Case-based visualization of a patient cohort using SEER
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Diplomarbeit Fallbezogene Visualisierung eines Patientenkollektivs unter Verwendung des SEERDatensatzes Christian Maier, 22.05.2014 Christian Maier // Fallbezogene Visualisierung eines Patientenkollektivs // 22.05.2014 Einleitung Problemstellung ● Tumorboard FK Patientin: Mustermann, Manuela Christian Maier // Fallbezogene Visualisierung eines Patientenkollektivs // 22.05.2014 Einleitung Aufgabenstellung Surveillance, Epidemiology and End Results Patientin: Mustermann, Manuela Christian Maier // Fallbezogene Visualisierung eines Patientenkollektivs // 22.05.2014 Einleitung Aufgabenstellung Surveillance, Epidemiology and End Results an ge Th w er an ap dt ien e Patientin: Mustermann, Manuela Üb Ka er pla leb n en Me sk ier ur ve n Christian Maier // Fallbezogene Visualisierung eines Patientenkollektivs // 22.05.2014 Einleitung Aufgabenstellung Surveillance, Epidemiology and End Results Patientin: Mustermann, Manuela a) Können Soarian und SEER-Daten sinnvoll verknüpft werden? b) Kann dem klinischen Anwendern ein Mehrwert geboten werden? an ge Th w er an ap dt ien e Üb Ka er pla leb n en Me sk ier ur ve n Christian Maier // Fallbezogene Visualisierung eines Patientenkollektivs // 22.05.2014 Methodik Konzeption der Applikationsstruktur Christian Maier // Fallbezogene Visualisierung eines Patientenkollektivs // 22.05.2014 Methodik Konzeption der Applikationsstruktur 1. Elementauswahl & Mapping Christian Maier // Fallbezogene Visualisierung eines Patientenkollektivs // 22.05.2014 Methodik Konzeption der Applikationsstruktur 1. Elementauswahl & Mapping 2. ETL Christian Maier // Fallbezogene Visualisierung eines Patientenkollektivs // 22.05.2014 Methodik Konzeption der Applikationsstruktur lokale Formulardaten zusammenführen 3. Neues Formular mit Aufruflogik 1. Elementauswahl & Mapping 2. ETL Christian Maier // Fallbezogene Visualisierung eines Patientenkollektivs // 22.05.2014 Methodik Konzeption der Applikationsstruktur lokale Formulardaten zusammenführen 3. Neues Formular mit Aufruflogik 1. Elementauswahl & Mapping 2. ETL Übergabe per Parameter-Werte-Paaren: http://url.tld/webseite.html?var1=val1&var2=val2 Übergabe der Daten des individuellen Patienten 4. Frontend Christian Maier // Fallbezogene Visualisierung eines Patientenkollektivs // 22.05.2014 Methodik Konzeption der Applikationsstruktur lokale Formulardaten zusammenführen 3. Neues Formular mit Aufruflogik Übergabe der Daten des individuellen Patienten 4. Frontend Aufruf 1. Elementauswahl & Mapping 5. Webservice 2. ETL 6. PL/SQL Fkt. Christian Maier // Fallbezogene Visualisierung eines Patientenkollektivs // 22.05.2014 Methodik Konzeption der Applikationsstruktur Übergabe der Daten des individuellen Patienten lokale Formulardaten zusammenführen 3. Neues Formular mit Aufruflogik 4. Frontend Zurückliefern und anzeigen 1. Elementauswahl & Mapping 5. Webservice 2. ETL 6. PL/SQL Fkt. Zurückliefern Christian Maier // Fallbezogene Visualisierung eines Patientenkollektivs // 22.05.2014 Ergebnisse Visualisierung ● Soarian-Formular Christian Maier // Fallbezogene Visualisierung eines Patientenkollektivs // 22.05.2014 Ergebnisse Visualisierung ● Diagramm 1: Verteilung der Altersgruppen Christian Maier // Fallbezogene Visualisierung eines Patientenkollektivs // 22.05.2014 Ergebnisse Visualisierung ● Diagramm 1: Verteilung der Altersgruppen Selektionsattribute Christian Maier // Fallbezogene Visualisierung eines Patientenkollektivs // 22.05.2014 Ergebnisse Visualisierung ● Diagramm 1: Verteilung der Altersgruppen Selektionsattribute Exponierte Darstellung des Kollektivs des Patienten Christian Maier // Fallbezogene Visualisierung eines Patientenkollektivs // 22.05.2014 Ergebnisse Visualisierung ● Diagramm 2: Operative Behandlungsmethoden Christian Maier // Fallbezogene Visualisierung eines Patientenkollektivs // 22.05.2014 Ergebnisse Visualisierung ● Diagramm 3: Kaplan Meier für Teilkollektiv der operativen Behandlungsmethoden Christian Maier // Fallbezogene Visualisierung eines Patientenkollektivs // 22.05.2014 Ergebnisse Visualisierung ● Diagramm 4: Kaplan Meier für fallbezogenes Gesamtkollektiv Christian Maier // Fallbezogene Visualisierung eines Patientenkollektivs // 22.05.2014 Ergebnisse Klärung der Fragestellungen ● Können zwischen Soarian & SEER sinnvolle Verknüpfungen hergestellt werden? Christian Maier // Fallbezogene Visualisierung eines Patientenkollektivs // 22.05.2014 Ergebnisse Klärung der Fragestellungen ● Können zwischen Soarian & SEER sinnvolle Verknüpfungen hergestellt werden? ● Ja, aber: – ➔ SEER numerische Kodierungen Soarian Freitextfelder Teilweise aufwändiges Mapping Christian Maier // Fallbezogene Visualisierung eines Patientenkollektivs // 22.05.2014 Ergebnisse Klärung der Fragestellungen ● Können zwischen Soarian & SEER sinnvolle Verknüpfungen hergestellt werden? ● Ja, aber: – ➔ SEER numerische Kodierungen Soarian Freitextfelder Teilweise aufwändiges Parsing Christian Maier // Fallbezogene Visualisierung eines Patientenkollektivs // 22.05.2014 Ergebnisse Klärung der Fragestellungen ● Kann dem klinischen Anwender ein Mehrwert geboten werden? Christian Maier // Fallbezogene Visualisierung eines Patientenkollektivs // 22.05.2014 Ergebnisse Klärung der Fragestellungen ● Kann dem klinischen Anwender ein Mehrwert geboten werden? ● Interview mit Ärzten des UKER ergab: Guter Ansatz, aber – – Keine Selektion nach HER2/neu Keine Visualisierung der medikamentösen Therapien Christian Maier // Fallbezogene Visualisierung eines Patientenkollektivs // 22.05.2014 Diskussion Alternative Kollektiv-Datenquellen ● Adjuvant! online ● ● Visualisierung von Überlebensraten abh. von (medikamentöser) Therapie ● Adjuvant-Datenbank liegt nicht offen ● Seit 2011 kein Update mehr Weitere denkbare Alternative: PREDICT ● „nur“ Rechenformel für Überlebensraten ● Formel abgeleitet aus Studien von 1988 bis 1992 Christian Maier // Fallbezogene Visualisierung eines Patientenkollektivs // 22.05.2014 Ausblick ● Weitere Datenquellen einbeziehen, evtl. Kombination ● Aussagekraft steigern durch ● ● ● weitere Selektionsattribute ● HER2/neu Fallbezogene Visualisierung technisch durchaus realisierbar Flaschenhals sind Krebsregisterdaten Christian Maier // Fallbezogene Visualisierung eines Patientenkollektivs // 22.05.2014 Ende Vielen Dank für Ihre Aufmerksamkeit!
