Chemie für Biologen WS 2005/6 Arne Lützen Institut für Organische Chemie der Universität Duisburg-Essen (Teil 13: Chiralität, Naturstoffe) Chiralität bedeutet Händigkeit chiral (griechisch cheir – Hand bzw. Händigkeit) Chirale Objekte sind mit ihrem Spiegelbild nicht deckungsgleich. Beispiele: Hände, Handschuhe, Schuhe, Füße, Beine, Schrauben, Korkenzieher, Schneckengehäuse, Hirschgeweihe, Spiralnebel, ... Dieses Phänomen tritt auch bei einigen Konfigurations- oder Stereoisomeren auf. Beispiele für Stereoisomere H3C CH 2 CH CH 3 Cl 2-Chlorbutan H3C CH 2 H3C CH COOH OH Milchsäure - stereogenes Zentrum asymmetrisches C-Atom H H3C H H C C CH 3 Cl H3C Cl CH 2CH3 COOH COOH C C OH Bild HO H CH 3 Spiegelbild nicht deckungsgleiche Enantiomere Ein 1:1-Gemische der Enantiomere heißt auch racemisches Gemisch oder Racemat. Unterscheidung von Enantiomeren Enantiomere sind trennbare, stabile Verbindungen. Sie sind nur durch Umgruppierung von Bindungen ineinander überführbar. Sie besitzen die gleiche Konstitution. Sie zeigen gegenüber achiralen Reagenzien gleiche chemische Eigenschaften. Auch die meisten physikalischen Eigenschaften sind gleich (z.B. Dichte, Schmelzpunkt, Siedepunkt). Lediglich die Wechselwirkung mit polarisiertem Licht ist anders. Enantiomere besitzen für zirkular polarisiertes Licht unterschiedliche Brechungsindices. Sie drehen die Ebene von linear polarisiertem Licht. Chirale Verbindungen sind optisch aktiv. Racemate sind optisch inaktiv. Polarimeter Messung der spezifischen Drehung [α]D Messung mit der D-Linie des Natriums (ca. 589 nm) stereogenes C-Atom und Enantiomerenpaar Kleinste chirale Einheit: C-Atom mit vier verschiedenen Substituenten. Beispiel: 2-Iodbutan, Enantiomerenpaar a≠b≠c≠d Et a C b c d Spiegel a c d C b C H I Me Konfiguration: S-(+) Spezifische Drehung: [α]D: +15.9° Et H C I Me R-(−) −15.9° Bild und Spiegelbild sind nicht deckungsgleich. Moleküle mit einem Asymmetriezentrum sind chiral. Bezeichnung der Konfiguration: R,S-System Die Angabe des Drehsinns (+ oder −) reicht nicht, da zwischen Konfiguration und Drehsinn keine einfache Beziehung besteht. In vielen Fällen ist es wichtig, die Konfiguration zu kennen. Sie muss empirisch bestimmt werden! R,S-Nomenklatur, (Cahn, Ingold, Prelog, 1951ff), Beispiel Milchsäure: H3C 3 C HO 1 HO2C 2 1 4 H HO 1 C CO2H 2 4 H 2 CO2H CH3 3 1 4 H 4 H CH3 3 C OH C R-(_)-Milchsäure R = rectus (rechts) Blickrichtung OH 3 CH3 CO2H S-(+)-Milchsäure S = sinister (links) 2 Sequenzregeln für Substituenten ~ Ordnungszahl Die linksdrehende Milchsäure besitzt die R-Konfiguration. Die rechtsdrehende Milchsäure besitzt die S-Konfiguration. Bezeichnung der Konfiguration: D,L-System Neben der R,S-Nomenklatur verwendet man bei bestimmten Stoffklassen wie Aminosäuren, Hydroxysäuren und Zuckern die D,L-Nomenklatur (E. Fischer, 1891), Beispiel Milchsäure: HO H 3C CO2H H C CO2H H HO2C CH3 S-(+)-Milchsäure H OH D-(_)-Milchsäure D = dexter (rechts) CH3 CO2H CO2H H C OH CH3 R-(_)-Milchsäure HO C CO2H HO C H HO L-(+)-Milchsäure H L = laevus (links) CH3 CH3 Fischer-Projektion Moleküle mit mehreren stereogenen Zentren. Ein Beispiel CH3 5 Das Molekül besitzt 3 stereogene Kohlenstoffatome. Damit ergeben sich 23 = 8 Stereoisomere, oder 4 Enantiomerenpaare. * 1 * * 2 H3C OH CH3 C10H20O ein Terpenalkohol C-1 R S S R C-2 S R S R C-5 R R R R *)Systematischer Enantiomere besitzen an allen C* entgegengesetzte Konfiguration. Diastereomere, also Stereomere, die keine Enantiomere sind, werden häufig mit Trivialnamen unterschieden. Name (−)-Menthol*) (+)-Isomenthol (+)-Neomenthol (+)-Neoisomenthol C-1 S R R S C-2 R S R S C-5 S S S S Name (+)-Menthol (−)-Isomenthol (−)-Neomenthol (−)-Neoisomenthol Name: (1R,2S,5R)-2-Isopropyl-5-methylcyclohexanol Trennung von Enantiomeren Bei technischen und Laborsynthesen entstehen zumeist racemische Gemische, da man in einer achiralen Umgebung arbeitet. Est in einer chiralen Umgebung kann es zu einer selektiven Bildung einzelner Enantiomerer kommen, wie z. B. bei den meisten biochemischen Synthesen. Zur Trennung racemischer Gemische kann man vor allem vier Methoden anwenden: 1. Spontane Kristallisation als Konglomerat (Pasteur 1848) 2. Biochemische Spaltung (Pasteur 1858) COOH COOH Enzym HO C H CH3 (S)- C Milchsäuredehydrogenase O CH3 COOH Enzym H C OH CH3 (R)-Milchsäure Trennung von Enantiomeren 3. Bildung von Diastereomeren mit optisch aktivem Auxiliar (Pasteur 1858) (R)-P x (R)-A (R)-P + (R)-A (S)-P x (R)-A (S)-P Racemat Enantiomer des Diastereomere von P Auxiliars A Trennung durch Beispiel: Ph CH CH3 (2R,3R)-Weinsäure Salz Umkristallisieren NH 2 4. Chromatographie mittels chiraler stationärer Phase Konfiguration und physiologische Eigenschaft O O S H2 N NH 2 HO OH bitter Asparagin süß O H S O N N O n - C 4H 9 CH 3 H3C O C6H5 Barbitursäure-Derivat N C6H5 O n - C 4H 9 R narkotisch O O H O N O H N O Krampfanfall S R H NH 2 O O H2 N H H O N O N N H extrem teratogen H Contergan O R O keine Mißbildungen CH 3 CH 3 S R H3C CH 2 Geruch nach Zitrone H2C Limonen CH 3 Geruch nach Orange Wichtige Naturstoffe - Übersicht Aminosäuren, Peptide, Proteine Hormone, Enzyme, Synthesebausteine, Energiequelle (Nahrungsmittel) Gewebe, Fasern, Muskeln Medikamente, Antibiotika Alkaloide, biogene Amine N-haltige Verbindungen, meist pflanzlicher Herkunft, pharmakologisch wirksam, Medikamente, Genussmittel Kohlenhydrate Zucker, Cellulose, Stärke, Glykogen, Energiespeicher Synthesebausteine, Nahrungsmittel Nucleoside, Nucleotide, Nucleinsäuren DNA, RNA, Speicher der genetischen Information, Proteinbiosynthese Lipide (Fette, Wachse, Öle) Nahrungsmittel, Membranen, Rohstoffe für Detergentien, Kosmetika Terpene Pflanzlicher Herkunft, Duft- und Geschmackstoffe, Kosmetika Lacke, Farbstoffe, Vitamine, Pharmaka Steroide Hormone, Vitamine, biologische Regulatoren Pheromone Signalstoffe, Sexual-, Aggregations-, Erkennungspheromone, Alarmstoffe, Repellentien Porphyrine Farbstoffe, Vitamine D-Glucose, Traubenzucker 1 H C OH H OH HO H 1 O C H C O CHOH 4 CH2OH Aldohexosen H HO OH H H 6 CH2OH O HO H α-D-Glucopyranose 36 % 6CH2OH H H OH H OH 6 CH2OH < 0.01% D-Glucose, eines von 24 = 16 Stereoisomeren 1 OH OH HO OH 1 HO C H H HO H OH H O 6 O HO HO CH2OH O OH OH OH 1 6 CH2OH β-D-Glucopyranose 64 % (stabilste Form) H Cyclische Halbacetale: Pyranosen Gleichgewicht in wässriger Lösung. Glucose bildet zwei Pyranosen (Sechsringe) als cyclische Halbacetale. Beide sind isolierbar. β-Form = kristalliner Traubenzucker D-Fructose, Fruchtzucker 6 HOCH2 O 1 CH2OH CH2OH C O CHOH HO 3 CH2OH Ketohexosen (a) 2C O H 1 CH2OH H 2 HO + OH H OH O H H OH H OH (a) 6 CH2OH D-Fructose, eines von 23 = 8 Stereoisomeren OH (b) α-Fructofuranose 9% 6 (b) CH2OH 1 H H HO 2 OH OH H α-Fructopyranose 3% H β-Fructofuranose 31 % 6 O 1 CH2OH HO diese Form ist rein isolierbar, = kristalliner Fruchtzucker OH H 2 HO H (< 1 %) *)Nur 6 HOCH2 H + O OH 2 HO H CH2OH HO 1 OH H β-Fructopyranose*) 57 % Gleichgewicht in wässriger Lösung. Fructose bildet vier cyclische Halbketale, mit Fünfringen: Furanosen mit Sechsringen: Pyranosen D-Aldosen Die natürlich vorkommenden Aldosen und Ketosen besitzen die D-Konfiguration. CHO H OH CH2OH D-(+)-Glycerinaldehyd CHO H OH H OH CH2OH D-Erythrose H H H 1 CHO 2 OH OH OH CH2OH D-Ribose H H H H CHO CHO OH HO H OH H OH OH H OH OH H OH CH2OH CH2OH D-Allose D-Altrose HO H H CHO HO H H OH CH2OH D-Threose 1CHO 2 CHO H OH HO H H OH CH2OH D-Xylose H OH OH CH2OH D-Arabinose 1CHO 2 1CHO 2 H OH HO H 3 HO H HO H 4 H OH H OH H OH H OH CH2OH CH2OH D-Glucose D-Mannose H H HO H CHO HO H HO H H OH CH2OH D-Lyxose CHO CHO OH HO H OH H OH H HO H OH H OH CH2OH CH2OH D-Gulose D-Idose 1 CHO 2 H OH HO 3 HO H HO 4 HO H HO H OH H CH2OH CHO H H H OH CH2OH D-Galactose D-Talose Disaccharide: Maltose und Cellobiose (+)-Maltose, Malzzucker H CH 2OHH HO HO H CH 2OHH O H OH HH CH 2OHH H O α-glucosidische HO Verknüpfung + H 2O O Maltas e H (α-Sp altung) 2 HO HO H H OH H H OH H O OH α-D-Glucopyranose OH (+)-Cellobiose H 6´ 4´ CH 2 OHH 5´ HO HO 3´ O 2´ H OH H H 3 HO 1´ O 4 H H HO 2 5 H 6CH 2OH O H H β-glucosidische Verknüpfung 1 OH + H 2O H6 4 CH 2OHH 2 HO HO Emulsin (β-Spaltung) 5 3 2 O 1 OH H OH H H β-D-Glucopyranose Disaccharide: Lactose und Saccharose (+)-Lactose, Milchzucker HO CH 2OHH H HO H H HO 3 O HO O 4 H OH HO 6 4 CH 2OHH H 2 1 + H 2O OH 5 H 6CH 2OH O 3 O HO 1 OH + HO 2 H OH O 5 3 1 2 OH H OH H H H β-galaktosidisch H 5 H HO H6 4 CH 2OHH H H β-D-Galaktopyranose H β-D-Glucopyranose (+)-Saccharose, Rohrzucker, "Zucker" H 6´ 4´ CH 2OHH HO HO 5´ 3´ 2´ H OH H O Vollacetal H 1´ H OH 3 4 OH 6 CH 2 OH O H O 2 Vollketal 1 CH 2 OH 5 3´ HO 2´ 2 5 O 1´ O CH 2OH 1 OH HO HO 5 3 Invertase 2 OH O 1 H + HO H OH O 1 CH 2OH 5 6 CH 2OH H β-D-Fructofuranose Endwert in Wasser: [α]D = −92° 6 CH 2OH 4 OH 2 H OH H H 3 α-D-Glucopyranose [α]D = +66.5° OH 4 + H 2O H 6´ CH 2OH HO 3 HO 4´ 5´ O H6 4 CH 2OHH Invertzucker: Gemisch aus Glucose und Fructose Honig: teilweise hydrolysierte Saccharose (= Kunsthonig) Cellulose, ein Polysaccharid H H H β-glucosidisch H 4 CH 2 OHH CH 2OHH 3 H HO 1 O O 2 HO O O 1 O H HO 3 O 4 2 HO O CH 2OH H OH H OH H H H H H Die Glucose-Moleküle sind β-glucosidisch verknüpft. Cellulose wird also aus der stabilsten Form der Glucose aufgebaut. Cellulose ist der mengenmäßig wichtigste Naturstoff. Chitin, ein Polysaccharid H CH OH 2 4 H O HO H H H O HO 1O 4 β AcNH H H H H CH2OH AcNH β H HO 1 O 4 1 HO HO CH2OH H H β O AcNH H Die Glucosamin-Moleküle sind β-glucosidisch verknüpft. Es bildet sich ein 2-Acetamido-2-desoxy-D-glycan, oder kurz (β-1,4-GlcNAc)n . Stärke, ein Polysaccharid Amylose (20% der Stärke) H6 4 CH 2 OHH HO HO α-glucosidisch 1 3 HH 2 4 CH 2 OHH H OH O H O 1 HH HO 4 CH 2OHH H OH O H O 1 H n HO H OH H OH H linkshändige Helix-Struktur CH 2OHH O O H HO H H OH Amylopektin (80% der Stärke) CH 2OHH O H O O HH HO CH 2OHH Glykogen: "Reservekohlenhydrat" H OH O H O des tierischen Organismus besitzt H HO eine ähnliche Struktur H OH H O 5 O Zucker und Basen der Nucleinsäuren 1 CH=O H OH H OH H OH CH 2OH D-Ribose C5H10O5 1 CH=O 2 CH 2 H OH H OH CH 2OH 2-Desoxy-D-ribose C5H10O4 HOCH2 O OH H H 1 H H 2 OH OH β-D-Ribofuranose in RNA Pyrimidin-Derivate N N O H Cytosin (C) DNA RNA Purin-Derivate O NH 2 HOCH2 O OH H H 1 H H 2 OH H 2-Desoxy-β-D-ribofuranose in DNA H3C NH N H O Thymin (T) nur DNA O NH 2 O NH N O H Uracil (U) nur RNA N N H N N Adenin (A) DNA RNA N N H NH N NH 2 Guanin (G) DNA RNA Adenin: Spontane Bildung aus Cyanwasserstoff in der "Ursuppe": 5 × HCN → C5H5N5 Nucleotide der Desoxyribonucleinsäure (DNA) NH 2 N O HOPOCH2 O OH O N O HOPOCH2 O OH N OH N N NH 2 N OH 2-Desoxyadenylsäure 2-Desoxyguanidylsäure O NH 2 O HOPOCH2 O OH H N N H3 C N N O OH 2-Desoxycytidylsäure O HOPOCH2 O OH N N H O OH 2-Desoxythymidylsäure Ausschnitt aus einer DNA-Kette - O P O T O H2C Base O H H H - G H O A C H O P O O H2 C Base O H H H T C G H O - A H O P O O H2C Base O H H H H O H Basenpaarung: Zwei komplementäre Stränge werden durch Wasserstoffbrückenbindungen zusammen gehalten. ⇒ Doppelhelix Komplementäre Basenpaare der DNA A G C T A C G A T C T C G A T G C T A G N N Zucker H N H O N H N N O CH 3 N Zucker T A Adenin-Thymin N N Zucker O H H N N H N N N H H O G C Guanin-Cytosin N Zucker Bei der Zellteilung wird zu jedem Einzelstrang der komplementäre neu synthetisiert, so dass jede Tochterzelle wieder die gleiche Doppelhelix wie die Mutterzelle besitzt. DNA-Modell nach Watson und Crick Nobelpreis 1962 für Medizin oder Physiologie. Genetischer Code Erste Base . U C A G Zweite Base U Phe Phe Leu Leu Leu Leu Leu Leu Ile Ile Ile Met (Start) Val Val Val Val C Ser Ser Ser Ser Pro Pro Pro Pro Thr Thr Thr Thr Ala Ala Ala Ala A Tyr Tyr "Stop" "Stop" His His Gln Gln Asn Asn Lys Lys Asp Asp Glu Glu G Cys Cys "Stop" Trp Arg Arg Arg Arg Ser Ser Arg Arg Gly Gly Gly Gly Dritte Base . U C A G U C A G U C A G U C A G Jeweils drei Nucleotide (Tripletts) codieren eine Aminosäure, z. B. AUG ⇒ Met = Methionin. (Der Code ist entartet.) Triplett-Codons für die 20 wichtigsten proteinogenen L-Aminosäuren UGA kann auch die seltene Aminosäure L-Selenocystein codieren. UAG kann auch die seltene Aminosäure L-Pyrrolysin codieren Aminosäuren α O α-Aminosäuren R CH C Bausteine von Peptiden und Proteinen NH 2 OH β 3-Aminopropansäure, O α CH 2 CH 2 C β-Alanin, eine β-Aminosäure OH Baustein von Coenzym A NH 2 γ γ-Aminobuttersäure (GABA) β α O CH 2 CH 2 CH 2 C Neurotransmitter, Mangel führt zu OH epileptischen Anfällen NH 2 Aminosäuren sind difunktionelle Verbindungen. Sie besitzen eine basische und eine saure funktionelle Gruppe. O R CH C NH 2 OH unpolare Form: Gasphase O R CH C NH 3 O zwitterionische (normale) Form: in polarem Lösungsmittel Titrationskurve von Glycin Isoelektrischer Punkt: pH-Wert, bei dem die Aminosäure im elektrischen Feld nicht wandert. pI = ½ (pK1 + pK2) α-Aminosäuren, Beispiele Schema der Peptide-Synthese Amid- bzw. Peptid-Bindung O CH 2 C OH NH 2 Glycin CH 3 O + H2N CH C OH O CH 3 O CH 2 C NH CH C OH NH 2 H-Gly-Ala-OH - H 2O Alanin O O H3C CH C NH CH 2 C OH NH 2 Isomere Dipeptide H-Ala-Gly-OH SäureO H2N AminKomponente OH + H R1 O H N R2 O OH R2 H2N - H2O R1 N H OH O (4) Schützen (1) Aktivieren (2) Schützen (3) Schützen = Desaktivieren Die Synthese kann so gesteuert werden, dass nur eines der beiden Isomere entsteht. Aminosäuresequenz (Primärstruktur) – Beispiel Humaninsulin Insulin ist ein Hormon der Bauchspeicheldrüse und wirkt blutzuckersenkend. Es besteht aus zwei Peptidketten, der A-Kette aus 21 und der B-Kette aus 30 Aminosäuren, die durch Disulfidbrücken verknüpft sind. Struktur von Proteinen Faltblattstruktur zweier Polypeptidketten Wasserstoffbrücken-Bindungen sind als .... markiert. α-Helix einer Polypeptidkette WasserstoffbrückenBindungen sind als ....... markiert. Rechtsgängige α-Helix mit den Atomen, die das Rückrat der Peptidkette bilden Alkaloide (−)-Morphin, Morphium HO O H N CH3 HO F.W.A. Sertürner, Apotheker, isolierte das 1. Alkaloid Schlaf-Mohn, Papaver somniferum Die Bezeichnung "Alkaloide" wurde 1819 von dem Apotheker C. F. W. Meissner für "alkaliähnliche Pflanzenstoffe" geprägt. Morphin (isoliert 1804 bzw. 1816, Sertürner), Strychnin (1818), Coffein (1820), Chinin (1820), Nicotin (1828), Atropin (1831), Codein (1832), Theobromin (1842), Cocain (1862). Präparate aus Opium sind alte und auch heute noch wirkungsvolle Heilmittel. Sie wirken schmerzstillend, beruhigend und einschläfernd. Morphium setzt man bei starken Schmerzen ein. Suchtgefahr. Alkaloide Alkaloide - Definitionen „alkalisch reagierende Pflanzenstoffe“ (W. Meissner, 1819) „stickstoffhaltige, nicht-saure Verbindungen“ (C. J. Löwig, 1839) organische „stickstoffhaltige organische Verbindungen natürlichen Ursprungs mit mehr oder weniger ausgeprägtem basischen Charakter“ (M. Hesse, 2000) Heute sind über 10.000 verschiedene Alkaloide bekannt, die aus pflanzlichen und tierischen Organismen, Pilzen sowie aus Drogenmixturen von Naturvölkern isoliert wurden. Bis heute gibt es wegen der großen Strukturvielfalt kein einheitliches allgemeines Einteilungsprinzip. Natürliche Funktionen von Alkaloiden Alkaloide werden von den Lebewesen, die sie produzieren, vor allem für folgende Zwecke synthetisiert: - UV-Schutz - Siderophore (eisenbindende Stoffe) - Fungizide - Herbizide - Insektizide - Schutz vor anderen Fraßfeinden - Angriffsgifte - Pheromone (z. B. Lockstoffe) Alkaloide, Beispiele Alkaloid Vorkommen Wirkung, Verwendung Atropin Tollkirsche Augenheilkunde, Asthma Chinin Chinarinde Chemotherapie von Malaria, Bitterstoff in Getränken Cocain Coca-Strauch Lokalanästhesie, Rauschgift Codein Mohn LSD (Mutterkorn) Halluzinogen, Rauschgift Schmerz-, Hustenmittel Morphin Mohn Schmerzmittel, Rauschgift Nicotin Blutdrucksteigerung, Lähmung (lethale Dosis: 50 mg) Tabak Reserpin Rauwolfia Beruhigungsmittel Strychnin Brechnuss Rattengift Ausgewählte Alkaloide R2 H3C N R1 COOCH3 N 2 1 1 R = R2 = H : Strychnin 1 2 R = OCH3 , R = H : Brucin 1 R = H , R2 = OH : Pseudostrychnin H 1 R N H H O C 3 O Cocain O H O H C6H5 H3C CH2 CO C N(CH3)2 CH2 C6H5 R C H CH3 (_ )-(R)-Form : Levomethadon Racemat : Methadon Heroinsubstitut N H CH3 (S )-Form Coniin O 7 C R 6 N 8 CH 3 H 9 10 11 5 R = OH : Lysergsäure R = N(C 2H 5)2 : Lysergsäure-diethylamid H3C CH3 N N (LSD) 4 O 3 2 N H O 1 N CH3 Coffein N C6H5