XI Inhaltsverzeichnis Inhaltsverzeichnis 1 Nucleinsäuren, Chromatin und Chromosomen . . . . . . . . . 1 1.1 1.2 1.3 1.3.1 1.3.2 1.3.3 1.4 1.4.1 1.4.2 1.4.3 1.5 1.5.1 1.5.2 1.6 1.6.1 1.6.2 1.6.3 1.6.4 1.6.5 1.7 1.7.1 1.7.2 1.8 1.8.1 1.8.2 1.8.3 2 Die DNA trägt die erblichen Eigenschaften eines Organismus . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . DNA- und RNA-Bausteine . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Bau der Nucleinsäuren . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Nucleotidketten und Basenpaarung . . . . . . . . . . . . . Die DNA-Doppelhelix . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Die Quadruplex-DNA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Eigenschaften der Nucleinsäuren . . . . . . . . . . . . . . Absorption von ultraviolettem Licht . . . . . . . . . . . . . Schmelzen und Renaturierung der DNA . . . . . . . . . . Haarnadelschleife . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Organisation der prokaryotischen Chromosomen . Organisation der Genome von Bakterien . . . . . . . . . Organisation der Genome von Archaea . . . . . . . . . . Bau eukaryotischer Chromosomen . . . . . . . . . . . . 10-nm-Faden (Primärstruktur) . . . . . . . . . . . . . . . . . 30-nm-Faden (Sekundärstruktur) . . . . . . . . . . . . . . . Schleifendomänen (Tertiärstruktur) . . . . . . . . . . . . . Chromatiden (Quartärstruktur) . . . . . . . . . . . . . . . . . Funktionselemente von Chromosomen . . . . . . . . . . . Chromosomenanalyse . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Analyse von sehr kleinen Chromosomen . . . . . . . . . Cytogenetik . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ungewöhnliche Chromosomenformen . . . . . . . . . Lampenbürstenchromosomen . . . . . . . . . . . . . . . . . . B-Chromosomen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Mikrochromosomen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1 4 7 8 9 14 16 16 17 18 21 21 23 25 26 28 28 30 30 41 41 42 48 48 49 49 Genomstruktur . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 50 2.1 2.2 2.2.1 2.2.2 2.3 2.3.1 2.3.2 2.3.3 2.3.4 Organisation und Größe von Genomen Virale Genome . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Bakteriophagen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Eukaryoten-Viren . . . . . . . . . . . . . . . . . . Prokaryotische Genome . . . . . . . . . . . . Das Chromosom der Bacteria . . . . . . . . . Das Chromosom der Archaea . . . . . . . . . Transposons bei Prokaryoten . . . . . . . . . Plasmide . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 50 51 53 55 59 60 63 64 65 aus: Munk, Genetik (ISBN 9783131448712), © 2010 Georg Thieme Verlag KG XII Inhaltsverzeichnis 2.4 2.4.1 2.4.2 2.5 2.5.1 3 4 Eukaryotische Genome . . Das Kerngenom . . . . . . . . Das Plasmon . . . . . . . . . . . Genomik . . . . . . . . . . . . . Das Humangenomprojekt . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 67 68 77 83 86 DNA-Replikation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89 3.1 3.1.1 3.1.2 3.1.3 3.2 3.2.1 3.2.2 3.2.3 3.3 3.3.1 3.3.2 3.4 3.5 3.5.1 3.6 3.6.1 3.6.2 3.6.3 Grundschema der Replikation . . . . . . . . . . . . . . . . . Semikonservative Verdopplung . . . . . . . . . . . . . . . . . Semidiskontinuierliche Verdopplung . . . . . . . . . . . . . Simultane Verdopplung . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ablauf der Replikation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Replikationsinitiation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Replikationselongation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Replikationstermination . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Replikation bei Bacteria . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ablauf der Replikation bei Bacteria . . . . . . . . . . . . . . . Kontrolle der Replikation in Bacteria . . . . . . . . . . . . . Replikation bei Archaea . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Replikation bei Viren . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Virale Replikationsmechanismen . . . . . . . . . . . . . . . . Replikation bei Eukarya . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ablauf der mitotischen Replikation . . . . . . . . . . . . . . Kontrolle von Replikation und Zellteilung in Eukarya DNA-Endoreplikation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89 91 92 94 95 96 100 103 105 106 110 112 115 115 118 122 124 129 Transkription . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 133 4.1 4.2 4.2.1 4.2.2 4.2.3 4.2.4 4.3 4.3.1 4.3.2 4.3.3 4.3.4 4.3.5 Allgemeine Prinzipien der Transkription . . . . . . Transkription bei Bacteria . . . . . . . . . . . . . . . . . Initiation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Elongation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Termination . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Prozessierung der RNA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Transkription bei Eukaryoten . . . . . . . . . . . . . . . Orte der Transkription . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Promotoren und Enhancer eukaryotischer Gene . . Faktoren: TF, TBP, TAF, Transkriptionsaktivatoren und Coaktivatoren . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Initiation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Elongation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 133 136 136 141 141 146 148 150 151 . . . . . . 153 . . . . . . 156 . . . . . . 157 aus: Munk, Genetik (ISBN 9783131448712), © 2010 Georg Thieme Verlag KG XIII Inhaltsverzeichnis 4.3.6 4.3.7 4.3.8 4.4 4.4.1 4.4.2 5 Cotranskriptionales Prozessieren: Capping, Spleißen und Polyadenylierung . . . . . . . . . . . . . . Termination . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Nachträgliches Ändern der RNA-Sequenz: Editing Transkription bei Archaea . . . . . . . . . . . . . . . . . Initiation, Elongation und Termination . . . . . . . . . Spleißen bei Archaea . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 159 169 170 174 174 175 Translation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 177 5.1 5.1.1 5.1.2 5.2 5.2.1 5.2.2 5.2.3 5.2.4 5.3 5.3.1 5.3.2 5.3.3 5.3.4 5.4 5.4.1 5.4.2 5.4.3 5.4.4 5.4.5 5.4.6 5.4.7 5.4.8 5.5 5.5.1 5.5.2 5.5.3 5.5.4 Allgemeine Prinzipien der Translation . . . . . . . . Der genetische Code . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Der genetische Code ist (fast) universell . . . . . . . . . Mittler zwischen mRNA und Protein: die tRNA . . Die Struktur der tRNA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Prozessierung und Modifikation von tRNAs . . . . . . Beladung der tRNAs: Aminoacyl-tRNA-Synthetasen Variabel aber nicht beliebig: „Wobbeln“ . . . . . . . . Orte der Translation: Ribosomen . . . . . . . . . . . . . Struktur der Ribosomen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Bildung von Ribosomen in Bacteria . . . . . . . . . . . . Bildung von Ribosomen in Eukarya . . . . . . . . . . . . Bildung von Ribosomen in Archaea . . . . . . . . . . . . Verlauf der Translation: Initiation, Elongation, Termination . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Initiation bei Bacteria . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Elongation bei Bacteria . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Termination bei Bacteria . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Initiation bei Eukaryoten . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Elongation und Termination bei Eukaryoten . . . . . Translation bei Archaea . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Translationsgenauigkeit: Pedantisch oder „quick and dirty“ ? . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Das Ribosom als Angriffspunkt für Antibiotika . . . . Aus dem Leben eines Proteins: Faltung, Translokation, Degradation . . . . . . . . . . . . . . . . . Faltung naszierender Proteine . . . . . . . . . . . . . . . . Translokation durch die Membran . . . . . . . . . . . . . Posttranslationale Modifikation . . . . . . . . . . . . . . . Das Ende: Degradation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 177 179 180 182 182 184 185 189 190 191 194 195 197 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 198 199 200 202 205 208 210 . . . . . 211 . . . . . 212 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 214 215 218 221 223 aus: Munk, Genetik (ISBN 9783131448712), © 2010 Georg Thieme Verlag KG XIV 6 7 Inhaltsverzeichnis Meiose . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 229 6.1 6.2 6.2.1 6.2.2 6.2.3 6.2.4 6.2.5 6.2.6 6.2.7 6.2.8 6.3 6.3.1 6.3.2 6.3.3 6.3.4 Die Bedeutung der Meiose . . . . . . . . . . . . . . . Die Phasen der Meiose . . . . . . . . . . . . . . . . . . Leptotän der Prophase I . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zygotän der Prophase I . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Pachytän der Prophase I . . . . . . . . . . . . . . . . . . Diplotän und Diakinese der Prophase I . . . . . . . Prometaphase I und Metaphase I . . . . . . . . . . . Anaphase I . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Telophase I und Interkinese . . . . . . . . . . . . . . . Prophase II bis Telophase II . . . . . . . . . . . . . . . Rearrangierte Chromosomen in der Meiose . Auswirkungen von Robertson-Translokationen Auswirkungen von reziproken Translokationen Auswirkungen von Inversionen . . . . . . . . . . . . Achiasmatische Meiose . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 229 232 233 237 237 240 242 242 243 243 244 245 247 249 251 Formalgenetik . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 254 7.1 7.1.1 7.1.2 7.1.3 7.2 7.2.1 7.2.2 7.2.3 7.3 7.3.1 7.3.2 7.3.3 7.4 7.4.1 7.4.2 7.4.3 7.4.4 7.5 7.6 7.7 7.7.1 7.7.2 7.7.3 In der Formalgenetik wichtige Grundbegriffe Genotyp und Phänotyp . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Dominanz und Kodominanz . . . . . . . . . . . . . . . Vereinbarungen der Schreibweise . . . . . . . . . . Probleme bei der genetischen Analyse . . . . . Pleiotropie und Polygenie . . . . . . . . . . . . . . . . . Penetranz und Expressivität . . . . . . . . . . . . . . . Umwelteinflüsse und Reaktionsnorm . . . . . . . . Modellorganismen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Pisum sativum (Erbse) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zea mays (Mais) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Drosophila melanogaster (Taufliege) . . . . . . . . . Die Mendel-Regeln . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Die Methode Mendels . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Erste Mendel-Regel (Uniformitätsregel) . . . . . . Zweite Mendel-Regel (Spaltungsregel) . . . . . . . Dritte Mendel-Regel (Unabhängigkeitsregel) . . Gekoppelte Gene und Genkartierung . . . . . . . Geschlechtsgebundene Vererbung . . . . . . . . . Stammbaumanalyse . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Autosomal dominanter Erbgang . . . . . . . . . . . . Autosomal rezessiver Erbgang . . . . . . . . . . . . . X-Chromosom-gebundene Vererbung . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . aus: Munk, Genetik (ISBN 9783131448712), © 2010 Georg Thieme Verlag KG 254 254 255 257 258 259 259 261 263 263 264 265 267 268 270 271 273 276 280 282 282 284 285 XV Inhaltsverzeichnis 7.8 7.9 7.9.1 7.9.2 7.9.3 7.9.4 8 9 Formalgenetik bei haploiden Organismen . Ausnahmen von den Mendel-Regeln . . . . . Formalgenetik der Mitochondrien . . . . . . . . Formalgenetik der Plastiden . . . . . . . . . . . . . Maternale cytoplasmatische Effekte . . . . . . . Genomic Imprinting . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 286 289 289 291 292 293 Geschlechtsbestimmung . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 295 8.1 8.2 8.3 8.4 8.5 8.6 8.6.1 8.6.2 8.7 8.8 8.9 8.10 Grundlagen der Geschlechtsbestimmung . . . . . . . . . . . Grundlagen der genotypischen Geschlechtsbestimmung Dosiskompensation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Sexuelle Differenzierung in Drosophila melanogaster . . Sexuelle Differenzierung in Caenorhabditis elegans . . . . Sexuelle Differenzierung in Säugetieren . . . . . . . . . . . . Das primäre Signal . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Die sekundäre Entwicklung (Geschlechtsdifferenzierung) . Haplodiploidie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Geschlechtsbestimmung bei Pflanzen . . . . . . . . . . . . . . Geschlechtsbestimmung durch Umweltfaktoren . . . . . Endokrine Ökotoxine . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 295 297 300 302 304 305 305 306 308 309 311 313 Rekombination . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 316 9.1 9.2 9.2.1 9.2.2 9.2.3 9.3 9.3.1 9.3.2 9.3.3 9.4 9.4.1 9.4.2 9.4.3 9.5 9.6 9.7 9.7.1 Einleitung und Übersicht . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Homologe Rekombination . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Formaler Ablauf . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Biochemie der homologen Rekombination . . . . . . . . . . . . Homologe Rekombination in biologischen Prozessen . . . . Ortsspezifische Rekombination . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Formaler Ablauf . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Biochemie von zwei konservierten Proteinfamilien . . . . . Ortsspezifische Rekombination in biologischen Prozessen Transposition und Retrotransposition . . . . . . . . . . . . . . DNA-Transposons . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Poly(A)-Retrotransposons . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . LTR-Retrotransposons . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ein „gezähmtes Transposon“ und das Immunsystem höherer Eukaryoten . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Rekombination und menschliche Krankheiten . . . . . . . Evolution durch Rekombination und Evolution der Rekombination . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Evolution durch Rekombination . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 316 318 318 323 331 340 340 341 345 351 352 355 358 359 361 362 362 aus: Munk, Genetik (ISBN 9783131448712), © 2010 Georg Thieme Verlag KG XVI Inhaltsverzeichnis 9.7.2 9.8 Evolution der Rekombination . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 364 Anwendung der Rekombination in Forschung, Biotechnologie und Gentherapie . . . . . . . . . . . . . . . . . . 366 10 Mutation und Reparatur 10.1 10.1.1 10.1.2 10.1.3 10.2 10.2.1 10.2.2 10.3 10.3.1 10.3.2 10.3.3 10.3.4 10.3.5 10.3.6 10.3.7 10.3.8 10.4 10.4.1 10.4.2 10.4.3 10.4.4 10.4.5 10.4.6 10.4.7 10.5 ........................... Welche Mutationen gibt es? . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Punktmutationen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Chromosomenmutationen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Genommutationen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Häufigkeit und Richtung spontaner Mutationen . . . . Spontane Mutationen sind ungerichtet . . . . . . . . . . . . . . Häufigkeit spontaner Mutationen . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ursachen für Mutationen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zerfallsreaktionen von Nucleinsäuren . . . . . . . . . . . . . . . Einbau falscher Basen führt zu Fehlpaarungen . . . . . . . . Reaktionen mit Nucleinsäuren – chemische Mutagenese Basananaloga und interkalierende Substanzen . . . . . . . . Strahleninduzierte Mutationen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Repetitive Trinucleotid-Sequenzen: Dynamische Mutationen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Mutationen durch „entsprungene Gene“ . . . . . . . . . . . . Zielgerichtete Mutagenese . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Reparatur von DNA-Schäden . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Direkte Reparatur modifizierter Basen . . . . . . . . . . . . . . Die Basen-Excisions-Reparatur . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Die Nucleotid-Excisions-Reparatur . . . . . . . . . . . . . . . . . Die Mismatch-Reparatur . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Reparatur durch Rekombination . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Reparatur von Einzel- und Doppelstrangbrüchen . . . . . SOS-Reparatur . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Suppression von Mutationen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 Kontrolle der Genexpression und Systembiologie 11.1 11.2 11.2.1 11.2.2 11.3 11.3.1 .. Ebenen der Genexpressionskontrolle . . . . . . . . . . . . . Genomstruktur und Genexpression . . . . . . . . . . . . . . Regulation der Genexpression über die Genomstruktur in Bakterien . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Regulation der Genexpression über die Genomstruktur in Eukaryoten . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Transkriptionskontrolle in Prokaryoten . . . . . . . . . . Alternative Sigmafaktoren . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 370 370 370 373 379 382 383 385 387 387 389 391 394 396 . . . . . . . . . . . . 398 400 401 404 405 407 409 412 414 414 415 419 . . 421 . . 421 . . 423 . . 423 . . 425 . . 426 . . 429 aus: Munk, Genetik (ISBN 9783131448712), © 2010 Georg Thieme Verlag KG XVII Inhaltsverzeichnis 11.3.2 11.3.3 11.3.4 11.3.5 11.4 11.4.1 11.4.2 11.4.3 11.4.4 11.4.5 11.4.6 11.4.7 11.5 11.5.1 11.5.2 11.5.3 11.5.4 11.5.5 11.5.6 11.5.7 11.5.8 11.5.9 11.6 11.6.1 11.6.2 11.6.3 11.6.4 11.6.5 11.7 11.8 11.8.1 11.8.2 11.8.3 11.8.4 11.8.5 11.8.6 Zweikomponenten-Regulationssysteme . . . . . . . . . . . Repressoren und Aktivatoren – negative und positive Kontrolle . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Regulation des lac-Operons durch den Lac-Repressor und den Crp-Aktivator . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Komplexe Regulation der Stationärphase und generellen Stressantwort . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Transkriptionskontrolle in Eukaryoten . . . . . . . . . . Chromatinstruktur und Genregulation . . . . . . . . . . . . Promotorelemente und Transkriptionsfaktoren . . . . . Häufige Regulatoren proximaler Promotorelemente . . Spezialisierte Transkriptionsregulatoren und ihre Promotorelemente . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Enhancer und Silencer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Kopplung von Transkription und RNA-Prozessierung Methylierung und Epigenetik . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Signaltransduktion in Eukaryoten . . . . . . . . . . . . . . Prinzipien der Signaltransduktion . . . . . . . . . . . . . . . . Sieben-Transmembranhelix-(7TM-)Rezeptoren und G-Protein-vermittelte Signalwege . . . . . . . . . . . . . . . Intrazelluläre Signalsubstanzen – Second Messenger Signaltransduktion durch pflanzliche Hormone . . . . . Signalwege über Serin/Threonin-spezifische Proteinkinasen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Cytokinrezeptoren und der JAK-STAT-Signalweg . . . Wachstumsfaktoren und Rezeptor-Tyrosinkinase . . . Von der Membran über Ras und MAP-Kinaseweg in den Zellkern . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Toll-like-Rezeptoren . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Posttranskriptionelle Kontrolle der Genexpression Alternatives Spleißen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . MicroRNAs und RNAi in Eukaryoten . . . . . . . . . . . . . . RNA-abhängige Regulation in Bakterien . . . . . . . . . . . Regulierte RNA-Stabilität . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Gesteuerte mRNA-Lokalisation und Translation . . . . Translationskontrolle in Eukaryoten . . . . . . . . . . . . Systembiologie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Systembiologie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Genome und Genomics . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Transkriptom und Transkriptomics . . . . . . . . . . . . . . . Proteom, Proteomics und Interactomics . . . . . . . . . . . Metabolom und Fluxom . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Bioinformatische Modellbildung . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 430 . . . 431 . . . 432 . . . . . . . . . . . . . . . 433 436 438 438 439 . . . . . . . . . . . . . . . . . . 440 442 444 445 446 446 . . . 449 . . . 450 . . . 452 . . . 452 . . . 454 . . . 454 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 455 456 458 458 460 462 465 465 466 469 470 471 472 472 473 474 aus: Munk, Genetik (ISBN 9783131448712), © 2010 Georg Thieme Verlag KG XVIII Inhaltsverzeichnis 12 Methoden der Molekularbiologie 12.1 12.1.1 12.1.2 12.1.3 12.2 12.2.1 12.2.2 12.2.3 12.2.4 12.2.5 12.2.6 12.2.7 12.2.8 12.2.9 12.2.10 12.2.11 12.2.12 12.2.13 12.2.14 12.2.15 12.2.16 12.3 12.3.1 12.3.2 12.3.3 12.3.4 12.3.5 12.3.6 12.4 .................... Einleitung . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Entwicklung der Molekularbiologie . . . . . . . . . . . . . . . . . Molekularbiologisches Arbeiten heute . . . . . . . . . . . . . . . Sicherheit und gesetzliche Grundlagen . . . . . . . . . . . . . . . In-vitro–Methoden der Molekularbiologie . . . . . . . . . . Reinigung von Nucleinsäuren . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Gelelektrophorese . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Einsatz von Restriktionsendonucleasen . . . . . . . . . . . . . . Ligation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Polymerasekettenreaktion . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Sequenzierungsmethoden und Genomsequenzierung . . . . Reverse Transkription . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Hybridisierung . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Mikroarray-Analysen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Genom-, cDNA- und Umwelt-DNA-Bibliotheken . . . . . . . In-vitro-Transkription und In-vitro-Translation . . . . . . . . In-vitro-Evolution . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Chemische DNA-Synthese . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Molekulare Marker (für die Züchtung und in der Medizin) Genetisches Screening und Genetischer Fingerabdruck . . Analyse von Populationsstrukturen . . . . . . . . . . . . . . . . . In-vivo-Methoden der Molekularbiologie . . . . . . . . . . . Transformation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Regeneration vielzelliger Organismen . . . . . . . . . . . . . . . . Heterologe Produktion von Proteinen . . . . . . . . . . . . . . . . Expressionsanalysen mittels GFP . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Analyse von Protein-Protein-Wechselwirkung . . . . . . . . . Deletion von Genen und konditionale Depletion von Proteinen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . In-silico-Methoden der Molekularbiologie . . . . . . . . . . 13 Anhang 476 476 476 477 478 479 480 481 482 483 484 487 491 492 494 495 496 497 497 498 500 503 505 505 509 510 510 512 513 516 Bildquellen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 523 Sachverzeichnis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 525 aus: Munk, Genetik (ISBN 9783131448712), © 2010 Georg Thieme Verlag KG