Dissertation_N.Rückert

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Aus dem Institut für Tierhygiene und Öffentliches Veterinärwesen
der Veterinärmedizinischen Fakultät
der Universität Leipzig
Charakterisierung von caninen und felinen Parvoviren
in archiviertem Organmaterial
aus den Jahren 1970 bis 1978
Inaugural-Dissertation
zur Erlangung des Grades eines
Doctor medicinae veterinariae (Dr. med. vet.)
durch die Veterinärmedizinische Fakultät
der Universität Leipzig
eingereicht von
Nicola Rückert
aus Bochum
Leipzig, 2007
Mit Genehmigung der Veterinärmedizinischen Fakultät der Universität Leipzig
Dekan:
Prof. Dr. Karsten Fehlhaber
Betreuer:
Prof. Dr. Uwe Truyen
Gutachter:
1.Gutachter:
Prof. Dr. Uwe Truyen
Institut für Tierhygiene und Öffentliches Veterinärwesen
der Veterinärmedizinischen Fakultät der Universität Leipzig
2.Gutachter:
Prof. Dr. Volker Moennig
Institut für Virologie
Stiftung Tierärztliche Hochschule Hannover
3.Gutachter:
Prof. Dr. Heinz-Adolf Schoon
Institut für Veterinär-Pathologie
der Veterinärmedizinischen Fakultät der Universität Leipzig
Tag der Verteidigung: 16.01.2007
Für meine Eltern
In Liebe und Dankbarkeit
Inhaltsverzeichnis
Inhaltsverzeichnis
1
Einleitung............................................................................................................ 1
2
Literaturübersicht .............................................................................................. 2
2.1
Entdeckung des CPV-2 als Pathogen ........................................................... 2
2.2
Pathogenese, Klinik und Pathologie einer Infektion mit CPV/ FPV ............... 3
2.3
Taxonomie der Parvoviren ............................................................................ 5
2.4
Das Genus Parvovirus .................................................................................. 6
2.5
Morphologie .................................................................................................. 7
2.6
Genomorganisation....................................................................................... 9
2.7
Replikation .................................................................................................. 11
2.8
Wirtsspektren von CPV und FPV ................................................................ 13
2.9
Transferrinrezeptor ..................................................................................... 14
2.10 Evolutionäre Mechanismen des Caninen Parvovirus .................................. 15
2.11 Theorien zur Entstehung des CPV ............................................................. 19
3
Material und Methoden .................................................................................... 21
3.1
Material ....................................................................................................... 21
3.1.1
Probenauswahl .................................................................................... 21
3.2
Methoden .................................................................................................... 22
3.2.1
Probennahme ...................................................................................... 22
3.2.2
Aufreinigung der Proben ...................................................................... 22
3.2.3
Auswahl der Oligonukleotide ............................................................... 22
3.2.4
Polymerase-Kettenreaktion ................................................................. 25
3.2.5
Agarose-Gel-Elektrophorese ............................................................... 28
3.2.6
Klonieren der PCR-Amplifikate in Escherichia coli............................... 29
3.2.7
Aufreinigung der PCR-Produkte .......................................................... 30
3.2.8
Sequenzierung der PCR-Amplifikate ................................................... 30
3.2.9
Bearbeitung und Analyse der Sequenzen ........................................... 31
3.2.10 Tierartspezifische PCR ........................................................................ 33
3.2.11 Immunhistochemie............................................................................... 33
4
Ergebnisse........................................................................................................ 34
4.1
Probenauswahl ........................................................................................... 34
4.2
Sensitivität der PCR .................................................................................... 34
4.3
Nachweis der parvoviralen DNA ................................................................. 35
4.4
Ergebnisse der PCR zur vollständigen Sequenzierung des VP2-Gens ...... 36
4.5
Ergebnisse der Immunhistochemie und der tierartspezifischen PCR ......... 39
4.6
Sequenzanalyse ......................................................................................... 40
4.6.1
Sequenzierung..................................................................................... 40
4.6.2
Sequenzanalyse der Hunde- und Katzenproben ................................. 40
5
Diskussion ........................................................................................................ 46
5.1
Nachweismethoden .................................................................................... 46
Inhaltsverzeichnis
5.2
5.3
Sequenzanalyse ......................................................................................... 47
Abschließende Betrachtung ........................................................................ 49
6
Zusammenfassung .......................................................................................... 50
7
Summary........................................................................................................... 52
8
Literaturverzeichnis ......................................................................................... 54
9
Anhang.............................................................................................................. 62
9.1
Chemikalien und Reagenzien ..................................................................... 62
9.2
Tabellen ...................................................................................................... 63
9.3
Verwendete Codes ..................................................................................... 73
9.4
Vergleich der Parvovirussequenzen aus den Katzengeweben mit der
Referenzsequenz FPV-b ....................................................................................... 75
10 Danksagung ..................................................................................................... 88
Abkürzungsverzeichnis
Abkürzungsverzeichnis
A
Adenin
Ala
Alanin
Arg
Arginin
AS
Aminosäure
Asn
Asparagin
Asp
Aspartat
bp
Basenpaare
BFPV
Polarfuchs-Parvovirus (blue fox parvovirus)
C
Cytosin
CPV
canines Parvovirus
DNA
Desoxyribonukleinsäure (Desoxyribo-nucleid-acid)
dNTP
Desoxyribonukleosidtriphosphat
ds
doppelsträngig (double-stranded)
EDTA
Ethylendiamintetraessigsäure
FPV
felines Panleukopenie-Virus
G
Guanin
g
Gramm
Gly
Glycin
Ile
Isoleucin
ITR
inverted terminal repeats
IZKF
Interdisziplinäres
Zentrum
für
klinische
Universität Leipzig
kD
Kilo-Dalton
Leu
Leucin
Lys
Lysin
M
Molar
Met
Methionin
MEV
Nerz-Enteritis-Virus (mink enteritis virus)
min
Minuten
ml
Milliliter
mM
Millimol
Forschung
der
Abkürzungsverzeichnis
mRNA
messengerRNA (Boten-RNA)
g
Mikrogramm
l
Mikroliter
nm
Nanomol
NS1
Nichtstrukturprotein1
NS2
Nichtstukturprotein2
NS3
Nichtstrukturprotein3
Nt
Nukleotid
OD
Optische Dichte
ORF
Leserahmen (open reading frame)
PCR
Polymerase Kettenreaktion
pg
Pikogramm
pmol
Pikomol
RDPV
Marderhund-Parvovirus (raccoon dog parvovirus)
RNA
Ribonukleinsäure (Ribo-nucleid-acid)
RPV
Waschbär-Parvovirus (raccoon parvovirus)
Ser
Serin
ss
einzelsträngig (single-stranded)
Tris
Tris(hydroxymethyl)aminomethan
Tyr
Tyrosin
UV
ultraviolettes Licht
V
Volt
Val
Valin
VP1
Virusstrukturprotein1
VP2
Virusstrukturprotein2
VP3
Virusstrukturprotein3
Tabellenverzeichnis
Tabellenverzeichnis
Tabelle 1:Die Familie der Parvoviridae* ......................................................... 6
Tabelle 2: Oligonukleotide ............................................................................ 24
Tabelle 3: Zyklusbedingungen für die Oligonukleotide M1RE+M2RE .......... 26
Tabelle 4: Reaktionskomponenten des PCR Master Mix mit Volumen und
Konzentrationsangaben ........................................................................ 26
Tabelle 5: Reaktionskomponenten des Taq PCR Core Kit mit Volumen und
Konzentrationsangaben ........................................................................ 27
Tabelle 6: Viursisolate mit Angabe der Genbank-Nummern, Referenz,
Herkunft und Jahr der Isolierung ........................................................... 32
Tabelle 7: Parvovirus-positive Hundeproben (1970-1978) ........................... 37
Tabelle 8: ausgewählte Parvovirus-positive Katzenproben (1970-1978) ..... 38
Tabelle 9: Nukleotid- und Aminosäurenunterschiede im VP2-Gen aller
Katzenproben im Vergleich mit FPV-b .................................................. 42
Tabelle 10: Sequenzübereinstimmungen der Parvovirussequenzen der
Katzenproben untereinander sowie mit FPV-b und CPV-d in Prozent .. 44
Tabelle 11: Ausgewählte Proben (Hunde und Katzen) von 1980 –1970 ...... 63
Tabelle 12: Ausgewählte Proben anderer Tierarten ..................................... 66
Tabelle 13: Parvovirus-positive Proben bei Hunden (1970-1980) ................ 67
Tabelle 14: Parvovirus-positive Proben bei Katzen (1970-1980) ................. 69
Tabelle 15: Parvovirus-positive Proben anderer Tierarten: Waschbär ......... 72
Abbildungsverzeichnis
Abbildungsverzeichnis
Abbildung 1: elektronenmikroskopische Aufnahme des caninen Parvovirus . 7
Abbildung 2: Schematische Darstellung des strukturellen Aufbaus des
Viruskapsids autonomer Parvoviren ....................................................... 8
Abbildung 3: Kapsidstruktur (CPV/FPV) mit eingezeichneter
Dreiecksuntereinheit (PARRISH u. HUEFFER 2006) ............................. 9
Abbildung 4: Replikation autonomer Parvoviren. Modifiziert nach COTMORE
und TATTERSALL (1987) ..................................................................... 12
Abbildung 5: Schema der Entstehung des caninen Parvovirus. Modifiziert
nach HUEFFER et al. (2004) ................................................................ 16
Abbildung 6: Asymmetrische Untereinheit des CPV Kapsid mit Darstellung
der Lokalisation substituierter Aminosäuren auf der Kapsidoberfläche
(SHACKELTON et al. 2005a)................................................................ 17
Abbildung 7: Verdünnungsreihe der Plasmid-DNA (von 10-4 bis10-13) ......... 35
Abbildung 8: PCR-Amplifikate der Oligonukleotide M1RE+M2RE ................. 36
Abbildung 9: PCR-Amplifikate der Oligonukleotidpaare A(f/r), A0(f/r),A1(f/r),
A2(f/r), A3(f/r), A4(f/r), B(f/r), B1(f/r) (Hundeprobe 464 aus dem Jahr
1978) ..................................................................................................... 38
Abbildung 10: Fortsetzung Abbildung 9; PCR-Amplifikate der
Oligonukleotidpaare B1(f/r), B2(f/r), B3(f/r), B4(f/r), B5 (f/r), C(f/r), C1(f/r),
M(f/r) (Hundeprobe 464 aus dem Jahr 1978) ........................................ 39
Einleitung
1 Einleitung
Das canine Parvovirus (CPV-2) trat erstmals 1978 in den Hundepopulationen auf
und verbreitete sich weltweit in einer schweren Pandemie. Die Infektion mit CPV-2
führte zu einer akuten Gastroenteritis und wies eine hohe Mortalität bei
Hundewelpen auf. Die pathologischen Befunde und die klinischen Erscheinungen
der Erkrankung waren dem Erkrankungsbild einer Infektion mit dem Felinen
Panleukopenie-Virus (FPV) sehr ähnlich. Die vermutete nahe Verwandtschaft des
neu aufgetretenen CPV-2 mit FPV wurde aufgrund genetischer und antigener
Untersuchungen schnell nachgewiesen.
Ein bis zwei Jahre nach dem ersten Auftreten des caninen Parvovirus verdrängte
eine neue antigene Variante (CPV-2a) das CPV-2 vollständig aus den
Hundepopulationen. Im Gegensatz zu CPV-2 ist diese Variante in der Lage neben
Hunden, auch Katzen zu infizieren. Ab 1984 trat eine weitere antigene Variante
(CPV-2b) auf, die zusammen mit CPV-2a in den Hundepopulationen bis heute
koexistiert.
Die Unterschiede im Wirtsspektrum von FPV und CPV-2 basieren auf nur wenigen
kodierenden
Nukleotidaustauschen
im
VP2-Gen.
Aufgrund
der
Aminosäureveränderungen im Kapsidprotein (VP2) kommt es zu einer strukturellen
Veränderung des Viruskapsids und zu einer Änderung wesentlicher biologischer
Eigenschaften des Virus.
Die Entstehung des CPV-2 konnte bis heute noch nicht vollständig aufgeklärt
werden. Retrospektiv wird angenommen, dass sich das canine Parvovirus aus dem
Felinen Panleukopenie-Virus oder einem nahe verwandten Virus entwickelt hat.
Neuere Studien, welche die Substitutionsraten von CPV-Sequenzen untersuchten,
berechneten, dass CPV-2 bereits 10 Jahre vor 1978 in den Hundepopulationen
vorgekommen sein musste. Basierend auf dieser Vermutung war es das Ziel dieser
Arbeit CPV-2 aus archivierten Gewebeproben von Hunden und Katzen aus den
Jahren 1970 bis 1978 zu isolieren, um einen möglichen Anzestor des caninen
Parvovirus unter den frühen Isolaten des Virus zu identifizieren.
1
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2 Literaturübersicht
2.1 Entdeckung des CPV-2 als Pathogen
In den späten 1970er Jahren wurde eine zum ersten Mal aufgetretene
Infektionserkrankung bei Hundewelpen beschrieben, die eine akute infektiöse
Gastroenteritis verursachte und eine hohe Mortalität aufwies. Diese Erkrankung
breitete sie sich weltweit in einer schweren Pandemie bei Hunden aus (PARRISH
1990b). Die Darmerkrankung war nach histopathologischen Untersuchungen und
den klinischen Erscheinungen dem Erkrankungsbild des felinen PanleukopenieVirus bei Katzen sehr ähnlich. Eine Verwandtschaft zum FPV wurde durch
genetische (PARRISH et al. 1988a; TRUYEN et al. 1995b) und antigene
Untersuchungen (PARRISH et al. 1982a; PARRISH u. CARMICHAEL 1983) in den
folgenden Jahren nachgewiesen. In den ersten Jahren der Ausbreitung des caninen
Parvovirus wurde auch eine bei Hundewelpen auftretende Myokarditis mit dieser
Infektion in Zusammenhang gebracht (LENGHAUS u. STUDDERT 1980). Die erste
publizierte Isolierung des caninen Parvovirus erfolgte 1978 in den USA (APPEL et
al. 1979). Auch in Europa (BURTONBOY et al. 1979; OSTERHAUS et al. 1980),
Australien (KELLY 1978), Canada (GAGNON u. POVEY 1979), Japan (AZETAKA et
al. 1981) und Neuseeland (HORNER et al. 1979) erfolgten Nachweise. Innerhalb
kürzester Zeit infizierte CPV weltweit sowohl wilde, als auch domestizierte Caniden.
Um das Virus von dem früher beschriebenen caninen Parvovirus, dem canine
minute virus (CnMV/CPV-1), unterscheiden zu können, wurde es als CPV-2
bezeichnet. Der erste Nachweis von caninen Parvoviren erfolgte retrospektiv in
Griechenland durch den Nachweis von CPV-Antikörpern in einer Hundeprobe aus
dem Jahr 1974 (KOPTOPOULOS et al. 1986c). Auch Untersuchungen von
Hundeproben aus Belgien und den Niederlanden aus dem Jahr 1976/77 wiesen
Antikörper gegen das CPV nach (OSTERHAUS et al. 1980). Neuere Studien,
welche die Substitutionsraten von CPV-Isolaten untersuchten, vermuten, dass CPV2 bereits 10 Jahre vor 1978 in den Hundepopulationen vorgekommen sein musste
(SHACKELTON et al. 2005e). Ein bis zwei Jahre nach dem ersten Auftreten des
CPV-2 wurde eine neue antigene Variante (CPV-2a) beschrieben, die das CPV-2 in
den folgenden Jahren vollständig verdrängte (PARRISH et al. 1985c; PARRISH et
al. 1988c; PARRISH 1991b). Ab 1984 verbreitete sich in den Populationen eine
2
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weitere Variante (CPV-2b). In den USA ersetzte CPV-2b den vorherigen Typ CPV2a fast vollständig (PARRISH et al. 1991c). Das Wirtsspektrum des CPV-2, das sich
auf Hunde beschränkte, wurde durch die neuen anitgenen Varianten erweitert. So
besitzen diese die Fähigkeit sowohl Hunde als auch Katzen zu infizieren.
Neuere Studien berichten von weiteren antigenen Varianten. Eine dieser Varianten
scheint sich in Vietnam und Taiwan bei Leopardenkatzen (IKEDA et al. 1999;
MIYAZAWA et al. 1999; IKEDA et al. 2000a; NAKAMURA et al. 2004a), eine andere
in Italien in den Hundepopulationen auszubreiten (BUONAVOGLIA et al. 2001a;
MARTELLA et al. 2004).
Grundlage für die Unterschiede zwischen FPV und CPV sowie seinen antigenen
Varianten bilden wenige Aminosäurenaustausche im Viruskapsid (vgl. Punkt 2.10).
2.2 Pathogenese, Klinik und Pathologie einer Infektion mit
CPV/ FPV
Die
Infektion
mit
dem
caninen
Parvovirus
führt
zu
einer
schweren
Allgemeinerkrankung, die eine hohe Mortalität aufweist. Sie stellt eine zyklisch
verlaufende Allgemeininfektion dar.
Das Virus wird oral aufgenommen und vermehrt sich in den ersten 1-3 Tagen
zunächst in dem lymphatischen Gewebe des Nasopharynx, insbesondere den
Tonsillen (CSIZA et al. 1971c; CARMAN u. POVEY 1982; POLLOCK 1982;
MACARTNEY et al. 1984c). In der nachfolgenden virämischen Phase gelangt das
Virus zu den Zielorganen: Thymus, Knochenmark, Mesenteriallymphknoten, Milz,
Peyer’sche Platten und Darmepithel (CSIZA et al. 1971b; CARLSON et al. 1977;
MACARTNEY et al. 1984b; MEUNIER et al. 1985b). Die Annahme, dass eine
Infektion der Lymphozyten der Peyer’schen Platten auch direkt via M-Zellen
erfolgen könnte (CARMAN u. POVEY 1985), wurde durch Studien widerlegt, die den
Beginn der Infektion primär in den pharyngealen Lymphozyten nachwiesen
(PETERS
1996).
3-5
Tage
post
infectionem
infiziert
das
Virus
die
Epithelvorläuferzellen in den Lieberkühnschen Krypten und es kommt zu einer
massiven Zerstörung der Darmepithelzellen. Histopathologisch zeigt sich das
typische Bild einer Zottenatrophie vor allem im Ileum und im Jejunum (COOPER et
al. 1979; MACARTNEY et al. 1984a). Histologisch lassen sich intranukleäre
3
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Einschlusskörperchen nachweisen. Der Grad und die Schwere der Infektion sind
zum Teil durch die Erneuerungsrate der intestinalen Epithelzellen bestimmt
(CARLSON u. SCOTT 1977). Koinfektionen mit Darmparasiten oder Bakterien wie
Rota- und Coronaviren sind möglich und verschlimmern den Krankheitsverlauf.
Pathologisch-anatomisch ist eine akute katarrhalische bis fibrinös-hämorrhagische
Gastroenteritis nachweisbar.
Klinisch zeigen die Tiere vor allem starken, wässrig-blutigen Durchfall, häufiges
Erbrechen sowie Anorexie, Fieber und Depression. Eine Infektion mit CPV und FPV
kann jedoch auch mild oder subklinisch verlaufen (PARRISH et al. 1982b). Obwohl
CPV Zellen des Knochenmarks infiziert (MACARTNEY et al. 1984d; MEUNIER et al.
1985a; TRUYEN u. PARRISH 1992a), kommt es bei Hunden im Vergleich mit einer
FPV-Infektion bei Katzen eher zu einer relativen Lymphopenie. Ursächlich dafür
könnte sein, dass CPV und FPV unterschiedliche Zielzellen im Kochenmark
infizieren (PARRISH 2006). 4-6 Tage post infectionem beginnt die Ausscheidung
des Virus über den Kot.
Die Pathogenese sowie das klinische Erscheinungsbild stimmten weitgehend mit
der Infektion von Katzen mit FPV überein. Pathologisch-anatomisch kommt es hier
zu einer akuten katarrhalischen bis fibrinösen Enteritis. Der starke Befall der
Stammzellen
im
Knochenmark
führt
zu
einer
Panleukopenie.
Bei
einer
diaplazentaren Infektion der Katzenwelpen mit dem Virus kommt es zum klinischen
Erscheinungsbild der felinen Ataxie (KILHAM et al. 1971; CSIZA et al. 1971a).
Klinisch
zeigen
die
Katzen
neben
der
Ataxie
auch
Hypermetrie
und
Koordinationsstörungen. Ursache ist eine durch das Virus hervorgerufene
Kleinhirnhypoplasie.
Eine Infektion neugeborener Hundewelpen mit CPV kann eine cerebelläre
Erkrankung verursachen (SCHATZBERG et al. 2003).
Charakteristisches Anzeichen einer frühen Infektion mit CPV bei Hundewelpen ist
eine Myokarditis. Diese besondere Verlaufsform der caninen Parvovirose kann bei
Infektion innerhalb der ersten Lebenstage bei immunologisch naiven Welpen
auftreten. Es kommt zu kardialen Arrythmien, Dyspnoe und zum plötzlichen Tod der
zwei bis acht Wochen alten Welpen (HAYES et al. 1979). Da die Myokardzellen
zum Zeitpunkt der Infektion noch mitotisch aktiv sind, stellen sie aufgrund des
Tropismus des Virus zu teilungaktiven Zellen ein Zielorgan dar. Es kommt zu
multifokalen Nekrosen der Myokardzellen. Oft können histologisch intranukleäre
4
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Einschlusskörperchen nachgewiesen werden. Die Lungen sind sekundär infolge der
Herzschäden ödematös verändert. Diese Verlaufsform kommt allerdings aufgrund
der Durchseuchung der Populationen bzw. Impfungen und den damit vorhandenen
maternalen Antikörpern nur noch selten vor.
Lebendimpfstoffe gegen das CPV wurden frühzeitig entwickelt. Aufgrund der engen
Verwandtschaft zwischen FPV und CPV wurde anfangs ein attenuiertes FPV in
hohen Dosen eingesetzt, das beim Hund eine Wirksamkeit zeigte. Später erfolgte
der Einsatz eines CPV-spezifischen Lebendimpfstoffes.
Erkrankungen durch Infektion mit CPV kommen meistens nur noch als
Einzelerkrankungen vor. Insbesondere die Welpen erkranken, welche zum Zeitpunkt
der Impfung hohe maternale Antikörpertiter aufweisen. Die noch vorhandenen
Antikörper neutralisieren das Impfvirus, so dass es nicht zu einer durch das
Impfvirus induzierten Immunität kommen kann. Durch die Entwicklung wirksamer
Lebendimpfstoffe konnte der seuchenhafte Charakter der Erkrankung wirksam
bekämpft werden.
2.3 Taxonomie der Parvoviren
Die Familie der Parvoviridae (parvus (lat.) = klein) wird in zwei Subfamilien unterteilt.
Die
in
der
Subfamilie
Densovirinae
zusammengefassten
Viren
infizieren
ausschließlich Arthropoden und sind veterinärmedizinisch ohne Bedeutung. Die
Subfamilie der Parvovirinae repräsentiert alle Parvoviren, die bei Vertebraten
vorkommen. Die Klassifizierung erfolgt in drei Genera: Dependovirus, Erythrovirus
und Parvovirus. Viren des Genus Dependovirus benötigen für ihrer Replikation
sogenannte Helferviren wie z.B. Adeno- oder Herpesviren (MCPHERSON et al.
1982). Die Genera Erythrovirus und Parvovirus dagegen repräsentieren Viren, die
keine Helferviren benötigen und daher auch als autonome Parvoviren bezeichnet
werden. Im Genus Erythrovirus ist das für den Menschen pathogene Parvovirus B19
klassifiziert. Dieses Virus zeichnet sich durch einen hohen Tropismus zu erythroiden
Vorläuferzellen aus. Das Genus Parvovirus repräsentiert alle tierpathogenen
Parvoviren. Einen Überblick der taxonomischen Einteilung gibt Tabelle 1.
5
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Tabelle 1: Die Familie der Parvoviridae*
Subfamilie
Genus
Spezies
Wirt
Parvovirinae
Parvovirus
Minute virus of mice (MVM)
Maus
Feline panleukopenia virus
Stämme:
Feline panleukopenia virus
Katze
-
Canine parvovirus
Hund
-
Raccoon parvovirus
Waschbär
-
Mink enteritis virus (MEV)
Nerz
H-1 parvovirus
Nager
Kilham rat virus (KVR)
Ratte
LuIII virus
Maus
Mouse parvovirus 1 (MPV-1)
Maus
Porcine parvovirus
Schwein
Adeno-associated virus (AAV1-5)
Mensch
Avian adeno-associated virus (AAAV)
Huhn
Bovine adeno-associated virus (BAAV)
Rind
Duck parvovirus (DPV)
Ente
Goose parvovirus
Gans
Canine adeno-associated virus (CAAV)
Hund
Equine adeno-associated virus (EAAV)
Pferd
Ovine adeno-associated virus (OAAV)
Schaf
Erythrovirus
Human parvovirus B19
Mensch
Amdovirus
Aleutian mink disease virus (AMDV)
Nerz
Bocavirus
Bovine parvovirus type 1 (BPV-1)
Rind
Dependovirus
Densovirinae
-
Canine minute virus (CnMV)
Hund
Densovirus1
Junonia coenia densovirus
Schmetterling
Iteravirus1
Bombyx mori Densovirus
Seidenspringer
Brevidensovirus
Aedes aegypti Densovirus
Stechfliege
Pefudensovirus
Periplaneta fuliginosa Densovirus
Schabe
* Modifiziert nach (TATTERSALL 2006)
1
exemplarisch jeweils nur ein Vertreter aufgeführt
2.4 Das Genus Parvovirus
Das canine Parvovirus (CPV-2), feline Panleukopenie-Virus (FPV) und eine weitere
Anzahl FPV-ähnlicher Viren wie das Nerz-Enteritis-Virus (MEV, mink enteritis virus),
6
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Marderhund-Parvovirus (RDPV, raccoon dog parvovirus), Waschbär-Parvovirus
(RPV, raccoon parvovirus) und das Polarfuchs-Parvovirus (BFPV, blue fox
parvovirus) führen alle zu einem ähnlichen Krankheitsbild bei der jeweiligen Spezies
und weisen auf DNA-Ebene eine Homologie von über 98% auf (REED et al. 1988;
MARTYN et al. 1990; PARRISH 1991c).
Das canine minute virus (CnMV bzw. CPV-1; (BINN et al. 1970)) wurde 1967 aus
einem Hund isoliert und in die Subfamilie der Parvovirinae eingeordnet. Das als
CPV-1 bezeichnete Virus weist zu dem später entdeckten CPV-2 keine genetische
Ähnlichkeit auf (MACARTNEY et al. 1988; MOCHIZUKI et al. 2002) und ist eher
verwandt mit dem bovinen Parvovirus Typ-1 (SCHWARTZ et al. 2002). Das Virus
wird mit Fruchtbarkeitsstörungen und Welpenerkrankungen in Zusammenhang
gebracht (CARMICHAEL et al. 1991; CARMICHAEL et al. 1994).
2.5 Morphologie
Parvoviren sind kleine unbehüllte Viren, die im Durchschnitt 18-26nm groß sind.
Aufgrund der fehlenden Hülle besitzen sie eine hohe Tenazität in der Außenwelt.
Das Virus ist bei pH-Werten zwischen pH 3 bis pH 9 und Temperaturen bis 56°C
stabil (SIEGL et al. 1985).
Abbildung 1: elektronenmikroskopische Aufnahme des caninen Parvovirus
Das Genom ist von einem Kapsid umgeben, das sich aus 60 Kopien der
Strukturproteine VP1 und VP2 zusammensetzt (TSAO et al. 1991a). Diese liegen im
Kapsid in einem Verhältnis von 1:10 vor. Aufgeklärt wurde die Kapsidstruktur von
CPV-2 und FPV mit Hilfe der Röntgenstrukturanalyse (TSAO et al. 1991b;
7
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AGBANDJE et al. 1993b; LLAMAS-SAIZ et al. 1996a; SIMPSON et al. 2000;
GOVINDASAMY et al. 2003).
Die oberflächliche Struktur des Viruskapsids bildet einen Ikosaeder, der 20 Flächen
und 12 Ecken besitzt. Auf die Flächen lassen sich 60 identische gleichseitige
Dreiecke projizieren. Jede Dreiecksuntereinheit ist aus Teilen der Proteinkette des
VP2 zusammengesetzt. Es wird ein fassförmiges Faltungsmuster gebildet, das aus
acht anitparallelen ß-Faltblattsträngen besteht. Die Verbindung dieser Stränge
erfolgt durch große ineinandergreifende Schleifen. Diese als „loops“ bezeichneten
Schleifen befinden sich auf der Kapsidoberfläche und werden durch zahlreiche
nichtkovalente Bindungen stabilisiert. Dadurch erklärt sich die hohe Stabilität des
Kapsids.
Durch die Anordnung der Dreiecke kommt es zur Ausbildung verschiedener
Symmetrieachsen. Es werden 2x-Achsen, 3x-Achsen und 5x-Achsen unterschieden
(Abb. 2).
5x-Achse
Canyon
Three-fold-spike
3x-Achse
Dimple
Three-fold-spike
2x-Achse
3x-Achse
Abbildung 2: Schematische Darstellung des strukturellen Aufbaus des Viruskapsids
autonomer Parvoviren
Die 5x-Achse besitzt eine zylinderartige Form, ist hervorgehoben und von einer
kreisförmigen Vertiefung, dem sogenannten „canyon“, umgeben. Die 2x-Achse wird
von einer Einkerbung durchzogen, die als „dimple“ bezeichnet wird und die 3xAchse bildet eine Erhebung den „Three-fold-spike“(AGBANDJE et al. 1993a).
8
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Eine weitere Struktur zwischen „Canyon“ und „Dimple“ am Rande des „Three-foldspike“ wird als Schulter des „Dimple“ bezeichnet (STRASSHEIM et al. 1994d).
5x-Achse
3x-Achse
Abbildung 3: Kapsidstruktur (CPV/FPV) mit eingezeichneter Dreiecksuntereinheit
(PARRISH u. HUEFFER 2006)
Die Strukturen um den „Three-fold-spike“ sind von besonderem Interesse. Studien
ergaben, dass diese an den zellulären Transferrinrezeptor binden und für die
Kontrolle des Wirtsspektrums ausschlaggebend sind (PALERMO et al. 2003b;
HUEFFER u. PARRISH 2003b).
Auf die Lage wichtiger Aminosäuren bzw. Veränderungen von Aminosäuren an den
oben genannten Regionen bei FPV, CPV-2 und den neuen antigenen Varianten
CPV-2a und 2b wird im Rahmen der Evolution des caninen Parvovirus ausführlich in
Punkt 2.10 eingegangen.
2.6 Genomorganisation
Parvoviren besitzen ein einzelsträngiges lineares DNA-Genom von ungefähr 5000
Basen Länge (COTMORE u. TATTERSALL 1987). Das Genom codiert für die
Strukturproteine VP1 und VP2 sowie für drei Nichtstrukturproteine (NS1, NS2 und
NS3). Es sind zwei große offene Leserahmen („open reading frame“, ORF)
vorhanden. Am 3’-Ende des Genoms befindet sich der rechte ORF, der für die
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Strukturproteine codiert. Die Informationen für die Nichtstrukturproteine sind im
linken ORF enthalten, der sich am 5’-Ende befindet. Innerhalb des linken ORF ist
ein weiterer kleinerer Leserahmen verankert.
Die Nichtstrukturproteine werden durch alternatives Spleißen prozessiert, bei dem
der gleiche Genomabschnitt in verschiedenen Leserastern abgelesen wird. Die
gespleißten und ungespleißten Transkripte dienen als mRNA für die anschließende
Translation. Die genetischen Informationen des VP2 sind vollständig im VP1
enthalten. Damit eine mRNA für das VP2 transkribiert wird, ist ein „Splice“-Schnitt
erforderlich. Durch diesen erfolgt die Translation nicht vom ersten Startcodon
sondern vom zweiten Startcodon aus (COTMORE u. TATTERSALL 1987). Findet
die Translation vom ersten Startcodon aus statt, entsteht das am aminoterminalen
Ende um 143 Aminosäuren längere VP1. Ein drittes als VP3 bezeichnetes Protein
entsteht durch proteolytische Spaltung des VP2 am aminoterminalen Ende (TULLIS
et al. 1992). Die Funktion ist nicht genau geklärt.
Das Spleißen und das Ablesen des Genoms in verschiedenen Leserastern
ermöglichen den Parvoviren ihre gesamte Erbinformation auf dem sehr kleinen
Genom unterzubringen. (PARRISH 1990a).
Die Funktion der Nichtstrukturproteine ist noch nicht eindeutig geklärt. Am meisten
ist über das NS1 bekannt, das eine Nickase-, Helikase- und ATPase Aktivität besitzt
und bei der Replikation wichtig für die Auflösung der sogenannten „hairpin“Strukturen ist (WILSON et al. 1991). Das NS2 ist am Besten bei dem Minute Virus
of Mice untersucht worden, bei dem es eine entscheidende Rolle für eine effiziente
Translation spielt (NAEGER et al. 1993). Ebenso wird es bei der Kapsidbildung
benötigt (COTMORE et al. 1997a; COTMORE et al. 1997b).
Die Strukturproteine VP1 und VP2 bilden die Oberfläche des Kapsids und besitzen
eine besondere Bedeutung im Hinblick auf das Wirtszellspektrum (vgl. Punkt 2.9).
Insbesondere das VP2 bestimmt neben der Wirtsspezifität auch andere biologische
Unterschiede bei verschiedenen Parvoviren. Ein Austausch weniger Aminosäuren in
diesem Strukturprotein ist dafür verantwortlich, dass sich genetische und antigene
Eigenschaften verändern (PARRISH et al. 1991b; TRUYEN et al. 1995c).
10
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2.7 Replikation
Die Replikation der Parvoviren ist abhängig von der S-Phase der Wirtszelle, da die
Viren auf zelluläre Replikationskationsmechanismen angewiesen sind. Während der
S-Phase in der Mitose werden DNA-Polymerasen exprimiert, welche für die
Synthese des komplementären Stranges zur Doppelstrang-DNA des Virus benötigt
werden. Parvoviren besitzen deshalb einen ausgeprägten Tropismus zu mitotisch
aktiven Zellen. Die Viruskapside binden an den Transferrinrezeptor und gelangen
relativ schnell in die Zelle mit einem anschließenden langsameren Transport
innerhalb des endosomalen Systems (VIHINEN-RANTA et al. 2000; PARKER u.
PARRISH 2000; VIHINEN-RANTA et al. 2002).
Die im Zellkern stattfindende DNA-Replikation wird mit einem „rolling-hairpin“-Modell
erklärt (COTMORE u. TATTERSALL 1987; COTMORE et al. 1995). Besondere
Bedeutung besitzen die palindromischen Sequenzen, die sich am 3’- und 5’-Ende
des Genoms befinden. Diese auch als ITR-Regionen (inverted terminal repeats)
bezeichneten Strukturen (ASTELL et al. 1985) bilden Y- (3’-Ende) bzw. T-förmige
(5’-Ende) doppelsträngige Sekundärstrukturen aus. Der „hairpin“ am 3’-Ende dient
der DNA-Polymerase als Primer. Die Synthese erfolgt in Richtung 5’-Ende mit
anschließender Ligation zum geschlossenen Genom. Durch die Nickase-Aktivität
des NS1-Proteins wird das Genom an einer sequenzspezifischen Stelle wieder
aufgespalten und die DNA-Synthese wird entlang der Matrize fortgesetzt. Auf diese
Weise entsteht ein doppelsträngiges DNA-Molekül doppelter Genomlänge. Dieses
wird in zwei intermediäre Formen getrennt, die am 5’-Ende verlängert werden. Eines
dieser beiden Intermediate kann für einen weiteren Replikationszyklus eingesetzt
werden. Das andere liefert den Minus-Strang, der in das Viruskapsid verpackt wird
(s.Abb.4).
11
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Abbildung 4: Replikation autonomer Parvoviren. Modifiziert nach (COTMORE u.
TATTERSALL 1987)
ABa, EFf : palindromische Sequenzen
1)“hairpin”-Struktur am 3’-Ende dient als Primer 2)Amplifikation mittels zellulärer
Polymerase 3)Ligation 4)Auftrennen der zirkulären DNA durch Nickase-Aktivität des NS1
5) bis 7)Bildung eines doppelsträngiges DNA- Molekül 8)Spaltung, Ligation und
Verlängerung
des
DNA-Moleküls
9)Bildung
von
zwei
Intermediärprodukten
10)Verpackung des Minus-Strangs in das Kapsid 11)Virion mit noch angehefteten NS1
12
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2.8 Wirtsspektren von CPV und FPV
Das Wirtsspektrum von CPV und FPV in vivo und in vitro ist sehr unterschiedlich. In
felinen Zelllinien repliziert FPV in vitro und infiziert Katzen in vivo. In caninen
Zelllinien erfolgt keine Replikation. Bei Hunden, die mit FPV experimentell infiziert
wurden, erfolgt eine Replikation im Thymus und im Knochenmark ohne
Krankheitsanzeichen (TRUYEN u. PARRISH 1992b). Im Gegensatz dazu erfolgt bei
CPV-2 in vivo eine Replikation nur im Hund (PARRISH 1990b; TRUYEN u.
PARRISH 1992c). In vitro allerdings repliziert CPV-2 sowohl in felinen als auch in
caninen Zelllinien.
Mit Hilfe von monoklonalen Antikörpern wurden die neuen antigenen Varianten
CPV-2a und 2b bestimmt (PARRISH et al. 1985b; PARRISH et al. 1991a). CPV-2a
weist zwei von CPV-2 abweichende Epitope auf. (STRASSHEIM et al. 1994c).
Diese befinden sich in drei separaten Regionen auf oder um den „Three-fold-spike“.
Wie unter Punkt 2.10 beschrieben wird, resultieren die Unterschiede zwischen den
Varianten aus nur wenigen Aminosäurenunterschieden im Kapsidprotein. Durch
diese Veränderungen gewannen die neuen antigenen Varianten die Fähigkeit, in
Katzen zu replizieren (TRUYEN et al. 1996a).
Dass Katzen nicht nur nach experimenteller Infektion mit CPV-2a erkranken,
sondern dass diese Variante in verschiedenen Katzenpopulationen vorkommt,
zeigen Untersuchungen von erkrankten Katzen in Asien, Deutschland und USA. Bei
ca. 5% der untersuchten Katzen wurde CPV-2a nachgewiesen (MOCHIZUKI et al.
1993; TRUYEN et al. 1996b; IKEDA et al. 2000b; IKEDA et al. 2002). Ebenso sind
auch Wildtiere für die neuen anitgenen Varianten CPV-2a und 2b empfänglich. Vor
allem Großkatzen, bei denen klinische Symptome einer Parvovirusinfektion
festgestellt wurden, waren mit CPV-2a oder 2b infiziert (STEINEL et al. 2001).
In den Hundepopulationen wurde der ursprüngliche Typ CPV-2 durch die neuen
antigenen Varianten CPV-2a und 2b vollständig verdrängt (PARRISH et al. 1985a;
PARRISH et al. 1988d; PARRISH 1991a), wohingegen die neuen Varianten, die
sich
nur
in
einer
Katzepopulationen
Aminosäureposition
koexistieren.
Diese
unterscheiden,
Varianten
sind
in
in
Hunde-
und
unterschiedlich
ausgeprägter Verteilung weltweit vertreten. In den USA scheint das CPV-2b mit
80% dominant zu sein, während in Deutschland eine Verteilung von 60% CPV-2a zu
40% CPV-2b vorliegt (TRUYEN et al. 1996c).
13
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2.9 Transferrinrezeptor
Der Transferrinrezeptor ist physiologisch für die Aufrechterhaltung der EisenHomöostase der Zelle verantwortlich (PONKA u. LOK 1999). Er wird auf vielen
Zellen, aber vor allem auf mitotisch aktiven Zellen (Darmgewebe, lymphatisches
System), exprimiert, welche das Hauptziel bei einer CPV- oder FPV-Infektion
darstellen (PARRISH 1995). Der Transferrinrezeptor ist ein Transmembran-Protein
(90 kD) mit einem Amino- und einem Carboxyterminus. Der Aminoterminus befindet
sich im Zytoplasma, der Carboxyterminus extrazellulär. Die extrazelluläre Domäne
des humanen Transferrinrezeptors besitzt eine große Sequenzhomologie zum
felinen und caninen Rezeptor (HUEFFER et al. 2003c). An der extrazellulären
Domäne kann eine helikale und eine apikale Domäne, strukturell ähnlich zu einer
Protease, unterschieden werden. Die apikale Domäne wurde als der Teil des
Rezeptors identifiziert, der mit dem Kapsid von CPV und FPV interagiert
(PALERMO et al. 2003a). Von besonderer Bedeutung für die Kontrolle des
Wirtsspektrums von CPV und FPV scheinen eine Insertion einer AsparaginAminosäure in die apikale Domäne des caninen Transferrinrezeptors und eine
zusätzliche Glykolisierungsstelle in dieser Domäne zu sein (PALERMO et al.
2003c).
Als funktionaler Rezeptor für CPV und FPV wurde zunächst der feline
Transferrinrezeptor identifiziert (PARKER et al. 2001). In Versuchen mit Zellkulturen
wurden canine Zellen, die nicht für FPV empfänglich sind, mit dem Gen des felinen
Transferrinrezeptors transfiziert. Es zeigte sich, dass diese Zellen für FPV
empfänglich waren (HUEFFER et al. 2003d) und eine Infektion caniner Zellen durch
FPV unter normalen Bedingungen nicht möglich ist, weil ein funktionaler Rezeptor
auf diesen Zellen fehlt. Das canine Wirtsspektrum wird diesen Untersuchungen zu
Folge durch die Unterschiede in der Bindung von CPV und FPV an den caninen
Transferrinrezeptor kontrolliert. Die Bindung an den Rezeptor wird durch die
Regionen auf der Erhebung der 3x-Achse bestimmt (HUEFFER et al. 2003e).
Welche Aminosäurepositionen und Aminosäuren in dieser Region entscheidend für
eine strukturelle Veränderung des Kapsids und damit dem Wirtsspektrum sind, wird
ausführlich in Punkt 2.10 beschrieben.
Bestimmte strukturelle Veränderungen in dieser Region führen bei den antigenen
Varianten
CPV-2a/2b
zu
einer
effektiveren
14
Bindung
an
den
caninen
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Transferrinrezeptor als bei CPV-2 und legen den Schluss nahe, dass die Bindung
und die effektivere Nutzung des caninen Transferrinrezeptors wichtige Ereignisse in
der Evolution und der Pathogenese des caninen Parvovirus darstellen (HUEFFER
et al. 2003f). Es ist anzunehmen, dass das ursprüngliche CPV-2 den caninen
Transferrinrezeptor nur ineffizient nutzen konnte und sich im weiteren Verlauf seiner
Evolution die Bindungs- und damit die Infektionseffizienz verbesserte (HUEFFER u.
PARRISH 2003a).
2.10 Evolutionäre Mechanismen des Caninen Parvovirus
Die Anpassung des caninen Parvovirus an den Hund war ein komplexer Vorgang.
Die Fähigkeit des Anzestors von CPV in den frühen 1970er Jahren Hunde zu
infizieren, führte 1978 zu einer weltweiten Verbreitung des CPV-2 in einer schweren
Pandemie.
Die Veränderungen im Genom von CPV im Vergleich zu FPV basieren auf wenigen
Nukleotidunterschieden. Die kodierenden Nukleotidaustausche und die sich daraus
ergebende Aminosäureunterschiede im Kapsidprotein führen zu einer Veränderung
des Wirtsspektrums. Kontrolliert werden die Wirtsspektren von CPV und FPV durch
3 Regionen, die sich auf und um den sogenannten „Three-fold-spike“ befinden.
Insbesondere die zwei Aminosäuren an den Positionen 93 und 323 im VP2
bestimmen zusammen das canine Wirtsspektrum. Versuche zeigten, dass
Veränderungen dieser Aminosäuren in FPV, vergleichend zu denen in CPV, dazu
führten, dass diese so veränderten Viren nun in der Lage waren, auch canine Zellen
zu infizieren. (CHANG et al. 1992b; HORIUCHI et al. 1994; STRASSHEIM et al.
1994b; LLAMAS-SAIZ et al. 1996b; PARKER u. PARRISH 1997; HUEFFER et al.
2003a). Allerdings führte ein Austausch von nur einer dieser Aminosäuren zu keiner
Veränderung des Wirtsspektrums. Dies deutet darauf hin, dass erst eine bestimme
Kombination von Veränderungen in FPV dazu führte, dass dieses Virus canine
Zellen infizieren konnte.
Bestimmte Aminosäureaustausche in Regionen nahe den Aminosäurepositionen
299 und 300 auf dem „Three-fold-spike“ verhindern eine Infektion caniner Zellen.
Diese Regionen scheinen das feline Wirtsspektrum in vivo zu kontrollieren
(TRUYEN et al. 1994a). Die Aminosäuresubstitutionen an den Positionen 80, 564
15
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und 568 scheinen für eine effiziente Vermehrung des Virus in der Katze
verantwortlich zu sein (TRUYEN et al. 1996d).
Die antigene Variante CPV-2a weist im Vergleich zu CPV-2 Aminosäureaustausche
an den Positionen 87, 300 und 305 auf. Diese befinden sich an der Schulterregion
des „Three-fold-spike“ (TRUYEN et al. 1995d; TRUYEN et al. 1996e). Bei dem ab
1984 nachgewiesenen anitgenen Typ CPV-2b sind im Vergleich zu CPV-2a
Substitutionen an den Aminosäurepositionen 426 und 555 vorhanden. In Abbildung
5 ist die Entstehung des CPV mit seinen neuen Varianten und den entsprechenden
Aminosäuresubstitutionen schematisch dargestellt.
CPV-2
(1978-1981)
heute ausgestorben
(Fuchs,Nerz)?
Val103Ile
Hund
Lys80Arg
Lys93Asn
Leu87Met
Asp323Asn
Anpassung an caninen TfR
Ala300Gly
Ser564Asn
Asp305Tyr
Hund und Katze
Gly568Ala
CPV-2a (1978 bis heute)
Katze
FPV
(< 1900 bis heute)
Asp426Asn
MEV
(1940 bis heute)
Ile555Val
Bindung an felinen TfR
CPV-2b (1984-heute)
Abbildung 5: Schema der Entstehung des caninen Parvovirus. Modifiziert nach
(HUEFFER et al. 2004)
16
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Blau/Türkis: Unterschiede zwischen FPV  CPV
Grün: Unterschiede zwischen CPV-2  CPV-2a/b
Gelb: Varianten innerhalb von CPV2a/b
Abbildung 6: Asymmetrische Untereinheit des CPV Kapsid mit Darstellung der
Lokalisation substituierter Aminosäuren auf der Kapsidoberfläche (SHACKELTON et
al. 2005d)
Die Funktion einiger Mutationen wurde in verschiedenen Studien bestimmt. Die
Aminosäureaustausche an den Positionen 93 und 323 kontrollieren zusammen die
Bindung an den caninen Transferrinrezeptor (HUEFFER et al. 2003b). Die
Veränderungen der Aminosäuren an den Positionen 87, 300 und 305, die bei CPV2a vorliegen, führen zu einer verbesserten bzw. effektiveren Bindung an den
caninen Transferrinrezeptor (HUEFFER et al. 2003g). Dies legt den Schluss nahe,
dass CPV-2a durch diese Fähigkeiten in der Lage war, die frühere antigene
Variante CPV-2 vollständig zu verdrängen und dass diese Aminosäureaustausche
von zentraler Bedeutung in der Evolution und Pathogenese des caninen Parvovirus
sind (HUEFFER et al. 2003h).
Die Unterschiede in diesen Aminosäurepositionen haben neben der Veränderung
des Wirtsspektrum und der Bindung an den Transferrinrezeptor auch zu
Veränderungen der Epitope des Kapsidproteins geführt. Der Unterschied zwischen
FPV und CPV an dem CPV-spezifischen Epitop um Aminosäure 93 (CHANG et al.
1992a) zeigte sich in einer Substitution von Lys zu Asn. Zwischen CPV-2 und CPV2a waren mehrere Aminosäureaustausche im Kapsidprotein (AS 87, 300, 305) an
dem Verlust eines CPV-2 spezifischen Epitops und dem Gewinn eines für CPV-2a
spezifischen Epitops beteiligt (STRASSHEIM et al. 1994a). Das CPV-2b spezifische
17
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Epitop um Aminosäure 426 (PARRISH et al. 1991d) veränderte im Vergleich zu
CPV-2a ebenfalls ein Epitop des Virus.
Veränderungen weiterer Aminosäuren in CPV-2a/2b finden sich an zwei Regionen
des VP2 nahe den Positionen 93 und 300 auf dem „Three-fold-spike“, zum einen an
der
Aminosäureposition 426,
zum
anderen an der
Position 297.
Diese
Aminosäureveränderungen wurden bei zwei CPV-Isolaten von Hunden aus Italien
beschrieben (BUONAVOGLIA et al. 2001b). Die Aminosäuren Asn bei CPV-2a und
Asp bei CPV-2b die an der Position 426 vorliegen, wurden durch Glu ersetzt.
Möglicherweise handelt es sich um eine neue Variante des caninen Parvovirus, die
in der Hundepopulation in Italien neben CPV-2a und 2b koexistiert (BUONAVOGLIA
et al. 2001c).
Die Aminosäuresubstitution an Position 297 (AlaSer) wurde bei verschiedenen
CPV-Isolaten in Deutschland nachgewiesen (TRUYEN 1999a). Diese Mutation
kommt sowohl bei CPV-2a als auch CPV-2b vor und scheint in Deutschland sehr
verbreitet zu sein. Ebenso wurde diese Veränderung bei Isolaten in Asien (IKEDA et
al. 2000c) und Italien (BATTILANI et al. 2001; BUONAVOGLIA et al. 2001d)
nachgewiesen. In den USA scheint diese Mutation bis wenigstens 1999 in CPV2a/2b nicht vorherrschend zu sein (TRUYEN 1999b).
Weitere Aminosäureaustausche wurden bei Leopardenkatzen aus Vietnam und
Taiwan beschrieben (NAKAMURA et al. 2004b). Diese neue Variante (CPV-2c)
weist an der Aminosäureposition 300 einen Austausch von Gly durch Asp auf.
Weitere Nukleotidaustausche, die vereinzelt weltweit vorkommen, wurden bei
verschiedenen CPV-Isolaten beschrieben. Es wird vermutet, dass diese zusammen
mit anderen im Genom vorkommenden Austauschen korrelieren (PARRISH u.
HUEFFER 2006).
Die immer wieder neu auftauchenden Nukleotidaustausche weisen darauf hin, dass
die Anpassung des caninen Parvovirus an den Wirt Hund noch nicht abgeschlossen
ist und in den folgenden Jahren mit einer Weiterentwicklung des Virus gerechnet
werden kann.
18
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2.11 Theorien zur Entstehung des CPV
Zum Entstehungsmechanismus des caninen Parvovirus gibt es verschiedene
Theorien. Eine Theorie basiert auf der Annahme, dass sich CPV durch eine zufällige
Mutation der Nukleotide in FPV entwickelt hat. Phylogenetische Sequenzvergleiche
der beiden Viren aus den 1970er Jahren zeigten allerdings, dass sich Isolate von
CPV und FPV immer deutlich unterschieden. Es wurde bis heute keine
Zwischenform in FPV- und CPV-Sequenzen aus dieser Zeit gefunden, die eine
zufällige Entstehung von CPV aus FPV erklären könnte.
Der Einsatz von FPV-Lebendvakzinen führte früh zu einer weiteren Theorie, welche
eine mögliche Entstehung von CPV aus einer veränderten FPV-Vakzine vermutete.
In Untersuchungen mit polyklonalen Seren und Restriktionsenzymen früher CPVIsolate sowie FPV-Vakzine-Stämme aus den 1970er Jahren wurde eine enge
Verwandschaft von CPV und FPV nachgewiesen (TRATSCHIN et al. 1982). Die
Vermehrungsfähigkeit von CPV in felinen Zellkulturen stützt diese Theorie. Es
konnte jedoch kein Nachweis einer direkten Abstammung aus den FPVImpfstämmen erbracht werden. Eingehende Sequenzanalysen der viralen DNA
früher CPV-Isolate aus 1978/79, der FPV-Impfstämme sowie FPV-Isolate aus dieser
Zeit widerlegten diese Theorie (TRUYEN et al. 1998a).
Eine Sequenz eines Parvovirus-Isolats bei einem europäischen Rotfuchs (Vulpes
vulpes) stützt eine dritte Theorie, die eine Entwicklung des CPV über FPV-ähnliche
Viren bei Wildtieren für möglich hält (TRUYEN et al. 1998d). Diese DNA-Sequenz
weist einen kodierenden Nukleotidunterschied an Position 3094 auf, der zu einer
Aminosäuresubstitution an Position 103 (ValIle) im VP2 führt. Das plötzliche
Auftreten von CPV in domestizierten Hundepopulationen könnte durch eine
Übertragung dieses Virus von wilden auf domestizierte Carnivoren erklärt werden
(TRUYEN et al. 1998c).
Untersuchungen zu phylogenetischen Verwandtschaftsverhältissen der Familien
Canidae und Felidae der Ordnung Carnivora ergaben, dass es unter den Caniden
Spezies gibt, die verwandtschaftlich gesehen den Feliden näher stehen als dem
Hund. Diese Spezies (z.B. Füchse, Nerze, Waschbären) könnten als potentielle
Wirte für eine intermediäre Form des CPV gedient und diese auf den Hund
übertragen haben. Im Anschluss könnte eine Anpassung an den neuen Wirt Hund
erfolgt sein.
19
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Neuere
Studien,
welche
die
Substitutionsraten
von
verschiedenen
Parvovirussequenzen aus der Genbank untersuchten, ergaben, dass CPV bereits
10 Jahre vor der weltweiten Ausbreitung im Jahr 1978 in den caninen Populationen
hat zirkulieren müssen (SHACKELTON et al. 2005c).
CPV-2 mit einem ermittelten mittleren Alter von 36 Jahren zirkulierte demnach
zwischen 1968 und 1978 in den caninen Populationen. Ein Bericht aus
Griechenland, in dem rückwirkend 1974 CPV-Antikörper in einem Hundeserum
nachgewiesen wurde, stützt diese Annahme (KOPTOPOULOS et al. 1986b). Für
CPV-2a wurde im Mittel ein Alter von 28 Jahren bestimmt. Diese Variante des
caninen Parvovirus existierte nach diesen Untersuchungen bereits seit 1976. Es
wird angenommen, dass diese beiden Varianten des caninen Parvovirus in den
1970er Jahren in den caninen Populationen kozirkulierten und nützliche Mutationen
unter strenger positiver Selektion anhäuften, bis es schließlich zum Ausbruch einer
Epidemie kam (SHACKELTON et al. 2005b).
20
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3 Material und Methoden
3.1 Material
3.1.1 Probenauswahl
Die im Rahmen der vorliegenden Arbeit ausgewählten und untersuchten Proben
wurden freundlicherweise vom Institut für Pathologie der Stiftung Tierärztliche
Hochschule Hannover zur Verfügung gestellt.
Es wurde ein Zeitraum von 1970 bis 1980 festgelegt. In diesem Zeitraum erfolgte
eine Auswahl der in Befundordnern dokumentierten Fälle. Dabei handelte es sich
um Hunde- und Katzenproben sowie eventuell vorhandene Proben anderer
Karnivoren.
Die Proben wurden nach folgenden Kriterien in Vorberichten und Befunden
ausgewählt. Vorberichtliche Erwähnungen wie Erbrechen, Durchfall, katarrhalische
oder hämorrhagische Enteritis, Welpensterben als Bestandproblem, plötzlicher Tod
sowie Ataxie und Verdacht auf Panleukopenie bei Katzen wurden als Hinweise für
eine Infektion mit Parvoviren gewertet. Bei den pathologisch-anatomischen
Befunden, den pathologischen Diagnosen und den histopathologischen Befunden
wurde auf Kriterien wie katarrhalische bis fibrinöse Enteritis, andere pathologische
Veränderungen
des
Darmepithels
(z.B.
Zottenatrophie,
Abschilferung
des
Darmepithels) und Lymphopenie geachtet. Weitere Auswahlkriterien bei Katzen
waren Hinweise auf Panleukopenie oder auch „Katzenseuche“ sowie Myokarditis
und Parvovirose bei Hunden. Die Auswahl erfolgte, wenn mindestens eines der
aufgeführten Kriterien erfüllt wurde.
Die Paraffinblöcke mit Darm- und/ oder Herzgewebe
wurden aussortiert und gekennzeichnet.
21
von ausgewählten Fällen
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3.2 Methoden
3.2.1 Probennahme
Von jedem Paraffinblock wurden jeweils drei Schnitte mit einer Dicke von 10m mit
Hilfe eines Schlittenmicrotoms (Firma Jung) entnommen und anschließend in 1,5 ml
Eppendorfgefäße verbracht. Nach jeder Probe wurden zwei Schnitte von einem
paraffineingebetteten Gehirngewebe eines Hirsches zur Kontaminationskontrolle
entnommen.
Die Desinfektion des Arbeitsplatzes erfolgte jahrgangsweise nach den Katzen- bzw.
Hundeproben mit 70%igem Ethanol und 10%igem Natriumhypochlorit. Die Klingen
des Schlittenmicrotoms wurden gewechselt.
3.2.2 Aufreinigung der Proben
Um die DNA isolieren zu können, wurden die Gewebeproben mit 1200l Xylol
deparaffinisiert und anschließend zweimal mit jeweils 1200l 100%igem Ethanol
gewaschen (TRUYEN et al. 1994b). Bis zur vollständigen Verdunstung des Ethanols
wurden die Proben in den geöffneten Eppendorfgefäßen unter dem Abzug
getrocknet.
Die weitere DNA-Aufreinigung wurde mit Hilfe des DNA Micro Kit (Qiagen, Hilden)
gemäß den Angaben des Herstellers durchgeführt. Das Gewebe wird bei der
Aufreinigung zunächst lysiert und anschließend auf eine Silikagel-Membran
aufgetragen. Die DNA wird durch Zentrifugieren an der Membran adsorbiert. Nach
zweimaligem Waschen mit Pufferlösungen wird die DNA mit Hilfe eines weiteren
Puffers eluiert. Das Eluat diente dem anschließenden Nachweis der parvoviralen
DNA.
3.2.3 Auswahl der Oligonukleotide
Zum Nachweis der parvoviralen DNA wurde das von Steinel et al. (2000)
veröffentliche Oligonukleotidpaar M1RE+M2RE verwendet. Weitere angegebene
Oligonukleotidpaare (M10+M11, M13+M44, M1+M41) konnten nicht verwendet
werden, da mit diesen keine Ergebnisse bei den Proben erzielt werden konnten.
22
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Daher
wurden
zur
vollständigen
Sequenzierung
des
VP2-Gens
weitere
Oligonukleotide anhand einer FPV-Nukleotidsequenz (Genbank-Nr. M24004, FPV-b
Isolat CU4) entweder mit dem Programm Primer 3 (ROZEN u. SKALETSKI 2000)
oder manuell erstellt. Die Überprüfung der Oligonukleotide hinsichtlich ihrer
Spezifität wurde mit der Datenbank des National Center for Biotechnology
Information (NCBI, Bethesda, MD, USA, http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Genbank/) und
dem Programm BLAST (ALTSCHUL et al. 1997) durchgeführt. Die Überprüfung
erfolgte, um eine fehlerhafte Anlagerung (sog. mismatching) der Oligonukleotide an
ähnliche, nicht FPV- bzw. CPV- spezifische Gensequenzen zu verhindern. Die
Bezeichnung der Oligonukleotide, die Sequenz und die Nukleotid-Position bezogen
auf die Nukleotidsequenz des FPV-b Isolates CU4 sind in Tabelle 2 aufgeführt.
Die Synthese der Oligonukleotide erfolgte durch die Firma Biomers, Ulm.
23
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Tabelle 2: Oligonukleotide
Primer Nukleotidsequenz
nt-Position Fragmentlänge
A0f
5’-cca tca aca tca aga cca aca-3’
379-399
A0r
5’-gac cac cgt ctg gtt gaa ct-3’
535-516
Af
5’-ccg gtg cag gac aag taa aa-3’
464-483
Ar
5’-tac ccg tag aaa tcc cca ca-3’
631-612
A1f
5’-ggt gca gga caa gta aaa ag-3’
466-485
A1r
5’-agt ctg ctt gag ttt gct gt-3’
704-685
M1RE
5’-agc tgt cga cga aaa cgg atg ggt gga aat-3’
656-683
M2RE
5’-gct cga gaa ttc agt tgc caa tct cct gga tt-3’
896-865
A2f
5’-cat tgg ttg atg caa atg ct-3’
830-849
A2r
5’-gct gct gga gta aat ggc ata-3’
1067-1047
A3f
5’-cat tga tgg ttg cat tag at-3'
1016-1035
A3r
5’-tgg cac aga att ttc aat ag-3’
1254-1235
A4f
5’-cca tgg aaa cca acc ata cc-3’
1096-1115
A4r
5’-tct aca tgg ttt Rca atc aaa aa-3’
1323-1301
Bf
5’-taa gaa cag gtg atg aat tt-3’
1265-1284
Br
5’-ctc agc tgg tct cat aat ag-3’
1506-1487
B1f
5’-tgc ctc aat ctg aag gag cta-3’
1382-1402
B1r
5’-tca cca tct gct gct tga tt-3’
1625-1606
B2f
5’-cgt cta cac aag ggc cat tta-3’
1541-1561
B2r
5’-tga atc caa tct cct tct gga-3’
1748-1728
B3f
5’-caa cag gag aaa cac ctg aga g-3’
1670-1691
B3r
5’-ccc aaa ttt gac cat ttg gat-3’
1912-1892
B4f
5’-cca att gga ggt aaa aca gga-3’
1804-1824
B4r
5’-ttc gtt aaa tta ggc gca ac-3’
2024-2005
B5f
5’-cac cag ttt atc caa atg gtc a-3’
1883-1904
B5r
5’-cct ttc cac caa aaa tct gaa-3’
2093-2073
Cf
5’-atc ctg atg cat ctg cta at-3’
2033-2052
Cr
5’-ggt gct agt tga gat ttt tca t-3’
2240-2219
C1f
5’-ttc aga ttt ttg gtg gaa agg-3’
2073-2093
C1r
5’-tgt tct agg tgc tag ttg ata tg-3’
2307-2285
f:
r:
 :
R:
156 bp
167 bp
238 bp
240 bp
237 bp
238 bp
227 bp
241 bp
243 bp
207 bp
242 bp
220 bp
210 bp
207 bp
234 bp
vorwärts gerichtete Amplifikationsrichtung (forward)
rückwärts gerichtete Amplifikationsrichtung (reverse)
nicht zu FPV-b komplementär
__:
Restriktionsenzymschnittstelle
Nukleotid A oder G
bp:
Basenpaare
24
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3.2.4 Polymerase-Kettenreaktion
3.2.4.1 Durchführung der PCR
Die Polymerase-Kettenreaktion ist eine in-vitro-Methode, um DNA spezifisch zu
amplifizieren. Es werden zwei Primer benötigt, wobei einer am 3’-Ende des zu
amplifizierenden DNA-Abschnittes, der andere am 5’-Ende bindet. Dadurch sind
zwei Startpunkte für die DNA-Polymerasereaktion definiert. Die Vervielfältigung der
DNA erfolgt durch eine thermostabile DNA-Polymerase (Taq-Polymerase) in sich
wiederholenden Zyklen.
Zunächst wird die DNA bei 94°C denaturiert. Anschließend erfolgt die Anlagerung
(Annealing) der Oligonukleotide an die einzelsträngige DNA bei den für die
Oligonukleotide jeweils spezifischen Annealing-Temperaturen. Danach wird durch
die DNA-Polymerase mit Hilfe der Desoxynukleotidtriphosphate ein komplementärer
DNA-Strang bei 72°C synthetisiert (Elongation). Anschließend erfolgt wieder eine
Denaturierung bei 94°C und der Zyklus wiederholt sich. Bei jedem dieser Zyklen
kann somit die Anzahl der Amplifikate verdoppelt werden. Nach Ablauf des letzten
Zyklus erfolgt eine finale Elongation bei 72°C und anschließend das Abkühlen auf
4°C.
Die PCR diente zum einen dem Nachweis der parvoviralen DNA, zum anderen der
Herstellung von PCR-Amplifikaten, die zur vollständigen Sequenzierung des VP2Gens erforderlich waren.
Die optimalen Zyklusbedingungen für die Oligonukleotide M1RE+M2RE sind in
Tabelle 3 aufgeführt. Die optimale Annealing-Temperatur bei den übrigen
Oligonukleotiden betrug 54°C. Die weiteren Parameter des Zyklus wurden
übernommen.
25
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Tabelle 3: Zyklusbedingungen für die Oligonukleotide M1RE+M2RE
Phase
Temperatur
Zeit
1.Denaturierung
94°C
5min
2.Denaturierung
94°C
30s
3.Annealing
59°C
30s
4.Elongation
72°C
1min
5.finale Elongation
72°C
10min
6.kühlen
4°C

Zyklenzahl
35 x
Die Menge je Reaktionsansatz betrug 25l. Je Reaktion wurde 1,5l Template und
jeweils ein Oligonukleotidpaar in einer Konzentration von 200nM eingesetzt. Es
wurde entweder der PCR Master Mix (1.1x ReddyMix ABgene House, Surrey, UK)
oder der Taq PCR Core Kit (Qiagen, Hilden) für die PCR Reaktion verwendet. Die
genauen Mengen- und Konzentrationsangaben sind in Tabelle 4 und 5
wiedergegeben.
Tabelle 4: Reaktionskomponenten des PCR Master Mix mit Volumen und
Konzentrationsangaben
Reagenzien
Bestandteile
Volumen
Konzentrationen in 25l
PCR Master Mix
(in l)
Reaktionsansatz
PCR MasterMix*
22,5
DNA Polymerase
0,625 units
Tris-HCL
75mM
(NH4)2SO4
20mM
MgCl2
2,5mM
Tween 20
0,01%
dNTP
0,2mM 1)
Primer f
0,5
200nM
Primer r
0,5
200nM
* enthält 2,5mM MgCl2, Laufpuffer
1)
für jedes dNTP (dATP, dCTP, dGTP, dTTP)
26
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Tabelle 5: Reaktionskomponenten des Taq PCR Core Kit mit Volumen und
Konzentrationsangaben
Qiagen
PCR
Konzentration in 25l
Volumen (in l)
Reagenzien
Puffer*
Reaktionsansatz
2,5
(Tris Cl, KCL, (NH4)2SO4,)
Q-Solution
2,5
MgCl2 1)
3
2,25mM 2)
dNTP (1:3 verdünnt)
2
200M 3)
Destilliertes Wasser
11,4
-
Primer f
1
400nM
Primer r
1
400nM
0,1
0,5 units
Taq DNA Polymerase
*enthält 15 mM MgCl2, pH 8,7
1)
25 mM MgCl2
2)
zusammen mit MgCl2 im PCR Puffer: 3,75mM
3)
für jedes dNTP
Für jedes Oligonukleotidpaar wurde ein Versuchsansatz in einem Reaktionsgefäß
hergestellt und das Oligonukleotidpaar hinzugefügt. Anschließend wurden räumlich
getrennt dazu die Gefäße für die PCR-Reaktion mit 23,5l pro Gefäß befüllt und die
Proben hinzupipettiert. Die einzelnen Reagenzien sowie die Reaktionsansätze
wurden dabei immer auf Eis gehalten. Bei jeder PCR-Reaktion wurde eine Positivund eine Negativkontrolle mitgeführt. Als Positivkontrolle diente der aufgereinigte
Zellkulturüberstand des Isolats CPV-d.
Die
PCR-Reaktionen
fanden
im
Eppendorf
Mastercyclergradient
(Firma
Eppendorf, Hamburg) statt.
3.2.4.2 Optimierung der PCR
Die optimalen Zyklusbedingungen sowie die Sensitivität der PCR für die
Oligonukleotide M1RE+M2RE und die weiteren in Tabelle 2 aufgeführten
Oligonukleotide wurden experimentell ermittelt. Dazu wurde eine Verdünnungreihe
von 10-4 bis 10-12 für die Oligonukleotide M1RE+M2RE mit einem Plasmid, das ein
27
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partielles VP2-Gen (891bp) von einem CPV-Isolat enthält, angefertigt. Für die
weiteren Oligonukleotide wurde eine 10-3 bis 10-6 Verdünnung des aufgereinigten
Zellkulturüberstandes des Isolats CPV-d benutzt. Mit Hilfe eines Gradientencyclers
(Eppendorf Mastercyclergradient, Firma Eppendorf, Hamburg) wurden die
optimalen Annealing-Temperaturen für die Oligonukleotide ermittelt. Die PCRProdukte wurden dazu auf ein 2%iges Agarosegel aufgetragen und nach Färbung
im Ethidiumbromidbad visuell ausgewertet.
3.2.5 Agarose-Gel-Elektrophorese
Die Gelelektrophorese wurde eingesetzt, um die PCR-Produkte nachzuweisen. Sie
basiert darauf, dass Nukleinsäuren bei einem neutralen pH aufgrund ihrer
Phosphatgruppen polyanionisch sind und bei angelegter Spannung in der
Gelelektrophoreseapparatur in Richtung Anode wandern. Die Nukleinsäuremoleküle
werden durch eine Gelmatrix, die aus einem Agarosegel besteht, entsprechend ihrer
Größe aufgetrennt. Mit steigender Konzentration des Gels können immer kleinere
DNA-Fragmente auch mit nur wenigen hundert Basenpaaren aufgetrennt und
nachgewiesen werden.
Der Nachweis der PCR-Produkte erfolgte mit 2%igen Agarosegelen. Zur Herstellung
des Agarosegels wurden 2g Agarosepulver in 100 ml TBE Laufpuffer gelöst, in der
Mikrowelle erhitzt und anschließend in einen Gelträger gegossen. Nach Erstarren
der Agarose wurde das Gel in die mit TBE gefüllte Elektrophoresekammer (Firma
Peqlab Biotechnologie GmbH, Erlangen) gelegt. Die Zusammensetzung des
Laufpuffers und die des Agarosegels sind detailliert im Anhang aufgeführt.
Es wurden jeweils 8l der PCR-Produkte, sowie der Positiv- und Negativkontrollen
in die Kavitäten des Agarosegels pipettiert. Zur Größenbestimmung der Amplifikate
wurde 4l des Molekulargewichtsmarkers (PeqGold 50 bp DNA-Leiter, Firma
Peqlab Biotechnologie GmbH, Erlangen) aufgetragen. Da der Taq PCR Core Kit
(Qiagen, Hilden) keinen Laufpuffer enthält, wurde zu 8l der PCR-Amplifikate je
1,5l Ladepuffer (Firma Peqlab Biotechnologie GmbH, Erlangen) zugesetzt und die
gesamte Menge in die Kavitäten des Gels pipettiert.
An der Elektrophoresekammer wurde mit einem Netzgerät (Powerpack 200, BioRad Laboratories, Hercules, USA) eine Spannung von 140 V für 60 min angelegt.
Anschließend wurde das Gel mit dem interkalierenden Fluoreszenzfarbstoff
28
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Ethidiumbromid (Ethidiumbromid-Lösung 1%, Firma AppliChem GmbH, Darmstadt)
für ca. 10 bis 15 Minuten angefärbt. Die Konzentration des Ethidiumbromidbades
betrug 0,5g/ ml. Durch Einlagerung des Ethidiumbromids in die DNA kann diese
unter UV-Licht (Wellenlänge 460nm) als Banden sichtbar gemacht werden. Zur
Visualisierung und zum Fotografieren wurde das Geldokumentationssystem Gel
Doc 2000 (Bio-Rad Laboratories, Hercules, USA) und die Software Bio Rad
Quantity One- 4.0.3. (Bio Rad Laboratories, Herkules, USA) benutzt.
3.2.6 Klonieren der PCR-Amplifikate in Escherichia coli
In Einzelfällen wurden die amplifizierten PCR-Produkte mit Hilfe des TOPO TA
Cloning-Kits (Firma Invitrogen, Karlsruhe) kloniert. Es wurden PCR-Produkte
entweder direkt aus dem Reaktionsansatz oder ausgeschnitten aus einem 2%igen
TAE-Gel verwendet. Die Aufreinigung im letzteren Fall erfolgte mittels QIAquick Gel
Extraction Kit (Qiagen, Hilden). Die Insertion der DNA-Fragmente in den pCR 2.1Vektor erfolgte gemäß den Angaben des Herstellers. Anschließend wurden die
Plasmide in TOP10F’ (E.coli)-Bakterien transformiert. Gemäß Herstellerangaben
erfolgte die Blau-Weiß-Selektion der Klone mit inseriertem PCR-Produkt auf LB-ZNährböden mit Ampicillin. Die genaue Zusammensetzung ist im Anhang aufgeführt.
Nach Aufschütteln der Klone in LB-Bouillon (Sigm, LB Broth, Miller, Luria Bertani)
für 6-8 Stunden erfolgte die Aufreinigung der Plasmid-DNA mit Hilfe des QIAprep
Miniprep Kit (Qiagen, Hilden).
Zur Kontrolle, ob das gewünschte PCR-Produkt tatsächlich in dem Plasmidvektor
enthalten ist, wurde vor der Sequenzierung ein Restriktionsverdau mit dem
Restriktionsenzym EcoRI (New England BioLabs GmbH, Frankfurt a.M.) in einer
Konzentration von 100000 U/ml durchgeführt. Das „insert“, das bei dem
verwendeten Vektor von EcoRI-Schnittstellen flankiert ist, kann somit aus dem
Plasmid geschnitten werden.
Verdau:
Plasmid
4l
EcoRI
2l
EcoRI Puffer
4l
Destilliertes Wasser
30l
29
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Nach 2 Stunden Inkubation bei 37°C erfolgte der Nachweis der erwarteten Größe
des „inserts“ mit Hilfe der Gelelektrophorese (2%iges Agarosegel, 140 V, 60 min.).
3.2.7 Aufreinigung der PCR-Produkte
Die in der PCR amplifizierten DNA-Fragmente wurden für die folgende
Sequenzierung mit Hilfe des QIAquick PCR Purification Kit (Qiagen, Hilden)
aufgereinigt. Die Aufreinigung erfolgte gemäß den Angaben des Herstellers. Die
DNA-Fragmente werden dabei an eine Silicagel-Membran gebunden. Die restlichen
noch enthaltenen Bestandteile der PCR wie Oligonukleotide, dNTP, Pufferionen und
DNA-Polymerase wurden mit Hilfe eines Waschschrittes entfernt. Die Elution
erfolgte mit einem Elutionspuffer. Anschließend wurden die Proben an das IZKFLeipzig (IZKF- Interdisziplinäres Zentrum für klinische Forschung der Universität
Leipzig) weitergeleitet.
3.2.8 Sequenzierung der PCR-Amplifikate
Die Nukleotidsequenzen wurden durch das IZKF Leipzig (IZKF- Interdisziplinäres
Zentrum für klinische Forschung der Universität Leipzig) ermittelt. Die Bestimmung
erfolgte nach der Kettenabbruchmethode nach Sanger (SANGER et al. 1977).
Prinzip dieser Methode ist es, dass es durch Einbau von Didesoxy-Nukleotiden zum
Abbruch
der
Polymerisationsreaktion
kommt.
Dabei
verläuft
die
Polymerisationsreaktion in vier getrennten Ansätzen mit jeweils den vier NukleotidMonomeren und der Didesoxy-Variante einer Nukleotidsorte. Der Start der
Polymerisationsreaktionen ist bei allen Strängen gleich und wird durch ein
Oligonukleotid, das als Primer dient, vorgegeben. Die Kettenverlängerung läuft
solange ab, bis schließlich ein Didesoxy-Nukleotid eingebaut wird und damit die 3’OH-Gruppe zur Ausbildung der Phosphodiesterbindung zum nächsten Kettenglied
fehlt. Da der Anfangspunkt festgelegt ist, spiegelt die Länge der Synthesefragmente
in einem Reaktionsansatz die relative Position der jeweiligen Nukleobasenorte im
Molekül wider. Die Auftrennung der vier Ansätze nebeneinander entsprechend ihrer
Größe in einem Acrylamidgel ermöglicht das Ablesen der Basensequenz direkt vom
Gel.
30
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Die Nukleotide wurden vom IZKF mit Fluoreszenzfarbstoffen markiert. Die
Probenvorbereitung erfolgte mit dem Big Dye Terminator v. 3.1. Cycle Sequencing
Kit (Applied Biosystems, Foster City, CA, USA). Für die PCR-Reaktion wurde das
16 Kapillargerät ABI Prism 3100 Genetic Analyzer C (Applied Biosystems, Foster
City, CA, USA) eingesetzt. Die Auswertung der Daten erfolge mit Hilfe der
dazugehörigen Software DNA Sequencing analysis 5.1. (Applied Biosystems, Foster
City, CA, USA).
3.2.9 Bearbeitung und Analyse der Sequenzen
Die vom IZKF ermittelten Sequenzen wurden zunächst mit dem Programm BLAST
(ALTSCHUL et al. 1997) hinsichtlich ihrer Spezifität überprüft. Die Analyse und
Bearbeitung erfolgte im Anschluss mit den Programmen Chromas (Technelysium
Ltd, Tewantin Qld) und der Sofware LASERGENE (DNASTAR Inc., Madison,
Wisconsin).
Phylogenetische Untersuchungen wurden in einem Alignment der ermittelten
Sequenzen mit verschiedenen in der Genbank veröffentlichten Sequenzen (Tab.6)
von FPV-, CPV-, MEV-, RPV-, RDPV- und BFPV- Isolaten nach der clustal WMethode (THOMPSON et al. 1994) und mit Hilfe von Stammbäumen, die mit dem
Programm PAUP (Swofford, D.L. 1998, PAUP, Phylogenetic Analysis Using
Parsimony, Version 4.0b, Sinauer Associates, Sunderland, Massachusetts) erstellt
wurden, durchgeführt.
31
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Tabelle 6: Viursisolate mit Angabe der Genbank-Nummern, Referenz, Herkunft und
Jahr der Isolierung
Genbank-Nr.
Virusisolat
Referenz
Isolierung
Herkunft
(Jahr)
AB000056
FPlV-Obihiro
Horiuchi,M.; direct submission 1996
1974
JAPAN
AB000068
FPLV-tu4
Horiuchi,M.; direct submission 1996
1975
JAPAN
AB000066
FPLV-tu2
Horiuchi,M.; direct submission 1996
1975
JAPAN
AB000064
FPLV-tu12
Horiuchi,M.; direct submission 1996
1979
JAPAN
AB000061
FPLV-Som4
Horiuchi,M.; direct submission 1996
1995
JAPAN
AB000059
FPLV-Som1
Horiuchi,M.; direct submission 1996
1994
JAPAN
AB000052
FPLV-A04
Horiuchi,M.; direct submission 1996
1994
JAPAN
M24002
FPV-a (Philips Roxane)
(PARRISH et al. 1988b)
1962
U.K.a
M24004
FPV-b CU4
(PARRISH et al. 1988b)
1967
U.S.b
U22187
FPV-23
(TRUYEN et al. 1995a)
1990
U.S.
U22189
FPV-d
(TRUYEN et al. 1995e)
1964
U.S.
X55115
FPV-193
(MARTYN et al. 1990)
1970
AUSTRALIEN
M10824
FPV-Carlson
(CARLSON et al. 1985)
1966
U.S.
U22188
FPV-377
(TRUYEN et al. 1995a)
1993
DEUTSCHLAND
AY742934
CPV-447
(SHACKELTON et al. 2005e)
1995
DEUTSCHLAND
AY742935
CPV-U6
(SHACKELTON et al. 2005e)
1995
DEUTSCHLAND
AY869724
CPV-Taichung
(WANG et al. 2005)
2003/04
TAIWAN
M74849
CPV-39
Parrish,C.R. direct submission 1991
1984
U.S.
M24003
CPV-15
(PARRISH et al. 1988b)
1984
U.S.
M38245
CPV-d
(PARRISH 1991c)
1978
U.S.
NC_001539
CPV-Norden
(REED et al. 1988)
1978
U.S.
M24000
CPV-31
(PARRISH et al. 1988b)
1983
U.S.
M74852
CPV-133
Parrish, C.R.; direct submission 1991
1990
U.S.
AJ002928
CPV-Pudel
(TRUYEN et al. 1998b)
1979
DEUTSCHLAND
AJ002927
CPV-ChowChow
(TRUYEN et al. 1998b)
1979
DEUTSCHLAND
U22186
CPV-128
(TRUYEN et al. 1995a)
1979
U.S.
D26079
CPV-Y1
(HORIUCHI et al. 1994)
1982
JAPAN
U22193
RD-87
(TRUYEN et al. 1995a)
1987
FINNLAND
D00765
MEV-Abashiri
(KARIATSUMARI et al. 1991)
1978
JAPAN
U22191
MEV-e
(TRUYEN et al. 1995a)
1965
U.S.
M23999
MEV-a
(PARRISH et al. 1988b)
1973
U.S.
M24001
MEV-b
(PARRISH et al. 1988b)
1975
U.S.
U22190
MEV-d
(TRUYEN et al. 1995a)
1965
U.K.
U22185
BFPV-1
(TRUYEN et al. 1995a)
1983
FINNLAND
M24005
Raccoon
(PARRISH et al. 1988b)
1979
U.S.
a: United Kingdom
b: United States
32
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3.2.10
Tierartspezifische PCR
Die tierartspezifische PCR wurde vom Tierärztlichen Institut der Georg-AugustUniversität in Göttingen durchgeführt. Eine Probe wurde mit 7 katzenspezifischen
Mikrosatelliten als Marker (FCA26, FCA43, FCA58, FCA88, FCA90, FCA 126,
FCA132) und 11 hundespezifischen Markern (PEZ1;FHC5054; FHC2010; PEZ5;
PEZ12; PEZ6; PEZ8; FHC2079; FH2247; FH2164; FH2001) untersucht.
3.2.11
Immunhistochemie
Der immunhistochemische Nachweis von felinen / caninen Parvoviren einer Probe
wurde am Institut für Pathologie der Stiftung Tierärztliche Hochschule Hannover
durchgeführt. Dabei wurden folgende Antikörper benutzt:
-
Maus-anti-Parvovirus: CPV1-2A1 (von Chris Grant, Ph.D., D.Sc., 813
Harbor BLV #284), Balb/C Mäuseascites (BioLogo, Kronshagen)
-
Biotinyliertes
Ziege-anti-Maus-Serum:
Laboratories, Petersborough, U.K.).
33
GAM-b
IgG
(H+L)
(Vector
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4 Ergebnisse
4.1 Probenauswahl
Im Rahmen dieser Arbeit wurden in Befundordern des Instituts für Pathologie der
Stiftung Tierärztliche Hochschule Hannover in den Jahren von 1970 bis 1980 nach
den in Punkt 3.1.1 genannten Auswahlkriterien 493 Fälle ermittelt. Dabei handelte
es sich um 208 Katzen und 250 Hunde sowie 35 Fälle anderer Karnivoren, die für
eine Untersuchung in Frage kamen.
Jahrgangsweise wurden maximal jeweils 10 Hunde- und 10 Katzenproben
ausgewählt. 1973 wurden alle Hundeproben untersucht, da eine als Hundeprobe
gekennzeichnete Probe positiv war. Die Paraffinblöcke der Proben wurden im Archiv
herausgesucht und gekennzeichnet. Zusätzlich wurden aus dem Jahr 1967 zwei
Nerzproben, dem Jahr 1972 eine Wolfprobe, dem Jahr 1973 eine Nerz- und aus
dem Jahr 1974 zwei Waschbärproben untersucht.
Eine detaillierte Aufführung der ausgewählten Proben findet sich in Tabelle 11 und
12 im Anhang. Insgesamt wurden 204 Proben untersucht.
4.2 Sensitivität der PCR
Zur Bestimmung der Sensitivität der PCR mit den Oligonukleotiden M1RE+M2RE
wurde ein in TE-Puffer gelöstes Plasmid, welches das partielle VP2-Gen (891 bp)
eines CPV-Isolates enthielt, verwendet. Die Verdünnung erfolgte mit destilliertem
Wasser in Verdünnungsstufen von 10-4 bis 10-12. Nach Messung der optischen
Dichte bei 260nm wurde die Kopienzahl als Genomäquivalente nach folgender
Formel bestimmt: Eine Einheit OD260 entspricht einer Konzentration von 50g/ml.
Ein Nukleotidbasenpaar weist ein Molekulargewicht von 660pg/pmol auf. Daraus
resultierte für das verwendete Plasmid (4822 bp) ein Molekulargewicht von 3,2 x 10 6
g/mol. Für die PCR ergab sich demnach eine Nachweisgrenze von 10 bis 100
Kopien pro Reaktionsansatz. Die Bestimmung der optimalen Annealing-Temperatur
erfolgte mit Hilfe eines Gradientencyclers (Eppendorf Mastercyclergradient, Firma
Eppendorf, Hamburg) und wurde bei 59°C festgelegt. Die Annealing-Temperatur
wurde so gewählt, dass der Nachweis einer spezifischen Bande möglich war. Zur
34
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Bestimmung der Sensitivität der Polymerase-Kettenreaktionen der weiteren in
Tabelle 2 genannten Oligonukleotide wurde der mit dem QIAamp DNA Mini Kit
(Qiagen, Hilden) aufgereinigte Zellkulturüberstand des Isolats CPV-d eingesetzt. Im
Vergleich mit der Sensitivität der PCR mit den Oligonukleotiden M1RE+M2RE war
der Unterschied in der Sensitivität nicht mehr als um den Faktor 100 geringer. Die
optimale Annealing-Temperatur betrug 54°C.
MG: Molekulargewichtsstandard
10-4
10-8
10-12
250 bp 
MG
(50bp)
- : Negativkontrolle
-
Abbildung 7: Verdünnungsreihe der Plasmid-DNA (von 10-4 bis10-13)
4.3 Nachweis der parvoviralen DNA
Zum Nachweis der parvoviralen DNA wurde als spezifische und sensitive
Nachweismethode die PCR mit den Oligonukleotiden M1RE+M2RE eingesetzt.
Diese Oligonukleotide amplifizieren ein Sequenzstück von 240 bp Länge, das sich in
dem Genomabschnitt befindet, der für das VP2-Strukturprotein kodiert.
Von den insgesamt 198 untersuchten Hunde- und Katzenproben aus den Jahren
1970 bis 1980 konnten 17 positive Hunde- und 64 positive Katzenproben ermittelt
werden. Bei den ausgewählten Proben anderer Karnivoren war als einzige Probe
eine Waschbärprobe als positiv zu beurteilen. Die genaue Angabe des Jahres, der
Diagnose bzw. des Befundes, des Alters des Tieres, Vorberichts und untersuchten
Gewebes der positiven Proben sind in den Tabellen 13, 14 und 15 im Anhang
zusammengefasst.
Zur
Kontaminationskontrolle
wurde
bei
allen
positiven
Hundeproben
und
stichprobenweise bei den Katzenproben Gewebe einer anderen Spezies (Hirsch)
35
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untersucht. Die Hirschproben, welche jeweils zwischen den einzelnen Hunde- bzw.
Katzenproben entnommen wurden, waren in der PCR mit den Oligonukleotiden
M1RE+M2RE negativ.
In Abbildung 8 sind exemplarisch die PCR-Amplifikate der Oligonukleotide
M1RE+M2RE von drei Proben dargestellt.
MG: Molekulargewichtsstandard (50 bp)
1
2
3
250 bp 
1,2,3 : Proben
(Doppelansatz)
+ : Positivkontrolle (10-9)
- : Negativkontrolle
+ MG
Abbildung 8: PCR-Amplifikate der Oligonukleotide M1RE+M2RE
4.4 Ergebnisse der PCR zur vollständigen Sequenzierung
des VP2-Gens
Im Rahmen dieser Arbeit stand die Sequenzierung des VP2-Gens im Vordergrund.
Es war vor allem von Interesse in diesem Bereich nach Veränderungen im Genom
zu suchen, da sich hier die Nukleotidpositionen befinden, die für die phylogenetisch
wichtigen Aminosäuren kodieren und von besonderem Interesse bei der
Untersuchung der Evolution dieser Parvoviren sind.
Mit den von Steinel et al. (2002) veröffentlichen Oligonukleotid-Kombinationen
M1+M41, M10+M11 und M13+M14 konnten bei den Proben keine Ergebnisse
erzielt werden. Diese Oligonukleotidpaare amplifizieren DNA-Fragmente in der
Größenordnung von 538bp (M10+M11), 482bp (M13+M44) und 891bp (M1+M41).
Möglicherweise kam es aufgrund der Formalin- und Paraffinbehandlung zu einem
erhöhten Auftreten von Einzelstrangbrüchen, die zur Fragmentierung der DNA
führten und somit einen Nachweis der DNA-Fragmente in dieser Größenordnung
nicht erlaubten (DUBEAU et al. 1986). Aufgrund dessen wurden die in Tabelle 2
36
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aufgeführten Oligonukleotide ausgewählt, die kleinere Fragmente von 150bp bis
250bp amplifizieren.
Für die vollständige Sequenzierung des VP2-Gens wurden im Zeitraum von 1970
bis 1978 Polymerase-Kettenreaktionen mit diesen Oligonukleotidpaaren bei allen
positiven Hundeproben, 10 Katzenproben und einer Waschbärprobe durchgeführt.
Die vollständige Sequenzierung der Waschbärprobe war mit diesen OligonukleotidKombinationen nicht möglich. Bei dem untersuchten Gewebe handelte es sich bei
allen Proben um Darmgewebe. Die in jeder PCR mitgeführte Positivkontrolle
(aufgereinigter Zellkulturüberstand des Isolats CPV-d) wurde ebenfalls vollständig
sequenziert, um eine mögliche Kontamination mit dieser überprüfen zu können. In
Tabelle 7 und 8 sind die untersuchten Proben mit Fall- und Sektionsnummer
zusammengefasst. Die Abbildungen 9 und 10 zeigen exemplarisch das Ergebnis
einer PCR mit allen Oligonukleotid-Kombinationen einer Hundeprobe.
Tabelle 7: Parvovirus-positive Hundeproben (1970-1978)
Jahr*
Fall
Sektions-Nr1).
1978
464
S 1111/78
455
S 772/78
1977
420
S 6357/77
1973
281
S 5102/73
1)
Sektionsnummern des Instituts für Pathologie der Stiftung
Tierärztliche Hochschule Hannover
37
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Tabelle 8: ausgewählte Parvovirus-positive Katzenproben (1970-1978)
Jahr
Fall
Sektions-Nr.
1978
425
S 6599/78
430
S 6757/78
1977
386
S 4699/77
1976
363
S 2588/76
1975
361
S 2503/75
1974
308
S 5830/74
1973
277
S 4735/73
1972
232
S 2664/72
1971
195
S 571/71
1970
174
S 469/70
Die Waschbärprobe aus dem Jahr 1974 hat die Fallnummer 321 und die
Sektionsnummer S43/74.
A
A0
A1
A2
MG: Molekulargewichtsstandard
(50bp)
+ -
+ -
+ -
+: Positivkontrolle
+ -
(Zellkulturüberstand CPV 265 10-3)
MG
- : Negativkontrolle
MG
Oligonukleotidpaare (jeweils f u. r):
A2
A3
+ -
A4
+ -
B
+ -
B1
A, A0, A1, A2, A3, A4, B, B1
+ -
Abbildung 9: PCR-Amplifikate der Oligonukleotidpaare A(f/r),
A0(f/r),A1(f/r), A2(f/r), A3(f/r), A4(f/r), B(f/r), B1(f/r) (Hundeprobe 464 aus
dem Jahr 1978)
38
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MG: Molekulargewichtsstandard
B1
B2
B3
+ -
+ -
B4
(50bp)
+ -
+ -
MG
+: Positivkontrolle
(Zellkulturüberstand CPV 265 10-3)
- : Negativkontrolle
Oligonukleotidpaare (jeweils f und r):
MG
B5
C
C1
M
B1, B2, B3, B4, B5,C,C1
M: M1RE+M2RE
+ -
+ -
+ -
Abbildung 10: Fortsetzung Abbildung 9; PCR-Amplifikate der
Oligonukleotidpaare B1(f/r), B2(f/r), B3(f/r), B4(f/r), B5 (f/r), C(f/r), C1(f/r),
M(f/r) (Hundeprobe 464 aus dem Jahr 1978)
4.5 Ergebnisse der Immunhistochemie und der
tierartspezifischen PCR
Mit dem Antikörper CPV1-2A1 konnte bei der immunhistochemischen Untersuchung
der Hundeprobe 281/73 FPV / CPV nachgewiesen werden. Durchgeführt wurde
diese Untersuchung durch das Institut für Pathologie der Stiftung Tierärztliche
Hochschule Hannover.
Die Sequenz dieser Probe stellte sich als typische FPV-Sequenz dar. Am
Tierärztlichen
Institut
der
Georg-August-Universität
Göttingen
wurde
eine
Tierartbestimmung dieser Probe durchgeführt. In allen Systemen konnten die
Allelgrößen bestimmt werden. Es wurde eindeutig festgestellt, dass es sich um
Gewebe einer Katze handelt. Die Untersuchung mit 11 hundespezifischen Markern
verlief negativ.
Aufgrund dieser Ergebnisse wird die Probe 281 aus dem Jahr 1973 in folgenden
Analysen bei den Katzenproben mit aufgeführt.
39
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4.6 Sequenzanalyse
4.6.1 Sequenzierung
Nach Aufreinigung der in Tabelle 7 und 8 aufgeführten Proben, wurden die
Nukleotidsequenzen vom IZKF-Leipzig (IZKF- Interdisziplinäres Zentrum für
klinische Forschung der Universität Leipzig) ermittelt.
Die Sequenzen wurden zunächst mit dem Programm BLAST (ALTSCHUL et al.
1997) überprüft. Die anschließende Bearbeitung wurde mit der Software
LASERGENE (DNASTAR Inc., Madison, Wisconsin) und dem Programm
Chromas (Technelysium Ltd, Tewantin Qld) durchgeführt. Die Sequenzen der
komplementären
DNA-Stränge
wurden
mit
dem
Programm
Chromas
(Technelysium Ltd, Tewantin Qld) miteinander verglichen, wobei eine Bestätigung
bei zweifelhaften Sequenzergebnissen einzelner Nukleotide jeweils durch den
komplementären DNA-Strang erfolgten. Anschließend wurden die Sequenzen
editiert und in einem Alignment überprüft.
Die Sequenzen der überlappenden Amplifikate aller Oligonukleotidpaare aus
Tabelle 2 wurden zur vollständigen Sequenz mit einer Länge von 1755bp
zusammengefügt. Diese deckt das VP2-Strukturproteingenom komplett ab.
4.6.2 Sequenzanalyse der Hunde- und Katzenproben
Die ermittelten Sequenzen der positiven Hunde- und Katzenproben wurden mit je
einer Bezugssequenz in einem Alignment nach der clustal-W Methode verglichen.
Für die Hundeproben wurde das Alignment mit dem Isolat CPV-d aus dem Jahr
1978, für die Katzenproben mit dem Isolat FPV-b aus dem Jahr 1967 durchgeführt.
Die Sequenzen der Isolate wurden aus der Genbank übernommen. Die genauen
Angaben sind in Tabelle 6 aufgeführt.
Da sich der Vergleich ausschließlich auf das VP2-Strukturprotein bezog, wurde
auch bei den beiden Isolaten jeweils nur die VP2-Sequenz verwendet. Die
Gesamtlänge der untersuchten Sequenzen betrug 1755bp.
Der Vergleich der positiven Hundeproben ergab eine 100%ige Übereinstimmung mit
dem Isolat CPV-d.
Der Vergleich der Katzenproben mit dem Isolat FPV-b ergab dagegen mehrere
Nukleotidaustausche bei einzelnen oder auch mehreren Proben. Genaue Angaben
40
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dazu sind in Tabelle 9 aufgeführt. Es sind sowohl kodierende als auch nicht
kodierende Nukleotidaustausche in dieser Tabelle erfasst. Die kodierenden
Nukleotidaustausche sind im Folgenden kurz aufgeführt.
Im Vergleich zur Bezugssequenz ist an der NT-Position 694 bei allen Katzenproben
statt einem A ein G vorhanden. Daraus ergibt sich an der Aminosäurenposition 232
eine Änderung von Isoleucin zu Valin. Mit Ausnahme dieser Mutation sind die
weiteren kodierenden Nukleotidaustausche nur bei einzelnen Proben vorhanden.
Diese finden sich an den NT-Postionen 271 (K361/75 GT und K363/76 GA),
274 (K430/78 GA), 415 (K386/77 GA) und 1232 (K361/75 AC). Diese
Nukleotidaustausche führen auf den entsprechenden Aminosäurepositionen zu
folgenden Veränderungen: 91 AS (K361/75), 91 AT (K363/76), 92 VI
(K430/78), 139 VI (K386/77) und 411 EA (K361/75).
41
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Tabelle 9: Nukleotid- und Aminosäurenunterschiede im VP2-Gen aller Katzenproben im Vergleich mit FPV-b
NukleotidPosition
99
FPV-b K174 K195 K232 K277 K281 K308 K361 K363 K386 K425 K430 Amino70
71
72
73
73
74
75
76
77
78
78 säurenPosition
GGT
------------------C
----33
FPV-b K174 K195 K232 K277 K281 K308 K361 K363 K386 K425 K430
70
71
72
73
73
74
75
76
77
78
78
G
-
-
-
-
-
-
-
-
G
-
-
135
TTC
---
---
---
---
---
--T
---
---
---
---
---
45
F
-
-
-
-
-
F
-
-
-
-
-
171
GGG
--A
--A
--A
--A
--A
--A
--A
--A
--A
--A
--A
57
G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
183
ATC
--T
---
---
---
---
---
---
---
---
---
---
61
I
I
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
246
GTA
---
--G
---
---
---
---
---
---
---
---
---
82
V
-
V
-
-
-
-
-
-
-
-
-
271
GCA
---
---
---
---
--
---
T--
A--
---
---
---
91
A
-
-
-
-
-
-
S
T
-
-
-
274
GTT
---
---
---
---
---
---
---
---
---
---
A--
92
V
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
I
415
GTT
---
---
---
---
---
---
---
---
A--
---
---
139
V
-
-
-
-
-
-
-
-
I
-
-
448
TTA
---
---
---
---
---
C--
---
---
---
---
---
150
L
-
-
-
-
-
L
-
-
-
-
-
501
AAT
---
---
---
---
---
---
---
---
---
---
--C
167
N
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
N
585
TTG
---
---
--A
---
---
---
--A
---
---
---
---
195
L
-
-
L
-
-
-
L
-
-
-
-
648
AGA
---
---
---
---
---
--G
---
---
---
---
---
216
R
-
-
-
-
-
R
-
-
-
-
-
694
ATA
G--
G--
G--
G--
G--
G--
G--
G--
G--
G--
G--
232
I
V
V
V
V
V
V
V
V
V
V
V
699
TAT
---
--C
---
---
---
---
---
---
---
---
---
233
Y
-
Y
-
-
-
-
-
-
-
-
-
738
ATT
---
---
---
---
---
---
---
---
---
--A
---
246
I
-
-
-
-
-
-
-
-
-
I
-
801
TTT
---
---
---
--C
---
---
---
---
---
---
---
267
F
-
-
-
F
-
-
-
-
-
-
-
804
TTT
---
---
---
---
---
--C
---
---
---
---
---
268
F
-
-
-
-
-
F
-
-
-
-
-
810
TGC
--T
--T
--T
--T
--T
--T
--T
--T
--T
--T
--T
270
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
855
TTG
---
---
---
---
---
---
---
---
---
--A
---
285
L
-
-
-
-
-
-
-
-
-
L
-
871
TTA
C--
C--
C--
C--
---
C--
C--
C--
C--
C--
C--
291
L
L
L
L
L
-
L
L
L
L
L
L
1041
GCG
---
---
---
---
---
---
---
--A
---
---
--A
347
A
-
-
-
-
-
-
-
A
-
-
A
1092
GCG
---
---
---
--A
---
---
---
---
---
---
---
364
A
-
-
-
A
-
-
-
-
-
-
-
1232
GAA
---
---
---
---
---
---
-C-
---
---
---
---
411
E
-
-
-
-
-
-
A
-
-
-
-
1290
TTG
---
---
---
---
---
---
---
---
--A
---
---
430
L
-
-
-
-
-
-
-
-
L
-
-
1470
TGT
---
---
---
---
---
--C
---
---
---
---
---
490
C
-
-
-
-
-
C
-
-
-
-
-
1521
ACG
--A
---
---
---
--A
--A
--A
--A
--A
---
--A
507
T
T
-
-
-
T
T
T
T
T
-
T
1572
TAT
--C
--C
---
---
--C
--C
--C
--C
--C
---
--C
524
Y
Y
Y
-
-
Y
Y
Y
Y
Y
-
Y
1710
AAA
---
---
---
---
---
---
--G
---
---
---
---
570
K
-
-
-
-
-
-
K
-
-
-
-
42
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Auf der Grundlage eines Alignments nach clustalW wurde Tabelle 10 erstellt, die die
Übereinstimmung der Katzenproben untereinander und zu den Isolaten CPV-d und
FPV-b zeigen.
In der oberen Hälfte der durch eine Diagonale geteilten Tabelle sind die
Übereinstimmungen
auf
Nukleotidebene,
in
der
unteren
Hälfte
auf
Aminosäureebene in Prozent dargestellt.
Im Vergleich der Katzenproben mit dem FPV-b Isolat liegt ein Schwankungsbereich
der Übereinstimmungen auf Nukleotidebene von 99,4 bis 99,7% vor. Abweichungen
der Katzenproben untereinander sind von 0,5 bis 0,1% zu verzeichnen, die einer
Homologie von > 99,5% entsprechen. Im Vergleich mit dem CPV-d Isolat sind
größere Unterschiede vorhanden. Diese liegen zwischen 1,1 und 0,7%. Der
Unterschied zwischen den beiden Isolaten beläuft sich auf 1%.
Auf Aminosäureebene liegt der Schwankungsbereich der Übereinstimmungen der
Proben zu dem Isolat FPV-b zwischen 99,3% als niedrigsten und 99,7% als
höchsten Wert. Die Katzenproben untereinander zeigen Unterschiede zwischen 0,7
und 0,2%. Vergleich der Proben mit dem Isolat CPV-d ergab entsprechend der
Unterschiede auf Nukleotidebene größere Unterschiede im Bereich von 2,1 bis
1,7%. Die Isolate untereinander unterscheiden sich auf Aminosäureebene um 1,5%.
Auf
eine
Darstellung
der
Hundeproben
wurde
Übereinstimmung mit dem Isolat CPV-d verzichtet.
43
aufgrund
der
100%igen
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Tabelle 10: Sequenzübereinstimmungen der Parvovirussequenzen der Katzenproben
untereinander sowie mit FPV-b und CPV-d in Prozent
-----
FPVb
CPV- K174/ K195/ K232/ K277/ K281/ K308/ K361/ K363/ K386/ K425/ K430/
d
70
71
72
73
73
74
75
76
77
78
78
FPV-b
-----
CPV-d
98.5 -----
K174/70
99.7 98.3 -----
K195/71
99.7 98.3 99.8 -----
K232/72
99.7 98.3 99.8 99.8 -----
K277/73
99.7 98.3 99.8 99.8 99.8 -----
K281/73
99.7 98.3 99.8 99.8 99.8 99.8 -----
K308/74
99.7 98.3 99.8 99.8 99.8 99.8 99.8 -----
K361/75
99.3 97.9 99.5 99.5 99.5 99.5 99.5 99.5 -----
K363/76
99.5 98.1 99.7 99.7 99.7 99.7 99.7 99.7 99.5 -----
K386/77
99.5 98.1 99.7 99.7 99.7 99.7 99.7 99.7 99.3 99.5 -----
K425/78
99.7 98.3 99.8 99.8 99.8 99.8 99.8 99.8 99.5 99.7 99.7 -----
K430/78
99.5 98.1 99.7 99.7 99.7 99.7 99.7 99.7 99.3 99.5 99.5 99.7 -----
99.0 99.6 99.6 99.7 99.7 99.7 99.4 99.4 99.5 99.5 99.7 99.5
99.1 99.3 99.0 99.0 99.1 98.9 99.0 99.1 99.0 99.0 99.0
99.8 99.8 99.7 99.9 99.7 99.7 99.8 99.8 99.7 99.8
99.8 99.7 99.8 99.5 99.6 99.7 99.7 99.7 99.7
99.8 99.8 99.5 99.7 99.7 99.7 99.8 99.7
99.7 99.5 99.5 99.7 99.6 99.8 99.6
99.7 99.7 99.8 99.8 99.7 99.8
99.5 99.6 99.5 99.5 99.5
99.7 99.6 99.5 99.6
99.7 99.7 99.8
99.6 99.7
99.6
Aminosäure
Die phylogenetischen Untersuchungen wurden mit den in Tabelle 6 aufgeführten
Isolaten durchgeführt. Da sich die Untersuchungen auf das VP2-Strukturprotein
beschränkten, wurde dementsprechend von den einzelnen Isolaten ausschließlich
die Sequenz des VP-2 Gens für das Alignment verwendet. Die Gesamtlänge betrug
1755bp. Ausnahmen bildeten die Isolate CPV-Pudel und CPV-ChowChow, die das
VP2-Gen mit einer Länge von 1593bp nur partiell abdecken. Das Alignment wurde
mit der clustal-W Methode durchgeführt und diente als Grundlage für die Erstellung
phylogenetischer Stammbäume auf Nukleotid- und Aminosäureebene.
Die phylogenetische Verwandtschaft der einzelnen Insolate und der Proben wurde
anhand dieser Stammbäume untersucht. Es lassen sich zwei Cluster unterscheiden.
Zum einen ein Cluster mit CPV-ähnlichen Parvoviren mit Viren von Hund und
Marderhund und zum anderen ein Cluster mit FPV-ähnlichen Viren von Katze, Nerz
und Waschbär. In dem Cluster mit CPV-ähnlichen Viren lassen sich zwei
Unterkomplexe unterscheiden. Einer beinhaltet den Typ CPV-2, der andere die
44
DNA
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neueren Typen CPV-2a und 2b. Die untersuchten Sequenzen der positiven
Hundeproben ordnen sich in den Unterkomplex des CPV-2 Typs ein.
Bei dem Cluster, der durch die FPV-ähnlichen Viren gebildet wird, lässt sich keine
eindeutige Bildung von Unterkomplexen erkennen. Die Proben ordnen sich
zwischen die einzelnen Sequenzen der FPV-, MEV- und RPV-Isolate ein. Eine
zeitliche Einordnung der Proben zu älteren FPV-Isolaten ist nicht zu erkennen.
45
Diskussion
5 Diskussion
Der Zeitpunkt der weltweiten Ausbreitung des CPV-2 in den Hundepopulationen in
einer Pandemie wird auf das Jahr 1978 datiert. Neuere Studien, die eine große Zahl
von CPV-Sequenzen aus den 1970er Jahren untersuchten, kamen zu den Schluss,
dass sich dieses Virus bereits 10 Jahre früher in den caninen Populationen
befunden haben musste (SHACKELTON et al. 2005a). Ebenso wird angenommen,
dass CPV-2a schon einige Jahre früher (ab 1976) zusammen mit CPV-2 in den
Populationen existierte. Gestützt wird diese Annahme unter anderem durch eine
Untersuchung aus Griechenland, die retrospektiv in einer Hundeprobe aus dem Jahr
1974
CPV-Antikörper
nachwies
(KOPTOPOULOS
et
al.
1986a).
Alle
Untersuchungen im Hinblick auf einen möglichen Anzestor des caninen Parvovirus
haben bis heute noch zu keinem eindeutigen Ergebnis geführt. Gestützt auf die
Annahme, dass CPV vor 1978 in den caninen Populationen vorgekommen sein
müsste, wurden in dieser Arbeit Gewebeproben aus den Jahren 1970 bis 1978 von
Katzen, Hunden und Wildtieren (Waschbär) aus dem pathologischen Archiv des
Instituts für Pathologie der Stiftung Tierärztliche Hochschule Hannover untersucht.
Ziel war es, eine mögliche intermediäre Form zwischen FPV und CPV in den
Proben zu finden und damit einen Anzestor des caninen Parvovirus zu identifizieren.
5.1 Nachweismethoden
Die Aufreinigung der paraffineingebetteten Gewebeproben von Hunden und Katzen
aus diesem Zeitraum erfolgte mit Xylol und 100%igem Ethanol nach der von Truyen
et al. (1994) beschriebenen Methode. Für eine vollständige Lyse des Gewebes war
es notwendig, die Proben über Nacht zu inkubieren. Hunde- und Katzenproben
wurden
jahrgangsweise
Aufreinigung
wurde
und
eine
getrennt
voneinander
Negativkontrolle
aufgereinigt.
mitgeführt,
um
eine
Bei
jeder
mögliche
Kontamination ausschließen zu können.
Der Nachweis von CPV / FPV in diesen Proben wurde mit Hilfe der PCR
durchgeführt. Die verwendeten Oligonukleotide M1RE und M2RE wurden aus der
Studie von STEINEL et al. (2000) übernommen. Nach Etablierung der PCR mit
einer ausreichenden Sensitivität von 10 bis 100 Kopien pro Reaktionsansatz wurden
46
Diskussion
diese für den Nachweis der parvoviralen DNA in den Proben benutzt. Dieses
Oligonukleotidpaar ergibt Amplifikate, die sich innerhalb des VP2-Gens befinden
und eine Länge von 240bp aufweisen. Im Hinblick auf die vollständige
Sequenzierung des VP2-Gens ergaben sich Probleme bei der Übernahme weiterer
von STEINEL et al. (2000) verwendeten Oligonukleotidpaare, die DNA-Fragmente in
der Größenordnung von ca. 500 bis 900bp amplifizieren. Mit diesen waren bei den
Proben keine Ergebnisse zu erzielen. Grund dafür kann die Behandlung der Proben
mit Formalin und Paraffin bei der Fixierung des Gewebes gewesen sein, die zu
einem erhöhten Auftreten von Einzelstrangbrüchen der parvoviralen DNA geführt
hat. Zur vollständigen Sequenzierung des VP2-Gens wurden aus diesem Grund
Oligonukleotidpaare erstellt, die kleinere DNA-Fragmente amplifizieren (150bp bis
250bp). Bei allen positiven Hundeproben und einigen ausgewählten positiven
Katzenproben konnte mit diesen 15 Oligonukleotidpaaren das vollständige VP2-Gen
amplifiziert und sequenziert werden. Bei einer positiven Waschbärprobe war es
allerdings mit diesen Oligonukleotiden nicht möglich, die vollständige Sequenz zu
ermitteln.
Bei allen Polymerase-Kettenreaktionen wurden sowohl Positiv- (aufgereinigter
Zellkulturüberstand des Isolats CPV-d) als auch Negativkontrollen mitgeführt. Die
Negativkontrollen, die bei der Aufreinigung der Proben und bei der Herstellung der
Versuchsansätze für die PCR mitgeführt wurden, waren bei allen Durchläufen
negativ, so dass eine Kontamination während dieser Arbeitsschritte ausgeschlossen
werden konnte. Als Kontrolle einer möglichen Kontamination während der
Probennahme mit Hilfe des Schlittenmicrotoms wurden zwischen den einzelnen
Proben
Paraffinschnitte
eines
Gewebes
einer
anderen
Spezies
(Hirsch)
entnommen. Diese Proben wurden bei allen positiven Hundeproben und
stichprobenweise bei den positiven Katzenproben im Hinblick auf eine mögliche
Kontamination überprüft. Alle untersuchten Hirschproben waren negativ, so dass
auch hier eine Kontamination ausgeschlossen werden konnte.
5.2 Sequenzanalyse
In einer als Hundeprobe gekennzeichneten Probe aus dem Jahr 1973 wurden FPVtypische Sequenzen nachgewiesen. Die ermittelte Sequenz ordnete sich in einem
Stammbaum mit FPV- und CPV-Sequenzen eindeutig in den FPV-Cluster ein.
47
Diskussion
Aufgrund der eindeutigen Zuordnung zu den FPV-Isolaten wurde eine Überprüfung
der Spezies des Gewebes vorgenommen. Diese ergab, dass es sich um Gewebe
einer Katze und nicht um das eines Hundes handelt. Das feline PanleukopenieVirus wurde demnach bei einer Katze nachgewiesen. Somit konnte diese Probe
nicht, wie zunächst angenommen, zur Aufklärung der Herkunft des CPV beitragen.
Im untersuchten Zeitraum von 1970-1978 wurde in drei Hundeproben das CPV-2
nachgewiesen. Zwei Proben stammen aus dem Jahr 1978 und eine Probe aus dem
Jahr 1977. Der Nachweis des caninen Parvovirus in einer Hundeprobe aus 1977
stützt die Annahme, dass CPV-2 schon vor 1978 in den Hundepopulationen
existierte. Durch Sequenzvergleiche auf Nukleotid- und Aminosäureebene und
anhand der daraus abgeleiteten Stammbäume konnten die Sequenzen der drei
positiven Hundeproben eindeutig den CPV-2-Isolaten zugeordnet werden. Im
Vergleich mit der Referenzsequenz CPV-d war eine 100%ige Übereinstimmung
vorhanden.
Eine
mögliche
Kontamination
der
Proben
mit
der
Positivkontrolle
(Zellkulturüberstand des Isolats CPV-d) konnte ausgeschlossen werden, da sich in
einem Sequenzvergleich auf Nukleotidebene ein Unterschied zwischen den
Hundeproben und der Positivkontrolle an der Position 1123 (AG) zeigte. Auf
Aminosäureebene führt dies an Position 375 zu einer Substitution von Asparagin zu
Aspartat bei der Positivkontrolle. Damit unterscheidet sich die Sequenz des
Zellkulturüberstandes des Isolats CPV-d von den Sequenzen der Hundeproben aber
auch von der CPV-d-Sequenz , die in der Genbank-Datenbank hinterlegt ist. Die
Ursache für den Unterschied zwischen der hinterlegten CPV-d-Sequenz und der
CPV-d-Sequenz aus der Zellkultur kann in der wiederholten Passagierung des Virus
in Zellkultur liegen. Eine Kontamination der Hundeproben untereinander kann
aufgrund der negativen Ergebnisse der Hirschproben sowie der Negativkontrollen
ausgeschlossen werden.
Die Stammbaumanalyse ergab, dass sich die Sequenzen der Hundeproben
eindeutig in die Gruppe der CPV-2 –Viren einordnen und bestätigen das Bild, dass
1978 beziehungsweise wie in dieser Arbeit gezeigt, bereits 1977 Hunde in
Deutschland mit CPV-2 infiziert waren. Bei den untersuchten Sequenzen der
Katzenproben ergaben sich im Vergleich zur Referenzsequenz FPV-b einige
kodierende und nicht-kodierende Nukleotidunterschiede. Diese vereinzelt bei den
48
Diskussion
Proben vorkommenden Mutationen scheinen zufällige nicht gerichtete oder
selektierte Veränderungen im Genom darzustellen.
Bei der Analyse der Stammbäume auf Nukleotid- und Aminosäureebene ließ sich
für die FPV-Sequenzen keine Gruppierung der Proben entsprechend des Zeitpunkts
der Isolierung erkennen.
Die Distanztabelle mit den Sequenzen des VP2-Gens der Parvovirus-positiven
Katzenproben und den Isolaten CPV-d und FPV-b bestätigt die in verschiedenen
Studien dargestellte hohe Homologie > 98% zwischen CPV und FPV. Die
Abweichungen
auf
Nukleotidebene
lagen
zwischen
0,1
und
1,1%,
auf
Aminosäureebene zwischen 0,2 und 2,1%.
5.3 Abschließende Betrachtung
Die hier beschriebenen Untersuchungen zeigen, dass sich sowohl die ermittelte
Sequenz einer positiven Hundeprobe aus dem Jahr 1977 als auch die Sequenzen
der beiden anderen positiven Hundeproben aus 1978 typische CPV-2-Sequenzen
darstellen. Es konnte somit eine Probe vor der Erstbeschreibung 1978 identifiziert
werden,
die
die
Theorie
stützt,
dass
CPV
bereits
vor
1978
in
den
Hundepopulationen existierte.
Aufgrund der 100%igen Übereinstimmung der Sequenzen untereinander und mit
CPV-2 Sequenzen aus der Genbank wird die Vermutung untermauert, dass alle
CPV-Isolate auf einen einzigen Anzestor zurückgeführt werden können.
Im Hinblick auf die Anzestorfrage erscheint es sinnvoll, weitere Proben aus den
frühen 1970er Jahren zu untersuchen. Durch die Möglichkeit, Virus-DNA aus
paraffineingebetteten Geweben amplifizieren und sequenzieren zu können, ist die
Untersuchung dieser Fragestellung leicht möglich. Der Nachweis des caninen
Parvovirus in Hundeproben oder in Proben von Wildtieren aus dieser Zeit könnte
dazu beitragen, den Entstehungsmechanismus weiter aufzuklären.
49
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6 Zusammenfassung
Charakterisierung von caninen und felinen Parvoviren
in archiviertem Organmaterial aus den Jahren 1970 bis 1978
Nicola Rückert
Institut für Tierhygiene und Öffentliches Veterinärwesen
Veterinärmedizinische Fakultät, Universität Leipzig
Eingereicht im August 2006
89 Seiten, 10 Abbildungen, 15 Tabellen, 100 Literaturstellen
Schlüsselworte:
canines Parvovirus, CPV-2, VP2, Evolution,
paraffineingebettetes Gewebe, PCR, Phylogenie
Das canine Parvovirus (CPV-2) wurde erstmals bei Hunden im Jahr 1978
beschrieben. Dieses Virus verbreitete sich innerhalb weniger Monate weltweit in
einer schweren Pandemie. Retrospektiv wird angenommen, dass es sich aus dem
Felinen Panleukopenie-Virus (FPV) oder einem nah verwandten Virus entwickelt
hat. CPV-2 und FPV sind genetisch sehr ähnlich und zeigen eine Identität auf DNAEbene von >98%. Zur Entstehung des CPV-2 gibt es verschiedene Theorien.
Neueste
Studien,
welche
die
Substitutionsraten
von
Parvovirusisolaten
untersuchten, kamen zu dem Ergebnis, dass CPV-2 bereits 10 Jahre vor der
Erstbeschreibung in 1978 in den Hundepopulationen hat zirkulieren müssen.
Ziel dieser Arbeit war es, durch Untersuchung von archivierten paraffineingebetteten
Gewebeproben von Hunden und Katzen aus den frühen 1970iger Jahren einen
möglichen Anzestor des caninen Parvovirus zu identifizieren und die Hypothese zu
überprüfen, dass CPV-2 schon vor 1978 in den Hundepopulationen zirkulierte.
Auswahlkriterien für die Entnahme von Gewebeproben waren pathologische (v.a.
akute Gastroenteritis, Myokarditis (Hd.) ) sowie histopathologische Befunde (z.B.
Zottenatrophie). Vorberichtliche Erwähnungen wie z.B. Erbrechen und Durchfall,
hämorrhagische Enteritis, Lymphopenie, Welpensterben als Bestandsproblem
wurden ebenfalls als Hinweise für eine Infektion mit Parvoviren gewertet. Auf der
Grundlage dieser Auswahlkriterien wurden aus den Jahren 1970 bis 1980 aus dem
50
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Archiv des Instituts für Pathologie der Stiftung Tierärztliche Hochschule Hannover
204 Proben ausgewählt und mit Hilfe der PCR untersucht.
Nachdem mit einem Oligonukleotidpaar (M1RE /M2RE) das Vorkommen von FPV
oder CPV in den Proben nachgewiesen wurde, erfolgte eine Auswahl Parvoviruspositiver Proben aus den Jahren 1970 bis 1978 für die vollständige Sequenzierung
des VP2-Gens.
Es wurden alle Parvovirus-positiven Hundeproben (zwei Proben aus 1978 und eine
Probe aus 1977) und 11 Parvovirus-positive Katzenproben untersucht. Um das
1755bp große VP2-Gen sequenzieren zu können, wurden 15 Oligonukleotidpaare
erstellt, die überlappende Amplifikate in einer Größenordnung von ca. 150 bis 250bp
amplifizieren.
Die ermittelten Sequenzen der Hunde- und Katzenproben wurden jeweils mit einer
Referenzsequenz
untereinander
verglichen.
und
zu
der
Die
Sequenzen
Referenzsequenz
der
Hundeproben
(CPV-d)
eine
wiesen
100%ige
Übereinstimmung auf. Dagegen waren bei den Sequenzen der Katzenproben einige
kodierende und nicht kodierende Nukleotidaustausche im Vergleich mit der
Referenzsequenz (FPV-b) vorhanden.
Unter den untersuchten Sequenzen konnte ein Anzestor des caninen Parvovirus
nicht identifiziert werden. Es konnte aber 1977 in einer Hundeprobe CPV-2
nachgewiesen werden. Dieses Ergebnis stützt die Theorie, dass CPV-2 bereits vor
der Erstbeschreibung 1978 in den Hundepopulationen existiert haben muss.
51
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7 Summary
Characterization of canine and feline parvoviruses in archived tissue samples
from 1970 to 1978
Nicola Rückert
Institute of Animal Hygiene and Veterinary Public Health
Faculty of Veterinary Medicine, University of Leipzig
Submitted in August 2006
89 pages, 10 figures, 15 tables, 100 references
Keywords:
canine parvovirus, CPV-2, VP2, evolution,
paraffin-embedded tissues, PCR, phylogeny
Canine parvovirus (CPV-2) was first isolated as the cause of disease in dogs in
1978. Within a few months CPV-2 spread epidemically worldwide. In retrospective it
is clear that CPV-2 emerged from feline panleukopenia virus (FPV) or a closley
related virus.
CPV-2 and FPV are >98% identical in their DNA sequences and very similar
antigenically. There are many theories about the evolution of CPV-2 and recent
studies determined substitution rates of several parvoviruses. The results indicate,
that CPV-2 circulated in the canine population up to 10 years before it was first
recognized.
The goal of the study was to identify a possible ancestor of the canine parvovirus
and to determine if CPV-2 was prevalent in dog population prior to 1978.
Proofing this hypothesis archived paraffin-embedded tissue samples from dogs and
cats from 1970 to 1978 were investigated.
Tissue samples had been selected on the basis of pathological (especially
gastroenteritis, myocarditis (puppies)) and histopathological (e.g. necrosis of the
crypt cells of the intestinal epithelium) results. Reports of vomiting, diarrhoea,
haemorrhagic enteritis, lymphopenia, death of puppies were also regarded as
possible symptoms of an infection with parvoviruses.
On the basis of these conditions 204 samples from 1970-1980 were selected from
the Institute of Pathology of the University of Veterinary Medicine, Hannover and
investigated by polymerase chain reaction. In a first assay, samples were tested for
52
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the presence of CPV-2 or FPV with primer pair M1RE and M2RE. Then the VP2gene with a total length of 1755 bp of all positive samples from 1970-1978 from
dogs (two from 1978, one from 1977) and 11 samples from cats were amplified and
sequenced.
Fifteen Primer pairs were designed to amplify overlapping fragments of 150 to 250
nucleotides in length. The sequences were compared with reference sequences
retrieved from the Genbank. The dog samples were 100% identical to the reference
sequence CPV-d. The cat samples showed several coding and non-coding single
nucleotide substitutions in comparison with reference sequence FPV-b.
In conclusion of this study we were able to identify a CPV-2 sequence in one dog
sample from 1977, supporting the hypothesis that CPV-2 was already present prior
1978 in the German dog population.
53
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61
Anhang
9 Anhang
9.1 Chemikalien und Reagenzien
TBE Puffer (1 Liter)
Tris
10,8g
Borat
5,5g
EDTA
0,83g
destilliertes Wasser
2%iges Agarosegel
peq GOLD Universal Agarose
2g
TBE Puffer
100ml
TE Puffer
10mM Tris-CL
1mM EDTA
TAE Puffer (1 Liter)
Tris
249g
Essigsäure
57,1 ml
EDTA
50mM
destilliertes Wasser
LB-Z-Nährböden
LB-Platte: Difco Luria Agar Base, Miller
Ampicillin
100mg/l
X-Gal
2%
IPTG
0,1M
62
Anhang
9.2 Tabellen
Tabelle 11: Ausgewählte Proben (Hunde und Katzen) von 1980 –1970
Jahr
Hund
Sektions-Nr.
Gewebe
Katze
Sektions-Nr.
Gewebe
1980
552
S 4209/80
Darm
549
S 4159/80
Darm
556
S 4290/80
Darm
574
S 4531/80
Darm
576
S 4801/80
Herz
583
S 5378/80
Darm
580
S 4952/80
Darm
593
S 5608/80
Darm
584
S 5470/80
Darm
604
S 5981/80
Darm
585
S 5514/80
Herz
605
S 6039/80
Darm
600
S 5791/80
Darm
615
S 6221/80
Darm
610
S 6161/80
Darm
616
S 6227/80
Darm
621
S 6312/80
Darm
624
S 6339/80
Darm
656
S 6538/80
Darm
631
S 6362/80
Darm
488
S 2060/79
Darm
497
S 2442/79
Darm
490
S 2110/79
Darm
503
S 3056/79
Darm
491
S 2126/79
Darm
505
S 3112/79
Darm
494
S 2335/79
Darm
507
S 3207/79
Darm
498
S 2520/79
Darm
510
S 3414/79
Darm
513
S 3530/79
Darm
515
S 3544/79
Darm
518
S 3580/79
Darm
516
S 3553/79
Darm
531
S 3726/79
Darm
519
S 3591/79
Darm
533
S 3769/79
Darm
528
S 3700/79
Darm
541
S 4063/79
Darm
535
S 3795/79
Darm
431
S 6772/78
Darm
425
S 6599/78
Darm
437
S 6931/78
Darm
428
S 6718/78
Darm
443
S 195/78
Darm
429
S 6728/78
Darm
445
S 300/78
Darm
430
S 6757/78
Darm
447
S 326/78
Darm
436
S 6918/78
Darm
455
S 772/78
Darm
444
S 259/78
Darm
458
S 880/78
Darm
452
S 663/78
Darm
1979
1978
63
Anhang
1977
1976
1975
Hund
Sektions-Nr.
Gewebe
Katze
Sektions-Nr.
Gewebe
472
S 1401/78
Darm
453
S 708/78
Darm
478
S 1638/78
Herz
462
S 1098/78
Darm
464
S 1111/78
Darm
476
S 1527/78
Darm
389
S 5034/77
Darm
386
S 4699/77
Darm
398
S 5533/77
Darm
390
S 5043/77
Darm
403
S 5731/77
Darm
391
S 5134/77
Darm
404
S 5732/77
Darm
394
S 5342/77
Darm
417
S 6222/77
Darm
399
S 5534/77
Darm
420
S 6357/77
Darm
400
S 5616/77
Darm
421
S 6361/77
Darm
408
S 5898/77
Darm
422
S 6415/77
Darm
410
S 5969/77
Darm
412
S 5984/77
Darm
416
S 6171/77
Darm
366
S 2771/76
Darm
363
S 2588/76
Darm
367
S 2775/76
Darm
365
S 2744/76
Darm
369
S 2833/76
Darm
371
S 3397/76
Darm
372
S 3631/76
Herz
374
S 3771/76
Darm
379
S 4113/76
Darm
375
S 3934/76
Darm
381
S 4295/76
Darm
376
S 3967/76
Darm
378
S 3985/76
Darm
383
S 4443/76
Darm
384
S 4458/76
Darm
385
S 4487/76
Darm
345
S 1191/75
Herz
337
S 674/75
Darm
348
S 1617/75
Herz/Darm
338
S 704/75
Darm
354
S 2152/75
Herz
340
S 859/75
Darm
362
S 2547/75
Herz
341
S 924/75
Darm
342
S 974/75
Darm
347
S 1450/75
Darm
351
S 2115/75
Darm
352
S 2135/75
Darm
359
S 2467/75
Darm
361
S 2503/75
Darm
64
Anhang
Jahr
Hund
Sektions-Nr.
Gewebe
Katze
Sektions-Nr.
Gewebe
1974
305
S 5706/74
Darm/Herz
307
S 5823/74
Darm
316
S 6457/74
Darm
308
S 5830/74
Darm
322
S 93/74
Darm
309
S 5945/74
Darm
323
S 105/74
Herz
313
S 6296/74
Darm
331
S 538/74
Darm
318
S 6472/74
Darm
332
S 539/74
Darm
324
S 234/74
Darm
335
S 650/74
Darm
326
S 408/74
Darm
328
S 459/74
Darm
329
S 460/74
Darm
334
S 587/74
Darm
1973
1972
256
S 3883/73
Darm
258
S 4005/73
Darm
257
S 3888/73
Darm
259
S 4013/73
Darm
264
S 4165/73
Darm
260
S 4025/73
Darm
265
S 4265/73
Darm
267
S 4362/73
Darm
268
S 4428/73
Herz
273
S 4607/73
Darm
269
S 4562/73
Herz
277
S 4735/73
Darm
272
S 4587/73
Darm
278
S 4887/73
Darm
275
S 4630/73
Darm
279
S 4888/73
Darm
276
S 4634/73
Darm
281
S 5102/73
Darm
271
S 4585/73
Darm
274
S 4614/73
Herz
286
S 5313/73
Darm
287
S 5318/73
Darm
290
S 5359/73
Darm
292
S 5373/73
Darm
293
S 5374/73
Darm
301
S 5523/73
Darm
222
S 2052/72
Darm
221
S 2049
Darm
224
S 2070/72
Darm
227
S 2187
Darm
229
S 2336/72
Darm
232
S 2664
Darm
238
S 3001/72
Herz
240
S 3152
Darm
241
S 3178/72
Darm
243
S 3528
Darm
65
Anhang
1971
1970
Hund
Sektions-Nr.
Gewebe
Katze
Sektions-Nr.
Gewebe
242
S 3187/72
Darm
244
S 3524
Darm
245
S 3529/72
Darm
246
S 3538
Darm
252
S 3749/72
Herz
249
S 3669
Darm
250
S 3679
Darm
251
S 3747
Darm
191
S 220/71
Herz
193
S 569/71
Darm
192
S 444/71
Darm
194
S 570/71
Darm
198
S 614/71
Herz
195
S 571/71
Darm
207
S 899/71
Darm
196
S 588/71
Darm
208
S 986/71
Darm
210
S 1099/71
Darm
213
S 1825/71
Darm
214
S 1841/71
Darm
217
S 1936/71
Darm
215
S 1853/71
Darm
173
S 419/70
Herz
171
S 246
Darm
176
S 661/70
Darm
172
S 297
Darm
177
S 723/70
Darm
174
S 469
Darm
180
S 1295/70
Herz
179
S 881
Darm
181
S 1339/70
Herz
183
S 1384
Darm
182
S 1367/70
Darm/Herz
184
S 1521
Darm
186
S 1849/70
Herz
187
S 1850/70
Herz
188
S 1851/70
Herz
Tabelle 12: Ausgewählte Proben anderer Tierarten
Jahr
Tierart
Fall
Sektions-Nr.
Gewebe
1967
Nerz
108
S 1014/67
Herz/Darm
Nerz
109
S1015/67
Herz/Darm
1972
Wolf
225
S 2098/72
Darm
1973
Nerz
294
S 5384/73
Darm
1974
Waschbär
320
S 42/74
Darm
Waschbär
321
S 43/74
Darm
66
Anhang
Tabelle 13: Parvovirus-positive Proben bei Hunden (1970-1980)
Fall
SektionsNr.
Diagnose/ Befund
Alter
Gewebe
Vorbericht
S 5102/73
Hämorrhagisch-katarrhalische Enteritis
8 Wo.
Darm
Schreien, blutiger Durchfall, Erbrechen
S 6357/77
Enteritis cat., hgr. Schwellung der Mesenterial Lnn.
10 Wo.
Darm
?
455
S 772/78
Hgr. fibrinöse Enteritis
7 Wo.
Darm
Durchfall, mehrere Tiere tot
464
S 1111/78
Gastroenteritis cat. acuta
11 Wo.
Darm
Erbrechen, Durchfall, gestorben
490
S 2110/79
hgr. ulzerierende Enteritis
10 Wo.
Darm
verendet
498
S 2520/79
Enteritis cat. akuta
juvenil
Darm
Erbrechen, blutiger Durchfall, Bestand krank
513
S 3530/79
Enteritis, Verlust der Darmschleimhaut
16 Mon
Darm
Erbrechen, Durchfall
518
S 3580/79
Virusinfektion unbekannter Genese
?
Darm
Erbrechen, blutiger Durchfall
513
S 3726/79
Gastroenteritis, ulzerierte Darmschleimhaut
8 Wo.
Darm
gestorben
552
S 4209/80
Enteritis (Parvoviren)
13 Wo.
Darm
Hämorrhagische Enteritis
556
S 4290/80
Virale hämorrhagische Enteritis
3 Mon.
Darm
Erbrechen, blutiger Durchfall
580
S 4952/80
Parvo-Virus-Enteritis
4 Mon.
Darm
Erbrechen, Durchfall, Panleukopenie
585
S 5514/80
Parvovirusenteritis
10 Wo.
Herz
Erbrechen, Durchfall
600
S 5791/80
Parvovirusinfektion
9 Wo.
Darm
Erbrechen, Druchfall
610
S 6161/80
Parvovirusinfektion
12 Wo.
Darm
Erbrechen, Durchfall
1973
281
1977
420
1978
1979
1980
67
Anhang
621
S 6312/80
fibrinöse Auflagerung Darm, wässrig-blutiger Inhalt
8 Mon.
Darm
Erbrechen,
blutiger
Druchfall,
Parvovirose
656
S 6538/80
Parvovirusinfektion
3 Mon.
68
Darm
Erbrechen, Durchfall, aus Tierheim
Verdacht
Anhang
Tabelle 14: Parvovirus-positive Proben bei Katzen (1970-1980)
Fall
SektionsNr..
Diagnose/ Befund
Alter
Gewebe
Vorbericht
172
S 297/70
Enteritis, Lymphadenitis
8 Mon.
Darm
gestorben
174
S 469/70
Panleukopenie
9 Mon.
Darm
ganze Würfe gestorben oder tot geboren
183
S 1384/70
Verdacht Laryngoenteritis, Enteritis cat., Tonsillitis
?
Darm
häufig Todesfälle im Katzenbestand
184
S 1521/70
hgr. cat. Enteritis
4 Mon.
Darm
Verdacht Panleukopenie
194
S 570/71
Verdacht Katzenseuche, chronische Enteritis
?
Darm
plötzlich gestorben
195
S 571/71
Verdacht Laryngoenteritis, Enteritis
?
Darm
plötzlich gestorben
196
S 588/71
Verdacht Panleukopenie
?
Darm
Transport von 15 Katzen, davon 4 tot
214
S 1841/71
blutige Enteritis
?
Darm
Niesen
215
S 1853/71
Panleukopenie
Welpe
Darm
?
221
S 2049/72
Panleukopenie
?
Darm
?
227
S 2187/72
Panleukopenie
?
Darm
1 Wurf davon 3 tot
232
S 2664/72
fibrinöse Enteritis
4 Mon.
Darm
Verdacht Katzenseuche
240
S 3152/72
Panleukopenie, diphteroide Enteritis
5 Mon.
Darm
Erbrechen, Durchfall, Fieber
243
S 3528/72
hgr. akute kat. Gastroenteritis
?
Darm
Fieber, Durchfall, gestorben
244
S 3524/72
hgr. akute kat. Gastroenteritis
?
Darm
Fieber, Durchfall, gestorben
246
S 3538/72
Katzenseuche
?
Darm
Verdacht Vergiftung
249
S 3669/72
hgr. akute kat. Gastroenteritis
?
Darm
Verdacht Panleukopenie
1970
1971
1972
69
Anhang
Fall
Sektions-Nr.
Diagnose/ Befund
Alter
Gewebe
Vorbericht
250
S 3679/72
Katzenseuche
5 Mon.
Darm
?
259
S 4013/73
Verdacht Panleukopenie
9 Mon.
Darm
Erbrechen, gestorben
260
S 4025/73
Panleukopenie
?
Darm
Erbrechen, Durchfall, Fieber
267
S 4362/73
Panleukopenie
?
Darm
Apathie, Anorexie
273
S 4607/73
Infektiöse Laryngoenteritis
2 Jahre
Darm
Apathie, Inappetenz
277
S 4735/73
Infektiöse Laryngoenteritis
8 Wo.
Darm
Stammt aus Tierheim, Inappetenz
279
S 4888/73
Panleukopenie
10 Wo.
Darm
gestorben
307
S 5823/74
Panleukopenie
?
Darm
?
308
S 5830/74
Panleukopenie
1 Jahr
Darm
3 Katzen tot, Erbrechen, Durchfall
318
S 647/274
Panleukopenie
17 Mon.
Darm
Erbrechen, Untertemperatur
324
S 234/74
Panleukopenie
adult
Darm
?
328
S 459/74
Gastroenteritis
9 Mon.
Darm
Erbrechen, Durchfall
337
S 674/75
Panleukopenie
?
Darm
?
341
S 924/75
Panleukopenie
6 Mon.
Darm
Erbrechen, Durchfall
342
S 974/75
Panleukopenie
jung
Darm
?
347
S 1450/75
Panleukopenie
2 Jahre
Darm
?
359
S 2467/75
Panleukopenie
4 Mon.
Darm
Gastroenteritis, Stomatitis
361
S 2503/75
Panleukopenie
?
Darm
3 von 7 Katzen tot, Erbrechen, Durchfall
1973
1974
1975
70
Anhang
Fall
Sektions-Nr.
Diagnose/ Befund
Alter
Gewebe
Vorbericht
363
S 2588/76
Panleukopenie
3 Mon.
Darm
Brechdruchfall
375
S 3934/76
Panleukopenie, Enteritis cat. fibrinosa
2 Mon.
Darm
Rhinotracheitis
383
S 4443/76
Panleukopenie
1 Jahr
Darm
Erbrechen
386
S 4699/77
Laryngoenteritis
6 Mon.
Darm
Ohne Symptome gestorben
390
S 5043/77
/
5 Jahre
Darm
Verdacht Panleukopenie
391
S 5134/77
Verdacht Panleukopenie
1 Jahr
Darm
Erbrechen, Durchfall
408
S 5898/77
Gastoenteritis
5 Wo.
Darm
Brechdurchfall, Bestandserkrankung
410
S 5969/77
hgr. Zottenatrophie
1 Jahr
Darm
plötzlich tot
412
S 5984/77
Enteritis
1 Jahr
Darm
?
416
S 6171/77
Panleukopenie
1 Jahr
Darm
Inappentenz, gestorben
425
S 6599/78
Panleukopenie
10 Mon.
Darm
4 Katzen tot in einer Woche, Apathie
428
S 6718/78
Verdacht Panleukopenie
3 Mon.
Darm
Erbrechen, Durchfall
430
S 6757/78
Panleukopenie
8 Mon.
Darm
Verdacht Panleukopenie
436
S 6918/78
Panleukopenie
Adult
Darm
mehrere Katzen nach Erbrechen tot
452
S 663/78
Verdacht Panleukopenie
8 Mon.
Darm
Erbrechen, Durchfall
462
S 1098/78
Panleukopenie
14 Wo.
Darm
Erbrechen, Wurfgeschwister tot
476
S 1527/78
Verdacht Panleukopenie
3,5 Mon.
Darm
aus Tierheim, Erbrechen, Durchfall
1976
1977
1978
71
Anhang
Fall
Sektions-Nr.
Diagnose/ Befund
Alter
Gewebe
Vorbericht
497
S 2442/79
cat. häm. Enteritis
10 Mon.
Darm
Erbrechen, Durchfall
503
S 3056/79
Enteritis cat. akuta, Verdacht Vergiftung
8 Wo.
Darm
3 Katzen plötzlich tot
507
S 3207/79
Enteritis, Verdacht Panleukopenie
jung
Darm
?
510
S 3414/79
Panleukopenie
11 Wo.
Darm
Erbrechen, Inappetenz
515
S 3544/79
häm. Enteritis
2 Mon.
Darm
Erbrechen, Fieber, Apathie
516
S 3553/79
Panleukopenie
jung
Darm
Erbrechen, Durchfall, plötzlich tot
519
S 3591/79
Panleukopenie
2 Mon.
Darm
plötzlich tot
583
S 5378/80
Verdacht Panleukopenie
10 Wo.
Darm
Ataxie
593
S 5608/80
Verdacht Panleukopenie
3 Mon.
Darm
Erbrechen, Inappetenz
605
S 6039/80
Panleukopenie
5 Mon.
Darm
Erbrechen
615
S 6221/80
Panleukopenie
7 Mon.
Darm
?
616
S 6227/80
Panleukopenie
2 Mon.
Darm
gestorben
1979
1980
Tabelle 15: Parvovirus-positive Proben anderer Tierarten: Waschbär
Fall
Sektions-Nr.
Diagnose/ Befund
Alter
Gewebe
Vorbericht
S 42/74
fibrinöse Enteritis
?
Darm
Wildfang;
1974
321
seit
plötzlicher Tod
72
6
Wochen
im
Gehege;
Anhang
9.3 Verwendete Codes
genetischer Code
1. Position
(5’ Ende)
T
C
A
G
2. Position
3. Position
T
C
A
G
(3’ Ende)
Phe
Ser
Tyr
Cys
T
Phe
Ser
Tyr
Cys
C
Leu
Ser
STOP
STOP
A
Leu
Ser
STOP
Trp
G
Leu
Pro
His
Arg
T
Leu
Pro
His
Arg
C
Leu
Pro
Gln
Arg
A
Leu
Pro
Gln
Arg
G
Ile
Thr
Asn
Ser
T
Ile
Thr
Asn
Ser
C
Ile
Thr
Lys
Arg
A
Met
Thr
Lys
Arg
G
Val
Ala
Asp
Gly
T
Val
Ala
Asp
Gly
C
Val
Ala
Glu
Gly
A
Val
Ala
Glu
Gly
G
universeller genetischer Code
A
Adenin
C
Cytosin
G
Guanin
T
Thymin
73
Anhang
Aminosäuren und ihre Symbole
Codons
A
Ala
Alanin
GCA
GCC
C
Cys
Cystein
TGC
TGT
D
Asp
Aspartat
GAC
GAT
E
Glu
Glutamat
GAA
GAG
F
Phe
Phenylalanin
TTC
TTT
G
Gly
Glycin
GGA
GGC
H
His
Histidin
CAC
CAT
I
Ile
Isoleucin
ATA
ATC
K
Lys
Lysin
AAA
AAG
L
Leu
Leucin
TTA
TTG
M
Met
Methionin
ATG
N
Asn
Asparagin
AAC
AAT
P
Pro
Prolin
CCA
CCC
Q
Gln
Glutamin
CAA
CAG
R
Arg
Arginin
AGA
S
Ser
Serin
T
Thr
V
GCG
GCT
GGG
GGT
ATT
CTA
CTC
CCG
CCT
AGG
CGA
AGC
AGT
Threonin
ACA
Val
Valin
GTA
W
Trp
Tryptophan
TGG
Y
Tyr
Tyrosin
TAC
74
CTG
CTT
CGC
CGG
CGT
TCA
TCC
TCG
TCT
ACC
ACG
ACT
GTC
GTG
GTT
TAT
Anhang
9.4 Vergleich der Parvovirussequenzen aus den Katzengeweben mit
der Referenzsequenz FPV-b
Nukleotidsequenz des VP2-Gens
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
A T G A G T G A T G G A G C A G T T C A FPV-b CU4
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 174 Ktz. 70
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 195 Ktz. 71
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 232 Ktz. 72
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 277 Ktz. 73
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 281 Ktz. 73
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 308 Ktz. 74
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 361 Ktz. 75
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 363 Ktz. 76
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 386 Ktz. 77
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 425 Ktz. 78
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 430 Ktz. 78
21
21
21
21
21
21
21
21
21
21
21
21
A C C A G A C G G T G G T C A A C C T G FPV-b CU4
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 174 Ktz. 70
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 195 Ktz. 71
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 232 Ktz. 72
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 277 Ktz. 73
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 281 Ktz. 73
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 308 Ktz. 74
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 361 Ktz. 75
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 363 Ktz. 76
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 386 Ktz. 77
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 425 Ktz. 78
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 430 Ktz. 78
41
41
41
41
41
41
41
41
41
41
41
41
CTGTCAGAAATGAAAGAGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
61
61
61
61
61
61
61
61
61
61
61
61
A C A G G A T C T G G G A A C G G G T C FPV-b CU4
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 174 Ktz. 70
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 195 Ktz. 71
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 232 Ktz. 72
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 277 Ktz. 73
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 281 Ktz. 73
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 308 Ktz. 74
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 361 Ktz. 75
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 363 Ktz. 76
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 386 Ktz. 77
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 425 Ktz. 78
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 430 Ktz. 78
81
81
81
81
81
81
81
81
81
81
81
81
TGGAGGCGGGGGTGGTGGTG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - C- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
101
101
101
101
101
101
101
101
101
101
101
101
G T T C T G G G G G T G T G G G G A T T FPV-b CU4
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 174 Ktz. 70
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 195 Ktz. 71
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 232 Ktz. 72
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 277 Ktz. 73
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 281 Ktz. 73
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 308 Ktz. 74
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 361 Ktz. 75
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 363 Ktz. 76
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 386 Ktz. 77
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 425 Ktz. 78
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 430 Ktz. 78
121
121
121
121
121
121
121
121
121
121
121
121
TCTACGGGTACTTTCAATA A
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - T- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
141
141
141
141
141
141
141
141
141
141
141
141
TCAGACGGAATTTAAATTTT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
FPV-b CU4
174 Ktz. 70
195 Ktz. 71
232 Ktz. 72
277 Ktz. 73
281 Ktz. 73
308 Ktz. 74
361 Ktz. 75
363 Ktz. 76
386 Ktz. 77
425 Ktz. 78
430 Ktz. 78
FPV-b CU4
174 Ktz. 70
195 Ktz. 71
232 Ktz. 72
277 Ktz. 73
281 Ktz. 73
308 Ktz. 74
361 Ktz. 75
363 Ktz. 76
386 Ktz. 77
425 Ktz. 78
430 Ktz. 78
FPV-b CU4
174 Ktz. 70
195 Ktz. 71
232 Ktz. 72
277 Ktz. 73
281 Ktz. 73
308 Ktz. 74
361 Ktz. 75
363 Ktz. 76
386 Ktz. 77
425 Ktz. 78
430 Ktz. 78
75
FPV-b CU4
174 Ktz. 70
195 Ktz. 71
232 Ktz. 72
277 Ktz. 73
281 Ktz. 73
308 Ktz. 74
361 Ktz. 75
363 Ktz. 76
386 Ktz. 77
425 Ktz. 78
430 Ktz. 78
Anhang
161
161
161
161
161
161
161
161
161
161
161
161
TGGAAAACGGGTGGGTGGAA
- - - - - - - - - - A - - - - - - - - - - - - - - - - - - A - - - - - - - - - - - - - - - - - - A - - - - - - - - - - - - - - - - - - A - - - - - - - - - - - - - - - - - - A - - - - - - - - - - - - - - - - - - A - - - - - - - - - - - - - - - - - - A - - - - - - - - - - - - - - - - - - A - - - - - - - - - - - - - - - - - - A - - - - - - - - - - - - - - - - - - A - - - - - - - - - - - - - - - - - - A - - - - - - - - -
201
201
201
201
201
201
201
201
201
201
201
ACTTGTACATTTAAATATGC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
FPV-b CU4
174 Ktz. 70
195 Ktz. 71
232 Ktz. 72
277 Ktz. 73
281 Ktz. 73
308 Ktz. 74
361 Ktz. 75
363 Ktz. 76
386 Ktz. 77
425 Ktz. 78
430 Ktz. 78
181
181
181
181
181
181
181
181
181
181
181
181
A T C A C A G C A A A C T C A A G C A G FPV-b CU4
- - T - - - - - - - - - - - - - - - - - 174 Ktz. 70
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 195 Ktz. 71
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 232 Ktz. 72
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 277 Ktz. 73
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 281 Ktz. 73
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 308 Ktz. 74
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 361 Ktz. 75
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 363 Ktz. 76
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 386 Ktz. 77
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 425 Ktz. 78
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 430 Ktz. 78
FPV-b CU4
174 Ktz. 70
195 Ktz. 71
232 Ktz. 72
277 Ktz. 73
281 Ktz. 73
308 Ktz. 74
361 Ktz. 75
386 Ktz. 77
425 Ktz. 78
430 Ktz. 78
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CAGAAAGTGAAAATTATAAA
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A G A G T A G T T G T A A A T A A T A T FPV-b CU4
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- - - - - G - - - - - - - - - - - - - - 195 Ktz. 71
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- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 277 Ktz. 73
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 281 Ktz. 73
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- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 363 Ktz. 76
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- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 425 Ktz. 78
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 430 Ktz. 78
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261
G G A T A A A A C T G C A G T T A A A G FPV-b CU4
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 174 Ktz. 70
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 195 Ktz. 71
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 232 Ktz. 72
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 277 Ktz. 73
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 281 Ktz. 73
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 308 Ktz. 74
- - - - - - - - - - T - - - - - - - - - 361 Ktz. 75
- - - - - - - - - - A - - - - - - - - - 363 Ktz. 76
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 386 Ktz. 77
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 425 Ktz. 78
- - - - - - - - - - - - - A - - - - - - 430 Ktz. 78
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GAAACATGGCTTTAGATGAT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
FPV-b CU4
174 Ktz. 70
195 Ktz. 71
32 Ktz. 72
277 Ktz. 73
281 Ktz. 73
308 Ktz. 74
361 Ktz. 75
363 Ktz. 76
386 Ktz. 77
425 Ktz. 78
430 Ktz. 78
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301
ACTCATGTACAAATTGTAAC
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ACCTTGGTCATTGGTTGATG
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FPV-b CU4
174 Ktz. 70
195 Ktz. 71
232 Ktz. 72
277 Ktz. 73
281 Ktz. 73
308 Ktz. 74
361 Ktz. 75
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386 Ktz. 77
425 Ktz. 78
430 Ktz. 78
341
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341
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341
C A A A T G C T T G G G G A G T T T G G FPV-b CU4
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 174 Ktz. 70
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 195 Ktz. 71
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 232 Ktz. 72
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 277 Ktz. 73
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 281 Ktz. 73
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 308 Ktz. 74
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 361 Ktz. 75
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 363 Ktz. 76
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 386 Ktz. 77
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 425 Ktz. 78
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 430 Ktz. 78
76
FPV-b CU4
174 Ktz. 70
195 Ktz. 71
232 Ktz. 72
277 Ktz. 73
281 Ktz. 73
308 Ktz. 74
363 Ktz. 76
386 Ktz. 77
425 Ktz. 78
430 Ktz. 78
FPV-b CU4
174 Ktz. 70
195 Ktz. 71
232 Ktz. 72
277 Ktz. 73
281 Ktz. 73
308 Ktz. 74
361 Ktz. 75
363 Ktz. 76
386 Ktz. 77
425 Ktz. 78
430 Ktz. 78
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TTTAATCCAGGAGATTGGCA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
FPV-b CU4
174 Ktz. 70
195 Ktz. 71
232 Ktz. 72
277 Ktz. 73
281 Ktz. 73
308 Ktz. 74
361 Ktz. 75
363 Ktz. 76
386 Ktz. 77
425 Ktz. 78
430 Ktz. 78
381
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381
381
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ACTAATTGTTAATACTATGA
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FPV-b CU4
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195 Ktz. 71
232 Ktz. 72
277 Ktz. 73
281 Ktz. 73
308 Ktz. 74
361 Ktz. 75
363 Ktz. 76
386 Ktz. 77
425 Ktz. 78
430 Ktz. 78
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GTGAGTTGCATTTAGTTAGT
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FPV-b CU4
174 Ktz. 70
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386 Ktz. 77
425 Ktz. 78
430 Ktz. 78
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421
421
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TTTGAACAAGAAATTTTTAA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
FPV-b CU4
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361 Ktz. 75
363 Ktz. 76
386 Ktz. 77
425 Ktz. 78
430 Ktz. 78
441 T G T T G T T T T A A A G A C T G T T T
441 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 441 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 441 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 441 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 441 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 441 - - - - - - - C - - - - - - - - - - - 441 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 441 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 441 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 441 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 441 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
FPV-b CU4
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425 Ktz. 78
430 Ktz. 78
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C A G A A T C T G C T A C T C A G C C A FPV-b CU4
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 174 Ktz. 70
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CCAACTAAAGTTTATAATAA
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FPV-b CU4
174 Ktz. 70
195 Ktz. 71
232 Ktz. 72
277 Ktz. 73
281 Ktz. 73
308 Ktz. 74
361 Ktz. 75
363 Ktz. 76
386 Ktz. 77
425 Ktz. 78
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TGATTTAACTGCATCATTGA
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FPV-b CU4
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386 Ktz. 77
425 Ktz. 78
430 Ktz. 78
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TGGTTGCATTAGATAGTAAT
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FPV-b CU4
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AATACTATGCCATTTACTCC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
FPV-b CU4
174 Ktz. 70
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AGCAGCTATGAGATCTGAGA
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FPV-b CU4
174 Ktz. 70
195 Ktz. 71
232 Ktz. 72
277 Ktz. 73
281 Ktz. 73
308 Ktz. 74
361 Ktz. 75
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FPV-b CU4
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AAACCAACCATACCAACTCC
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FPV-b CU4
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FPV-b CU4
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GGGATAGAACATTAATACCA
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FPV-b CU4
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T C T C A T A C T G G A A C T A G T G G FPV-b CU4
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- - - - - - - - - - - - -G- - - - - - - - - - - - - - - - - -G- - - - C- - - - - - - - - - - - -G- - - - - - - - - - - - - - - - - -G- - - - - - - - - - - - - - - - - -G- - - - - - - - - - - - - - - - - -G- - - - - - - - - - - - - - - - - -G- - - - - - - - - - - - - - - - - -G- - - - - - - - - - - - - - - - - -G- - - - - - - - - - - - - - - - - -G- - - - - - - - - - - - - - - - - -G- - - - - -
FPV-b CU4
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A T G G T A C A G A T C C A G A T G A T FPV-b CU4
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AAATTCTGTGCCAGTACACT
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FPV-b CU4
174 Ktz. 70
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308 Ktz. 74
361 Ktz. 75
363 Ktz. 76
386 Ktz. 77
425 Ktz. 78
430 Ktz. 78
Anhang
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TACTAAGAACAGGTGATGAA
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FPV-b CU4
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TTTGCTACAGGAACATTTTT
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801 T T T T G A T T G C A A A C C A T G T A
801 - - - - - - - - - T - - - - - - - - - 801 - - - - - - - - - T - - - - - - - - - 801 - - - - - - - - - T - - - - - - - - - 801 C - - - - - - - - T - - - - - - - - - 801 - - - - - - - - - T - - - - - - - - - 801 - - - C - - - - - T - - - - - - - - - 801 - - - - - - - - - T - - - - - - - - - 801 - - - - - - - - - T - - - - - - - - - 801 - - - - - - - - - T - - - - - - - - - 801 - - - - - - - - - T - - - - - - - - - 801 - - - - - - - - - T - - - - - - - - - -
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G A C T A A C A C A T A C A T G G C A A FPV-b CU4
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ACAAATAGAGCATTGGGCTT
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- - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
FPV-b CU4
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- - - - - - - - - - C- - - - - - - - - - - - - - - - - - C- - - - - - - - - - - - - - - - - - C- - - - - - - - - - - - - - - - - - C- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - C- - - - - - - - - - - - - - - - - - C- - - - - - - - - - - - - - - - - - C- - - - - - - - - - - - - - - - - - C- - - - - - - - - - - - - - - - - - C- - - - - - - - - - - - - - - - - - C- - - - - - - - -
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ACTAACTTTGGTGATATAGG
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G T G G T G T A A C T C A A A T G G G A FPV-b CU4
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FPV-b CU4
174 Ktz. 70
195 Ktz. 71
232 Ktz. 72
277 Ktz. 73
281 Ktz. 73
308 Ktz. 74
361 Ktz. 75
363 Ktz. 76
386 Ktz. 77
425 Ktz. 78
430 Ktz. 78
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AATACAGACTATATTACTGA
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FPV-b CU4
174 Ktz. 70
195 Ktz. 71
232 Ktz. 72
277 Ktz. 73
281 Ktz. 73
308 Ktz. 74
361 Ktz. 75
363 Ktz. 76
386 Ktz. 77
425 Ktz. 78
430 Ktz. 78
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AGCTACTATTATGAGACCAG
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FPV-b CU4
174 Ktz. 70
195 Ktz. 71
232 Ktz. 72
277 Ktz. 73
281 Ktz. 73
308 Ktz. 74
361 Ktz. 75
363 Ktz. 76
386 Ktz. 77
425 Ktz. 78
430 Ktz. 78
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CTGAGGTTGGTTATAGTGCA
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FPV-b CU4
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232 Ktz. 72
277 Ktz. 73
281 Ktz. 73
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363 Ktz. 76
386 Ktz. 77
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430 Ktz. 78
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CCATATTATTCTTTTGAAGC
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FPV-b CU4
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232 Ktz. 72
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425 Ktz. 78
430 Ktz. 78
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GTCTACACAAGGGCCATTTA
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FPV-b CU4
174 Ktz. 70
195 Ktz. 71
232 Ktz. 72
277 Ktz. 73
281 Ktz. 73
308 Ktz. 74
361 Ktz. 75
363 Ktz. 76
386 Ktz. 77
425 Ktz. 78
430 Ktz. 78
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AAACACCTATTGCAGCAGGA
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C G G G G G G G A G C G C A A A C A G A FPV-b CU4
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- - - - - - - - - - - A - - - - - - - - 277 Ktz. 73
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T G A A A A T C A A G C A G C A G A T G FPV-b CU4
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- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 281 Ktz. 73
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GTGATCCAAGATATGCATTT
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GGTAGACAACATGGTCAAAA
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FPV-b CU4
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281 Ktz. 73
308 Ktz. 74
361 Ktz. 75
363 Ktz. 76
386 Ktz. 77
425 Ktz. 78
430 Ktz. 78
80
FPV-b CU4
174 Ktz. 70
195 Ktz. 71
232 Ktz. 72
277 Ktz. 73
281 Ktz. 73
308 Ktz. 74
361 Ktz. 75
363 Ktz. 76
386 Ktz. 77
425 Ktz. 78
430 Ktz. 78
FPV-b CU4
174 Ktz. 70
195 Ktz. 71
232 Ktz. 72
277 Ktz. 73
281 Ktz. 73
308 Ktz. 74
361 Ktz. 75
363 Ktz. 76
386 Ktz. 77
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AACTACTACAACAGGAGAAA
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FPV-b CU4
174 Ktz. 70
195 Ktz. 71
232 Ktz. 72
277 Ktz. 73
281 Ktz. 73
308 Ktz. 74
361 Ktz. 75
363 Ktz. 76
386 Ktz. 77
425 Ktz. 78
430 Ktz. 78
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CACCTGAGAGATTTACATAT
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FPV-b CU4
174 Ktz. 70
195 Ktz. 71
232 Ktz. 72
277 Ktz. 73
281 Ktz. 73
308 Ktz. 74
361 Ktz. 75
363 Ktz. 76
386 Ktz. 77
425 Ktz. 78
430 Ktz. 78
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ATAGCACATCAAGATACAGG
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FPV-b CU4
174 Ktz. 70
195 Ktz. 71
232 Ktz. 72
277 Ktz. 73
281 Ktz. 73
308 Ktz. 74
361 Ktz. 75
363 Ktz. 76
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AAGATATCCAGAAGGAGATT
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FPV-b CU4
174 Ktz. 70
195 Ktz. 71
232 Ktz. 72
277 Ktz. 73
281 Ktz. 73
308 Ktz. 74
361 Ktz. 75
363 Ktz. 76
386 Ktz. 77
425 Ktz. 78
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GGATTCAAAATATTAACTTT
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AACCTTCCTGTAACAAATGA
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FPV-b CU4
174 Ktz. 70
195 Ktz. 71
232 Ktz. 72
277 Ktz. 73
281 Ktz. 73
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363 Ktz. 76
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425 Ktz. 78
430 Ktz. 78
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T A A T G T A T T G C T A C C A A C A G FPV-b CU4
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 174 Ktz. 70
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 195 Ktz. 71
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ATCCAATTGGAGGTAAAACA
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FPV-b CU4
174 Ktz. 70
195 Ktz. 71
232 Ktz. 72
277 Ktz. 73
281 Ktz. 73
308 Ktz. 74
361 Ktz. 75
363 Ktz. 76
386 Ktz. 77
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GGAATTAACTATACTAATAT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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ATTTAATACTTATGGTCCTT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
FPV-b CU4
174 Ktz. 70
195 Ktz. 71
232 Ktz. 72
277 Ktz. 73
281 Ktz. 73
308 Ktz. 74
361 Ktz. 75
363 Ktz. 76
386 Ktz. 77
425 Ktz. 78
430 Ktz. 78
FPV-b CU4
174 Ktz. 70
195 Ktz. 71
232 Ktz. 72
277 Ktz. 73
281 Ktz. 73
308 Ktz. 74
361 Ktz. 75
363 Ktz. 76
386 Ktz. 77
425 Ktz. 78
430 Ktz. 78
81
FPV-b CU4
174 Ktz. 70
195 Ktz. 71
232 Ktz. 72
277 Ktz. 73
281 Ktz. 73
308 Ktz. 74
361 Ktz. 75
363 Ktz. 76
386 Ktz. 77
425 Ktz. 78
430 Ktz. 78
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TAACTGCATTAAATAATGTA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
FPV-b CU4
174 Ktz. 70
195 Ktz. 71
232 Ktz. 72
277 Ktz. 73
281 Ktz. 73
308 Ktz. 74
361 Ktz. 75
363 Ktz. 76
386 Ktz. 77
425 Ktz. 78
430 Ktz. 78
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CCACCAGTTTATCCAAATGG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1401
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TCAAATTTGGGATAAAGAAT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
FPV-b CU4
174 Ktz. 70
195 Ktz. 71
232 Ktz. 72
277 Ktz. 73
281 Ktz. 73
308 Ktz. 74
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363 Ktz. 76
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425 Ktz. 78
430 Ktz. 78
1421
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1421
TTGATACTGACTTAAAACCA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
FPV-b CU4
174 Ktz. 70
195 Ktz. 71
232 Ktz. 72
277 Ktz. 73
281 Ktz. 73
308 Ktz. 74
361 Ktz. 75
363 Ktz. 76
386 Ktz. 77
425 Ktz. 78
430 Ktz. 78
1441
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1441
A G A C T T C A T G T A A A T G C A C C FPV-b CU4
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 174 Ktz. 70
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 195 Ktz. 71
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 232 Ktz. 72
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 277 Ktz. 73
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 281 Ktz. 73
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 308 Ktz. 74
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 361 Ktz. 75
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 363 Ktz. 76
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- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 430 Ktz. 78
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ATTTGTTTGTCAAAATAATT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - C - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
FPV-b CU4
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195 Ktz. 71
232 Ktz. 72
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281 Ktz. 73
308 Ktz. 74
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363 Ktz. 76
386 Ktz. 77
425 Ktz. 78
430 Ktz. 78
1481
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1481
GTCCTGGTCAATTATTTGTA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
FPV-b CU4
174 Ktz. 70
195 Ktz. 71
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277 Ktz. 73
281 Ktz. 73
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361 Ktz. 75
363 Ktz. 76
386 Ktz. 77
425 Ktz. 78
430 Ktz. 78
1501
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1501
A A A G T T G C G C C T A A T T T A A C FPV-b CU4
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 174 Ktz. 70
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 195 Ktz. 71
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 232 Ktz. 72
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- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 281 Ktz. 73
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- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 361 Ktz. 75
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1521 G A A T G A A T A T G A T C C T G A T G FPV-b CU4
1521 A - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 174 Ktz. 70
1521 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 195 Ktz. 71
1521 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 232 Ktz. 72
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1521 A - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 281 Ktz. 73
1521 A - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 308 Ktz. 74
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1521 A - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 430 Ktz. 78
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1541
C A T C T G C T A A T A T G T C A A G A FPV-b CU4
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 174 Ktz. 70
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 195 Ktz. 71
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 232 Ktz. 72
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- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 281 Ktz. 73
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- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 425 Ktz. 78
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 430 Ktz. 78
82
FPV-b CU4
174 Ktz. 70
195 Ktz. 71
232 Ktz. 72
277 Ktz. 73
281 Ktz. 73
308 Ktz. 74
361 Ktz. 75
363 Ktz. 76
386 Ktz. 77
425 Ktz. 78
430 Ktz. 78
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A T T G T A A C T T A T T C A G A T T T FPV-b CU4
- - - - - - - - - - - C - - - - - - - - 174 Ktz. 70
- - - - - - - - - - - C - - - - - - - - 195 Ktz. 71
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 232 Ktz. 72
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 277 Ktz. 73
- - - - - - - - - - - C - - - - - - - - 281 Ktz. 73
- - - - - - - - - - - C - - - - - - - - 308 Ktz. 74
- - - - - - - - - - - C - - - - - - - - 361 Ktz. 75
- - - - - - - - - - - C - - - - - - - - 363 Ktz. 76
- - - - - - - - - - - C - - - - - - - - 386 Ktz. 77
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 425 Ktz. 78
- - - - - - - - - - - C - - - - - - - - 430 Ktz. 78
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TTGGTGGAAAGGTAAATTAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
FPV-b CU4
174 Ktz. 70
195 Ktz. 71
232 Ktz. 72
277 Ktz. 73
281 Ktz. 73
308 Ktz. 74
361 Ktz. 75
363 Ktz. 76
386 Ktz. 77
425 Ktz. 78
430 Ktz. 78
1601
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TATTTAAAGCTAAACTAAGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
FPV-b CU4
174 Ktz. 70
195 Ktz. 71
232 Ktz. 72
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308 Ktz. 74
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363 Ktz. 76
386 Ktz. 77
425 Ktz. 78
430 Ktz. 78
1621
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1621
GCATCTCATACTTGGAATCC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
FPV-b CU4
174 Ktz. 70
195 Ktz. 71
232 Ktz. 72
277 Ktz. 73
281 Ktz. 73
308 Ktz. 74
361 Ktz. 75
363 Ktz. 76
386 Ktz. 77
425 Ktz. 78
430 Ktz. 78
1641
1641
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1641
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1641
AATTCAACAAATGAGTATTA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
FPV-b CU4
174 Ktz. 70
195 Ktz. 71
232 Ktz. 72
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281 Ktz. 73
308 Ktz. 74
361 Ktz. 75
363 Ktz. 76
386 Ktz. 77
425 Ktz. 78
430 Ktz. 78
1661
1661
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1661
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1661
ATGTAGATAACCAATTTAAC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
FPV-b CU4
174 Ktz. 70
195 Ktz. 71
232 Ktz. 72
277 Ktz. 73
281 Ktz. 73
308 Ktz. 74
361 Ktz. 75
363 Ktz. 76
386 Ktz. 77
425 Ktz. 78
430 Ktz. 78
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TATGTACCAAATAATATTGG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
FPV-b CU4
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195 Ktz. 71
232 Ktz. 72
277 Ktz. 73
281 Ktz. 73
308 Ktz. 74
361 Ktz. 75
363 Ktz. 76
386 Ktz. 77
425 Ktz. 78
430 Ktz. 78
1701
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1701
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1701
AGCTATGAAAATTGTATATG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -G- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
FPV-b CU4
174 Ktz. 70
195 Ktz. 71
232 Ktz. 72
277 Ktz. 73
281 Ktz. 73
308 Ktz. 74
361 Ktz. 75
363 Ktz. 76
386 Ktz. 77
425 Ktz. 78
430 Ktz. 78
1721
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1721
1721
1721
1721
1721
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1721
AAAAATCTCAACTAGCACCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
FPV-b CU4
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363 Ktz. 76
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1741
1741
1741
1741
1741
1741
1741
1741
1741
1741
1741
1741
AGAAAATTATATTAA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
83
FPV-b CU4
174 Ktz. 70
195 Ktz. 71
232 Ktz. 72
277 Ktz. 73
281 Ktz. 73
308 Ktz. 74
361 Ktz. 75
363 Ktz. 76
386 Ktz. 77
425 Ktz. 78
430 Ktz. 78
Anhang
Aminosäuresequenz des VP2-Gens
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
MSDGAVQPDGGQPAVRNERA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
FPV-b CU4
174 Ktz. 70
195 Ktz. 71
232 Ktz. 72
277 Ktz. 73
281 Ktz. 73
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361 Ktz. 75
363 Ktz. 76
386 Ktz. 77
425 Ktz. 78
430 Ktz. 78
21
21
21
21
21
21
21
21
21
21
21
21
TGSGNGSGGGGGGGSGGVGI
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
FPV-bCU4
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281 Ktz. 73
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363 Ktz. 76
386 Ktz. 77
425 Ktz. 78
430 Ktz. 78
41
41
41
41
41
41
41
41
41
41
41
41
STGTFNNQTEFKFLENGWVE
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
FPV-b CU4
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195 Ktz. 71
232 Ktz. 72
277 Ktz. 73
281 Ktz. 73
308 Ktz. 74
361 Ktz. 75
363 Ktz. 76
386 Ktz. 77
425 Ktz. 78
430 Ktz. 78
61
61
61
61
61
61
61
61
61
61
61
61
ITANSSRLVHLNMPESENYK
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
FPV-b CU4
174 Ktz. 70
195 Ktz. 71
232 Ktz. 72
277 Ktz. 73
281 Ktz. 73
308 Ktz. 74
361 Ktz. 75
363 Ktz. 76
386 Ktz. 77
425 Ktz. 78
430 Ktz. 78
81
81
81
81
81
81
81
81
81
81
81
81
R V V V N N M D K T A V K G N M A L D D FPV-b CU4
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- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 195 Ktz. 71
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 232 Ktz. 72
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 277 Ktz. 73
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 281 Ktz. 73
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 308 Ktz. 74
- - - - - - - - - - S - - - - - - - - - 361 Ktz. 75
- - - - - - - - - - T - - - - - - - - - 363 Ktz. 76
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 386 Ktz. 77
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 425 Ktz. 78
- - - - - - - - - - - I - - - - - - - - 430 Ktz. 78
101
101
101
101
101
101
101
101
101
101
101
101
THVQIVTPWSLVDANAWGVW
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
FPV-b CU4
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232 Ktz. 72
277 Ktz. 73
281 Ktz. 73
308 Ktz. 74
361 Ktz. 75
363 Ktz. 76
386 Ktz. 77
425 Ktz. 78
430 Ktz. 78
121
121
121
121
121
121
121
121
121
121
121
121
F N P G D W Q L I V N T M S E L H L V S FPV-b CU4
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- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 195 Ktz. 71
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 232 Ktz. 72
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 277 Ktz. 73
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 281 Ktz. 73
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 308 Ktz. 74
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 361 Ktz. 75
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 363 Ktz. 76
- - - - - - - - - - - - - - - - - - I - 386 Ktz. 77
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 425 Ktz. 78
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 430 Ktz. 78
141 F E Q E I F N V V L K T V S E S A T Q P
141 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 141 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 141 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 141 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 141 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 141 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 141 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 141 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 141 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 141 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 141 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
84
FPV-b CU4
174 Ktz. 70
195 Ktz. 71
232 Ktz. 72
277 Ktz. 73
281 Ktz. 73
308 Ktz. 74
361 Ktz. 75
363 Ktz. 76
386 Ktz. 77
425 Ktz. 78
430 Ktz. 78
Anhang
161
161
161
161
161
161
161
161
161
161
161
161
P T K V Y N N D L T A S L M V A L D S N FPV-b CU4
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 174 Ktz. 70
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 195 Ktz. 71
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 232 Ktz. 72
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 277 Ktz. 73
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 281 Ktz. 73
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 308 Ktz. 74
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 361 Ktz. 75
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 363 Ktz. 76
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 386 Ktz. 77
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 425 Ktz. 78
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 430 Ktz. 78
181
181
181
181
181
181
181
181
181
181
181
181
NTMPFTPAAMRSETLGFYPW
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
FPV-b CU4
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195 Ktz. 71
232 Ktz. 72
277 Ktz. 73
281 Ktz. 73
308 Ktz. 74
361 Ktz. 75
363 Ktz. 76
386 Ktz. 77
425 Ktz. 78
430 Ktz. 78
201
201
201
201
201
201
201
201
201
201
201
201
KPTIPTPWRYYFQWDRTLIP
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
FPV-b CU4
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430 Ktz. 78
221
221
221
221
221
221
221
221
221
221
221
221
SHTGTSGTPTNIYHGTDPDD
- - - - - - - - - - - V- - - - - - - - - - - - - - - - - - V- - - - - - - - - - - - - - - - - V- - - - - - - - - - - - - - - - - V- - - - - - - - - - - - - - - - - V- - - - - - - - - - - - - - - - - V- - - - - - - - - - - - - - - - - V- - - - - - - - - - - - - - - - - V- - - - - - - - - - - - - - - - - V- - - - - - - - - - - - - - - - - V- - - - - - - - - - - - - - - - - V- - - - - - -
FPV-b CU4
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425 Ktz. 78
430 Ktz. 78
241
241
241
241
241
241
241
241
241
241
241
241
VQFYTIENSVPVHLLRTGDE
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
FPV-b CU4
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261
261
261
261
261
261
261
261
261
261
261
261
FATGTFFFDCKPCRLTHTW
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
FPV-b CU4
174 Ktz. 70
195 Ktz. 71
232 Ktz. 72
277 Ktz. 73
281 Ktz. 73
308 Ktz. 74
361 Ktz. 75
363 Ktz. 76
386 Ktz. 77
425 Ktz. 78
430 Ktz. 78
281
281
281
281
281
281
281
281
281
281
281
281
TNRALGLPPFLNSLPQSEGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
FPV-b CU4
174 Ktz. 70
195 Ktz. 71
232 Ktz. 72
277 Ktz. 73
281 Ktz. 73
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- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 281 Ktz. 73
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- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 361 Ktz. 75
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174 Ktz. 70
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363 Ktz. 76
386 Ktz. 77
425 Ktz. 78
430 Ktz. 78
Danksagung
10 Danksagung
Herrn Prof. Dr. Uwe Truyen danke ich für die Bereitstellung des Themas, die
wissenschaftliche Betreuung und die stets gewährte Hilfe und Unterstützung.
Herrn Dr. Peter Wohlsein danke ich für die Bereitstellung der Gewebeproben aus
dem umfassenden Archiv des Institus für Pathologie in Hannover sowie für seine
Hilfe und Beratung bei der Probennahme.
Frau Dr. Sonja Wilhelm danke ich besonders für ihre stets gewährte freundliche
Hilfe. Beim praktischen Arbeiten im Labor sowie bei allen anfallenden Fragen im
Bereich der Molekularbiologie war sie mir eine sehr große Hilfe. Ich danke ihr sehr
für ihre Unterstützung in allen Bereichen während meiner Zeit am Institut und ihre
konstruktive Kritik bei der Anfertigung der Dissertationsmanuskriptes.
Herrn Dr. Uwe Rösler danke ich für seine freundliche Hilfe bei Computerproblemen
und anderen diversen Problemen, die im Rahmen meiner Doktorarbeit aufgetreten
sind.
Frau Nadja Leinecker und Frau Evelin Brumme danke ich herzlich für ihre
Hilfsbereitschaft im Labor.
Bedanken möchte ich mich auch bei den Doktoranden des Insituts für Tierhygiene
und Öffentliches Veterinärwesen, insbesondere meiner besten Freundin Vivian
Hennig für ihre Unterstützung. Gemeinsam haben wir alle Höhen und Tiefen im
Studium und im Institut gemeistert.
Besonders möchte ich mich bei meinem Freund Lars Schneider für seine Geduld,
seine Hilfe und seine aufmunternden Worte bedanken, die mich immer wieder
motiviert und mir viel bedeutet haben.
Meinen Eltern gilt mein ganz besonderer Dank. Ich danke ihnen für ihre
Unterstützung sowohl während meiner Studienzeit als auch während meiner Zeit als
Doktorandin. Ihre konstruktive Kritik bei allen Fragen rund um die Doktorarbeit
waren mir eine große Hilfe.
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