Einblicke in Biofilme bei Endokarditis

Werbung
BIOFILMZENTRUM
Einblicke in Biofilme bei Endokarditis
Annette Moter
Biofilmzentrum
Deutsches Herzzentrum Berlin
BIOFILMZENTRUM
Biofilme
Komplexe Lebensgemeinschaften:
 Eingebettet in EPS‐Matrix
 Nahrungsketten
 Kommunikation (Quorum Sensing)
 Ruhende Zellen (Persister, VBNC,…)
Resistenter
Toleranter gegenüber Antibiotika
BIOFILMZENTRUM
Biofilme (Costerton et al. 1978)
komplexe sesshafte Lebensgemeinschaften
“Hard to detect and hard to treat“
= Schwer zu detektieren und schwer zu behandeln
Problem:
• schwer nachweisbar da oft kulturnegativ
BIOFILMZENTRUM
NIH: “Biofilms are medically important, accounting for over 80 percent of microbial infections in the body”
Derzeit fehlen sowohl
diagnostische Nachweismethoden
als auch therapeutische Konzepte
?
BIOFILMZENTRUM
Fluoreszenz in situ Hybridisierung
FISH
Sonde
Fixierung
Objektträger
Zielstruktur
Hybridisierung
Waschen
Mikroskopie
BIOFILMZENTRUM
FISH
•
molekulare Methode
•
wer?
•
wo?
•
wieviele?
•
wie aktiv?
BIOFILMZENTRUM
FISH
DNA
16S rRNA gene PCR
Sequencing
• who?
• where?
• how many?
• how active?
Species
identification
BIOFILMZENTRUM
Endocarditis
Heart valve tissue section
E. faecalis
DAPI
Background,
Erythrocytes
100µm
10 µm
Curr Infect Dis Rep (2010) 12:244–252
BIOFILMZENTRUM
Endocarditis
Koagulase negative staphylococci:
Differentiation between contamination and infection
Bacteria
Staphylococcus spp. Curr Infect Dis Rep
2011
BIOFILMZENTRUM
Endocarditis
discriminative orange fluorescence intensity
indicates differential ribosomal content of the cells
Streptococcus
DAPI
Background, Erythrocytes
Curr Infect Dis Rep (2010) 12:244–252
B I O F I L M Z E NBiofilme
TRUM
Mikrobielle
A. Moter
Prosthetic heart valves, Charité
culture
FISH/PCR
CNS
9
6
S. aureus
Strep
5
7
Enterococcus
10
P. acnes
7
T. whipplei
3
Coxiella
Candida
53
9
Listeria
66
Acinetobacter
Spezies?
negativ
2
A. Moter
B I O F I L M Z E NBiofilme
TRUM
Mikrobielle
20%
Prosthetic heart valves
Culture versus FISH/PCR
culture = FISH/PCR positive
culture + FISH/PCR ‐
49%
7%
FISH/PCR different species
3%
culture ‐ FISH/PCR +
21%
culture = FISH/PCR negative
B I A.
OM
F oI Lt eMr Z- EB N
Tf iRl mUsM
io
Mikrobielle
Biofilme
A. Moter
FISH - Limitationen
• Postoperativ
• ‚Snapshot‘
• ‚DAPI only‘ - Fälle
• keine ‚stand alone‘ Technik
A. Moter
B I O F I L M Z E NBiofilme
TRUM
Mikrobielle
FISH/PCR erlaubt
• Detektion und Identifikation in
kulturnegativen Fällen
• Diskriminierung zwischen Kontamination
und Infektion
• Menge und Verteilung im Gewebe
BIOFILMZENTRUM
Biofilm assoziierte Infektionen
• Kultur und Resistenzmessung (MHK) ist zur Zeit der
Goldstandard mikrobiologischen Diagnostik
• Standardisiert und reproduzierbar
• Jahre klinischer Erfahrung der MHK-Interpretation
Aber:
• kulturelles Wachstum unerlässlich
• Sensitivität in vivo in Biofilmen ist anders
BIOFILMZENTRUM
Endocarditis
• Endocarditis ist ein Biofilm-Problem
• Vitale Bakterien in kulturnegativen Fällen
• Antibiotikatoleranz ist in vivo höher,
als wir in vitro messen
BIOFILMZENTRUM
Fälle und Raritäten
Biofilm associated infections
Patient, 57J
• Jan 2014
• August 2015
AKE bei kombiniertem Vitium, Bioprothese
Leistungsknick, Dyspnoe,
Paravalvuläre Leckage
• Kultur:
• 16S rRNA-Gen:
negativ
M. abscessus/chelonae/
massiliense/bolletti
99,9% Identität über 474 BP
• Labor Uni Regensburg: rpoB-Gen M. chelonae
Infektionsquelle???
BIOFILMZENTRUM
Biofilm associated infections
Biofilm associated infections
BIOFILMZENTRUM
Biofilme in der Endokarditis
• sind komplex aber nicht chaotisch
• sind relevant in vivo
• haben einen großen Einfluss auf den
Infektionsverlauf
Biofilm associated infections
FISH + PCR/Sequenzierung
• Detektion und Identifikation in
kulturnegativen Fällen
• Diskriminierung zwischen Kontamination
und Infektion
• Menge und Verteilung im Gewebe
• Indikator für Aktivität
• ein wichtiger Beitrag zur Diagnostik
BIOFILMZENTRUM
Thank you!
DHZB
DHZB
V. Falk
Judith Kikhney
David Hrankovic
Jenny Hoffmann
Laura Kursawe
Pablo Rojas
Julia Schulze
Smita Sutrave
Alexandra Wießner
Julia Drescher
Benjamin Gocht
Antje Müller
Annett Petrich
Dinah Schmiedel
Brush your teeth!
Traunstein
J. Fraunhofer
S. Hübler
F. Kaufmann
T. Krabatsch
M. Musci
E. Potapov
F. Schönrath
K. Schönrath
C. Starck
Trostberg
T. Glück
Charité
K. Affeld
P. Dohmen
G. Gabel
H. Grubitzsch
O. Kumpf L. Goubergrids
U. Kertzscher
Bogenhausen
W. Eichinger
P. Neumeier-Prauser
und Team
Herunterladen