Standardisierte Terminologien in der Medizin zwischen Begriffssemantik und Anwendungspragmatik GMDS-Jahrestagung 2005, Freiburg Mittwoch, 14. September 2005 Dr. Josef Ingenerf Institut für Medizinische Informatik Universität zu Lübeck Vortragsinhalte Standardisierte Terminologie: Was ist gemeint? Typisierung von Terminologien Ordnungssystem für Begriffe => Begriffsorientierte Terminologien Klassen => Statistische Klassifikationen Themen => Kontrollierte Thesauren Zusammenfassung Ingenerf, Lübeck (2) Standardisierte Terminologie: Was ist gemeint? Ingenerf, Lübeck (3) Standardisierte Terminologie: Was ist gemeint? Ingenerf, Lübeck (4) Standardisierte Terminologie: Was ist gemeint? ISO/TC 215/WG 3 "Semantic content" (vorher "Health concept representation“) Ingenerf, Lübeck (5) Vortragsinhalte Standardisierte Terminologie: Was ist gemeint? Typisierung von Terminologien Ordnungssystem für Begriffe => Begriffsorientierte Terminologien Klassen => Statistische Klassifikationen Themen => Kontrollierte Thesauren Zusammenfassung Ingenerf, Lübeck (6) Typisierung von Terminologien Bildungsprinzipien Präkoordination, Identifikation System von Begriffen (Worten) System von Klassen/Themen Enumerative Begriffsliste, z.B. Alpha-ID, LOINC Hierarchisierung Einfache Postkoordination Formale Postkoordination Abstract-Band, S.80 Ingenerf, Lübeck (7) LOINC-Terminologie (RELMA) Ingenerf, Lübeck (8) Alpha-ID (“Entry Terms” der ICD-10) Ingenerf, Lübeck (9) Vortragsinhalte Standardisierte Terminologie: Was ist gemeint? Typisierung von Terminologien i.w.S. Ordnungssystem für Begriffe => Begriffsorientierte Terminologien Klassen => Statistische Klassifikationen Themen => Kontrollierte Thesauren Zusammenfassung Ingenerf, Lübeck (10) Unterscheidung von Begriff, Thema, Klasse Thema (Deskriptor, Schlagwort, Topic) Wüster, E (1971). Begriffs- und Themaklassifikation: Unterschiede in ihrem Wesen und in ihrer Anwendung. Nachrichten für Dokumentation 22 (3 & 4): 98-104 & 143-150. Ingenerf, Lübeck (11) MeSH-Thesaurus Ingenerf, Lübeck (12) MeSH-Thesaurus Themenhierarchie versus logische Begriffshierarchie Soualmia, LF, Golbreich, C, Darmoni, SJ (2004). Representing the MeSH in OWL: Towards a Semi-Automatic Migration. In: Hahn, U (ed.). Proc. of the First Int. Workshop on Formal Biomedical Knowledge Representation (KR-MED 2004) in Whistler (BC), Canada, 1 June, 2004. Online-Publikation (CEUR-Workshop Proceedings), siehe http://CEUR-WS.org/Vol-102/, 81-87. Ingenerf, Lübeck (13) MeSH-Thesaurus Nelson, SJ, Johnston, D, Humphreys, BL (2001). Relationships in Medical Subject Headings (MeSH), chapter 11. In: Bean, CA, Green, R (eds.). Relationships in the Organization of Knowledge. New York: Kluwer Academic Publishers, 171-184. Ingenerf, Lübeck (14) MeSH-Thesaurus: Deskriptor- und Konzeptebene desc2005.dtd Ingenerf, Lübeck (15) Typisierung von Terminologien Bildungsprinzipien Präkoordination, Identifikation Hierarchisierung Einfache Postkoordination Formale Postkoordination System von Begriffen (Worten) Enumerative Begriffsliste, z.B. Alpha-ID, LOINC System von Klassen/Themen - Einfache Themenliste Einfache Themenhierarchie, z.B. Gelbe Seiten Thesaurus oder multiaxiale Themenklassifikation, z.B. MeSH, Colon-Klass. Abstract-Band, S.80 Ingenerf, Lübeck (16) ICD-Klassifikation: Systematik Statistische Klassifikation versus Formales Begriffssystem Ingenerf, J, Giere, W (1998). Concept oriented Standardization and Statistics oriented Classification: Continuing the Classification versus Nomenclature Controversy. Meth.Inform.Med. 37 (4-5): 527-539. Ingenerf, Lübeck (17) Alpha-ID: Nummerierter alphabetischer Index der ICD-10 Alpha-ID ICD-10 Text der ICD I5051 I5057 I5052 I19021 I11881 I32930 K25.9 K25.9 K25.9 K25.9 K25.9 K25.9 (B96.81!) I85926 … K25.9 (F54) … Ulcus ventriculi Magenulkus Magengeschwür Magenschleimhautdefekt Ulcus pyloricum Infektion durch Helicobacter pylori bei Ulcus ventriculi Psychogenes Magenulkus … Synonymie? Ingenerf, Lübeck (18) Alpha-ID: Nummerierter alphabetischer Index der ICD-10 Alpha-ID ICD-10 Text der ICD SNOMED-CT I5051 I5057 I5052 I19021 I11881 I32930 K25.9 K25.9 K25.9 K25.9 K25.9 K25.9 (B96.81!) 14532008 6296006 253740007 9660004 5565008 42666000 I85926 … K25.9 (F54) … Ulcus ventriculi Magenulkus Magengeschwür Magenschleimhautdefekt Ulcus pyloricum Infektion durch Helicobacter pylori bei Ulcus ventriculi Psychogenes Magenulkus … 53189005 … Ingenerf, Lübeck (19) Typisierung von Terminologien i.w.S. Bildungsprinzipien Präkoordination, Identifikation Hierarchisierung System von Begriffen (Worten) Enumerative Begriffsliste, z.B. Alpha-ID, LOINC System von Klassen/Themen - Einfache Themenliste - Klassierter Wertebereich Einfache Themenhierarchie, z.B. Gelbe Seiten Statistische Klassifikation, z.B. ICD-10, NLM-Klass. Einfache Postkoordination Formale Postkoordination Thesaurus oder multiaxiale Themenklassifikation, z.B. MeSH, Colon-Klass. Abstract-Band, S.80 Ingenerf, Lübeck (20) Begriffsorientierte Terminologie SNOMED-CT Formales Begriffssystem Deduktion von Begriffswissen Beachtung von ontologischen Prinzipien Smith, B, Ceusters, W, Temmermann, R (2005). Wüsteria. In: Geissbuhler, A, Baud, R, Lovis, C (eds.). Proc. of the MIE 2005 conference, Geneva (Switzerland), 6 pages. Ingenerf, Lübeck (21) Begriffsorientierte Terminologie „SNOMED-CT“ 89662003 Helicobacter-assoziiertes pylorisches Ulkus (Störung) Fully defined by ... - ist ein/e - 128070006 infektiöse Krankheiten des Abdomens - 312121001 bakterielle Infektionskrankheit des Magen-Darm-Trakts - 39204006 pylorusnahes Magengeschwür - 6185008 in Verbindung mit Helicobacter stehende Krankheit - verursachendes Agens 80774000 Helicobacter pylori - Group - assoziierte Morphologie 56208002 Geschwür - Befundlokalisation 280119005 Struktur des Magenpförtners Ingenerf, Lübeck (22) Typisierung von Terminologien Bildungsprinzipien Präkoordination, Identifikation Hierarchisierung System von Begriffen (Worten) Enumerative Begriffsliste, z.B. Alpha-ID, LOINC Monoaxiales Begriffssystem (Taxonomie) Einfache Postkoordination Multiaxiales Begriffssystem, z.B. SNOMED II/III Formale Postkoordination Formales Begriffssystem, z.B. SNOMED CT System von Klassen/Themen - Einfache Themenliste - Klassierter Wertebereich Einfache Themenhierarchie, z.B. Gelbe Seiten Statistische Klassifikation, z.B. ICD-10, NLM-Klass. Thesaurus oder multiaxiale Themenklassifikation, z.B. MeSH, Colon-Klass. Abstract-Band, S.80 Ingenerf, Lübeck (23) Zusammenfassung Bildungsprinzipien Präkoordination, Identifikation Hierarchisierung System von Begriffen (Worten) Enumerative Begriffsliste, z.B. Alpha-ID, LOINC Monoaxiales Begriffssystem (Taxonomie) Einfache Postkoordination Multiaxiales Begriffssystem, z.B. SNOMED II/III Formale Postkoordination Formales Begriffssystem, z.B. SNOMED CT System von Klassen/Themen - Einfache Themenliste - Klassierter Wertebereich Einfache Themenhierarchie, z.B. Gelbe Seiten Statistische Klassifikation, z.B. ICD-10, NLM-Klass. Thesaurus oder multiaxiale Themenklassifikation, z.B. MeSH, Colon-Klass. Abstract-Band, S.80 Ingenerf, Lübeck (24)