RNA Viren

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Viren
Inhalt
1.
Einleitung
2.
Struktur
3.
Infektion
4.
Virusfamilien
Einleitung
VERÄNDERLICHKEIT
Infektion
Genom
Struktur
- Viren infizieren alle Lebensformen: Archea, Eubakterien, Eukaryoten (Einzeller, Pflanzen, Pilzen, Tiere)
- Menschenpathogene: milde Krankheiten: Schnupfen (Rhinoviren); letal (Tollwutvirus); Onkogen (Humanes
Papillomvirus)
- Sich ins Genom integrierende Viren (Retroviren)  nicht-integrierende: Replikation im Zellkern (Herpesviren),
Replikation im Zytoplasma (Poxviren)
- Infektion: schnell (Influensavirus)  langsam (HIV)
- Produktiv  latent  abortiv (unerfolgreich)
Dependoviren:
-- RNA
 DNA Vermehrung abhängig von anderen Viren (zB. Adeno-assoziierte Viren; AAV)
- Linear  zirkulär
- Doppelsträngig  einzelsträngig (minus, oder plus Strang)
- Eine einzige Nukleinsäure  zwei Nukleinsäuremoleküle (HIV)  segmentiertes Genom
(Influensavirus)
- Komplex (Poxviren, Herpesviren)  einfach (Tollwutvirus; Parvoviren)
Nackt  gehüllt
ÄHNLICHKEIT
Kleine Gröe (maximum 200 nm; Ausnahme: Mimiviren)
Obligate Parasiten, sie brauchen: Bausteine (Aminosäuren), Proteinsyntheseapparat, Energie (ATP)
1
2
Entdeckung der Viren
Tabakmosaikvirus
Dimitrij Ivansovsky
Martinus Beijerinck
Maul- und Klauenseuche-Virus
Friedrich Löffler
Paul Frosch
3
Leben die Viren?
Spore
4
Herkunft der Viren
1. Die regressive Hypothese
(Vereinfachung von Zell-basierenden Lebewesen)
2. Progressive Hypothese
(desertierte Nukleinsäuren)
Mimivirus
3. Symbiont-Hypothese
(aus intrazellulärer Symbiose)
AV: Archeaviren
A: Archaea
BV: Bakteriumviren
B: Bakterien
Urvirosphäre
4. Die „Virus zuerst” Hypothese
(unabhängig von der Zelle, aus der RNA-Welt)
MODERNE VIROSPHÄRE
MODERNE VIROSPHÄRE
LUCA:
last universal common ancestor
(letzter gemeinsamer Vorfahre)
EV: Eukaryotenviren
E: Eukaryoten
5
DIEBVIREN
Herpes simplex Virus
Aus der Wirtszelle:
Gen der DNA-Polymerase
Gen der Ribonucleotid-Reduktase
Gen der Thymidin-Kinase
6a
Systematik der Viren
KAPSID-KODIERENDE ORGANISMEN
Bakteriumviren
Eukaryotenviren
Archaeaviren
Bakterien
Archaea
Eukaryoten
RIBOSOMKODIERENDE ORGANISMEN
6b
Systematik der Viren
International Committee on Taxonomy of Viruses; ICTV): 1966
Einführung von systematischen Einheiten für die zellulären Lebewesen (Art, Gattung, Familie)
Aber: höhere systematische Kategorien existieren nicht, weil wir die entfernten Abstammungen
nicht kennen (der evolutionäre Stammbaum ist wurzellos)
Systematik:
Früher: Morphologie, Infektionsweg
Heute: Genomvergleich
7
Das Baltimore-System
der Viren
David Baltimore
(+)ssRNA
dsDNA
Retroviren
Hepadnaviren
DNA/RNA Hybrid
dsDNA
ssDNA
Herpesviren
Adenoviren
Poxviren
Papillomviren
Parvoviren
ssRNA
dsDNA
dsDNA
(-)ssRNA
Orthomyxoviren
(Influensaviren)
Rhabdoviren
mRNA
(-)ssRNA
(+)ssRNA
ss: single-stranded (einzelsträngig)
ds: double-stranded (doppelsträngig)
Picornaviren
dsRNA
Reoviren
Virusgenome
DNA-Genome
ss, linear
Parvoviren
ds, linear
Poxviren, Adenoviren, Herpesviren
ss, zirkulär
X174 Phage
Virion:
ausserhalb der Zelle
Vegetativer Virus: innerhalb der Zelle
Provirus:
im Wirtsgenom
8
RNA-Viren OHNE DNA-Phase
- Influensavirus, Poliovirus:
RNA-abhängige RNA-Polymerase
RNA Viren –
MIT DNA-Phase
- Retroviren: reverse Transkriptase
ds, zirkulär
Baculoviren (Insektviren)
Ins Genom integrierende Viren
- HIV, Phage Lambda
RNA-Genome
ss, linear
ds, linear
Viren mit segmentiertem Genom
Retroviren, Polioviren: plus Strang
Influensavirus, Tollwutvirus: minus Strang
Reoviren
- Influensavirus
Segmentiertes RNA-Genom
ss, zirkulär
Hepatitis delta Virus
9
Kapsid
Nukleinsäure
I.
Influensavirus
Kapsid
HELIX (SPIRAL)
II.
Adenoviren, Herpesviren
IKOSAEDER
III.
STOCK
HIV
Baculoviren
KEGEL
10
Gehüllte Viren
Kreis
Herpesvirus
Influensavirus
Hülle
Tegument
Kugel
Tollwutvirus
Stock
Baculovirus
Kapsid
DNA
Strang
Ebolavirus
11
Virusinfektion
Phasen der Vireninfektion:
1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.
Fusion
Adsorption
Penetration
Transkription
Translation
Genomreplikation
Zusammenbau
Freisetzung
Endozytose
Zytoplasma
Gehüllter Virus
1
Rezeptor-vermittelte
Endozytose
2
6
7
Endosom
5
3,4
Zellkern
Nukleinsäuren
12
Adsorption
ICAM-1 Rezeptor
(Rhinoviren)
CD4 Rezeptor
(HIV)
CD155 Rezeptor
(Poliovirus)
Extrazellulärer Raum
Plasmamembran
Zytoplasma
13
Penetration
Rezeptor
Gehüllte Viren
Ungehüllte Viren
Zellmembran
reversible Bindung
Endozytose
Zellmembran
Rezeptor
irreversible Bindung
Reversibile Bindung
Membranfusion
Endozytose
Irreversibile Bindung
Endozytose
Endosom
Endosom
14
Intrazellulärer Transport
Sich im Zellkern replizierende Viren:
- Mehrheit der DNA-Viren
- Influensaviren
- Lentiviren (zB. HIV)
Sich im Zytoplasma replizierende Viren :
- Mehrheit der RNA-Viren
- Poxviren (zB. Pockenvirus)
Kernpore
Zentrosom
Dinaktin
Dinein
Kinesin-2
Kinesin-1
ZELLKERN
15
Modifiziertes zenrales
Dogma
Zentrales Dogma
DNA
Transkription
Translation
RNA
Protein
GenomReplikation
DNA
MODIFIZIERTES ZENTRALES DOGMA
DNA
Transkription
RNA
reverse Transkription
GenomReplikation
GenomReplikation
DNA
Translation
RNA
Protein
Francis Crick
16
Transkription, Translation, Modifikation
Eukaryotenviren
DNA-VIREN
Translation
mRNA
Transkription
Protein
RNA-VIREN
Transport
mRNA
Transport
Transkription
Kernpore
DNA-VIREN
Translation
Raues Endoplasmatisches
Retikulum
Golgi
glükoprotein
POST-TRANSLATIONELLE MODIFIKATIONEN
zUCKER
GLYKOSYLATION
Myristylgruppe
MYRISTOYLATION
PHOSPHORYLATION
16
Transkription der zellulären Genen
Regulierende Elemente
Terminator
DNA
Transkriptionsfaktoren
RNA pol-II
RNA
Splice Donor
Akzeptor
Donor
Primer Transkript
Alternatives Splicing
Akzeptor
16
Transkription der viralen Genen
Zytoplasma
Zellmembran
dsDNA
dsRNA
(+)RNA
(-)RNA
DdRp
dsRdRp
ssRdRp
ssRdRp
mRNA
Zellkern
dsDNA
ssDNA
(-)RNA
ds: doppelsträngig (double-stranded)
ss: einzelsträngig (single-stranded)
DdRp (zellulär)
mRNA
DsRp: DNA-abhängige RNA-Polymerase (DNA-dependent RNA polymerase)
RdRp: RNA-abhängige RNA-Polymerase (RNA-dependent RNA polymerase)
16
Transkription der viralen Genen
Klasse
DNA-Viren
RNA-Viren
Revers transkribierende Viren
17
Translation der zellulären mRNA-s
5’-UTR
mRNA
Protein
3’-UTR
17
Translation der zellulären mRNA-s
1. IRES
2. Bi-cystronische mRNAs
1.
43S
2.
Initiationskomplex
i. „leaky” Scanning
HIV-1
(Vpu und Env)
3.
i. „leaky” Scanning
Rotavirus
(NSP5 und NSP6)
5.
4.
HIV-1
(Gag und Gag-Pol)
iii. IRES
ii. Gerutschte Termination
18
Transport der neu synthetisierten Proteine
mRNA
Zellkern
Kernpore
Ribosom
Raues ER
HIV Rev Protein
Protein
NLS
Golgi
Transportvesikel
Zellrezeptor
virales Glükoprotein
Zytoplasma
Zellmembran
NES
19
Genomreplikation
DNA-Viren
RNA-Viren
Revers transkribierende Viren
Replikation ringförmiger Genome
Theta-Typ Replikation
Sigma-Typ Replikation
Replikationsgabel
Replikationsgabel
Replikationsgabel
Replikationsursprung
parentale DNA
neue DNA
(Der Pfeil zegit die 5’  3’ Richtung der
Replikation)
20
21
Zusammenbau
Viren mit helikaler Symmetrie
RNA
Protein
Viren mit ikosahedraler Symmetrie
Pro-Kapsid
Kapsid
Genom
22
Freisetzung
Zellmembran
zelluläres Protein
virales Protein
Hülle
Kapsid
Genom
Nukleokapsid
Gehüllter Virus
22
Freisetzung
Lyse
Freisetzung
Protein
Kapsid
Pro-Kapsid DNA oder RNA
Protein
Zellmembran
Freisetzung
RNA
23
Ablauf der Vireninfektionen
Zellinfektion
abortive latente
Infektion Infektion
produktive
Infektion
Apoptose
Persistente Infektion (latent) persistente Infektion (produktiv) Zelltod
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