Molekularbiologische Charakterisierung überlappender Gene in

Molekularbiologische Charakterisierung überlappender Gene in EHEC Aufgrund des Triplet‐Codes der DNA ist es theoretisch möglich, dass sich Sequenzen von zwei oder mehr Protein‐kodierenden Genen überlappen. Aus Bakterien sind bisher nur eine Handvoll solcher Genpaare bekannt. Allerdings gibt es zahlreiche Hinweise aus Transkriptom‐ und Translatomdaten, sowie Homologie zu bekannten Genen, dass überlappende Gene häufiger vorkommen als bisher angenommen wird. Als Modellorganismus verwenden wir enterohämorrhagische Escherichia coli (EHEC). Dies ist ein bedeutendes Lebensmittelpathogen, in dem wir bis jetzt zwei antiparallel überlappende Genpaare in EHEC funktionell charakterisieren konnten. Es sollen weitere ausgewählte antiparallel überlappende Genpaare molekularbiologisch untersucht werden: Promoterstudien mit GFP, Protein‐Nachweis mittels Western Blot, und Erzeugung Strang‐spezifischer knock‐out Mutanten. Je nach Fortschritt des Projekts können diese Mutanten in kompetitiven Wachstumsversuchen auf einen veränderten Phänotyp im Vergleich zum Wildtyp getestet werden. Voraussetzung: Interesse an Molekularbiologie Methoden: steriles Arbeiten mit pathogenen Bakterien, Kultivierung und Konservierung von Bakterien, DNA‐Isolation, PCR, Agarose‐Gelelektrophorese, Restriktionsverdau, Ligation, Transformation, Überexpression von Proteinen, SDS‐PAGE, Western Blot. Betreuerin: Sarah Hücker Bewerbung bis 7.November 2014