DNA测序（DNA sequencing，或译DNA定序）是指分析特定DNA片段的

DNA 定序
DNA 测序（DNA sequencing，或译 DNA 定序）是指分析特定 DNA 片段的碱基序列，
也就是腺嘌呤（A）、胸腺嘧啶（T）、胞嘧啶（C）与鸟嘌呤的（G）排列方式。RNA 测序
则通常将 RNA 提取后，反转录为 DNA 后使用 DNA 测序的方法进行测序。目前应用最广
泛 的 是 由 Frederick Sanger 发 明 的 Sanger 双 脱 氧 链 终 止 法 （ Chain Termination
Method）
。新的测序方法，例如 454 生物科学的方法和焦磷酸测序法。
Sanger 测序法
Sanger（桑格）双脱氧链终止法是 Sanger 于 1975 年发明的。测序过程需要先做一个 PCR
反应。PCR 过程中，双脱氧核糖核酸可能随机的被加入到正在合成中的 DNA 片段里。由于
双脱氧核糖核酸多脱了一个氧原子，一旦它被加入到 DNA 链上，这个 DNA 链就不能继续
增加长度。最终的结果是获得所有可能获得的、不同长度的 DNA 片段。目前最普遍最先进
的方法，是将双脱氧核糖核酸进行不同荧光标记。将 PCR 反应获得的总 DNA 通过毛细管
电泳分离，跑到最末端的 DNA 就可以在激光的作用下发出荧光。由于 ddATP, ddGTP,
ddCTP, ddTTP（4 种双脱氧核糖核酸）荧光标记不同，计算机可以自动根据颜色判断该位
置上碱基究竟是 A，T，G，C 中的哪一个。
454 生物科学和焦磷酸测序法
454 测序法由 454 生物科学发明，是一个类似焦磷酸测序法的新方法。2003 年向 GenBank
提交了一个腺病毒全序列，使得他们的技术成为 Sanger 测序法后第一个被用来测生物基因
组全序列的新方法。454 使用类似于焦磷酸测序的方法，有着相当高的读取速度，大约为 5
小时可以测两千万碱基对。
已测序的生物指其基因组已经被完全测序的生物。其中部分生物的 DNA 序列已经被完全注
释，功能性的片段（如基因等）已作图。
借助於基因组研究及高通量处理等技术，
越来越多的生物的全部基因被人们获得。自从 1995
年以来已经有 150 个基因组被解密，将近每个星期有新的物种添加进来。
已测序的生物列表
下表是目前爲止已经被相当完全测序的生物。
古菌

Aeropyrum perni' - Archaea aus japanischen Thermalquellen

Archaeoglobus fulgidu' - Schwefel-Archaea

Halobacterium spec' - Archaea aus Salzseen

Methanobacterium thermoautotrophicu' - Methanproduzierender Archaea

Methanococcoides burtoni' - k?ltetolerante und aerobe Archaea aus dem
Ace Lake, Antarktis

Methanococcus jannaschi' - Tiefseearchaea an Black Smokern

Methanococcus maripalud' - Archaea aus Salzseen in Georgia

Methanogenium frigidu' - k?ltetolerante und aerobe Archaea aus dem Ace
Lake, Antarktis

Methanopyrus kandler' - Tiefseearchaea an Black Smokern

Methanosarcina acetivoran' - Archaea aus ?lquellen, Kuhm?gen u. a.

Methanosarcina maze' - Archaea mit der F?higkeit Acetat u. a. abzubauen

[equitans' - Archaea an hei?en Quellen, Parasit anderer Mikroorganismen

Pyrobaculum aerophilu' - Archaea aus hei?en Quellen

Pyrococcus abyss' - Tiefseearchaea an Black Smokern

Pyrococcus furiosu' - Tiefseearchaea an Black Smokern

Pyrococcus horikoshi' - Tiefseearchaea an Black Smokern

Pyrolobus fumari' - Tiefseearchaea an Black Smokern

Sulfolobus solfataricu' - Archaea aus hei?en Schwefelquellen

Sulfolobus tokodai' - Archaea aus hei?en Schwefelquellen

Thermoplasma acidophilu' - sehr s?ureliebender Archaea, reinigt
Bergwerkshalden u. a.
Thermoplasma volcaniu' - w?rmeliebender Archaea

细菌

[tumefaciens' - Pflanzenpathogenes Bakterium, tumorbildend

Aquifex aeolicu' - Hyperthermophiles Meeresbakterium

[anthracis' - Anthrax-Erreger

[cereus' - Erreger einer Lebensmittelvergiftung

Bacillus haloduran' - Enzymproduzierendes Bakterium (Industriell genutzt)

[subtilis' - Enzymproduzierendes Bakterium (Industriell genutzt)

Bacteroides thetaiotaomicro' - Darmbakterium

Bifidobacterium longu' - Darmbakterium

Blochmannia floridanu' - Bakterium in Symbiose mit Ernteameisen

[bronchiseptica' - Erreger chronischer Infektionen der Atemwege

[parapertussis' - Erreger von mildem Keuchhusten

[pertussis' - Erreger von Keuchhusten

Borrelia burgdorfer' - Borreliose-Erreger

Bradyrhizobium japonicu' - Kn?llchenbakterium der Sojabohne

[melitensis' - Erreger des Maltafiebers

Brucella sui' - potentielle Biowaffe der USA, wirkt abtreibend

Buchnera aphidicol' - Bakterium in Symbiose mit Blattl?usen

Burkholderia malle' - Erreger des Rotzes bei Huftieren, auch
humanpathogen (Einsatz als Biowaffe)

Burkholderia pseudomalle' - Erreger der Melioidose, vor allem in Sü
dostasien

[jejuni' - Erreger einer Lebensmittelvergiftung

Caulobacter crescentu' - Sü?wasserbakterium

Chlamydia muridaru' - Atemwegsinfektionen bei Maus und
Meerschweinchen

Chlamydophila cavia' - Augenentzündungen bei Meerschweinchen

Chlamydia trachomati' - Erreger der Harnr?hrenentzündung

[pneumoniae' - Erreger einer Bronchitis

Chlorobium tepidu' - Grünes Schwefelbakterium

Chromobacterium violaceu' - humanpathogenes Bakterium (Diarrhoe und
andere Erkrankungen)

Clostridium acetobutylicu' - Aceton- und Butanol-produzierendes
Bakterium

[perfringens' - Erreger Diarrhoe etc.

[tetani' - Tetanus-Erreger

[diphtheriae' - Erreger der Diphtherie

[jeikeium' - nosokomial pathogener Hautbewohner

Corynebacterium efficien' - Bakterium zur Produktion von Aminos?uren u. a.

[burnetti' - Erreger des Q-Fieber

Deinococcus radioduran' - extrem strahlungstolerantes Bakterium

Desulfotalea psychrophil' - extrem k?ltetolerantes Bakterium des arktischen
Eismeeres

Desulfovibrio vulgari' - Bakterium aus ?lfeldern, wirtschaftlicher Sch?dling

[faecalis' - Darmbakterium, Modellorganismus

[coli' - Darmbakterium, Modellorganismus

Fusobacterium nucleatu' - Verbreitetes Bakterium im Zahnbelag

[ducreyi' - Erreger des Schanker

[influenzae' - Erreger einer Erk?ltung

Helicobacter hepaticu' - Erreger chronischer Hepatis und von Lebergeschwü
ren bei M?usen.

[pylori' - Erreger von Magengeschwüren

[plantarum' - Milchs?urebakterium

[lactis' - K?sebakterium

''Legionella pneumophila - Erreger der Legion?rskrankheit

''Leifsonia xyli - ein pflanzenpathogenes Bakterium

Leptospira interrogan' - Erreger der Leptospirosis

Listeria innocu' - nicht pathogene Listeria-Art

Listeria monocytogene' - Erreger einer Lebensmittelvergiftung

Mannheimia succiniciproducen' - symbiotisches Bakterium im Magen von K
ühen

Mesoplasma floru' - Bakterium mit extrem kleinen Genom

Mesorhizobium lot' - Kn?llchenbakterium bei Lotus-Arten

[leprae' - Erreger der Lepra

[bovis' - Erreger der Rindertuberkulose

[paratuberculosis' - Erreger der Rinderkrankheit Johne's Desease

[tuberculosis' - Erreger der Tuberkulose

Mycoplasma gallisepticu' - Erreger einer chronischen Atemwegserkrankung
bei Geflügel

Mycoplasma genitaliu' - Erreger von Infektionen des Genitaltraktes

Mycoplasma penetran' - Erreger von Entzündungen des Harn- und
Genitaltraktes sowie der Atemwege, evtl. assoziiert mit dem HI-Virus (AIDS)

Mycoplasma pneumonia' - Erreger einer Bronchitis

Mycoplasma pulmoni' - Erreger von Infektionen des Harn- und
Genitaltraktes sowie der Atemwege bei M?usen

Neisseria meningitidi' - Erreger der Meningitis (Hirnhautentzündung)

[europaea' - Nitratbakterium

Oceanobacillus iheyensi' - Tiefseebakterium

[multocida' - Erreger von Vogelcholera, Ansteckender Kaninchenschnupfen,
H?morrhagischem Fieber bei Weidevieh und Arthritis bei Schweinen und
Menschen u.a.

[luminescens' - Bakterium in Symbiose mit insektenpathogenen Fadenwü
rmern

[gingivalis' - Erreger von Parodontose

[marinus' - Meeresbakterium

Pseudomonas aeruginos' - als Opportunist bei geschw?chtem
Immunsystem pathogen

Pseudomonas putid' - Bodenbakterium zum Abbau von Verseuchungen

Pseudomonas syringa' - Pflanzenpathogenes Bakterium, u. a.
Tomatensch?dling

Ralstonia solanacearu' - Pflanzenpathogenes Bakterium, Welke bei
Hunderten verschiedener Pflanzenarten

Rhodopirellula baltic' - Rotes Meeresbakterium

Rhodopseudomonas palustri' - Purpurbakterium

Rickettsia conori' - Erreger des Mittelmeer-Fleckfieber

Rickettsia prowazeki' - Erreger des Typhus

Rickettsia sibiric' - Erreger von Zeckenfieber in Nordasien

Rickettsia typh' - Erreger des M?usetyphus (auch humanpathogen)

[typhi' - Erreger des Typhusfieber

[typhimurium' - Erreger des Typhusfieber bei der Maus

Shewanella oneidensi' - Metallabbauendes Bodenbakterium

Shigella flexneri' - evtl. Ursache von Pl?tzlichem Kindstod

[meliloti' - Kn?llchenbakterium des Alfalfa

[aureus' - Erreger von Scharlachfieber und Toxinschocks

[epidermidis' - Hautbakterium, pathogen bei Wunden

[agalactiae' - Erreger von schweren Neugeboreneninfektionen, Meningitis u.
a.

[mutans' - Erreger von Karies

[pneumoniae' - Erreger von Lungenentzündungen, Menigitis und
Blutvergiftungen

[pyogenes' - Erreger von Rheumatischem Fieber, Toxinschocks u. a.

[avermitilis' - Antibiotikaproduzierendes Bakterium (industriell genutzt)

[coelicolor' - Antibiotikaproduzierendes Bakterium (industriell genutzt)

Thermoanaerobacter tengcongensi' - Bakterium aus hei?en Quellen in
Volksrepublik China

Thermotoga maritim' - sehr s?ureliebendes Bakterium, reinigt
Bergwerkshalden u. a.
Thermus thermophilu' - hitzeliebendes Bakterium aus Japan, findet Einsatz

in der PCR und anderswo.

[pallidum' - Erreger der Syphilis

Tropheryma whipple' - Erreger der Whipple-Krankheit

Ureaplasma urealyticu' - Erreger von Infektionen des Harn- und
Genitaltraktes

[cholerae' - Erreger der Cholera

[fischeri' - Leuchtbakterium, das im Meer lebt und für die
Qualit?tsbestimmung von Abwasser verwendet wird

Vibrio parahaemolyticu' - Erreger schwerer Magen-Darm-Entzündungen

Vibrio vulnificu' - Meeresbakterium, kann zu Erkrankungen durch Verzehr
von rohen Meeresorganismen führen.

[glossinidia' - Erreger der Schlafkrankheit

Wolinella succinogene' - Bakterium im Kuhmagen

[axonopodis' - Pflanzenpathogenes Bakterium, erzeugt Zitronenkrebs bei
Zitrusfrüchten
[campestris' - Pflanzenpathogenes Bakterium, erzeugt Schwarzf?ule bei

Kreuzblütern
Xylella fastidios' - Pflanzenpathogenes Bakterium, schwerer Sch?dling in

Obst-, Nuss- und Kaffee-Plantagen in Nord- und Südamerika
[pestis' - Erreger der Pest

蓝藻

Anabaena spec.' - Fadenblaualge

Gloeobacter violaceu' - primitive Blaualge

Synechococcus spec' - Meeres-Blaualge

Synechocystis spec' - Meeres-Blaualge
Thermosynechococcus elongatu' - Thermophile Blaualge
o
真核生物
原生生物

Leishmania infantu' - 一种利什曼原虫

Leishmania majo' - 一种利什曼原虫

Plasmodium falciparum' - 恶性疟原虫

Plasmodium yoelii yoeli' - 约氏疟原虫，引起啮齿动物疟疾

Thalassiosira pseudonan' - 一种海洋硅藻

Trypanosoma bruce' - 一种锥体虫

Trypanosoma congolens' - 一种锥体虫

Trypanosoma cruc' - 一种锥体虫

Trypanosoma viva' - 一种锥体虫
真菌

Ashbya gossypi' - 感染柑橘类和棉花的真菌

Aspergillus fumigatu' - 烟麴霉，人类致病菌

Aspergillus nidulan' - 构巢麴霉

Debaryomyces hanseni' - 耐盐的酵母

Encephalitozoon cuniculi' - 一种单细胞微孢子虫

Kluyveromyces lacti' - 具有潜在药用生産价值的酵母

Kluyveromyces walti' - 一种酵母

Magnaporthe grisea' - 稻瘟病病菌

Neurospora crassa' - 粗糙脉孢菌，橙色的麫包霉，模式生物

Phanerochaete chrysosporiu' - 白腐病病菌

Saccharomyces cerevisiae' - 酿酒酵母，模式生物

Schizosaccharomyces pombe' - 粟酒裂殖酵母

Trichoderma reese' = Hypocrea jecorin' - 一种木霉

Yarrowia lipolytic' - 一种酵母

Candida albican' - 白色念珠菌，人类致病菌
植物

Arabidopsis thalian' - 拟南芥，模式生物

Guillardia thet' - 一种隐藻

Oryza sativa' - 水稻
动物

Anopheles gambia' - 疟蚊

Apis mellifer' - 蜜蜂

Caenorhabditis briggsa' - 一种线虫

Caenorhabditis elegan' - 秀丽隐杆线虫，模式生物

Ciona intestinali' - 一种海鞘

Ciona savigny' - 一种海鞘

Drosophila melanogaste' - 黑腹果蝇，模式生物

Fugu rubripe' - 河豚
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Gallus gallu' - 鸡
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Homo sapien' - 人

Mus musculu' - 小鼠, 模式生物

Pan troglodyte' - 黑猩猩

Rattus norvegicu' - 大鼠