11. Rekombination 2 - Online Media Server

Werbung
Rekombination
1. Genetische Rekombination
2. Homologe Rekombination
3. Sequenzspezifische Rekombination
Die Integration des Bakteriophagen Lambda erfolgt an einer
ganz bestimmten Stelle im Genom von E. coli
Verschiedene Formen der sequenzspezifischen Rekombination
Insertion
Deletion
direct repeats
Erkennungsstellen der Rekombinase
Inversion
inverted repeats
Die Reaktion erfolgt über kovalente Protein-DNA-Intermediate
Serin- und Tyrosinfamilien der Rekombinasen
Rekombinase
Funktion
Serin-Familie
Salmonella Hin Invertase
Inversion eines chromosomalen Elementes,
das einen Promoter enthält. Erlaubt die
Expression unterschiedlicher Flagellengene.
Transposon Tn3 und "#
Resolvasen lösen das Cointegrat auf, das
während der replikativen Transpüosition
entsteht.
Resolvase
Tyrosin-Familie
Phage ! Integrase
Führt zur Integration des Phagen in eine
spezielle Stelle (attB) des Bakteriengenoms
Phage P1 Cre
Wird für die Zirkularisierung des
Phagengenoms während der Infektion
benötigt. Erkennungsstellen heißen lox-sites
E. coli XerC und XerD
Löst Dimere auf, die bei der Replikation des
zirkulären Bakterienchromosoms entstehen
können
Hefe FLP Rekombinase
Invertiert eine Region des 2µ-Plasmids.
Dies führt über eine rolling circle Replikation
zur Erhöhung der Kopienzahl
Mechanismus der Serin-Rekombinasen
Mechanismus der Tyrosin-Rekombinasen
Mechanismus der Cre-Rekombination
Kristallstruktur des Holliday-Intermediats während der Cre-Rekombination
Die Integration des Bakteriophagen Lambda erfolgt an einer
ganz bestimmten Stelle im Genom von E. coli
Integration des Bakteriophagen !
Integration benötigt
! Integrase und E.coli
IHF (integration host
factor)
Exzision benötigt
! Integrase, ! Xis
Protein und E.coli IHF
Krümmung der DNA durch IHF ist notwendig für die Integration
IHF
(integration host factor)
Salmonella typhimurium Flagellen
Phasenvariation durch DNA-Inversion bei S. typhimurium
DNA-Inversion benötigt Hin Rekombinase und FIS
FIS: Factor for Inversion Stimulation
Dimerbildung durch Rekombination während der Replikation
Rolle von XerC und XerD bei der Auflösung von Dimeren
Rolle von XerC und XerD bei der Auflösung von Dimeren
Rolle von XerC und XerD bei der Auflösung von Dimeren
Herunterladen