1a. RNAs Die RNAs - Einleitung 1 Eine neue RNA-Welt RNA-Gene sind transkribierte DNA-Abschnitte, die keine Proteine kodieren, und sind nichtkodierendeRNAs genannt. Im Focus der Forschung standen Protein-kodierende Gene, und aufgrund ihren ProteinFunktion dachte man als ob sie der wichtigste Teil des Genoms wären. Die nichtkodierenden-RNAs spielten keine Rolle in der ersten Version des Humangenoms und wurden nicht analysiert (2001). Die RNA-Welt-Hypothese besagt, dass am Anfang des Lebens RNAs waren Erbmaterial und Enzym gleichzeitig. Diese Rolle wurde später durch DNA und Proteine übernommen. Die boten-RNAs vermitteln die genetische Information, transfer-RNAs liefern Aminosäuren, rRNAs sind Bestandteile der Ribosomen. Heutzutage die Anzahl der nicht-kodierenden RNAs nimmt exponentiell zu, und die Anzahl der Proteinkodierenden Gene (20-21.000 beim Mensch) erhöht sich nicht. Im mitochondrialen Genom RNA-Gene vertreten 65 % als Ausnahme. Einige kleine RNA-Moleküle sind Komponente der Ribunucleoproteine, die im Spleissen, rRNA-, tRNA-Reifung teilnehmen. Diese RNAs verhalten sich als Fremdenführer, begleiten und anknüpfen Proteine an Ziel-RNA aufgrund Basen-Komplementarität. Andere Funktion der nichtkodierenden-RNAs ist die X-Chromosom Inaktivierung und genetisches Imprinting. Das Telomerase-Enzym enthält RNA auch, als bekannte Beispiele. In der letzten Zeiten regulatorische Funktion der nichtkodierenden-RNAs wurde entdeckt. Transkriptom-Analyse hat es gezeigt, dass mindestens 85% des menschlichen Genoms Transkriptionell aktiv ist; im Vergleich, nur 1.1 % kodiert Proteine und die Transposonen defekt sind. Es heisst, dass ausser Heterochromatin das ganze Genom transkribiert wird. Überraschungsweise multigenisch Transkription, ein RNA mit mehreren Gene wurde auch beobachtet, ähnlich an polycistronischer RNA (Operon) der Bakterien. Unerwartet wurde es gemeldet, dass ~70% der menschlichen Gene werden bidirektionell transkribiert, mit Bildung sense und antisense Transkripte. Konservative, langsam veränderliche RNA-Gene wurden entdeckt mit Sequenz-abhängiger Funktion; man vermutete, dass die langsame genetische Veränderung tritt nur für Protein-Gene auf, da die negative Selektion verhindert die Verbreitung mutanter Allele. Dies kollektiv führt zur Schlussfolgerung, dass die Gen-Definition radikal erneuert werden muss, und die Zellen nicht mehr als Protein-, sondern RNA-Maschienen interpretiert werden können. Proteine sind unfähig sich zu reproduzieren; die evolutionären Genetikern (Alexander Rich und Carl Woese) vermuteten es, dass RNA-Autokatalyse ermöglichte RNA als Doppelfunktion-Träger zu sein: Genetisches Material und Enzym für selbst-Reproduktion gleichzeitig. Experimentelle Beweise zeigen es, dass die zwei Funktionen heute immer noch existieren: RNA-Viren besitzen RNA als Erbmaterial, und RNA-Moleküle haben enzymatische Aktivität (Ribozyme). Die reverse, RNA-abhängige DNAPolymerase, die RNA-abhängige RNA-Polymerase auch Beispiele der neuen RNA-Welt sind. RNAMoleküle sind fest, biegen nicht wie Proteine, und Proteinflexibilität ermöglicht enorme Funtionsvielfaltigkeit. Die hohe chemische Stabilität der DNA tut sie einen besseren Informationsträger. EXTRA ANFORDERUNG 4. Vorlesung Boldogkői Zsolt © 1a. RNAs 2 RNA-Arten DNA und RNA sind Nukleinsäuren, aber unterscheiden sich durch ihrer Zusammensetzung: Die ZuckerPhosphat Wirbelsäule der RNA Molekülen enthält Ribose (daher stammt der Name), und Uracil ersetzt das Pyrimidin Thymin. Zusätzlich, RNA ist einzelsträngig; doppelsträngige RNA befindet sich in Viren, wie z.B. Parvoviren. Die RNAs sind zahlreich in ihrer Sekundärstruktur, da innerhalb der Kette Komplementarität auftritt. Proteinkodierende RNAs sind die Boten-RNAs (mRNA), die zweite Klasse ist die nicht-kodierende RNA. Boten-RNAs tragen die genetische Information der Gene, liefern sie an Ribosomen wo sie translatiert werden. Transfer-RNAs liefern die aktiviertenAminosäure an Ribosomgebundene mRNA, wo der Code der mRNA tritt in Wechselwirkung mit dem Anticodon der tRNA. Ribosomale RNA Bestandteil mit Proteinen der Ribosomen ist, und spielen eine strukturelle Rolle. Unter der nicht-kodierende tRNA und rRNA nehmen direkt im der Proteinsynthese teil. Die neulich entdeckten RNA-Arten verschiedene Funktionen. MicroRNAs, endogene siRNAs und antisense RNAs nehmen in genetischer Regulierung teil, die anderen reguliren Reifung der RNA, oder epigenetische Prozesse. RNAs nehmen auch teil in Steuerung der DNA-Synthese, Protein-Export, und in der Hemmung der Transposonsaktivität. Ribozyme besitzen Enzym-ähnliche katalytische Aktivität, z.B. in RNA-Reifung. EXTRA ANFORDERUNG 4. Vorlesung Boldogkői Zsolt ©