Dr. Rupert Christian Ecker

Dr. Rupert Christian Ecker
geboren am
in
8. März 1969
Linz, OÖ
Staatsbürgerschaft Österreich
Wissenschaftlicher Werdegang
1989–1990
Studium der Physik und Astronomie an der Universität Graz
1990–1992
Studium der Biologie an der Universität Graz, Hauptfach Zoologie/1.Abschnitt
Wahlfach Wissenschaftstheorie
1992–1996
Studium der Biologie an der Universität Wien, Hauptfach Zoologie/2.Abschnitt
Wahlfach Zellbiologie
Juli 1994–Juli 1996
Diplomarbeit
„Entwicklung einer automatisierten, durch 3-fach Fluoreszenzfärbung
mediierten Gewebszytometrie zur vergleichenden Analyse des
Proliferationsverhaltens von Lymphozyten in benignen und malignen
Geweben“
Oktober 1996
Sponsion zum Magister der Naturwissenschaften
Nov.1996–Aug.2000
Dissertation
„Strategien zur Standardisierung und Automatisierung der Immunhistologie“
Februar 2001
Promotion zum Doktor der Naturwissenschaften
Mai 2001 – Dez. 2003 Wissenschaftlicher Mitarbeiter (PostDoc) am Kompetenzzentrum für
Biomolekulare Therapie (BMT)
seit April 2003
Gründungsgesellschafter und Geschäftsführer der Firma TissueGnostics
GmbH
seit Juni 2005
Gründungsgesellschafter der Firma K2RG Research Group SRL, Iasi,
Rumänien
Wissenschaftsbezogene Tätigkeiten
1998–2000
Mehrere Auftragsarbeiten zur Automation von Mikroskop-basierten
Analyseverfahren im Bereich der medizinischen Bildanalyse am AKH-Wien
Mai–Oktober 2001
WIFI - Lehrgang: Ausbildung zum Software Developer - C/C++
Nov.2001–Feb.2002
Organisation und Leitung des Symposiums Advanced Techniques in
Microscopy and Cellular Bioinformatics am 4./5. Februar 2002 in Wien.
26.April 2002
Vorsitzender des Arbeitsgebietes „Konfokalmikroskopie und Bildanalyse“ auf
der 1. Jahrestagung der Österreichischen Gesellschaft für Zytometrie
(FlowTime 2002) in Wien.
2003
Organisation mehrerer Seminare „BMT Seminars on Advanced Techniques“
seit November 2003
Reviewer bei der Fachzeitschrift Cytometry
29. April - 1. Mai 2004 Co-Organisation und Leitung des 2nd Symposion on Advanced Techniques in
Microscopy and Cellular Bioinformatics in Krems/Donau.
23. Mai 2004
Vorsitzender des Arbeitsgebietes „Tissue Cytometry“ auf der 22.
Jahrestagung der International Society for Analytical Cytology (ISAC)
Juli 2005 – Juni 2006
Vorsitzender des Lenkungsausschuss für das Kplus Zentrum Advanced
Computer Vision
seit Oktober 2005
Mitglied des Beirats am Ludwig Boltzmann Institut für Krebsforschung
Mitgliedschaften (in alphabetischer Reihenfolge)
-
International Society for Analytical Cytology (seit 2004)
Österreichische Gesellschaft für Allergologie und Immunologie (seit 2002)
Österreichische Gesellschaft für Biochemie und Molekularbiologie (seit
2003)
Österreichische Gesellschaft für Zytometrie (seit 2002)
Preise und Auszeichnungen
1997
Posterpeis des Vereins zur Förderung der wissenschaftlichen Forschung für
die Arbeit „Protein Kinase C in Human Prostate Cancer Cell Lines: Expression
of Isoenzymes and Activation by the Environmental Pollutant 2,3,7,8Tetrachlorodibenzo-p-Dioxin (TCDD)“ (Autoren: Schaufler K, Schöller A, Ecker
R, Steiner G, Marberger M, Graf J, Thalhammer T)
2002
Leistungsstipendium der Naturwissenschaftlichen Fakultät der Universität
Wien
Patente
(1)
Georg E. Steiner and Rupert C. Ecker
System und Methode zur vollautomatisierten, quantitativen Analyse von
mehrfachgefärbten Oberflächen- und/oder intrazellulären Antigenen bei
definierten Zellpopulationen in Gewebe und in Suspension.
Austrian patent # 408.032
(2)
Georg E. Steiner und Rupert C. Ecker
Verfahren und Anordnung zur Untersuchung von Zellen.
Austrian patent # 411.066
(3)
Georg E. Steiner und Rupert C. Ecker
Verfahren und Anordnung zur Untersuchung von Zellen.
Patent Cooperation Treaty (PCT) WO 02/35207 A2
(4)
Georg E. Steiner und Rupert C. Ecker
Verfahren und Anordnung zur Untersuchung von Zellen.
EU 1334461
(5)
Georg E. Steiner und Rupert C. Ecker
A process and set-up for the analysis of single cells.
USA patent application – submitted on April 24th, 2003
(6)
Dr. Rupert Ecker, Georg E. Steiner und Vincent Laurain
Verfahren und Einrichtung zur Segmentierung von Bereichen.
Austrian patent application – filed on 26.7.2005
(7)
Dr. Rupert Ecker und Dr. Herbert Ramoser
Vefahren zum Segmentieren von Leukozyten.
Austrian patent application, filed on 15.6.2005
Positiver 1. Vorbescheid des Österr. Patentamtes, ergangen am 27.10.2005
(8)
Dr. Rupert Ecker, Georg E. Steiner und Vincent Laurain
Verfahren und Einrichtung zur Segmentierung von Bereichen.
Patent Cooperation Treaty (PCT) – laufendes Anmeldeverfahren
(9)
Dr. Rupert Ecker und Dr. Herbert Ramoser
Vefahren zum Segmentieren von Leukozyten.
Patent Cooperation Treaty (PCT) – laufendes Anmeldeverfahren
Publikationen
(10)
Barbara Gebhard, Gerti Schütz, Rupert C. Ecker, Georg E Steiner,
Margaretha Rudas, Michael Gnant and Rudolf Oehler.
MHC- Class-I Expression in Human Breast Cancer Correlates with Nuclear
Localization of the 90 kDa Heat-Shock-Protein. 1999, Anticancer Research
19:5293-5298
(11)
Georg Erich Steiner, Rupert Christian Ecker, Gero Kramer, Felix
Stockenhuber, Michael Johann Marberger.
Automated data acquisition by confocal laser scanning microscopy and image
analysis of triple stained immunofluorescent leukocytes in tissue. 2000, J Immunol
Methods 237(1-2):39-50
(12)
Alessandra Handisurya, Georg E. Steiner, Ursula Stix, Rupert C. Ecker,
Sabine Pfaffeneder-Mantai, Dina Langer, Gero Kramer, Nima Memaran-Dadgar,
and Michael Marberger.
Differential Expression of Interleukin-15, a Pro-Inflammatory Cytokine and T-Cell
Growth Factor, and Its Receptor in Human Prostate. 2001, The Prostate 49:251262
(13)
Georg E. Steiner, Ursula Stix, Alessandra Handisurya, Martin Willheim,
Andrea Haitel, Franz Reithmayr, Doris Paikl, Rupert Ecker, Kristian Hrachowitz,
Gero Kramer, Chung Lee, and Michael Marberger.
Cytokine expression pattern in benign prostatic hyperplasia infiltrating T-cells and
impact of lymphocytic infiltration on cytokine mRNA profile in prostatic tissue.
2003, Laboratory Investigation 83(8):
(14)
Rupert C. Ecker, Rainer de Martin, and Georg E. Steiner.
Histopathologische Quantifizierung immunologischer Prozesse. 2003,
Biomedizinische Technik 48 (Suppl. 1):546-547
(15)
Christoph W. Kopp, Thomas Hölzenbein, Sabine Steiner, Rodrig Marculescu,
Helga Bergmeister, Daniela Seidinger, Isabella Mosberger, Christoph Kaun,
Manfred Cejna, Reinhard Horvat, Johann Wojta, Gerald Maurer, Rupert C. Ecker,
Rainer de Martin, Erich Minar.
Tissue Factor Pathway Inhibitor mediates Inhibition of Restenosis by Suppression
of Monocyte Chemoattraction and Gelatinase Activity. 2004, Blood 103(5):165361.
(16)
Nicola Ilk, Seta Küpcü, Gerald Moncayo, Sigrid Klimt, Rupert C. Ecker,
Renate Hofer-Warbinek, Eva M. Egelseer, Uwe B. Sleytr, and Margit Sára.
Heterologous Expression of a Chimeric S-Layer/Enhanced Green Fluorescent
Protein to Follow the Uptake of S_Layer-coated Liposomes into Eukaryotic Cells.
2004, Biochemical Journal 379(Pt 2):441-8.
(17)
Wolfram Hoetzenecker, Josef G. Meingassner, Rupert C. Ecker, Georg Stingl,
Anton Stuetz, Adelheid Elbe-Buerger.
Corticosteroids but not Pimecrolimus affect viability, maturation and immune
function of murine epidermal Langerhans cells. 2004, Journal of Investigative
Dermatology 122(3):673-84.
(18)
Rupert C. Ecker and Georg E. Steiner.
Multicolor Microscopy-Based Tissue Cytometry at the Single Cell Level. 2004,
Cyometry 59A(2):172-81.
(19)
Rupert C. Ecker, Rainer de Martin, Georg E. Steiner, and Johannes A.
Schmid.
Spectral Imaging Microscopy: Application in Cytomics and Fluorescence
Resonance Energy Transfer (FRET) Analysis. 2004, Cytometry 59A(2):182-90.
(20)
Souyet Chang-Rodriguez, Rupert C. Ecker, Georg Stingl, Adelheid Elbe-
Bürger.
Autocrine IL-10 partially prevents differentiation of neonatal dendritic epidermal
leukocytes into Langerhans cells. 2004, Journal of Leukocyte Biology 76(3):65766.
(21)
Rupert C. Ecker, Attila Tarnok.
Cytomics goes 3D: towards tissomics. 2005, Cytometry 65A(1):1-3
(22)
Wolfram Hoetzenecker, Rupert Ecker, Tamara Kopp, Anton Stuetz, Georg
Stingl, Adelheid Elbe-Buerger.
Pimecrolimus leads to an apoptosis-induced depletion of T cells but not
Langerhans cells in patients with atopic dermatitis. 2005, Journal of Allergy and
Clinical Immunology: 115(6):1276-83
(23)
Herbert Ramoser, Vincent Laurain, Horst Bischof, Rupert Ecker. Leukocyte
segmentation and classification in blood-smear images. Proc. Of the Int. Conf. Of
the IEEE Engineering In Medicine and Biology Society (EMBS); September 0104, 2005
(24)
Vincent Laurain, Herbert Ramoser, Christoph Nowak, Rupert Ecker. Fast
Automatic Segmentation of Nuclei in Microscopy Images of Tissue Sections.
Proc. Of the Int. Conf. Of the IEEE Engineering In Medicine and Biology Society
(EMBS); September 01-04, 2005
(25)
Rupert C. Ecker, Radu Rogojanu, Marc Streit, Katja Oesterreicher and Georg
Steiner. An improved method for discrimination of cell populations in tissue
sections using Microscopy-Based Multicolor Tissue. 2006, Cytometry A
69(3):119-23
(26)
Marc Streit, Rupert C. Ecker, Katja Österreicher, Georg E. Steiner, Horst
Bischof, Christine Bangert, Tamara Kopp, Radu Rogojanu. 3D Parallel Coordinate
Systems – A New Data Visualization Method in the Context of Microscopy-Based
Multicolor Tissue Cytometry (MMTC). 2006, Cytometry A 69(7):601-11