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Phytochemie
P. Braun / H. Scheer
WS 2007 / 2008
H. Scheer
Inhalte

Vorlesung
Donnerstags 11:30 – 13:00, Kl. Hörsaal Botanik
Pflanzentypische Stoffwechselwege
Tetrapyrrole, Isoprenoide, Flavonoide
Acetogenine, Alkaloide
Lipide
Prinzipien der Isolierung und Strukturaufklärung

Abschlussklausur
Donnerstag, 7.2.08 11:30
Fragen zur Vorlesung
Zugangsberechtigung zum Praktikum

Praktikum
10. – 15.3.08, ganztägig,
Vorbesprechung 7.2.2008, 12:30, Kl. Hörsaal
Isolierung von Pflanzeninhaltsstoffen
Selbständiges Arbeiten nach Vorschrift (Anleitung, Bücher)
Seminare jeweils Freitags
H. Scheer
Lehrbücher zur Phytochemie

Klassische Biochemie Lehrbücher (Stryer, Voeth & Voeth, Lehninger)

Heldt: Pflanzenbiochemie, Spektrum Verlag (2003)

Richter: Biochemie der Pflanzen, Thieme, Stuttgart (2002)

Buchanan, Gruissem & Jones (2000). Biochemistry and Molecular
Biology of Plants. Amer. Soc. Plant Physiol. Rockville, Md.
H. Scheer
Wichtige Stoffklassen
Tetrapyrrole
Isoprenoide
Terpene
Carotinoide
Sterole
Gibberelline
Polyprenoide
Phenylpropanoide
Flavonoide
Stilbenoide
Monolignole
Alkaloide
150
>22.000
>5.000
>10.000
H. Scheer
http://www.expasy.ch/cgi-bin/search-biochem-index
H. Scheer
Anaplerotic reactions
H. Scheer
Aminosäure Biosynthesen - Übersicht
H-C=O
H2-C-NH2
COOH
Glyoxylat
Gly
CH3
CH3
C=O
H-C-NH2
COOH
Pyruvat
Ser, Cys, Trp
COOH
+ Ery-4-P
COOH
COOH
CH2
CH2
C=O
H-C-NH2
Oxalacetat
His
Asn, Lys, Homocystein, Met, Thr, Ile
Asp
COOH
CH2
CH2
CH2
CH2
C=O
H-C-NH2
Ketoglutarat
PRPP
COOH
COOH
COOH
Phe, Tyr, Trp
Ala
COOH
COOH
Val, Leu
Gln, Pro, Ornithin, Arg, Lys, Tetrapyrrole
COOH
Glu
H. Scheer
Tetrapyrrole
-Strukturen
-Cyclische Tetrapyrrole
-Lineare Tetrapyrrole
-Funktionen
-Fe – Tetrapyrrole
-Redoxreaktionen
-O2 –Transport
-Oxigenierungen
-Mg – Tetrapyrrole
-Lichtsammlung
-Energietransduktion
-Redoxreaktionen
-Co – Tetrapyrrole
- C – Gerüstumlagerungen
-Methylierungen
-Ni – Tetrapyrrole
-Biosynthese
- Methan-Bildung
- -Aminolävulinsäure
- Protoporphyrin IX
- Modifikationen und Metallierungen
- Ringöffnung
-Abbau
- Ringöffnung
- Folgereaktionen
-Spektroskopie
H. Scheer
Häm-Typen: I
Cys (Apoprotein)
S
HO
H
N
N
N
Fe
N
N
N
Fe
N
N
N
S Cys (Apoprotein)
Fe
N
N
N
H
O
COO-
COO-
Häm A
(Cytochrom a)
Endoxidase
Atmungskette
COO-
COO-
Häm
(Cytochrom b)
Hämoglobin
Peroxidasen
Cytochrom P450
COOCOOHäm-bis-Thioether
(Cytochrom c, f)
Cytochrom c
Cytochrom f
H. Scheer
Häm-Typen: II
COOH
COOH
HOOC
N
COOH
N
N
Fe
N
Fe
N
N
OH
OH
HOOC
COO-
N
COOHäm D
Nitrit – Reduktase
(1 e- - Reduktion zu NO)
N
HOOC
COOH
COOCOOSiro-Häm
Sulfit – Reduktase
Nitrit – Reduktase
(6 e- - Reduktion zu NH3)
H. Scheer
Chlorophylle vom Porphyrin – Typ (Chl c)
R1
R2
N
N
N
N
Mg
N
Mg
N
H
COOR3
N
COOCH3
O
N
H
COOCH3
O
O
O
Pigment
Chl(ide) c1
Chl(ide) c2
Chl(ide) c3
PChl(ide) a
[8-Vinyl]-PChl(ide) a
R1
CH3
CH3
COOCH3
CH3
CH3
R2
Remarks
C2H5
1
C2H3
1
C2H3/5
1,4
C2H5
2
C2H3 1,2,3
HO
O
OH
O
O
O
O
OH
O
H. Scheer
Absorptionsspektren der Chlorophylle
H. Scheer
R1
R2
3
2
Chlorophylle
vom Chlorin – Typ:
A
1
5
21
6
22
N
20
9
N
10
N
D 16
18
H
24
N
11
23
14
15
17
R3
8
B
Mg
19
Oxygene Photosynthese
7
4
C
13
E
13
H
R4
COOR6
2
1
13
O
R5
Phytyl =
Pigment
Chl a
Chl a'
Chlid a
Chl b
Chl d
[8-Vinyl]-Chl a
82-OH-Chl a
Phe a
R1
C2H3
C2H3
C2H3
C2H3
CHO
C2H3
C2H3
C2H3
R2
R3
R4
R5
CH3
C2H5
H
COOCH3
CH3
C2H5
COOCH3
H
CH3
C2H5
H
COOCH3
CHO
C2H5
H
COOCH3
CH3
C2H5
H
COOCH3
CH3
C2H3
H
COOCH3
CH3 C2H4-OH
H
COOCH3
CH3
C2H5
H H. Scheer
COOCH3
R6
Phy
Phy
H
Phy
Phy
Phy
Phy
Phy
OH
Chlorophylle
vom Chlorin – Typ:
R1
*
R2
N
Anoxygene
Photosynthese
(Grüne Bakterien)
R5
N
Mg
N
N
R3
H
H
O
COOR4
Pigment
BChl c
BChl d
BChl e
R1
R2
CH3 et,pr,ib,np
CH3 et,pr,ib,np
CHO et,pr,ib,np
R3
me,et
me,et
me,et
R4
Farn,18:0,many others
Farn,18:0,many others
Farn,18:0,many others
H. Scheer
R5
CH3
H
CH3
R1
Chlorophylle vom
Bakteriochlorin – Typ:
H
R3
R2
N
Anoxygene
Photosynthese
N
M
N
N
H
H
H
COOR4
Pigment
BChl a
BChl b
BChl g
R1
COCH3
COCH3
C2H3
COOCH3
R2
O
R3
H
CH3
=CH-CH3
=CH-CH3
R4
variable
variable
variable
As a rule, M = Mg, in Acidiphilium rubrum M = Zn
H. Scheer
Andere Metallo – Tetrapyrrole
O
HOOC
CONH2
N
H
H2NOC
H2NOC
N
COOH
H2NOC
CONH2
N
N
Ni+
N
H
HOOC
Co+
N
H
N
COOH
H
R N
N
N
O
Ni-F430
N
HO
H2NOC
O
CO
COOH
OH
O
CO NH
PO2
CONH2
Cobalamin (Vitamin B12)
(R = 5'-desoxyadenosyl)
Methyl-CoM - Reduktase
Methyltransferasen, Isomerasen
(z.B. Methyl-Malonyl-CoA Succinyl-CoA)
H. Scheer
Andere cyclische Tetrapyrrole I
O
CH3COO
H
O
HO
H
O
H
N
N
HN
OCOCH3
NH
Zn
OH
H
N
N
N
N
O
H
O
H
H
COOR
Tolyporphine
Cyanobakterien (Tolypothrix)
(Schutzpigmente ?)
COOCH3
O
Zn-BChl a
Purpurbakterien (Acidiphilium)
Photosynthese
H. Scheer
Andere cyclische Tetrapyrrole II
• Tunichlorine: Ni – Chlorine, wahrscheinlich Schutzpigmente
(Tunicaten)
• Bonnelin:
Pyropheophorbid – Derivat,
geschlechtsbetimmend
(Bonella viridis, mariner Wurm)
• Namenlos:
Pyropheophorbid – Derivat,
Sehpigment in Tiefseefisch
Melanocosteus niger
H. Scheer
Lineare Tetrapyrrole
H
OO
18
17
16
OO
3
4
HN
NH
H
OO
3
2
1
19
H
2
3
1
15
NH
HN
NH
N
H
NH
HN
NH
N
5
14
NH
11
13
12
N
6
7
9
10
8
COOH
COOH
COOH
COOH
Phycicyanobilin (PCB)
COOH
COOH
Phytochromobilin (PB)
Phycoerythrobilin (PEB)
Type 1 chromophores: 3-ethylidene group
OO
OO
OO
NH
HN
NH
HN
NH
N
NH
N
COOH
COOH
COOH
Biliverdin (BV)
H
H
NH
HN
NH
N
H
COOH
COOH
Phycoviolobilin (PVB)
Type 2 chromophores (some hypothetical): 3-vinyl group
COOH
Phycourobilin (PUB)
H. Scheer
Biosynthese der Tetrapyrrole - Übersicht
COOH
NH2
COOH
(1)
COOH
COOH
C5-Pathway
HOOC
Glutamic acid
(3)
2x, - 2H2O
NH
COOH
COOH
(2)
NH2
NH2
Porphobilinogen
O
+
C4+1-Pathway
NH2
COOH
5-Aminolev ulinic acid
4x
(4)
Succinic acid
Gly cin
- 3 NH3
COOH
COOH
COOH
COOH
HOOC
HOOC
3
COOH
NH
HO
NH
NH
HN
HN
HN
NH
(6)
(7)
- 6 CO2
Oxidation
NH
HN
10
N
19
COOH
HOOC
8
N
20
18
HOOC
B
9
NH
(5)
HN
6
1
HN
Cyclization, ring rotation, - H2O
NH
7
5
A 4
2
COOH
C
D
17
COOH
HN
11
14
16
12
13
15
HOOC
COOH
Hy droxy methy l-Bilan
COOH
COOH
Uroporphy rinogen III
COOH
COOH
Protoporphy rinogen IX
COOH
COOH
Protoporphy rin IX
Fe
Siroheme, F430, Vitamin B12
Mg
Hem e s
Chlorophylls
- Fe
CO
- Mg
Bilins
H. Scheer
C5-Weg der ALA - Synthese
a)
b)
NH2
N
tRNA
CH2
N
N
N
OH
N
CH2
O
O
H
NADPH
OH
N
N
H
O
H2N
NADP+
O
N
H2N
PLP/PMP
OH
O
O
O
GluTR
GSAM
H2N
H2N
tRNAGlu
COOH
COOH
COOH
glutamyl-tRNA
COOH
GSA
ALA
glutamycin
(aus Jahn, 2003)
H. Scheer
N
N
Komplex der tRNAGlu mit:
Glu-tRNA-Synthetase (GluRS)
Glu-tRNA-Reduktase (GluTR)
tRNAGlu
tRNAGlu
a
b
as
as
2
n
2
d
d
acs
1
3
ac
4
g
acs
ac
1
s
GluRS
5
as: Aminosäure-Bindungsstelle
ac: Anticodon
acs: Anticodon Stamm
3
GluTR
g Glutamycin
(aus Jahn, 2003)
n: NADPH-Bindungsstelle
s: Rückgrat Helix
H. Scheer
Jahn et al, Fig. 4: Glu-tRNA-Reduktase
aus Methanopyrus kandleri
Glu-tRNA-Reduktase
aus Methanopyrus
kandleri
a
n
g
s
1
3
2
2
3
s
1
g
n
b
n
n
s
s
2
2
g
g: Glutamycin
n: NADPH
s: Rückgrat Helix
g
1
1
3
3
(aus Jahn, 2003)
H. Scheer
ALA
C5-Weg:
a
ALA-Synthese
(C -Weg):
Modell für
Modell
für
Substrate Channeling
Substrate Channeling
GSAM
tRNAGlu
5
Glu-Semialdehyd2,1-Aminomutase
(grau/weiss)
GluTR
Glu-tRNA-Reduktase
(grün/gelb)
GluTR
Glu-tRNA (blau)
GSAM
b
tRNAGlu
GluTR
GluTR
(aus Jahn, 2003)
tRNAGlu
GSAM
H. Scheer
5-Aminolevulinsäure und Porphobilinogen
COOH
H2N
COOH
C5 - Pathway
COOH
COOH
G ul a
tm a e
t
- m ni o el vu lni a e
t
O 5A
COOH
D e h yd ra a
t se
COOH
+
NH2
G yl c ni e
COOH
2 x A LA , - 2 H O
2
C4 + C1 - Pathway
NH2
HN
NH2
COOH
S u c c ni a e
t
5A
- m ni o el vu lni a e
t A
( LA )
P o rp ho b ilni o g e n P
( BG )
H. Scheer
Von Porphobilinogen zum Corpoporphyrinogen III
COOH
COOH
COOH
COOH
COOH
COOH
COOH
HOOC
COOH
B
A
NH
NH
HN
HN
NH
Hydroxymethylbilane I Synthase
Hydroxymethylbilane I
Synthase
HN
D
4 x PBG, - 4 NH3
NH
HN
NH
HN
COOH
HO
COOH
Enzyme-Cys
B
A
COOH
C
COOH
HOOC
D
C
HOOC
HOOC
COOH
HOOC
COOH
COOH
Enzyme-bound hexapyrrole intermediate
Hydroxymethylbilane I
COOH
COOH
COOH
COOH
HOOC
HOOC
NH
Uroporphyrinogen III Synthase
HN
HN
HN
COOH
NH
HN
NH
HN
COOH
Hemes, Chls, BChls
Uroporphyrinogen III
Decarboxylase
+
COOH
COOH
COOH
HOOC
COOH
COOH
COOH
HOOC
Spiro-intermediate
Uroporphyrinogen III
Siroheme, F430, Vitamin B12
H. Scheer
13C
– Markierung Chl a
20
10 5
14 16 4 9
15
H. Scheer
13C–13C
– Kopplungen in Chl a
COOCH2
CH2
C=O
Chl a
CH2
C-20
NH2
C-5
C-10
C-14
C-16
C-9
C-15
C-4
 [ppm]
H. Scheer
Vom Coproporphyrinogen III zum Protoporphyrin IX
COOH
COOH
COOH
HOOC
NH
HN
NH
HN
HOOC
COOH
- 4 CO2
Uroporphyrinogen III
Decarboxylase
HN
NH
HN
COOH
COOH
COOH
COOH
COOH
Uroporphyrinogen III
+ O2
NH
- 4 CO2, - 2 H2O
Coproporphyrinogen III
+1.5 O2
Coproporphyrinogen III
Oxidase
COOH
NH
HN
NH
HN
COOH
Protoporphyrinogen IX
COOH
- 3 H2O
NH
Protoporphyrinogen IX
Oxidase
N
COOH
N
HN
COOH
Protoporphyrin IX
H. Scheer
F. Meyer-Betz : Ein Selbstversuch (1912)
Schwellungen nach intravenöser Injektion von 0,2 Gramm Hämatoporphyrin
(einem Verwandten des Chlorophylls und des Blutfarbstoffs) und anschließendem
Aussetzen ans Sonnenlicht. Dr. Meyer-Betz, der diesen Selbstversuch am 14.10.1912
durchgeführt hatte, war noch Anfang Dezember Lichtempfindlich, erst im Frühjahr
1913 war er wieder völlig desensibilisiert.
H.H.Scheer,
Scheer 9/05
Porphyrie: Die königliche Krankheit
Georg III
(1738 – 1820)
König Georg III von England und König Friedrich Wilhelm I von Peußen litten unter
Porphyrie, bei der der Stoffwechsel des Blutfarbstoffs gestört ist. Durch die
angehäuften Porphyrine werden die Patienten lichtempfindlich, sie führt außerdem zu
schweren Störungen im Gehirn. Ihre Krankheit war genetisch bedingt und lässt sich
über mehrere Generationen verfolgen.
Auch bei Graf Dracula wird eine Porphyrie als Ursache der Lichtscheu und des
Blutbedarfs vermutet
H. Scheer, 9/05
H. Scheer
Porphyrie: Ursachen
Porphyrien können genetisch bedingt sein, oder durch Umwelteinflüsse hervor
gerufen (z.B. Schwermetalle). Sie können auch dadurch verstärkt werden. So
nimmt man an, dass die Krankheit bei Georg III besonders schwer war, weil er
mit (Arsen-haltigem) Antimon behandelt wurde.
Der Münchener Porphyriker Petri hat jahrelang seinen rotweinfarbenen Urin (rechts
im Glas) der Arbeitsgruppe von Prof. Hans Fischer zur Verfügung gestellt, und damit
zur Strukturaufklärung des Blutfarbstoffs beigetragen.
H. Scheer, 9/05
H. Scheer
Vom Protoporphyrin IX zu Proto-Häm und Chlorophyll a
Mg++, ATP
NH
ADP, Pi
SAM
N
N
SAH
N
N
Mg
Mg
N
HN
Mg-Chelatase
N
SAM:Mg-Protoporphyrin IX
Methyltransferase
N
O
COOH
COOH
Protoporphyrin IX
COOH
N
Mg-Protoporphyrin IX
N
2
and /o r
COOH
N
COOH
N AD P H
/ O
2
HO
2
COOCH3
Mg-Protoporphyrin IX Monomethylester
and /o r
NADPH
M g -P ro o
t po rphy rni X
I
M onom e h
t y el s e
t rC yc al se
Fe-Chelatase
NADPH
N
NADP
N
N
Mg
N
N
COOH
Fe
N
Mg
8-Vinyl-Reductase
N
N
H
N
O
COOCH3
N
COOH
N
H
O
COOCH3
N
[8-Vinyl]-Protochlorophyllide a
COOH
Protochlorophyllide a
COOH
Fe-Protoporphyrin IX
(Protoheme)
H. Scheer
Die verschiedenen Chlorophylle
(8)
3
7
5
A 4
2
6
B
8
1
9
NH
Porphyrine
(ungesättigt)
N
N
20
N
19
18
HN
C
D
17
a) Mg-insertion (9)
b) Methylation by SAM (10)
11
N
N
N
Mg
Cyclization (11)
N
N
Mg
Dehydrogenation
N
N
N
N
+ other modifications
N
12
14
16
N
Mg
10
13
15
COOH
COOH
COOH
Mg-Protoporphyrin IX-133-mme
Protoporphy rin IX
H COOCH O
3
COOH
COOCH3
H COOCH O
3
COOH
PChlide a
Chlide c2 + other c-type chlorophyll(ide)s
a) Hydrogenation ring D (12, 13)
Hydrogenation 8-vinyl (14)
Hydrogenation 8-vinyl (14)
Hydrogenation ring D (13)
b) Esterification (GGPP, Fig.8) (15)
Hydrogenation of alcohol (16)
Hydratation 3-vinyl group
HO
H
HO
R
R
Chlorine
(Dihydro)
N
R
N
N
?
Mg
N
N
Several reactions
N
N
H
N
Mg
N
N
H
H
H H
O
N
H COOCH O
3
COOR
[3-Hydroxyethyl]-Chlide a
N
Reduction (18)
N
N
H
H
H
COOH
BChls c, d, e
N
Oxygenation (17)
Mg
H
H
COOR
N
Mg
H COOCH O
3
Chl a (+ BChl g?)
COOR
H COOCH O
3
Chl b
a) Hydrogenation ring B (13a)
b) Esterification (GGPP, Fig.8) (14)
Hydrogenation of alcohol (16)
O
H
H
Bacteriochlorine
(Tetrahydro)
N
N
Mg
N
N
H
H
H COOCH O
3
COOR
H
BChl
a (+ b, g ?)
H. Scheer
O
Absorptionsspektren der Chlorophylle
H. Scheer
Fe
OO
NH
OO
HN
H
NH
HN
NH
N
Fd
He m e
NH
Heme-Oxygenase
N
PEB-Oxidoreductase
Biliverdin-15,16-hydrogenase
CO
CO
Heme-Oxigenase
COOH
COOH
COOH
COOH
Biliverdin
15,16-Dihydrobiliverdin
Apoproteins
Ancient Phytochrom es
PCB-Oxidoreductase
PcyA
H
OO
NH
HN
NH
N
Apoproteins
PC, PEC, APC, Phytochrom es
Phycobilin-Lyasen
CpcE, F, S,T,U,V
Vom Häm zu den
Gallenfarbstoffen
und Biliproteinen
COOH
COOH
3E-PCB
3E-PB
H. Scheer
Photosynthetische Einheit
H. Scheer
Phytochrom
H. Scheer
Insektenbiline
H. Scheer
Conformation
and charge
control
absorption
H. Scheer
Cys
Cys
S
S
Cys
H
H
H
S
D
O
A
H
N
H
N
N
H
N
C
B
H
H
H
O
O
H
N
H
N
O
N
H
N
COO-
COO-
H
COO-
COO-
31(,181-Di)-Cys - phycoerythrobilin
Phycocyanobilin - adduct
Phycobiline:
Nativ
Cys -  8 4
S
Cys
S
H
H
H
H
O
O
H
N
H
N
N
H
N
COO-
31-Cys - phycoviolobilin
-
COO
O
Cys -  8 4
S
H
H
H
H
N
COO-
N
H
N
COO-
31(,181-Di)-Cys - phycourobilin
H. Scheer
O
NH
COOH
N
N
O
Non-fluorescent
COOH
HN
O
NH
COOH
N
NH
O
Fluorescent
COOH
HN
O
H. Scheer
Phycocyanin fluorescence
nativ
denatured
renatured
boarder
Conformational
mobility controls
fluorescence
H. Scheer
Spontaneous chromophore addition to PhyA from
Anabaena PCC7120
IQPHGV
H. Scheer
Chromophore ligation
Autocatalytic
84: faulty binding
ß84: faulty binding
ß155: unclear
Catalytic
E/F-type lyase
S/U/V lyases
T-lyase
H. Scheer
H
H
O
H
O
R
S
HN
(Cys-a84 specific)
H
HN
E/F – Type Lyases
+ RSH
(A)
HN
HN
Lyase-only type
PCB:-CPC - Lyase
-
-
COO
COO
(D)
1
5 = PCB
Isomerization
(C)
O
H
O
R
S
HN
HN
H
H
+ RSH
(B)
HN
PVB:a-PEC - Lyase
HN
-
COO
6 = PVB
Isomerising lyase
-
COO
2
H. Scheer
Isoprenoide: Übersicht
OH
GAP + Pyruvat
O
P
OH
HO
Deoxyxylulose - Weg (Plastiden, Bakterien)
PP
O
3 Acetyl-CoA
HOOC
O
PP
+
O
PP
PP
OH
HO
Terpene
O
Gerany l-py rophosphat
OH
Mevalonat - Weg (Tiere, Cytoplasma bei Pflanzen)
Beispielstrukturen
+ C5
HO
OH
PP
Steroide
Squalen
Sesquiterpene
O
2x
Farnesy l-py rophosphat
Beispielstrukturen
+ C5
Chlorophylle (Alkohol an C-173)
OH
O
C
CH3COO
O
OH
Beispielstrukturen
O
Carotinoide
PP
2x
O
Geranyl-gerany-pyrophosphat
Diterpene
+ 5 x C5
COOH
CHO
Beispielstrukturen
PP
Prenyl-Chinone
O
+ n x C5
P
O
Dolicholphosphat
+ n x C5
Kautschuk, Guttapercha
Übersicht Isoprenoide mit Beispiel-Strukturen der EndprodukteH.
Scheer
Isoprenoide.cdr (H. Scheer)
Isoprenoide höherer Pflanzen
Aus Heldt, Pflanzenbiochemie; Spektrum
H. ScheerVerlag
Dolicholphosphat
(aus Stryer, Biochemistry, 2002)
Cytoplasma
ER-Lumen
H. Scheer
Carotinoide: Endgruppen
H. Scheer
Einige Carotinoide
H. Scheer
Carotinoide: Spektroskopie II
H. Scheer
Carotinoide: Spektroskopie I
H. Scheer
Carotinoide: Spektroskopie III
H. Scheer
Alternative Wege zum IPP
2 NADPH
O
O
2x
S-CoA
OH
O
Acetyl-CoA-Transferase
OH
S-CoA
COOH
Acetyl-CoA
Acetoacetyl-CoA
OH
O
S-CoA
CoA-SH
2 ATP
OH
CoA-SH
+ 2 NADP
3-Hydroxy-3-methyl-glutaryl-CoA
HMG-CoA-Synthase
O-PP
COOH
Mevalonat
HMG-CoA-Reduktase
2 ADP
COOH
Mevalonyl-pyrophosphat
Mevalonat-Kinase
P-Mevalonat-Kinase
Diphosphomevalonat
-Decarboxylase
Mevalonat - Weg
Pflanzen: Cytosol
(Wirbel)tiere
Streptomyces
O-PP
Isopentenyl-pyrophosphat
Fe4S4
CH3
O
COOH
P-O
CHO
GAP
CH2OH
HO
TPP
H3C
OH
CO2
Pyruvat
CTP, ATP
O
OH
+
NADPH
CH2O-P
OH
H3C
OH
NADP
1-Deoxyxylulose-5-P
Deoxyxylulose-5-P-Synthetase
CH2OH
CH2O-P
O-P
H3C
OH
PPi, ADP
2-Methyl-erythritol-4-P
Dox-5-P-Reduktase-Isomerase
CH2OH
Synthase
CH2O-CDP
O P
OH O
CMP
CDP-MEP
O P
cyclo-MEPP
Cyclase
Deoxy-xylulose - Weg
Pflanzen: Plastide
Cyanobakterien
Eubakterien (E. coli, B. subtilis)
Streptomyces
Protozoen, Plasmodium
H. Scheer
Inhibitor des Mevalonat - Wegs
2 NADPH
OH
OH
O
S-CoA
COOH
OH
CoA-SH
+ 2 NADP
3-Hydroxy-3-methyl-glutaryl-CoA
COOH
Mevalonat
HMG-CoA-Reduktase
HO
COOH
OH
Mevinolin (aus Aspergillus terreus)
H. Scheer
Mevalonat- und Deoxyxylulose-Weg:
Markierungen aus Glucose
GAP
Pyr
Acetyl-CoA
Mevalonat - Weg
Acetyl-CoA
Deoxyxylulose- Weg
Pyr
GAP
H. Scheer
Aus Eisenreich
et al., 2004
Abschätzung von Markierungsraten aus 1-13C-Glc
Leu-C2 stammt aus Acetyl-CoA
Val-C4 stammt aus Hydroxyethyl-TPP (= Pyruvat)
Tyr-C3 stammt aus Pyruvat und GAP
H. Scheer
Aus Eisenreich
et al., 2004
Markierungsvergleich
Aus Eisenreich
et al., 2004
H. Scheer
Produkte des Deoxyxylulose-Wegs (1)
Aus Eisenreich
et al., 2004
H. Scheer
Produkte des Deoxyxylulose-Wegs (2)
Aus Eisenreich
et al., 2004
H. Scheer
Phylogenie der Isoprenoid-Biosynthesewege
Deoxy-Xylulose-Weg
Archaea
Bakterien
+
Aquifales
Chlamydien
Cyanobakterien
B. subtilis
Deinococcus
Staphylococcus
Streptomyces
E. coli
Borrelia
Listeria
+
+
+
+
+
+
+
+
+
Tiere
+
+
+
Pflanzen
+ (Plastid)
Hefen
Protozoen
Mevalonat-Weg
+
+
Plasmodium
+
H. Scheer
2C-Methyl-D-erythritol4-phosphat-synthase
als Antimalaria-Target
NADPH
Fosmidomycin
Inhibitoren
NADP
FR 900098
H. Scheer
Analyse von
Gerüstumlagerungen
Aus Eisenreich
et al., 2004
H. Scheer
Kettenverlängerung
OPP
H H
OPP
OPP
Kopf-Schwanz-Kondensation
H. Scheer
Symmetrische Kondensation
+
OPP
R
R
R
R
OPP
OPP
PPi-
HPPi
R
H- (NADPH)
R
R
Kopf-Kopf-Kondensation
R
R = C5: Squalen
R = C10: Phytoen
R
R
H. Scheer
Squalenepoxid-Mutase
Squalen-2,3-Epoxid
Lanosterin
H. Scheer
2x
2 x IPP
DMAPP
OPP
Diapophytoene synthase
Heliobacteria
Aerobics
Farnesyl-pyrophosphate
Diaponeurosporene
Diapophytoene
Aerobics
IPP
O
2x
RO
Phytoene synthase
OPP
Glc
O
O
Glc
OR
O
Phytoene
C30 - Carotenoids
Geranylgeranyl-pyrophosphate
Phytoene desaturase
O
CH3O
Neurosporene
CH3O
OCH3
Okenone
Chromatiaceae
Aerobics
Rhodospirillaceae
Ectothiorhodospiraceae
Chromatiaceae
Rhodospirillaceae
Spirilloxanthin
H3CO
Rhodospirillaceae
Chromatiaceae
Rhodospirillaceae
Aerobics
Lycopene
O
Chlorobiaceae
Chloroflexaceae
Spheroidenone
Green Plants
Algae
Chloroflexaceae
-cyclase
Isoreniaretene
OH
CHO
-Carotene
-cyclase
Algae
Green plants
Chloroflexaceae
Cyanobacteria
Prochlorophytes
Green plants
Algae
Aerobics
Thiocapsa
(Chromatiaceae)
-cyclase
HO
13-cis-Rhodopinal
OH
-Carotene
HO
Lutein
Algae
Green plants
Cyanobacteria
Prochlorophytes
OH
O
Carotinoide
O
HO
Violaxanthin
Algae
OH
O
C
CH3COO
O
OH
Peridinin
O
H. Scheer
H. Scheer
COOH
Shikimatweg
O
H
O
COOH
OH
Pi
H2O
HO
O
OP
OH
OH
O
H
H
OH
OH
OH
OH
OH
(NAD)
COOH
OH
H
COOH
H
CH2OP
CH2OP
Ery-4-P
PEP
COOH
3-Dehydro-chinat
7P-2-Dehydro-3-deoxyD-arabino-heptulosonat
NADH
COOH
Pi
H
H
H
H
O
COOH
OH
COOH
COOH
OH
H
O -(1-carboxyvinyl)3-P-schikimat
HO OH
ATP
OH
H
PEP
5
H
Schikimat-5-P
CO2, H2O
H
H
PO OH
OH
H
Chorismat
H
H
PO O
FMN/NADH
3-Dehydro-schikimat
Glu
COOH
Schikimat
KG
COOH
COOH
OH
O
O
NH2
COOH
Prephenat
Phenylpyruvat
H
Phenylalanin
COOH
OH
O
COOH
Arogenat
H. Scheer
COOH
Phenylpropanoide in Pflanzen
Aus G. Michal:
Biochemical
Pathways,
Wiley, 1999
H. Scheer
Lignin
Aus D.E.Metzler:
Biochemistry
Academic Press, 2003
H. Scheer
Einige Stilbene und Flavonoide
HO
4'
HO
5'
3'
H
O
OH
HO
HO 2'
+
8
O
1'
7
2
3
O
HO
*
HO
RhaGlc
OH
Pinosylvin
O
Rutin (Quercetin Glykosid)
(Antioxidant (Radikalfänger), bakterizid, viruzid)
Stilben
4
6
5
*: gly kosiliert in Anthocy anen
OH
OH
* OH
Cyanidin; Dephinidin (5'-OH); Petunidin (3'-OCH3, 5'-0H)
Peonidin (3'-OCH3); Malvidin (3',5'-OCH3); Pelargonidin (3'-H)
(Blütenfarbstoffe)
Flavonol
Anthocyani(di)ne
HO
CH3O
HO
OH
O
O
HO
O
OH
Phlorhizin
(Nierengift)
Chalcon
GlcRha
O
OH
Hesperidin
(Antioxidant, Radikalfänger)
Flavon
H. Scheer
pH-Effekt bei Anthocyanen
HO
HO
O
OH
+
O
O
OH
OH
O
HO
HO
OH
HO
HO
HO
HO
OH
OH
pH >3
OH
pH 4-5
pH 6-7
HO
O
OH
O
OH
-
HO
O
O
HO
HO
HO
OH
OH
pH >8
pH 7-8
H. Scheer
Metallkomplexe von Anthocyanen
Aus Wikipedia
H. Scheer
Wikipedia Abbildung von User Chris 73, frei verfügbar unter http://commons.wikimedia.orf/wiki/image:Urakuen_tea_garden_03.jpg under thze creative commons ccby-sa2.5 licenceschriftfarbe
H. Scheer
Funktionen
•
Lichtschutz
Flavonoide
a) Passiv
b) Aktiv
•
Lock-Pigmente
Anthocyane
Blütenfarben
•
Abwehr
a) Bakterizide, Fungizide, Viruzide
Lignane (a,b)
b) Fraßgifte
Stilbene (a)
c) Schlechter Geschmack
Cumarine (a,b,d) d) Phototoxizität
Flavonoide (a) (z.B. Hemmung Mitose, PDase, Atmung, Störung
Tannine (a,b)
des Hormonhaushalts, Proteinbindung)
•
Festigung
Lignin
Druckstabile Strukturen, zusammen mit
zugstabiler Cellulose Verbundwerkstoff
•
Sperrschichten
Suberin, Cutin
Gas- und Wasser-undurchlässig
UV- und Blau-Absorption
Quencher von Radikalen (wasserlöslich)
H. Scheer
Modularer Aufbau von Polyketiden: II
Polyketid-Synthese
O
Kette
S-CoA
O
O
O
O
OH
O
O
O
HOOC
S-CoA
R
S-CoA
CO2
R
Kette
S-CoA
R
R
Ketoacyl-Synthase
S-CoA
R
S-CoA
R
S-CoA
R
Ketoreductase
Dehydratase
Reductase
Fettsäure-Synthese
H. Scheer
Modularer Aufbau von Polyketiden: 1
Aus D.E.Metzler:
Biochemistry
Academic Press, 2003
AT: Acyltransferase
ACP: Acyl-carrier
KS: KetoacylSynthase
KR: Ketoreductase
DH: Dehydratase
ER: Enoylreductase
TE: Thioesterase
H. Scheer
Polyketide: Urushiol
Aus D.E.Metzler:
Biochemistry
Academic Press, 2003
H. Scheer
Polyketide: Diverse
Aus D.E.Metzler:
Biochemistry
Academic Press, 2003
H. Scheer
Polyketide: Tetracyclin
Aus D.E.Metzler:
Biochemistry
Academic Press, 2003
H. Scheer
Polyketide: Griseofulvin
Aus D.E.Metzler:
Biochemistry
Academic Press, 2003
H. Scheer
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