Dr. Rupert Christian Ecker
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Dr. Rupert Christian Ecker geboren am in 8. März 1969 Linz, OÖ Staatsbürgerschaft Österreich Wissenschaftlicher Werdegang 1989–1990 Studium der Physik und Astronomie an der Universität Graz 1990–1992 Studium der Biologie an der Universität Graz, Hauptfach Zoologie/1.Abschnitt Wahlfach Wissenschaftstheorie 1992–1996 Studium der Biologie an der Universität Wien, Hauptfach Zoologie/2.Abschnitt Wahlfach Zellbiologie Juli 1994–Juli 1996 Diplomarbeit „Entwicklung einer automatisierten, durch 3-fach Fluoreszenzfärbung mediierten Gewebszytometrie zur vergleichenden Analyse des Proliferationsverhaltens von Lymphozyten in benignen und malignen Geweben“ Oktober 1996 Sponsion zum Magister der Naturwissenschaften Nov.1996–Aug.2000 Dissertation „Strategien zur Standardisierung und Automatisierung der Immunhistologie“ Februar 2001 Promotion zum Doktor der Naturwissenschaften Mai 2001 – Dez. 2003 Wissenschaftlicher Mitarbeiter (PostDoc) am Kompetenzzentrum für Biomolekulare Therapie (BMT) seit April 2003 Gründungsgesellschafter und Geschäftsführer der Firma TissueGnostics GmbH seit Juni 2005 Gründungsgesellschafter der Firma K2RG Research Group SRL, Iasi, Rumänien Wissenschaftsbezogene Tätigkeiten 1998–2000 Mehrere Auftragsarbeiten zur Automation von Mikroskop-basierten Analyseverfahren im Bereich der medizinischen Bildanalyse am AKH-Wien Mai–Oktober 2001 WIFI - Lehrgang: Ausbildung zum Software Developer - C/C++ Nov.2001–Feb.2002 Organisation und Leitung des Symposiums Advanced Techniques in Microscopy and Cellular Bioinformatics am 4./5. Februar 2002 in Wien. 26.April 2002 Vorsitzender des Arbeitsgebietes „Konfokalmikroskopie und Bildanalyse“ auf der 1. Jahrestagung der Österreichischen Gesellschaft für Zytometrie (FlowTime 2002) in Wien. 2003 Organisation mehrerer Seminare „BMT Seminars on Advanced Techniques“ seit November 2003 Reviewer bei der Fachzeitschrift Cytometry 29. April - 1. Mai 2004 Co-Organisation und Leitung des 2nd Symposion on Advanced Techniques in Microscopy and Cellular Bioinformatics in Krems/Donau. 23. Mai 2004 Vorsitzender des Arbeitsgebietes „Tissue Cytometry“ auf der 22. Jahrestagung der International Society for Analytical Cytology (ISAC) Juli 2005 – Juni 2006 Vorsitzender des Lenkungsausschuss für das Kplus Zentrum Advanced Computer Vision seit Oktober 2005 Mitglied des Beirats am Ludwig Boltzmann Institut für Krebsforschung Mitgliedschaften (in alphabetischer Reihenfolge) - International Society for Analytical Cytology (seit 2004) Österreichische Gesellschaft für Allergologie und Immunologie (seit 2002) Österreichische Gesellschaft für Biochemie und Molekularbiologie (seit 2003) Österreichische Gesellschaft für Zytometrie (seit 2002) Preise und Auszeichnungen 1997 Posterpeis des Vereins zur Förderung der wissenschaftlichen Forschung für die Arbeit „Protein Kinase C in Human Prostate Cancer Cell Lines: Expression of Isoenzymes and Activation by the Environmental Pollutant 2,3,7,8Tetrachlorodibenzo-p-Dioxin (TCDD)“ (Autoren: Schaufler K, Schöller A, Ecker R, Steiner G, Marberger M, Graf J, Thalhammer T) 2002 Leistungsstipendium der Naturwissenschaftlichen Fakultät der Universität Wien Patente (1) Georg E. Steiner and Rupert C. Ecker System und Methode zur vollautomatisierten, quantitativen Analyse von mehrfachgefärbten Oberflächen- und/oder intrazellulären Antigenen bei definierten Zellpopulationen in Gewebe und in Suspension. Austrian patent # 408.032 (2) Georg E. Steiner und Rupert C. Ecker Verfahren und Anordnung zur Untersuchung von Zellen. Austrian patent # 411.066 (3) Georg E. Steiner und Rupert C. Ecker Verfahren und Anordnung zur Untersuchung von Zellen. Patent Cooperation Treaty (PCT) WO 02/35207 A2 (4) Georg E. Steiner und Rupert C. Ecker Verfahren und Anordnung zur Untersuchung von Zellen. EU 1334461 (5) Georg E. Steiner und Rupert C. Ecker A process and set-up for the analysis of single cells. USA patent application – submitted on April 24th, 2003 (6) Dr. Rupert Ecker, Georg E. Steiner und Vincent Laurain Verfahren und Einrichtung zur Segmentierung von Bereichen. Austrian patent application – filed on 26.7.2005 (7) Dr. Rupert Ecker und Dr. Herbert Ramoser Vefahren zum Segmentieren von Leukozyten. Austrian patent application, filed on 15.6.2005 Positiver 1. Vorbescheid des Österr. Patentamtes, ergangen am 27.10.2005 (8) Dr. Rupert Ecker, Georg E. Steiner und Vincent Laurain Verfahren und Einrichtung zur Segmentierung von Bereichen. Patent Cooperation Treaty (PCT) – laufendes Anmeldeverfahren (9) Dr. Rupert Ecker und Dr. Herbert Ramoser Vefahren zum Segmentieren von Leukozyten. Patent Cooperation Treaty (PCT) – laufendes Anmeldeverfahren Publikationen (10) Barbara Gebhard, Gerti Schütz, Rupert C. Ecker, Georg E Steiner, Margaretha Rudas, Michael Gnant and Rudolf Oehler. MHC- Class-I Expression in Human Breast Cancer Correlates with Nuclear Localization of the 90 kDa Heat-Shock-Protein. 1999, Anticancer Research 19:5293-5298 (11) Georg Erich Steiner, Rupert Christian Ecker, Gero Kramer, Felix Stockenhuber, Michael Johann Marberger. Automated data acquisition by confocal laser scanning microscopy and image analysis of triple stained immunofluorescent leukocytes in tissue. 2000, J Immunol Methods 237(1-2):39-50 (12) Alessandra Handisurya, Georg E. Steiner, Ursula Stix, Rupert C. Ecker, Sabine Pfaffeneder-Mantai, Dina Langer, Gero Kramer, Nima Memaran-Dadgar, and Michael Marberger. Differential Expression of Interleukin-15, a Pro-Inflammatory Cytokine and T-Cell Growth Factor, and Its Receptor in Human Prostate. 2001, The Prostate 49:251262 (13) Georg E. Steiner, Ursula Stix, Alessandra Handisurya, Martin Willheim, Andrea Haitel, Franz Reithmayr, Doris Paikl, Rupert Ecker, Kristian Hrachowitz, Gero Kramer, Chung Lee, and Michael Marberger. Cytokine expression pattern in benign prostatic hyperplasia infiltrating T-cells and impact of lymphocytic infiltration on cytokine mRNA profile in prostatic tissue. 2003, Laboratory Investigation 83(8): (14) Rupert C. Ecker, Rainer de Martin, and Georg E. Steiner. Histopathologische Quantifizierung immunologischer Prozesse. 2003, Biomedizinische Technik 48 (Suppl. 1):546-547 (15) Christoph W. Kopp, Thomas Hölzenbein, Sabine Steiner, Rodrig Marculescu, Helga Bergmeister, Daniela Seidinger, Isabella Mosberger, Christoph Kaun, Manfred Cejna, Reinhard Horvat, Johann Wojta, Gerald Maurer, Rupert C. Ecker, Rainer de Martin, Erich Minar. Tissue Factor Pathway Inhibitor mediates Inhibition of Restenosis by Suppression of Monocyte Chemoattraction and Gelatinase Activity. 2004, Blood 103(5):165361. (16) Nicola Ilk, Seta Küpcü, Gerald Moncayo, Sigrid Klimt, Rupert C. Ecker, Renate Hofer-Warbinek, Eva M. Egelseer, Uwe B. Sleytr, and Margit Sára. Heterologous Expression of a Chimeric S-Layer/Enhanced Green Fluorescent Protein to Follow the Uptake of S_Layer-coated Liposomes into Eukaryotic Cells. 2004, Biochemical Journal 379(Pt 2):441-8. (17) Wolfram Hoetzenecker, Josef G. Meingassner, Rupert C. Ecker, Georg Stingl, Anton Stuetz, Adelheid Elbe-Buerger. Corticosteroids but not Pimecrolimus affect viability, maturation and immune function of murine epidermal Langerhans cells. 2004, Journal of Investigative Dermatology 122(3):673-84. (18) Rupert C. Ecker and Georg E. Steiner. Multicolor Microscopy-Based Tissue Cytometry at the Single Cell Level. 2004, Cyometry 59A(2):172-81. (19) Rupert C. Ecker, Rainer de Martin, Georg E. Steiner, and Johannes A. Schmid. Spectral Imaging Microscopy: Application in Cytomics and Fluorescence Resonance Energy Transfer (FRET) Analysis. 2004, Cytometry 59A(2):182-90. (20) Souyet Chang-Rodriguez, Rupert C. Ecker, Georg Stingl, Adelheid Elbe- Bürger. Autocrine IL-10 partially prevents differentiation of neonatal dendritic epidermal leukocytes into Langerhans cells. 2004, Journal of Leukocyte Biology 76(3):65766. (21) Rupert C. Ecker, Attila Tarnok. Cytomics goes 3D: towards tissomics. 2005, Cytometry 65A(1):1-3 (22) Wolfram Hoetzenecker, Rupert Ecker, Tamara Kopp, Anton Stuetz, Georg Stingl, Adelheid Elbe-Buerger. Pimecrolimus leads to an apoptosis-induced depletion of T cells but not Langerhans cells in patients with atopic dermatitis. 2005, Journal of Allergy and Clinical Immunology: 115(6):1276-83 (23) Herbert Ramoser, Vincent Laurain, Horst Bischof, Rupert Ecker. Leukocyte segmentation and classification in blood-smear images. Proc. Of the Int. Conf. Of the IEEE Engineering In Medicine and Biology Society (EMBS); September 0104, 2005 (24) Vincent Laurain, Herbert Ramoser, Christoph Nowak, Rupert Ecker. Fast Automatic Segmentation of Nuclei in Microscopy Images of Tissue Sections. Proc. Of the Int. Conf. Of the IEEE Engineering In Medicine and Biology Society (EMBS); September 01-04, 2005 (25) Rupert C. Ecker, Radu Rogojanu, Marc Streit, Katja Oesterreicher and Georg Steiner. An improved method for discrimination of cell populations in tissue sections using Microscopy-Based Multicolor Tissue. 2006, Cytometry A 69(3):119-23 (26) Marc Streit, Rupert C. Ecker, Katja Österreicher, Georg E. Steiner, Horst Bischof, Christine Bangert, Tamara Kopp, Radu Rogojanu. 3D Parallel Coordinate Systems – A New Data Visualization Method in the Context of Microscopy-Based Multicolor Tissue Cytometry (MMTC). 2006, Cytometry A 69(7):601-11
