Skript Tutorium 3
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Biochemietutorium Nr 3 Jonathan Hammer, Selina Lerch Tutorium Nummer 3 Übersicht Nachtrag zur letzten Stunde Berechnung von K Aminosäuren Grundlagen Aminosäuren Chiralität UV-Absorption, Lambert-Beer-Gesetz Wiederholung funktionelle Gruppen Ladungen der Gruppen Peptide Peptidbindungen Nachtrag zur letzten Stunde 1. Berechnen Sie anhand des nachstehenden Energie-Reaktionsdiagramms a) ΔG und b) Gleichgewichtskonstante K der Reaktion bei 25˚C und ΔG0‘ = 5,0 kJ*mol-1! Lösung: K=0,133 (mit ΔG0‘ = -5,0 kJ*mol-1 wäre K= 7,5) Biochemietutorium Nr 3 Jonathan Hammer, Selina Lerch Aminosäuren 1. Was ist eine Aminosäure chemisch betrachtet? Wie liegt eine Aminosäure bei einem physiologischen pH vor? 2. Wie viele proteinogene Aminosäuren gibt es? 20 (22 mit Selenocystein und Pyrrolysin) Welches Enantiomer ist für die Proteinsynthese von Bedeutung? In welche Gruppen lassen sich die proteinogenen Aminosäuren einteilen? 3. Welche Aminosäure besitzt KEIN chirales C-Atom? Zeichnen Sie dieses und geben Sie den Namen, den Drei- und den Einbuchstabencode an! Hinweis: chirales Zentrum 4 verschiedene Substituenten (Zur Erinnerung: Was ist ein Stereoisomer? Was ist ein Enantiomer? Warum wird nur die LForm von Aminosäuren in der Proteinsynthese verwendet? Wie kann man das vorliegende Enantiomer nachweisen?) 4. Welche Aminosäuren besitzen zwei chirale Zentren? Zeichnen Sie diese und geben Sie die Namen, den Drei- und den Einbuchstabencode an! 5. Welche Aminosäuren sind in der Lage UV-Licht zu absorbieren? Worauf beruht diese Fähigkeit? 6. Bei der photometrischen Messung einer 1:50 verdünnten DNA-Lösung wurde eine Absorption von 0,132 bei einer Wellenlänge von 260nm gemessen. Der Extinktionskoeffizient von DNA (εDNA ) beträgt 50ml*µg-1*cm-1 und die Küvettendicke 1cm. Berechnen Sie die DNAKonzentration der Ausgangslösung! Wichtige Formel: Lambert-Beer-Gesetz A(λ)...Absorption [] ε...Extinktionskoeffizient [ml/µg*cm] c...Konzentration [µg/ml] d...Küvettendicke [cm] 7. Benennen Sie die funktionellen Gruppen folgender Moleküle! Biochemietutorium Nr 3 Jonathan Hammer, Selina Lerch 8. Bestimmen Sie die Ladung von Histidin bei a) PH = 5 b) PH= 7 und c) PH = 10 ! pKS (-COOH) = 1,82 pKs (-NH2) =9,17 pKs (-R) = 6,00 a) +1 b) +/-0 c) -1 9. Bestimmen Sie die Ladung von Glutaminsäure bei a) pH = 1 b) pH=3 c) pH = 7 und d) pH =12,3 pKS (-COOH) = 1,82 pKs (-NH2) =9,17 pKs (-R) = 4,3 a) b) c) d) +1 +/- 0 -1 -2 Peptide Wie entsteht eine Peptidbindung? Welcher Reaktionstyp ist das? Um welche funktionelle Gruppe handelt es sich? Aminosäuren der Woche Glycin Threonin Isoleucin
