DNA-Reparatur und Mutagenese-2 (Ulrich)

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DNA-Schäden
UV-Strahlung
Absorptionsmaximum der Basen
nicht
abschirmbar
Konsequenzen: Pyrimidin-Dimere (T-T, C-T, C-C)
O
H
O
N
O
O
H
H
N
O
N
H
N
N
N
O
N
N
O
O
O
H
O
N
O
cis-syn-(T-T)-Cyclobutan-Dimer
O
H
O
N
N
H
N
H
N
O
O
N
N
N
O
O
H
OH
N
O
T(6-4)T-Photoprodukt
Störung der helikalen Struktur
N
N
N
O
DNA-Schäden
ionisierende Strahlung
(g-, Röntgenstrahlung)
Gefahr von g- und Röntgenstrahlen:
Folgereaktionen:
Ionisierung von Wasser
H2O+ + H20 –> .OH + H3O+
.
OH + .OH <–> H2O2
eaq- + O2 –> O22 O2- + 2 H+ –> O2 + H2O2
H2O –> H20+ + e(Hydroxyl-Radikal)
(Peroxid)
(Superoxid)
(Peroxid)
==> reaktive Sauerstoff-Spezies
1. Basenschäden
oxidative Schäden
2. Strangbrüche
- Einzelstrangbrüche
- Doppelstrangbrüche (durch Angriff am Zucker, Ringspaltung und Eliminierung)
DNA-Schäden
durch Chemikalien und spontan
(hydrolysis)
hydrolysis
DNA-Schäden
spontan
Desaminierung: Hydrolyse der exocyclischen Amino-Gruppen
unnatürliche Base –> wird als Schaden erkannt
G
U
natürliche Base –> wird als Fehlpaarung erkannt
G
T
Depurinierung: Hydrolyse der glycosidischen Bindung (Base-Zucker) - passiert auch bei Pyrimidinen
C
apurinische Stelle –> Verlust der genetischen Information
DNA-Schäden
spontan/Chemikalien/Strahlung
Oxidation: Angriff der Doppelbindungen durch reaktive Sauerstoff-Spezies (O2-, .OH, H2O2)
Verlust der Planarität
z.B.:
8-oxo-7,8-dihydro-Guanin (oxoG), verursacht Mutationen durch Paarung mit A
Thymin-Glycol, blockiert die Replikation
DNA-Schäden
Chemikalien
Alkylierung/Adduktbildung: Modifizierung der N- und O-Gruppen
Veränderung der Paarungseigenschaften
Störung der helikalen Struktur
endogene Agenzien:
S-Adenosyl-Methionin
O
exogene Agenzien:
mono-funktionell:
z.B. Ethyl-Methansulfonat (ethyliert): EMS
Cl
bi-funktionell:
Cl
Cl
vergleichbar:
cis-Platin (cis-Pt)
NH2
S
O
Cl
S
z.B. Senfgas
Stickstoff-Yperit
Mitomycin C
O
N
Cl
CH3
Pt
Cl
NH2
Strang-Vernetzungen („cross-links“)
CH3
DNA-Schäden
Chemikalien
Strangbrüche: clastogene Agenzien / Radiomimetika
z.B. Bleomycin (wirkt durch Radikalbildung)
DNA-Schäden
Chemikalien
Basen-Analoga: werden anstelle der normalen Nucleotide in die DNA eingebaut
z.B. 5-Bromo-Uracil
Fehlpaarung mit G
Interkalatoren: Einlagerung zwischen den Basenpaaren
z.B. Ethidiumbromid
Leserastermutationen
Br-
Kombination: Interkalation und Modifikation
z.B. Benz(a)pyren
metabolische Aktivierung
DNA-Schäden
Hauptverursacher von
Schäden/Mutationen
Chemikalien
DNA-Schäden: Konsequenzen
Abhilfe:
direkte Induktion von Fehlpaarungen
Desaminierung von C
Oxidation von G
Basen-Analoga
Induktion von Leserastermutationen
Interkalatoren
Störung von Transkription und Replikation
Photoprodukte
Depurinierung
Oxidation (nicht immer)
Alkylierung/Addukte (nicht immer)
Strangvernetzungen
Strangbrüche
- passiv (Schutzmechanismen)
- aktiv (Reparatur)
direkte Eliminierung
Excision des Schadens
Rekombination (Verpflanzung eines intakten Bereichs)
- Toleranz
Aufschub der Reparatur auf später
Passiver Schutz vor DNA-Schäden
Haut / Pigmente
Struktur der DNA
Schutz durch Basenpaarung
A-Form (Bacillus-Sporen, dehydriert)
Radikalfänger
z.B. Vitamin C
Redox-Puffer
z.B. Glutathion
H2O2 + 2 G-SH –> 2 H2O + G-S-S-H
2 .O2 + 2 H+ –> H2O2 + O2
2 H2O2 –> 2 H2O + O2
Enzyme
Superoxid-Dismutase:
Katalase:
Räumliche Trennung
DNA im Zellkern
reaktiver Sauerstoff in Mitochondrien, Peroxisomen
DNA-Reparatur: Photoreaktivierung
Enzym: Photolyase
- fehlt in Säugetieren
- spezifisch für cis-syn-T-T-Dimere
- Substratbindung im Dunkeln
- Katalyse ist lichtabhängig (300-500 nm)
- 2 Chromophore:
1x „Antenne“ (Lichtsammler)
1x katalytisch (e--Donor)
Lichtsammler
katalytischer Cofaktor
DNA-Reparatur: Alkyltransferasen
Reaktion:
G
Enzym (E. coli):
Ada = O6-Methylguanin-DNA-Methyltransferase
T
Spezifität:
O6-Methylguanin
O4-Methylthymin
Methylphosphotriester (nur S)
andere Alkylgruppen (Ethyl, Propyl, Butyl, Chlorethyl)
„Selbstmord“-(suicide)-Enzym:
wirkt stöchiometrisch, nicht katalytisch
„Adaptive Response“
Beobachtung:
Ada ist notwendig für die Anpassung an Alkylierungs-Schäden
Verringerung der Sensitivität und Mutagenese
Proteolyse
Termination
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