FB1018.0922
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Lehrveranstaltungen im Sommersemester 2016 Veranstalter Prof. Dr. K. Weising und MitarbeiterInnen Fachgebiet Botanik Titel der Veranstaltung FB1018-0922 Pflanzliche Molekularsystematik und Genomanalyse Empfohlenes Semester MSc Biol., ab 1. (2.) Art der Veranstaltung Forschungspraktikum, Seminar (12 SWS) Voraussetzungen für den Besuch der Veranstaltung Vorheriger Besuch des Seminars 0970 (läuft in jedem WS) und molekularsystematische Grundkenntnisse, z.B. aus Vorlesung 0901 Zeit und Raum 4 Wochen ganztags, n.V., Laborräume der Botanik, AVZ, 3.Stck. Zuordnung zu Modulen MScBio F3 Forschungsmodul Botanik/Systematik Sprache Deutsch, bei Bedarf englisch Zeit und Ort der Vorbesprechung Praktikumstermine nach individueller Absprache. Voranmeldung bei Frau Dr. Tina Wöhrmann (Tel. 804-4322) Leistungsnachweis(e) Benotetes Praktikumsprotokoll, Kurzvortrag im Rahmen des AGSeminars Kompetenzen, Thema und Inhalte Die molekulare Systematik hat die Aufklärung der Verwandtschaftsverhältnisse der Lebewesen auf der Basis von DNA-Sequenzen zum Ziel. Dazu gibt es zahlreiche methodische Ansätze. Zum einen können ausgewählte DNABereiche aus den zu untersuchenden Organismen vergleichend sequenziert und aus der daraus resultierenden Information Stammbäume erstellt werden. Andererseits kann man mit Hilfe sog. molekularer Markertechniken Informationen über Gemeinsamkeiten und Unterschiede der DNA-Sequenzen erhalten, ohne diese tatsächlich zu bestimmen. Im Rahmen dieses Forschungspraktikums werden moderne Methoden der molekularen Systematik und Genomanalyse vermittelt und von den Studierenden für Fragestellungen auf unterschiedlichen systematischen Ebenen angewendet. Die Betreuung erfolgt gruppenweise (in der Regel 2-3 Studierende pro Gruppe). Je nach Problemstellung kommen unterschiedliche Methoden zum Einsatz, u.a. - Isolation hochmolekularer DNA aus Pflanzenmaterial - Agarose- und Polyacrylamid-Gelelektrophorese von DNA, Polymerase-Kettenreaktion (PCR) - Mikrosatelliten-Analyse, genetischer Fingerabdruck und populationsgenetische Studien - DNA-Sequenzierung nach Sanger, Sequenz-Alignment und Rekonstruktion von Stammbäumen am Computer - Erstellung von Haplotyp-Netzwerken - Recherchen in DNA-Datenbanken Empfohlene Literatur (Auswahl; zusätzliche Literatur wird je nach zu bearbeitender Fragestellung individuell vergeben) Mülhardt, C. (2003) Der Experimentator: Molekularbiologie. Fischer, Stuttgart. 3. Aufl. (oder neuer) Weising, K., Nybom, H., Wolff, K., Kahl, G. (2005) DNA Fingerprinting in Plants. Principles, Methods and Applications, 2nd Edition. CRC Press, Boca Raton, Florida, Bibl.-Signatur 95bio M4 DNA Simpson (2006) Plant Systematics. Elsevier Academic Press, 590 S., Bibl.-Signatur 95bio NO SIM Knoop, V., Müller, K. (2009) Gene und Stammbäume. 2. Auflage Spektrum Akademischer Verlag. Bibl.-Signatur 95bio I6 KNO (1. Auflage in der Bib)
