Jens Wöhnert „Chemische Biologie – RNA-Strukturbiologie“, Institut für Molekulare Biowissenschaften, Johann-Wolfgang-Goethe Universität, Frankfurt Modul 2 – Biochemie: Enzymmechanismen Folien zur Vorlesung: http://www.uni-frankfurt.de/fb/fb15/institute/inst-3-mol-biowiss/ AK-Woehnert/lehre.html Biochemie_2016 Username: NMR2016 Passwort: NMR2016 Fragen/Vorschläge/Probleme: [email protected] Literatur: Stryer – aktuelle deutsche Übersetzung der 7. Auflage 2 Zusammensetzung und Struktur der Proteine. 8 Enzyme: Grundlegende Konzepte und Kinetik. 9 Katalytische Strategien. 10 Regulatorische Strategien Ähnliche Kapitel in Voet & Voet „Biochemie“ Literatur: T.D.H. Bugg „Introduction to enzyme and coenzyme chemistry“ 3. Auflage 2012, Wiley R.B. Silverman „Organic chemistry of enzymatic reactions“ 2002, Academic Press Gliederung (1) Enzyme - Einführung (2) Katalytische Strategien von Enzymen (3) Proteasen (4) ATPasen, GTPasen (5) SAM-abhängige Enzyme (6) Thiaminpyrophosphat abhängige Enzyme (7) Evolution von Enzymen (1) Enzyme - Einführung N2 + 3 H2 2 NH3 Fritz Haber 1868-1934 Nobelpreis 1918 Carl Bosch 1874-1940 Nobelpreis 1931 BASF Haber-Bosch-Verfahren 1910 ~ 500°C, ~ 200 atm, ~ 17% NH3, Eisenoxid-Mischkatalysator (1) Enzyme - Einführung N2 + 3 H2 2 NH3 Nitrogenase: Nitrogen-fixierende Bakterien (Rhizobien, Cyanobakterien) RT, 1 atm, 8 ATP 60% des weltweiten Stickstoffbedarfs (1) Enzyme - Einführung - Enzyme werden für alle chemischen Reaktionen in der Zelle benötigt - ermöglichen den Ablauf anspruchsvoller chemischer Reaktionen bei RT, atmosphärischem Druck und ~ neutralem pH-Wert - kein Leben ohne Enzyme - wichtige Targets für Pharmazeutika Aspirin: irreversibler Inhibitor der Cyclooxygenase (ProstaglandinEndoperoxid-Synthase) (1) Enzyme - Einführung - Herstellung wichtiger chemischer Verbindungen durch Fermentation Isopenicillin N-Synthase Ausgangsstoff für die Synthese synthetischer Penicillinvarianten organische Synthese: < 1% Ausbeute, mehrstufige Reaktion (1) Enzyme - Einführung - Herstellung wichtiger chemischer Verbindungen durch Fermentation Cyclosporin A synthesized by a nonribosomal peptidsynthase (1.4 Mda) (1) Enzyme - Einführung - Biotechnologie – Enzyme für Waschmittel, Lebensmittelherstellung - Molekularbiologie: Restriktionsenzyme, DNA- und RNAPolymerasen, CRISPR/Cas, TEV-Protease … - Wichtige Modellsysteme für das Design „biomimetischer“ Katalysatoren in der Chemie („green chemistry“) (1) Enzyme - Historie - Enzym = „in Hefe“ (Kühne 1878) - „Entdeckung“ 1897 durch Eduard Buchner - Zellfreier Hefeextrakt ist nach Zusatz von Zucker in der Lage, alkoholische Gärung durchzuführen Biochemische Reaktionen laufen auch Eduard Buchner 1860 – 1917 Nobelpreis 1907 außerhalb von Zellen ab Verantwortlich „Zymase“ – Enzyme der Glykolyse - Seit 1898: Alle Enzyme sollen einen Namen tragen, der auf …ase endet (1) Enzyme - Historie - Enzyme sind sehr spezifisch für ihre Substrate: „Schlüssel-Schloß-Prinzip“ – Emil Fischer 1894 Emil Fischer 1852 - 1919 Nobelpreis 1902 (1) Enzyme - Historie - Enzyme sind sehr spezifisch für ihre Substrate: „Schlüssel-Schloß-Prinzip“ – Emil Fischer 1894 25 mal langsamer 2.5 mal langsamer (1) Enzyme - Historie - Enzyme sind sehr spezifisch stereospezifische Reaktionen Hexokinase Nur die C6‘-OH – Gruppe wird phosphoryliert (1) Enzyme - Historie - Enzyme sind chemisch reine Makromoleküle: Proteine - Kristallisation der „Jack bean“ – Urease 1926 2 James B. Sumner 1887 - 1955 Nobelpreis 1946 (1) Enzyme – Struktur der Urease - Gelöst durch P. Andrew Karplus und Mitarbeiter 1995 (1) Enzyme – Struktur der Urease - Gelöst durch P. Andrew Karplus und Mitarbeiter 1995