Transcription Factors

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Rainer deMartin:
Prinzipien der Transkriptionsregulation
Strukturmerkmale von Transkriptionsfaktoren
Basismechanismen der Transkriptionsregulation
NFkB
Erhard Hofer
Überblick Hauptsignalkaskaden Rezeptor-Kern
spezielle Beispiele:
T Zellrezeptor
Regulation von Signalkaskaden/Transkriptionsfaktoren
durch proteolytische Spaltungen:
WNT, HEDGEHOG, NOTCH (Embryonalentwicklung, adulte Stammzellen)
Kernimport, -export
Chromatin
Ausgewählte Beispiele Transkriptionsfaktoren
CREB, SRF, NFAT, SMAD
Signalwege Rezeptor
A-Cyclase
PLC
Ras
Transkriptionsfaktoren
SMAD
STAT
IKKK
SMAD/Co-SMAD
cAMP
PKA
NFAT
/ NFkB
SRF
STAT
SMAD
Oberflächenrezeptoren assoziiert mit Enzymen
(Rezeptoren ohne eigene Enzymaktivität, welche
mit Enzymen assoziieren direkt oder über Adaptoren)
Beispiel 3
Antigenrezeptor der T Lymphocyten
Im T Zellrezeptorkomplex sind die Funktionen Ligandenbindung,
Tyrosinkinase und P-Tyr-Andockstellen auf verschiedenen Proteinketten
Regulation von Transkriptionsfaktoren
durch proteolytische Spaltung
WNT Signalweg
Sezerniertes Signalpeptid,
wichtig in Embryonalentwicklung
Mutationen in Proteinen des Signalweges häufig
bei Krebs
Beispiel 4a
Wnt
Wingless (Drosophila)
Int-1 (Brustkrebs-Onkogen)
(experimentell detektiert durch Virus Integration)
Im Signalweg:
APC (adenomoteous polyposis coli)
mutiert in Adenoma des Dickdarms
und 80 % der Dickdarmkrebsfälle
induziert myc Gen
Wachstum und Proliferation
b-Catenin Signalweg:
ohne Signal: b-catenin wird laufend phosphoryliert, ubiquitinyliert, in Proteasomen abgebaut
Wnt-Signal: Kinase wird inhibiert, unphosphoryliertes b-Catenin geht in Kern,
aktiviert Transkription durch Verdrängung eines Korepressors
(LDL rceptor related protein)
(Signaling protein)
Phosphorylierung,
Ubiquitinylierung,
Abbau im Proteasom
(Corepressor)
(b-Catenin
Coaktivator)
Komponenten des WNT Signalweges z.B wichtig
für Erhaltung der Stammzell-Population im
Magen/Darm Trakt,
Überaktivierung durch APC Mutation - Krebs
Beispiel 4b
notch
hedgehog
Embryonalentwicklung
z.B. Nervenzellen Drosophila,
Delta auf Nervenzelle signalisiert der Nachbarzelle
kein Neuron zu werden,
Peptid geht in Kern und konvertiert CSL
von Repressor zu Aktivator
Beispiel 4c
notch
hedgehog
e.g. WNT
Kernimport / -export
Transport des Transkriptionsfaktors NFAT in den Kern
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Kernmembran:
Doppelmembran
mit Kernporen
26 nm
Kernporenkomplex
innere Seite
Das Kernlokalisierungssignal
ist eine basische
Aminosäurensequenz
Modell des Kernimports
vermittelt durch das
kleine G-protein Ran
Ran-GDP: im Zytosol
Ran-GTP: im Kern
GAP: GTPase aktivierendes Protein
GEF: Guanin-Nukleotid Exchange Faktor
Modell des Kermimports und Kernexports
Beispiel 9
CREB, SRF, JUN/FOS, NFAT, SMAD
Genregulation durch 7 TM Rezeptoren und PKA
Genregulation durch PKA
CREB gebunden an CRE
wird durch PKA
phosphoryliert,
aktiviert Transkription
ohne Effekt auf DNA
Bindung
Die phosphorylierte MAPK ERK wird in den Kern transportiert
und phosphoryliert dort den Transkriptionsfaktor TCF
ERK: extracellular signal regulated kinase
TCF: ternary complex factor
SRF: serum response factor
SRE: serum response element
(DNA Bindungssequenz für TCF und SRF
im Promoter verschiedener Gene)
Gene für
Zellzyklus/
Proliferation
early response
genes, c-fos
Ca++ Signalweg - Genregulation
die Phosphatase
Calcineurin
dephosphoryliert
NFAT
NFAT transloziert
in den Kern
P
I
Ca++
NFAT
Calmodulin
Calcineurin
P
NFAT= Transkriptinsfaktor
(nuclear factor
activated T cell)
Kern
TGF-b Rezeptor Signale
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Transport der
phosphorylierten
SMADs in den Kern
CHROMATIN
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Zusammenfassung
Interphase
Metaphase
Eigenschaften von Insulatorelementen
Modellvorstellung
Änderung der Chromatinstruktur durch Aktivatorproteine
CHROMATIN
NUKLEOSOM
HAT
Ac
DNA
HDAC
Ac
KONDENSIERTES CHROMATIN
LOCKERES CHROMATIN
KEINE TRANSKRIPTION
TRANKRIPTION
Z.B. HETEROCHROMATIN
Z.B. EUCHROMATIN
HAT = HISTONAZETYLTRANSFERASE AKTIVATOR DER TRANSKRIPTION
HDAC = HISTONDAZETYLASE REPRESSOR DER TRANSKRIPTION
GENEXCS18
REGULATION DER TRANSKRIPTION DURCH
VERÄNDERUNG DER CHROMATINSTRUKTUR
REPRIMIERUNG
Repressor
HDAC
X
ZIELGEN
kondensiertes Chromatin
AKTIVIERUNG
Aktivator
Z
Y
A
HAT
zugängliches Chromatin
GENEXCS19
ZIELGEN
Genregulationsproteine
bilden häufig Komplexe
Mediator
DNA Looping
Genexpression
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