barral 2007 6 Summary One single enzyme, protein disulfide isomerase (PDI), is able to catalyze both the introduction of disulfide bonds, their reduction and isomerisation in the cndoplasmic reticulum (ER). However, almost 20 PDI-like thiol-disulfide oxidoreductases are known, indicating the complexity of the system that underlies the correct pairing of two cysteines into a native disulfide bond. To fully understand oxidative protein folding, it is necessary to elucidate the role of novel PDI-family members. In this thesis, we provide a first characterization of a novel ER thiol-disulfide oxidoreductase, TMX4 (thioredoxin-like transmembrane protein 4). Sequence analysis showed that the protein contains a single thioredoxin-like domain, which holds an unusual CPSC active-site motif. The CPSC active-site sequence of HA-TMX4 is partially oxidized in the ER of living ceHs. Unlike other PDI-like family members it is predominantly oxidized, indicating that TMX4 has a different redox activity than well-known PDIs and that its in vivo redox state is subject to a different regulation. TMX4 is expressed in a wide variety of human tissues and 1S not upregulated by the unfolded protein response. By immunofluorescence, TMX4 was shown to localize to the ER. Furtherrnare, TMX4 was found to be a type I transmembrane protein that contains an Endoglycosidase Hsensitive N-glycan. Interestingly, TMX4 does not have a classical ER retention signal at the Ctenninus of its cytosolic tail. This region, however, holds an RQR sequence. Previously, RXR sequences have been found to confer ER localization to type II and multispanning membrane proteins. When the C-tcrminal tail was removed, HATMX4 partially redistributed to the cell surface. The same result was seen when mutating the two arginines of the RQR sequence to lysines, indicating that the RQR sequence contributes to the ER targeting of HA-TMX4. By attaching the RQRhearing C-terminal region to a plasma membrane protein, CD4, we generated chimeras that remained in the ER. In thc same construct, mutation of the RQR sequence resulted in cell surface expression. Overall, the results demonstrate that the RQR sequence in TMX4 is sufficient for ER localization. 7 Zusammenfassung Ein Enzym, Proteindisulfidisomerase (PDI), ist ganz alleine in der Lage, Disulfidbrücken im endoplasmatischen Reticulum (ER) sowohl zu bilden, als auch zu reduzieren und isomerisieren. Dass dennoch beinahe 20 PDI-ähnliche Thioldisulfidoxidoreduktasen bekannt sind, weist auf die Komplexität hin, die der korrekten Paarung zweier Cysteine zu einer native Disulfidbindung zugrundeliegt. Um oxidative Proteinfaltung vollständig zu verstehen, ist es notwendig, die Rolle der neuen Mitglieder der PDI-Familie zu beleuchten. Im Rahmen dieser Dissertation legen wir die erste Charakterisierung einer neuen Thioldisulfidoxidoreduktase des ER, TMX4 (thioredoxin-like transmembrane protein 4), vor. Die Analyse der Aminosäuresequenz von TMX4 zeigte, dass das Protein eine einzige Thioredoxin-ähnliche Domäne mit einem ungewöhnlichen CPSC-Motiv im aktiven Zentrum besitzt. Das ein CPSC-Motiv enthaltende aktive Zentrum von HATMX4 liegt in einem teilweise oxidierten Zustand vor. Anders als andere Mitglieder der PDI-Familie ist es vorwiegend oxidiert, was darauf hindeutet, dass sich die Redoxaktivität und die Regulierung des in vivo Redoxzustands von denen bislang charakterisierten PDI-ähnlichen Proteinen unterscheiden. Die Expression der TMX4mRNA wurde in einer breiten Vielfalt menschlicher Gewebe nachgewiesen und nicht durch die "unfolded protein response", der zellulären Antwort auf ungefaltete Proteine, aufreguliert. TMX4 ist ein Typ-I-Transmembranprotein mit einem Nverknüpften Glykan, das sich gegenüber Endoglykosidase H sensitive verhält. Durch lmmunofluoreszenz wurde gezeigt, dass TMX4 im ER lokalisiert ist. Interessanterweise besitzt TMX4 kein klassisches ER-Lokalisierungssignal am C-Terrninus des cytosolischen Schwanzes. Diese Region birgt jedoch eine RQRSequenz. Schon vor der vorliegenden Arbeit war bekannt, dass RXR-Sequenzen die ER-Lokalisierung von Typ-II-Transmembranproteinen und Proteinen mit mehreren Transmembrandomänen gewährleistet. Als der C-terminale Schwanz entfernt wurde, gelangte HA-TMX4 teilweise an die Zelloberfläche. Das gleiche Resultat wurde erhalten, als die Arginine der RQR-Sequenz zu Lysinen mutiert wurden, was darauf hindeutet, dass die RQR-Sequenz zum ER-"Targeting" von HA-TMX4 beiträgt. Durch Anheftung der RQR-beinhaltenden C-terminalen Region von TMX4 an das Plasmamembranprotein CD4 erzeugten wir Chimären, die im ER verblieben. Mutation der RQR-Sequenz im gleichen Konstrukt stellte die Zelloberflächen- 8 expression wieder her. Insgesamt zeigen die Resultate, dass die RQR-Sequenz von TMX4 hinreichend für die ER-Lokalisierung ist.