INHALTSVERZEICHNIS 1.AllgemeineGrundlagen 2.Grundbegriffeorganisch-chemischerReaktionen 3.Stereochemie 4.Stoffgruppen 4.1.Alkane 4.2.Alkene,Alkine 4.3.AromatischeSysteme 4.4.Halogenkohlenwasserstoffe 4.5.Alkohole 4.6.Phenole 4.7.Amine 4.8.Carbonyle– Aldehyde,Ketone,(Chinone) 4.9.CarbonsäurenundDerivate 4.10.Heterocyclen EMPFOHLENESLEHRBUCH Latscha,Kazmaier,ChemiefürBiologen,3.Auflage,2008,SpringerVerlag 6 Biochemie LehrederchemischenVorgängeinLebewesen Biomolekulare Strukturen Stoffwechsel Informationsfluss inundzwischenOrganismen OrganischeChemie ChemiederKohlenstoffverbindungen Nomenklatur derVerbindungen Analytische OrganischeChemie z.B.Strukturaufklärung Reaktionen AnorganischeChemie Chemiederkohlenstoff-freienSubstanze,derKohlensäure, derBlausäureundSalzedieserSubstanzen Chemie derMetalle Komplexchemie Kristallographie 7 ZusammensetzungdesmenschlichenKörpers Element Massenanteilin% Sauerstoff(Element-Symbol:O) Kohlenstoff(Element-Symbol:C) Calcium(Element-Symbol:Ca) Natrium(Element-Symbol:Na) Kalium(Element-Symbol:K) Magnesium(Element-Symbol:Mg) Wasserstoff(Element-Symbol:H) Phosphor(Element-Symbol:P) Stickstoff(Element-Symbol:N) 65 19.5 1.5 0.2 0.4 0.1 9.5 0.2 3.3 Summe 99.7 Rest– Spurenelemente(Cu,Co,Cr,Fe,usw.) 8 WozubrauchenBiologenorganischeChemie? (1) Verständnis für Struktur und Funtkion von Biomolekülen (Proteine, Nukleinsäuren, Vitamine) (2) Reaktivitäten (à à Funktion) von Biomolekülen folgen Regeln der Organischen Chemie Protein VitaminC DNA Thiaminpyrophosphat VitaminB1 VitaminD2 9 DasEnzym- DNAPolymerase O O O O O O H H H H H H H H H H H +H N C C N C C N C C N C C N C C N C C O3 CH2 CH2 CH2 CH3 CH2 CH2 C O CH2 C O OH C O OH HN NH2 OH Hybridisierung, Funktionelle Gruppen Eigenschaften, Wechselwirkungen (fG), zwischen Säure-Base fG (z.B. Wasserstoff-Brücken), ... 10 DasEnzym- DNAPolymeraseunddiekatalysierteReaktion DNA O NH2 N O O O P OH O N N DNA O N NH2 DNA Polymerase N N O O O P OH O O O N O N NH2 OH + O O O HO P O P O P O OH OH OH N N N O O O P OH O N NH2 N N O O O P OH O NH N NH2 O O N N O O O N O NH2 NH O NH N O O O P OH O NH N O OH OH Verstehen von Funktion und Reaktivität von Biomolekülen à z.B. PCR (Polymerase Chain Reaction, Nobelpreis 1993) 11 1.AllgemeineGrundlagen 12 AufbauderMaterie ATOMKERN ATOMHÜLLE ProtonenundNeutronen Elektronen Massenzahl Ladungszahl ELEMENTSYMBOL Ordnungszahl zB: Fluor 19 0 F 9 Bohr‘schesAtommodell Ein chemisches Element ist durch die Anzahl der Protonen im Kern charakterisiert. Anzahl der Protonen = Kernladungszahl = Ordnungszahl. Ein chemisches Element ist elektrisch neutral. Anzahl Protonen = Anzahl Elektronen. Die Summe der Zahl der Protonen und Neutronen wird Nukleonenzahl bzw. Massenzahl genannt. Nukleonenzahl = Protonenzahl + Neutronenzahl Quantenmechanische Betrachtung Isotopen eines chemischen Elements unterscheiden sich durch die Anzahl von Neutronen, d.h. unterschiedliche Massenzahl aber gleiche Protonenzahl. Symbol LLadung Ruhemasse Elektron e- -1 (-e = - 1.60 x 10-19 C) me = 9.11 x 10-31 kg Proton p+ +1 (+e =+ 1.60 x 10-19 C) mp = 1.673 x 10-27 kg Neutron n0 0 mn = 1.675 x 10-27 kg Elementarteilchen 13 PeriodensystemderElemente 14 Atomorbitaltheorie(AO-Theorie) Einführung/Wiederholung: Zustände von Elektronen eines Atoms können mit einer sogenannten Wellenfunktionen (WF, Ψ) beschrieben werden. Von diesen WF Ψ kann die Energie der Elektronen (Schrödinger Gleichung HΨ = EΨ) abgeleitet werden. Die Aufenthaltswahrscheinlichkeit der Elektronen ergibt sich aus Ψ2 (à Atomorbitale). Wellenfunktionen Ψ, die Lösungen der Schrödinger Gleichung sind, heißen Eigenfunktionen. Die Energiewerte E, welche zu diesen Funktionen gehören, heißen Eigenwerte. WellenfunktionenΨn,l,m =f(n,l,m) n=1,2,3,...,∞(ganzeZahlen) Hauptquantenzahl l=0,1,2,...bisn-1 Nebenquantenzahl m=+l,+(l-1),...,0,...,-(l-1),-l MagnetischeQuantenzahl(maximal2l+1Werte) Name ausgeschrieben Wert von l Aussehen s-Orbital sharp l=0 radialsymmetrisch p-Orbital principal l=1 hantelförmig in den drei Raumachsen d-Orbital diffuse l=2 gekreuzte Doppelhantel f-Orbital fundamental l=3 rosettenförmig 15 Atomorbitaltheorie(AO-Theorie) Wellenfunktionen Ψn,l,m = f(n,l,m) n = 1,2,3,...,∞ (ganze Zahlen) Hauptquantenzahl l = 0,1,2,... bis n-1 Nebenquantenzahl m = +l, +(l-1),...,0,...,-(l-1),-l Magnetische Quantenzahl (maximal 2l+1 Werte) Um die Elektronenzustände vollständig zu definieren braucht es eine vierte Quantenzahl: Spinquantenzahl s à s= +1/2 oder -1/2 Damit wird der Eigendrehimpuls des Elektrons ‚umschrieben‘. Durch die vier Quantenzahlen n, l, m und s ist der Zustand eines Elektrons im Atom eindeutig charakterisiert. n „Schale“ (zB K, L, M, ...), Energie, Orbitalgröße l Form des Orbitals (s, p,d, ...) m Orientierung im Raum s Richtung des Elektronen-Eigendrehimpulses 16 GraphischeDarstellungderOrbitale z y 1s-Orbital: n=1,l=0,m=0:radialsymmetrisch x z z y y x z x y x 2p-Orbitale: l=1,m=-1,0,+1:px,py,pz-Orbital,hantelförmig,Vorzeichenwechsel 17 Mehrelektronen-Systeme Mehrelektronen-System können näherungsweise durch bisher gezeigtes wiedergegeben werden. Pauli-Verbot Zwei Elektronen dürfen nicht in allen vie r Quantenzahlen übereinstimmen ! Ein Atomorbital kann höchstens mit 2 Elektronen und zwar mit antiparallelen Spin (s=+1/2 und s=-1/2) besetzt werden ! Hundsche Regel Besitzt ein Atom energetisch gleichwertige (entartete) Elektronenzustände, und werden mehrere Elektronen eingebaut, so erfolgt der Einbau derart, daß die Elektronen die Orbitale zuerst mit parallelem Spin besetzen. Anschließend erfolgt die paarweise Besetzung mit antiparallelem Spin. px py pz 2p-Orbitale: l=1,m=-1,0,+1:px,py,pz-Orbital,hantelförmig,Vorzeichenwechsel 18 Bindungsarten ChemischeBindung– Bindungsarten 1.starke Bindungen:ionische,kovalenteundmetallische Bindungenà energiereich, nichtleichtzubrechen. 2.schwache Bindungen:Wasserstoffbrückenbindung, VanderWaalsWechselwirkungà leicht(er)zubrechen. KovalenteBindung(auchAtombindung) v.a.wichtiginOrganischerChemie!! Kovalente(Elektronenpaar-)BindungenbildensichzwischenPartnernmitähnlicherElektronegativität(EN)aus. Beispiele: 1.Elementegleicher EN:Cl-Cl(=Cl2).Elektronenpaar-Bindungensindgerichtet,zwischenBindungspartner existiert erhöhteElektronendichte). Cl Cl Valenzstrichformel Cl Cl 2.Elementeunterschiedlicher EN:H-FFluorwasserstoff,CO2 Kohlendioxid,H2OWasser δ- F H δ+ δ+ O C O δ- δ- δδ+ H O H δ+ 19 KovalenteBindungeninorganischenVerbindungen Bindung BindendeOrbitale sp3 sp2,pz sp,pz,py Bindungstyp σ σ,π σ,π ,π WinkelzwischendenBindungen 109,5° 120° 180° Bindungslänge/pm[10-12 m] 154 134 120 Bindungsenergie/kJmol-1 331 620 812 DrehbarkeitumC-C ja nein nein 20 MolekülorbitaleinderOrganischenChemie indenmeistenorganischenVerbindungensindnurdieEnergieniveausmitdenHauptquantenzahlenn=1und2mitElektronen besetzt. n=1:1skugelsymmetrischesOrbitalmit2Elektronen n=2:2skugelsymmetrischesOrbitalmit2Elektronen,3x2pOrbitalmit6Elektronen 2s 1s 2pz 2py 2px 21 MolekülorbitaleinderOrganischenChemie ElektronenkonfigurationdesKohlenstoff-Atoms: 1s2 2s2 2p2=[He]2s2 2p2 BetrachtendasKohlenstoff-AtomimGrundzustand(GZ): 4e- inäußererSchaleà stehenzurAusbildungvonBindungenzurVerfügung. Energiezufuhr Energie 2p 2s Energie 2p 2s Grundzustand angeregter Zustand BeiEnergiezufuhr:e- aus2sOrbitalin2pOrbital 22 nunstehen4ungepaarteElektronenzurAusbildungvonBindungenzurVerfügungà C-AtombildetinderRegel4Bindungenaus!! ProblemedesModells Kohlenstoff-Atom Energie 2p 4xWasserstoff-Atom Energie 2s 1s 1s 1s 1s Überlappungwürdezu4Bindungenführen,eineohnefestgelegteRichtung(2s+1s)unddreisenkrecht zueinanderstehenden(1s+2px bzw.2py bzw.2pz) Manfindetaber,dassdie4BindungenimMethanmolekülgleichwertig(gleichlang)sindunddasMolekül vollkommensymmetrischaufgebautist!! Methan 23 MethanCH4 – dasHybridisierungsmodell Summenformel:CH4 Hybridisierungs-Modell: DievierOrbitaledesC-Atoms(2s,2px,2py,2pz)sindgemischt(hybridisiert) odergekreuzt. à FOLGE: 4neueenergetisch-entartete(=gleiche) sp3-Orbitale. Hybridisierung Energie 2p Energie 2s 4xsp3 Orbitale 24 Diesp3-Hybridisierung GraphischeDarstellungeinessp-Hybridorbitals Energie 4xspOrbitale(sp3-Hybridisierung) 2s 2p sp z Elektron C y x TetraedrischeAnordnungdurchAbstoßungderElektronen: 2Bindungenliegeninz/y-Ebene,1Bindungvorderz/y-Ebene(vollerKeil),1Bindungdahinter(gestrichelterKeil) 25 Dieσ σ-Bindung ! Beispiel:WasserstoffmolekülH2 Darstellung:H-H 1s 1s ! Beispiel:H-C-BindungDarstellung:H-C sp 1s Beispiel:C-C-BindungDarstellung:C-C ! sp sp à SubstanzenmitdergrößtmöglichenAnzahlvonσ-Bindungen(zBMethanCH4)nenntman gesättigteVerbindungen. à wichtigeEigenschaftvonσ-Bindungen:Siesindfreirotierbar entlangderBindung. Beispiel:Ethan C2H6 H H H C C H H H H 8xsp-Orbitalevon2sp -hybridisiertenC-Atomen 3 H H C C H H H FreieDrehbarkeit 6x1s-OrbitalvonH-Atomen 6xs-spCH-σ σ-Bindungen σ-Bindungen 1xsp-spCC-σ à 7σ σ-Bindungen 26 Ethan H H H C C H H Seitenansicht H Frontansicht (s.Pfeil) 27 Diesp2-Hybridisierung sp2-Hybridisierung sp -Hybridisierung 2 1x2pOrbital Energie 3xspOrbitale 3xsp-Orbital 1x2p-Orbital z C y x planareAnordnunginsp2-hybridisiertenC-Atomen: Alle4(3σ- und1π-)Bindungenliegeninz/y-Ebene 28 Dieπ π-Bindung Beispiel:inC-C-DoppelbindungDarstellung:C=C 2p 2p à verbindungenmitMehrfachbindungennenntmanungesättigteVerbindungen. à wichtigeEigenschaftvonπ-Bindungen: SiesindNICHT freirotierbar entlangderBindung(aufgrundVorzeichenwechselinp-Orbital). Beispiel:Ethen C2H4 H C H H 6xsp-Orbitalevon2sp2-hybridisiertenC-Atomen H 2xp-Orbitalevon2sp2-hybridisiertenC-Atomen H H C C H C H KEINEfreieDrehbarkeit 4x1s-OrbitalvonH-Atomen σ-Bindungen 4xs-spCH-σ σ-Bindungen 1xsp-spCC-σ σ-Bindungen à 5σ π-Bindung 1xp-pCC-π à 1π π-Bindung 29 Ethen H H C H Seitenansicht C H Frontansicht (s.Pfeil) 30 Diesp-Hybridisierung 2x2pOrbital sp-Hybridisierung Energie 2xspOrbitale 2xsp-Orbital 2x2p-Orbital z C y x lineareAnordnunginsp-hybridisiertenC-Atomenaus2σ- und2π-Bindungen 31 Diesp-Hybridisierung– BeispielEthin H C C H 4xsp-Orbitalevon2sp-hybridisiertenC-Atomen 2xs-spCH-σ σ-Bindungen σ-Bindungen 1xsp-spCC-σ σ-Bindungen à 3σ π-Bindungen 2xp-pCC-π à 2π π-Bindungen Seitenansicht 4xp-Orbitalevon2sp-hybridisiertenC-Atomen 2x1s-OrbitalvonH-Atomen Frontansicht 32 Zusammenfassung KovalenteBindungeninorganischenVerbindungen sp3-Hybridisierung aus2s-Orbitalund32p-Orbitalenentstehen4sp3-Orbitale. à gesättigter Kohlenstoff:bildetrotationssymmetrischeσ-Bindungaus– z.B.CH4,C2H6,C3H8 sp2-Hybridisierung aus2s-Orbitalund22p-Orbitalenentstehen3sp2-Orbitaleundein2p-Orbitalbleibtübrig. à ungesättigterKohlenstoff:bildet3σ-Bindungenundeineπ-Bindung,d.h.wirerhalteneineDoppelbindungzueinem Bindungspartner– z.B.Ethen C2H4.DurchdieDoppelbindungwirddieRotationsfreiheitumdieMehrfachbindungsachse aufgehoben. H3C H C C H CH3 Nichtgleich E-But-2-en H3C H C C CH3 H Z-But-2-en sp-Hybridisierung aus2s-Orbitalund12p-Orbitalentstehen2sp-Orbitaleundzwei2p-Orbitalebleibenübrig. à ungesättigterKohlenstoff: bildet2σ-Bindungenund2π-Bindung,d.h.wirerhalteneineDreichfachbindungzueinem Bindungspartner– z.B.EthinC2H2. H C C H 33 Mesomerie Bisher: sp3,sp2 undspHybridisierungà Einfach-,Doppel- undDreichfachbindungenà kovalenteBindungen. KovalenteBindungen: sindElektronenpaarbindungen(ausValenzelektronen),wobeijeweilseinElektronvoneinemderBindungspartnerzurVerfügung gestelltwird(BindungwirdalsStrichzwischenAtomendargestellt)à Valenzstruktur. BisherkonntenwirdieBindungsverhältnisseeinesMolekülsdurchEINEValenzstrukturangeben.EsgibtaberFällebeidenensich MEHREREValenzstrukturenfüreinMolekül formulierenlassenà MESOMERIE. O H3C O Essigsäure H -H+ O- O H3C O- H3C O 2gleichwertigemesomere GrenzstrukturendesAcetat-Anions 34 MolekülemitmehrerenDoppelbindungen 1. IsolierteDoppelbindungen: mehralseineEinfachbindungAbstand 2. KonjugierteDoppelbindungen: Doppelbindungdurcheine'Einfachbindung'verbunden KürzererAbstand alserwartetfürEinfachbindung 4xsp2 hybridisierteC-Atome Elektronensinddelokalisiert 35 Aromatizität BesondererFall: cyclisch-konjugierte,planareπ-Systememit4n+2π Elektronen bekanntesterVertreter:BenzolC6H6 hypothetisch2Formenmöglich– mitunterschiedlichenBindungslängen(Einfach- undDoppelbindungen) à ABER: ExperimentellerBefunde: ① AlleBindungeninBenzolsindgleichwertigundzeigeneinenAbstandvon1.39Å(vgl.r(C-C)=1.54Åundr(C=C)=1.34Å). ② AlleC-Atomesindsp2-hybridisiert. °. ③ Bindungswinkelbetragen120° à allezwölfAtome(C6H6)bildeneineEbene,diep-Orbitalealler6sp2-hybridisiertenC-Atomeüberlappenundsindsomitober- und unterhalbderRingebenedelokalisiert! à BenzolzeichnetsichdurcheineerhöhteStabilitätausundistinReaktionenträgeralsAlkene. 36 Aromatizität- Benzol 37 Aromatizität– DieHückelRegel NachHückelgilt: π –Elektronen aufweist! eineVerbindungistaromatisch,wennsieineinemcyclischenSystem(4n+2)π n=0:2π-Elektronen n=1:6π-Elektronen n=2:10π-Elektronen n=3:14π-Elektronen … CyclopropenylKation Benzol CyclopentadienylAnion Naphtalin Anthracen 38 SystematikorganischerVerbindungen OrganischeVerbindungen AcyclischeVerbindungen (kettenförmig) Gesättigte Kohlenwasserstoffe (Alkane) CyclischeVerbindungen (ringförmig) Ungesättigte Kohlenwasserstoffe (Alkene,Alkine) Carbocyclen Alicyclen Heterocyclen gesättigt Cycloalkane,Cycloalkene, Cycloalkine ungesättigt aromatisch Aromaten 39 ChemischeFormelsprache Beispiel: D-Glucose Verhältnisformel: gibtkleinstmöglichesVerhältnisderElemente einerorganischenVerbindung (CH2O) n C6H12O6 Summenformel: Anzahldereinzelnen ElementeinorganischerVerbindung Konstitutionsformel: WelcheAtomeüberwelcheBindungmiteinanderverknüpftsind,keineInformationüber dieräumlicheAnordnung. O C C C C C C H H H OH H OH H OH H OH H OH HO C H H OH H C OH H C OH C H H C OH H C O 40 ChemischeFormelsprache Beispiel: D-Glucose Konfigurationsformel: RäumlicheAnordnungderAtomeineinemMolekülmitbekannterKonstitution. O C H H C OH HO C H H C OH H C OH H C OH HO CH2 O H H H OH H HO H OH OH H Fischer-Projektion Haworth-Ringformel Konformationsformel: RäumlicheAnordnungderAtomeineinemMolekülmitbekannterKonstitutionunter BerücksichtigungvonRotationenumEinfachbindungen. H OH HO HO H HO H O H Sessel1 OH H OH H H OH O H OH H H OH Sessel2 OH 41 Isomerie Definition: AlsIsomere bezeichnetmanMolekülemitgleicher Summenformel,diesichjedochinderSequenzderAtome (Konstitutionsisomere)oderderenräumlichenAnordnung(Stereoisomere)unterscheiden. Isomere Konstitutionsisomere z.B.Pentan Stereoisomere z.B. Enantiomere cis-/trans-Isomere 42