Mikrobielle Kreisläufe Boden, Pflanze, Tier/Mensch

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Mikrobielle Kreisläufe
Boden, Pflanze, Tier/Mensch
M. Krüger
Institut für Bakteriologie und Mykologie
ZIM
Mikrobielle Vorkommen •
•
•
•
•
ZIM
Boden (größte Diversität)
Unbelebte Oberflächen (z. B. Steine)
Wasser
Pflanzen (oberflächlich, auch im Säftestrom)
Menschen/Tiere (oberflächlich und bes. in Hohlorganen, z. B. Darm)
Mikrobielle Diversitäten
Dickdarm (Mensch, Maus, Fisch)
Ozean, Boden Mensch
Maus
Fisch
Ozean
Stromatolith
Boden
Ley et al. (2006), Cell 124, 837–848 ZIM
Ursprung der Magen‐Darm‐Bakterien
• Die Identität der Mikroorganismen des Bodens und des Magen‐Darmtraktes (MDT) ist sehr hoch • Viele Bakterienarten des MDT haben ihre Entsprechung in den Bodenbakterien
• Die Verhältnisse in beiden Biotopen sind relativ gleich
ZIM
Ähnlichkeiten im Aufbau von Wurzeloberflächen und Darmoberflächen
ZIM
Wurzeloberfläche
Wurzelhaare
Epidermis
Wurzelhaare
Rost, 1997
ZIM
Darmoberfläche
Zotten
Mikrozotten
Mausdünndarm, Mikrozotten mit Resten vom Mukus, darin Bakterien Wikipedia
ZIM
Magen‐Darmtrakt (stilisiert)
Mukos
Mikrozotten
Zelle
ZIM
Wurzelbesiedlung
Bakterien
Wikipedia
ZIM
Pilze
Mycorrhiza‐Symbiose seit 500 Mio
Jahren
Wikipedia
Keine Pathogene für Mensch und Tier, extrahieren Nährstoffe und ziehen Wasser
ZIM
Rhizobakterien
•
•
•
•
Serratia odorifera, S. plymuthica
Pseudomonas fluorescens, P. trivialis
Stenotrophomonas maltophilia, S. rhizophila
Bacillus subtilis
• Diese Bakterien können auch Erkrankungen
bei Menschen und Tieren verursachen
ZIM
Stickstoffsammler
z. B.
Rhizobium
Bradyrhizobium
Frankia
Anabaena
Wikipedia
Apathogene Bakterien
ZIM
Zotten Hüftdarm
Alle blauen Teilchen sind Zellkerne von Darmzottenzellen und von Bakterien
ZIM
Verschiedene Darmteile tragen verschiedene Mengen und verschiedene MO‐Populationen (Maus)
Bakterien
Bakterien
Bakterien
Dünndarm, wenig
Bakterien
Blinddarm, hohe
Bakteriendichte
Nachweisgrenze 105/ml
Methode: FISH‐Technik
ZIM
Fotos: Dr. A. Swidsinski
Kolon , hohe
Bakteriendichte
Gesunder Darm grenzt Bakterien vom Darmepithel mit Mukusschicht ab Mukusschicht
ZIM
Dickdarm
Darmbesiedlung
Gesunder Dickdarm
Bakterienmasse
Bakterien
Mukus
Swidsinski, 2005
Bacteroides spp. im Caecum eines 14 d Ferkels
ZIM
Doppelpfeil = Mukos, blaue Pfeile Leukozyten
Dickdarm, Botulismus‐Rind
Grimmdarm
Blinddarm
Swidsinski, 2010
Bakterien
Keine Abgrenzung zwischen Bakterien und Darmzellen, Mukus fehlt
ZIM
Blinddarm, Botulismusrind
Bakteriennachweis mit Clostridiensonde
Swidsinski, 2010
ZIM
Versporte Bakterien
Darmgeschwür, Mensch
Swidsinski, 2009
ZIM
Fazit
• Wurzeloberflächen und MDT‐Oberflächen
haben einen ähnlichen Aufbau
• In Rhizosphäre leben und interagieren ver‐
schiedene Organismen wie Pilze, Nematoden, Ziliaten, Amöben, Viren und (Rhizo‐)Bakterien
• Im MDT leben verschiedene Organismen wie Bakterien, Protozoen (Amöben), Pilze, Viren, manchmal auch Würmer ZIM
Lebensraum Boden
Mikroflora (Bakterien, Pilze)
90% Abbauarbeit n x 106 Bakterien + 100 m Pilzmyzel/g
Mikrofauna (ca. 400 Prozozoenarten, bis106/g)
Pioniere in Rohböden, fressen Bakterien, Pilze, Pflanzenparasiten
ZIM
Mikroorganismengemeinschaften
• Autochthon (Standortflora)
• Allochthon (passagere, temporäre Flora, z. B. Güllekeime)
• Restflora (pathogene Flora)
ZIM
Potentiell oder obligat pathogene Bakterien im Bodenhabitat
Naturherdinfektionen
Leptospirose
Borreliose
Bakterien, die mit Ausscheidungen in Boden und Grundwasser gelangen
E. coli
Salmonellen
Clostridien
ZIM
Mensch/Tier
Kontaminationen von pflanzlichen Lebens‐
/Futtermitteln mit Pathogenen
• Epiphytisch
• Endophytisch
• Bodenbeimengungen im Produkt
• Wasser
ZIM
Kreisläufe pathogener
Mikroorganismen
Pflanze
Futtermittel
Boden
Nahrungsmittel
Tier
Mensch
ZIM
Kreislauf von C. botulinum
ZIM
Clostridium botulinum
• Anaerobier
• Sporenbildner
• Neurotoxinbildner
• Bodenseuchenerreger
ZIM
Anti-BotNt-A bis D
ZIM
Epidemiologie
•
•
•
•
•
•
•
ZIM
Weltweit verbreitet
durch Globalisierung keine Regionalität
ubiquitär vorkommend
Darmbewohner
Eintrag in Boden durch Fäkalien
Toxinbildung abhängig von Erregerzahl
7 Toxintypen, Mischformen
C. botulinum‐haltige Substrate
Kot
Pflanzen
Abfälle
Kompost
Staub
Schlämme
ZIM
Boden
Futter/
Lebensmittel
Erkrankte Kühe
ZIM
ZIM
ZIM
Einfluss der Erregerzahl und des Milieus auf die Erkrankung
Die Sporenmenge entscheidet
darüber, ob Toxine gebildet
werden (≥1000 Sporen/g)
Die Gesundheit der MDT-Flora
entscheidet, ob C. botulinum sich
überhaupt vermehrt
ZIM
Gesunde Kuh
ZIM
C. botulinum‐Kreislauf in einem sächsischen Milchviehbetrieb SA (Botulismus‐unverdächtig)
Kot
Mist
Boden
Futtermittel
Auch in gesunden Beständen kommt C. botulinum vor
ZIM
Beziehung zwischen Nachweis von C. botulinum‐ assoziierten Erkrankungen
und Rinderdichte
Böhnel, 2011
Rinderdichte in der BRD
ZIM
Beziehung zwischen Nachweis von C. botulinum‐ assoziierten Erkrankungen
und BGA‐Dichte
ZIM
Böhnel, 2011
Nachweis von C. botulinum
in Gülle und Mist, Bestand Sachsen
ZIM
Probe
Clostridien/g
Gülle Rind
Anreicherung BoNt
A
B
C
D
103
-
-
-
-
Gülle Schwein
104
-
-
-
-
Mist Krankenstall
100
-
-
-
-
Mist Trockensteher
103
-
-
-
-
Mist Frischabkalber
103
-
-
-
-
Mist Jungrinder
103
-
-
-
-
Mist Kälberstall
100
-
-
-
-
Mistlager Feld (1)
104
-
+
-
+
Mistlager Feld (2)
104
-
-
-
-
Mistlager Feld (3)
104
-
-
-
-
Clostridiengehalt/g Boden ausgewählter Felder über 6 Monate verteilt (DRCM), Betrieb SA
26.04.2005
31.05.2005
11.07.2005
16.08.2005
27.10.2005
1
105
106
104
104
104
2
104
104
104
105
105
3
104
104
103
105
105
4
104
105
105
104
104
5
103
105
104
104
104
In mit Wirtschaftsdüngern gedüngten Feldern kommen Clostridien vor.
ZIM
C. botulinum‐Nachweis im Boden ausgewählter Felder über 6 Monate verteilt (DRCM), Betrieb SA
26.04.05
31.05.05
11.07.05
16.08.05
27.10.05
Pos. C.b.
A B C D A B C D A B C D A B C D A B C D in %
1
-
-
-
-
- - -
- + - - -
+ -
-
-
+ - -
+ 20
2
-
+ -
-
- - -
- -
-
-
-
- - -
- 5
3
-
-
-
+ - - -
- + - - -
+ -
+ -
+ - -
- 25
4
-
-
-
+ - - -
+ -
- - -
-
-
-
-
- - -
- 10
5
-
-
-
+ - - -
- -
- - -
-
-
-
-
- - -
- 5
% 20
ZIM
5
10
- - -
15
-
15
In mit Wirtschaftsdüngern gedüngten Feldern kommt C. botulinum vor
Clostridiengehalt in verwendeten Futtermitteln, Betrieb SA
Anreicherung
BotNT
A
B
C
D
Clostridien
/g
DRCM
GPS Gras 10.07.05
-
-
-
-
102
< 103
< 103
Maissilage Frisch
-
-
-
-
102
< 103
< 103
Luzernesilage Frisch
-
-
-
-
102
1,1x105
< 103
Silage
aus
gehäckseltem Mais
-
-
-
100
4x104
1x103
Sojaschrot
-
-
-
-
100
< 103
< 103
Rapsschrot
-
-
-
-
100
< 103
< 103
Biertreber siliert
-
-
-
-
102
7x105
1,3x104
Biertreber frisch
-
-
-
-
100
5x105
1,8x104
Rübenpressschnitzel
-
-
-
-
102
5x106
1,3x104
Futtermittel
Lactobacillus
spp.
Hefen
Keimdynamik in TMR im 18 h‐Verlauf
TMR laktierende Tiere
Temp. (°C)
Entnahme
Anreicherung BotNT
A
B
C
D
Clostridien/g
DRCM
Lactobacillus
spp.
Hefen
TMR 5 Uhr 30
xx
-
-
-
-
104
7x106
<103
TMR 9 Uhr
xx
-
-
-
-
103
1,4x107
2,7x105
TMR Haufen 11 Uhr
18
(+)
-
-
-
105
6x106
5x105
TMR Futtert. 11 Uhr
xx
-
-
-
-
104
2x104
4x103
TMR Haufen 13 Uhr
23
-
-
-
-
105
1,5x107
1x105
TMR Futtert. 13 Uhr
xx
-
-
-
-
104
8x105
1,8x104
TMR Haufen 15 Uhr
23
-
-
-
-
105
4,7x106
4x104
TMR Futtert. 15 Uhr
xx
-
-
-
-
104
2,4x106
6x103
TMR Haufen 18 Uhr
25
-
-
-
-
104
8x106
Schimmel
pilz
-
104
Überschwärmt
(Clostridium
sp.)
5x103
TMR Futtert. 18 Uhr
ZIM
xx
-
-
-
Nachweis von C. botulinum in Umweltproben (Sachsen)
Probenart
n C. bot.
A
C.bot.
B
C.bot.
C
C.bot.
D
C.bot. E
Grassilage
5 1/5
0/5
0/5
0/5
0/5
Heu
2 0/2
0/2
0/2
0/2
0/2
Raps
1 0/1
0/1
0/1
0/1
0/1
Getreide
1 0/1
0/1
1/1
1/1
1/1
Tränkwass
er
9 0/9
0/9
5/9
4/9
0/9
Gülle
5 0/5
1/5
0/5
1/5
1/5
Boden
7 0/7
0/7
0/7
0/7
0/7
ZIM
Fazit
• Clostridien auch C. botulinum sind ubiquitär
(überall) verbreitet
• In Futtermitteln schlechter Qualität kommen höhere Clostridiengehalte vor • Die Menge und die Bedingungen entschei‐
den, ob eine Erkrankung ausgelöst wird
ZIM
Nachweis von C. botulinum bei gesunden Tieren
ZIM
C. botulinum‐Nachweis im Kot unverdächtiger Kühe und Färsen (Sachsen)
n
1 32
ZIM
Nachweis von C. botulinum‐IgG‐Antikörpern im Blut unverdächtiger Kühe und Färsen %
ZIM
n=60
n=60
C. bot.‐Nachweis in Tonsillen* von Schlachtrinder
%
25
20
BoNT
BoNT
BoNT
BoNT
BoNT
15
10
5
0
n = 96
ZIM
* mit Ultra Turrax zerkleinert
A
B
C
D
E
Erregernachweis bei erkrankten Tieren
(Schleswig‐Hollstein)
ZIM
ZIM
ZIM
ZIM
Nachweis von C. botulinum in Pansensaft und Blinddarminhalt bei 15 erkrankten euthanasierten Kühen aus einem Bestand in SH
n
3
2
ZIM
Nachweis von C. botulinum in verschiedenen Substraten von Milchviehbetrieben
in SH
n
196
77
40
21
ZIM
14
7
Clostridium botulinum‐Gehalt in Futtermitteln (Problembestände)
%
16
14
12
A
B
C
D
E
10
8
6
4
2
0
Kraftf.
Kraftfutter: n=126
Grassilage: n=34
ZIM
Grassilage
Nachweis von C. botulinum in Gärresten, Gebiet 1 (n=30)
n
40%
12
10
8
6
Nachweis
4
6,7%
2
0
ZIM
TypA TypB TypC TypD
Nachweis von C. botulinum in Gärresten, Gebiet 2 (n=26)
n
6
23,1%
5
4
3
11,5%
Nachweis
7,7%
2
1
0
ZIM
TypA
TypB
TypC
TypD
Schlußfolgerungen
• C. botulinum kommt auch in klinisch unauffälligen Rinderbeständen vor.
• Über Gülle und Mist wird C. botulinum in den Boden eingebracht und kann von hier über Futtermittel wieder in die Bestände gelangen.
• Im Kot und im Boden wurde C. botulinum mit der größten Häufigkeit nachgewiesen.
ZIM
Danke für die Aufmerksamkeit
ZIM
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